MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 107806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_017530	GGC	2	6	593979	593984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010143
11002	NC_017530	TG	3	6	594037	594042	0 %	50 %	50 %	0 %	386010143
11003	NC_017530	TCG	2	6	594055	594060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010143
11004	NC_017530	GCC	2	6	594077	594082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010143
11005	NC_017530	GGCC	2	8	594131	594138	0 %	0 %	50 %	50 %	386010143
11006	NC_017530	TGG	3	9	594181	594189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010143
11007	NC_017530	AAG	3	9	594190	594198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010143
11008	NC_017530	CCA	2	6	594403	594408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010144
11009	NC_017530	GT	3	6	594466	594471	0 %	50 %	50 %	0 %	386010144
11010	NC_017530	ACC	2	6	594588	594593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010144
11011	NC_017530	ATC	2	6	594597	594602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010144
11012	NC_017530	GCT	2	6	594626	594631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010144
11013	NC_017530	CGG	2	6	594632	594637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010144
11014	NC_017530	CAG	3	9	594651	594659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010144
11015	NC_017530	GGC	2	6	594660	594665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010144
11016	NC_017530	GGC	2	6	594684	594689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010144
11017	NC_017530	TGG	3	9	594695	594703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010144
11018	NC_017530	CAG	2	6	594705	594710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010144
11019	NC_017530	CGCCA	2	10	594730	594739	20 %	0 %	20 %	60 %	386010144
11020	NC_017530	CGG	2	6	594802	594807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010144
11021	NC_017530	AAC	2	6	594941	594946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010145
11022	NC_017530	CAG	2	6	594964	594969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010145
11023	NC_017530	GGC	2	6	595005	595010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010145
11024	NC_017530	TGG	2	6	595041	595046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010145
11025	NC_017530	TCG	2	6	595121	595126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010145
11026	NC_017530	CCAG	2	8	595149	595156	25 %	0 %	25 %	50 %	386010145
11027	NC_017530	GC	3	6	595222	595227	0 %	0 %	50 %	50 %	386010145
11028	NC_017530	GCC	2	6	595229	595234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010145
11029	NC_017530	CTG	3	9	595237	595245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010145
11030	NC_017530	GCT	2	6	595327	595332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010145
11031	NC_017530	GAT	2	6	595343	595348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010145
11032	NC_017530	GCG	2	6	595365	595370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010145
11033	NC_017530	GCA	2	6	595401	595406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010145
11034	NC_017530	GGGCT	2	10	595475	595484	0 %	20 %	60 %	20 %	386010145
11035	NC_017530	GTG	2	6	595598	595603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010145
11036	NC_017530	CAG	2	6	595612	595617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010145
11037	NC_017530	CAGG	2	8	595633	595640	25 %	0 %	50 %	25 %	386010145
11038	NC_017530	CG	3	6	595642	595647	0 %	0 %	50 %	50 %	386010145
11039	NC_017530	CGC	2	6	595686	595691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010145
11040	NC_017530	ATG	2	6	595724	595729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010145
11041	NC_017530	CAC	2	6	595756	595761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010145
11042	NC_017530	GCT	2	6	595780	595785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010145
11043	NC_017530	CCA	2	6	595791	595796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010145
11044	NC_017530	TAC	2	6	595825	595830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010145
11045	NC_017530	CTG	2	6	595831	595836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010145
11046	NC_017530	CAGC	2	8	595852	595859	25 %	0 %	25 %	50 %	386010145
11047	NC_017530	TTGT	2	8	595882	595889	0 %	75 %	25 %	0 %	386010145
11048	NC_017530	ACC	2	6	595900	595905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010145
11049	NC_017530	GAG	3	9	595940	595948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386010145
11050	NC_017530	CGT	2	6	595992	595997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010145
11051	NC_017530	TGA	2	6	596004	596009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010145
11052	NC_017530	GCCA	2	8	596113	596120	25 %	0 %	25 %	50 %	386010145
11053	NC_017530	GCT	2	6	596135	596140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010145
11054	NC_017530	TCG	2	6	596141	596146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010145
11055	NC_017530	ATC	2	6	596267	596272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010145
11056	NC_017530	TCG	2	6	596599	596604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010146
11057	NC_017530	GGT	4	12	596616	596627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010146
11058	NC_017530	CTG	2	6	596649	596654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010146
11059	NC_017530	GCC	2	6	596663	596668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010146
11060	NC_017530	GGC	2	6	596717	596722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010146
11061	NC_017530	CAG	2	6	596744	596749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010146
11062	NC_017530	GTTG	2	8	596768	596775	0 %	50 %	50 %	0 %	386010146
11063	NC_017530	ATC	2	6	596853	596858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010146
11064	NC_017530	GAG	2	6	596916	596921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386010146
11065	NC_017530	ACG	2	6	596986	596991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010146
11066	NC_017530	CTT	2	6	596993	596998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010146
11067	NC_017530	GCA	2	6	597013	597018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010146
11068	NC_017530	TCA	2	6	597022	597027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010146
11069	NC_017530	CTG	2	6	597042	597047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010146
11070	NC_017530	TGG	2	6	597115	597120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010146
11071	NC_017530	GTC	2	6	597141	597146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010146
11072	NC_017530	CTG	2	6	597150	597155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010146
11073	NC_017530	ACA	2	6	597175	597180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010146
11074	NC_017530	ACC	2	6	597190	597195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010146
11075	NC_017530	ACG	2	6	597226	597231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010146
11076	NC_017530	ACCTG	2	10	597292	597301	20 %	20 %	20 %	40 %	386010146
11077	NC_017530	CTG	2	6	597374	597379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010147
11078	NC_017530	CGCTGG	2	12	597475	597486	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386010147
