MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 107806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017530	CCA	2	6	698210	698215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010237
13002	NC_017530	ATC	2	6	698239	698244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010237
13003	NC_017530	GGTG	2	8	698270	698277	0 %	25 %	75 %	0 %	386010237
13004	NC_017530	CAA	2	6	698595	698600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010238
13005	NC_017530	TTG	2	6	698605	698610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010238
13006	NC_017530	GC	3	6	698618	698623	0 %	0 %	50 %	50 %	386010238
13007	NC_017530	GCCCCC	2	12	698701	698712	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	386010238
13008	NC_017530	GCA	2	6	698800	698805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010238
13009	NC_017530	CCA	2	6	698855	698860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010238
13010	NC_017530	CTGCGC	2	12	698932	698943	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386010238
13011	NC_017530	GCT	2	6	698988	698993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010238
13012	NC_017530	AGC	2	6	699008	699013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010238
13013	NC_017530	GCT	2	6	699087	699092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010238
13014	NC_017530	TTC	2	6	699157	699162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010238
13015	NC_017530	CAG	2	6	699213	699218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010238
13016	NC_017530	TAC	3	9	699223	699231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010238
13017	NC_017530	GC	3	6	699295	699300	0 %	0 %	50 %	50 %	386010238
13018	NC_017530	CG	3	6	699305	699310	0 %	0 %	50 %	50 %	386010238
13019	NC_017530	TGC	2	6	699320	699325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010238
13020	NC_017530	GC	3	6	699378	699383	0 %	0 %	50 %	50 %	386010238
13021	NC_017530	ATT	2	6	699398	699403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386010238
13022	NC_017530	GGC	2	6	699496	699501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010238
13023	NC_017530	GCG	2	6	699512	699517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010238
13024	NC_017530	CCA	2	6	699563	699568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010238
13025	NC_017530	GCT	2	6	699648	699653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010238
13026	NC_017530	TTC	2	6	699724	699729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010238
13027	NC_017530	TGC	2	6	699770	699775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010238
13028	NC_017530	CTG	2	6	699784	699789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010238
13029	NC_017530	CTG	2	6	699952	699957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010238
13030	NC_017530	GGCG	2	8	699970	699977	0 %	0 %	75 %	25 %	386010238
13031	NC_017530	GCA	2	6	700043	700048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010238
13032	NC_017530	GCCG	2	8	700113	700120	0 %	0 %	50 %	50 %	386010238
13033	NC_017530	GGT	2	6	700272	700277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010238
13034	NC_017530	ACTG	2	8	700320	700327	25 %	25 %	25 %	25 %	386010238
13035	NC_017530	GGT	2	6	700351	700356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010238
13036	NC_017530	AGC	2	6	700379	700384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010238
13037	NC_017530	GAG	2	6	700435	700440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386010238
13038	NC_017530	GAATTC	2	12	700462	700473	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386010238
13039	NC_017530	TGG	2	6	700475	700480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010238
13040	NC_017530	GGC	2	6	700503	700508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010238
13041	NC_017530	CGC	2	6	700540	700545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010238
13042	NC_017530	TAC	2	6	700549	700554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010238
13043	NC_017530	GCG	2	6	700772	700777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010238
13044	NC_017530	CCT	2	6	700817	700822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386010238
13045	NC_017530	GTCACC	2	12	700846	700857	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386010238
13046	NC_017530	CCGC	2	8	700858	700865	0 %	0 %	25 %	75 %	386010238
13047	NC_017530	TGA	2	6	700883	700888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010238
13048	NC_017530	TGG	2	6	700912	700917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010238
13049	NC_017530	CCG	2	6	700934	700939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010238
13050	NC_017530	GC	3	6	701000	701005	0 %	0 %	50 %	50 %	386010238
13051	NC_017530	GC	3	6	701049	701054	0 %	0 %	50 %	50 %	386010238
13052	NC_017530	TGC	2	6	701063	701068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010238
13053	NC_017530	GCC	2	6	701164	701169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010238
13054	NC_017530	TGT	3	9	701204	701212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010238
13055	NC_017530	CGG	2	6	701213	701218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010238
13056	NC_017530	GGCC	2	8	701334	701341	0 %	0 %	50 %	50 %	386010238
13057	NC_017530	GCC	2	6	701345	701350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010238
13058	NC_017530	G	6	6	701391	701396	0 %	0 %	100 %	0 %	386010238
13059	NC_017530	TCG	2	6	701423	701428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010238
13060	NC_017530	CAG	2	6	701431	701436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010238
13061	NC_017530	GAC	2	6	701455	701460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010238
13062	NC_017530	GGCCA	2	10	701470	701479	20 %	0 %	40 %	40 %	386010238
13063	NC_017530	CGC	2	6	701574	701579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010238
13064	NC_017530	CAC	2	6	701694	701699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010238
13065	NC_017530	GGC	2	6	701718	701723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010238
13066	NC_017530	TGA	2	6	701771	701776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010238
13067	NC_017530	AGGG	2	8	701792	701799	25 %	0 %	75 %	0 %	386010238
13068	NC_017530	GGGCA	2	10	701803	701812	20 %	0 %	60 %	20 %	386010238
13069	NC_017530	GCC	2	6	701974	701979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010238
13070	NC_017530	AGCC	2	8	702000	702007	25 %	0 %	25 %	50 %	386010238
13071	NC_017530	GCCG	2	8	702020	702027	0 %	0 %	50 %	50 %	386010238
13072	NC_017530	CG	3	6	702052	702057	0 %	0 %	50 %	50 %	386010238
13073	NC_017530	ACC	2	6	702091	702096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010238
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13080	NC_017530	CTG	2	6	702367	702372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010238
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13088	NC_017530	GGCA	2	8	702848	702855	25 %	0 %	50 %	25 %	386010238
13089	NC_017530	CAG	2	6	702976	702981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010238
13090	NC_017530	GGC	2	6	703021	703026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010238
13091	NC_017530	AG	3	6	703045	703050	50 %	0 %	50 %	0 %	386010238
13092	NC_017530	TGG	3	9	703157	703165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010238
13093	NC_017530	CTG	2	6	703168	703173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010238
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13099	NC_017530	GCC	3	9	703398	703406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010238
13100	NC_017530	GTCGA	2	10	703411	703420	20 %	20 %	40 %	20 %	386010238
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13102	NC_017530	CCAG	2	8	703675	703682	25 %	0 %	25 %	50 %	386010239
13103	NC_017530	GAT	2	6	703694	703699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010239
13104	NC_017530	GC	3	6	703704	703709	0 %	0 %	50 %	50 %	386010239
13105	NC_017530	CAG	2	6	703733	703738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010239
13106	NC_017530	GAT	2	6	703748	703753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010239
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13109	NC_017530	CGA	2	6	703864	703869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010239
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13111	NC_017530	GTT	2	6	704046	704051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010240
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13113	NC_017530	CGG	2	6	704082	704087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010240
13114	NC_017530	CTGG	2	8	704094	704101	0 %	25 %	50 %	25 %	386010240
13115	NC_017530	GAC	2	6	704134	704139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010240
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13119	NC_017530	GCG	2	6	704342	704347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010240
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13355	NC_017530	GGC	2	6	716616	716621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010251
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13476	NC_017530	CTG	2	6	723428	723433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010257
13477	NC_017530	TGC	2	6	723471	723476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010257
13478	NC_017530	GGC	2	6	723484	723489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010257
13479	NC_017530	CAT	2	6	723556	723561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010257
13480	NC_017530	GC	3	6	723597	723602	0 %	0 %	50 %	50 %	386010257
13481	NC_017530	TG	3	6	723632	723637	0 %	50 %	50 %	0 %	386010257
13482	NC_017530	TGC	2	6	723658	723663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010257
13483	NC_017530	GCT	2	6	723676	723681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010257
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13491	NC_017530	GTC	2	6	724592	724597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010258
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13499	NC_017530	G	6	6	724991	724996	0 %	0 %	100 %	0 %	386010258
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