11079	NC_017530	GATC	2	8	597548	597555	25 %	25 %	25 %	25 %	386010147
11080	NC_017530	CAA	2	6	597563	597568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010147
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11083	NC_017530	GAT	2	6	597629	597634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010147
11084	NC_017530	TGG	2	6	597688	597693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010147
11085	NC_017530	ATC	2	6	597711	597716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010147
11086	NC_017530	CTGG	2	8	597819	597826	0 %	25 %	50 %	25 %	386010147
11087	NC_017530	CGGGTG	2	12	597831	597842	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386010147
11088	NC_017530	GGT	2	6	597884	597889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010147
11089	NC_017530	GGA	2	6	597953	597958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386010147
11090	NC_017530	GCA	2	6	597963	597968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010147
11091	NC_017530	AGC	2	6	597988	597993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010147
11092	NC_017530	GCG	2	6	598047	598052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010147
11093	NC_017530	TTC	2	6	598254	598259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010148
11094	NC_017530	CGC	2	6	598265	598270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010148
11095	NC_017530	GCG	2	6	598296	598301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010148
11096	NC_017530	TCGG	2	8	598395	598402	0 %	25 %	50 %	25 %	386010148
11097	NC_017530	CAT	2	6	598457	598462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010148
11098	NC_017530	ACC	2	6	598483	598488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010148
11099	NC_017530	GCC	2	6	598552	598557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010148
11100	NC_017530	GCA	2	6	598585	598590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010148
11101	NC_017530	TGA	2	6	598642	598647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010148
11102	NC_017530	GAA	2	6	598676	598681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010148
11103	NC_017530	CCG	2	6	598735	598740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010148
11104	NC_017530	GGCT	2	8	598751	598758	0 %	25 %	50 %	25 %	386010148
11105	NC_017530	ACCA	2	8	598875	598882	50 %	0 %	0 %	50 %	386010149
11106	NC_017530	TCTGGT	2	12	598907	598918	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386010149
11107	NC_017530	GCA	2	6	598932	598937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010149
11108	NC_017530	CAA	2	6	598985	598990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010149
11109	NC_017530	ACT	2	6	599044	599049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010149
11110	NC_017530	GGGC	2	8	599087	599094	0 %	0 %	75 %	25 %	386010149
11111	NC_017530	ACG	2	6	599212	599217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010149
11112	NC_017530	TGA	2	6	599326	599331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010149
11113	NC_017530	AGC	2	6	599332	599337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010149
11114	NC_017530	CCT	2	6	599422	599427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386010149
11115	NC_017530	GCA	2	6	599477	599482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010149
11116	NC_017530	GCT	3	9	599525	599533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010149
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11118	NC_017530	GCT	2	6	599612	599617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010149
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11121	NC_017530	TGA	2	6	599761	599766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010149
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11222	NC_017530	CCTC	2	8	604046	604053	0 %	25 %	0 %	75 %	386010153
11223	NC_017530	GATC	2	8	604055	604062	25 %	25 %	25 %	25 %	386010153
11224	NC_017530	GCCC	2	8	604121	604128	0 %	0 %	25 %	75 %	386010153
11225	NC_017530	GCG	2	6	604183	604188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010153
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11228	NC_017530	TGC	2	6	604276	604281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010153
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11230	NC_017530	TGA	2	6	604370	604375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010153
11231	NC_017530	CAA	3	9	604430	604438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010153
11232	NC_017530	GCC	3	9	604440	604448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010153
11233	NC_017530	TGC	2	6	604450	604455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010153
11234	NC_017530	GC	4	8	604474	604481	0 %	0 %	50 %	50 %	386010153
11235	NC_017530	AAGG	2	8	604482	604489	50 %	0 %	50 %	0 %	386010153
11236	NC_017530	CAT	2	6	604490	604495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010153
11237	NC_017530	GGT	2	6	604521	604526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010153
11238	NC_017530	CAT	2	6	604544	604549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010153
11239	NC_017530	GCC	2	6	604617	604622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010153
11240	NC_017530	CTG	2	6	604641	604646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010153
11241	NC_017530	GCA	2	6	604660	604665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010153
11242	NC_017530	CAC	2	6	604685	604690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010153
11243	NC_017530	CCA	2	6	604724	604729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010153
11244	NC_017530	GCT	2	6	604742	604747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010153
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11253	NC_017530	CAGC	2	8	605171	605178	25 %	0 %	25 %	50 %	386010153
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11259	NC_017530	CTG	3	9	605444	605452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010154
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11262	NC_017530	GC	3	6	605547	605552	0 %	0 %	50 %	50 %	386010154
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11266	NC_017530	GCT	2	6	605701	605706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010154
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11268	NC_017530	CTG	2	6	605882	605887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010154
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11276	NC_017530	TGCA	2	8	606069	606076	25 %	25 %	25 %	25 %	386010154
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11342	NC_017530	GTA	2	6	609633	609638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010156
11343	NC_017530	GGCCG	2	10	609639	609648	0 %	0 %	60 %	40 %	386010156
11344	NC_017530	GC	3	6	609673	609678	0 %	0 %	50 %	50 %	386010156
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11350	NC_017530	GCCT	2	8	609861	609868	0 %	25 %	25 %	50 %	386010156
11351	NC_017530	GAG	2	6	609978	609983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386010156
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11353	NC_017530	CG	3	6	610285	610290	0 %	0 %	50 %	50 %	386010157
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11355	NC_017530	GTC	2	6	610319	610324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010157
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