MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 107806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_017530	CCGG	2	8	567606	567613	0 %	0 %	50 %	50 %	386010107
10503	NC_017530	CGA	2	6	567623	567628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010107
10504	NC_017530	CGA	2	6	567662	567667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010107
10505	NC_017530	GGT	2	6	567843	567848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010107
10506	NC_017530	CGTGAG	2	12	567999	568010	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386010107
10507	NC_017530	CGGTG	2	10	568028	568037	0 %	20 %	60 %	20 %	386010107
10508	NC_017530	AAGG	2	8	568047	568054	50 %	0 %	50 %	0 %	386010107
10509	NC_017530	TCG	2	6	568078	568083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010107
10510	NC_017530	CACC	2	8	568100	568107	25 %	0 %	0 %	75 %	386010107
10511	NC_017530	GAA	2	6	568152	568157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010107
10512	NC_017530	CGA	2	6	568181	568186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010107
10513	NC_017530	TCCG	2	8	568252	568259	0 %	25 %	25 %	50 %	386010107
10514	NC_017530	TGC	2	6	568277	568282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010107
10515	NC_017530	CG	3	6	568394	568399	0 %	0 %	50 %	50 %	386010107
10516	NC_017530	GGT	2	6	568437	568442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010107
10517	NC_017530	CG	3	6	568447	568452	0 %	0 %	50 %	50 %	386010107
10518	NC_017530	CGT	2	6	568473	568478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010107
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10520	NC_017530	CCGA	2	8	568566	568573	25 %	0 %	25 %	50 %	386010107
10521	NC_017530	CTG	2	6	568698	568703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010107
10522	NC_017530	TGC	2	6	568810	568815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010107
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10524	NC_017530	TGC	2	6	568945	568950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010107
10525	NC_017530	CTTC	2	8	568999	569006	0 %	50 %	0 %	50 %	386010107
10526	NC_017530	AAC	2	6	569012	569017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010107
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10528	NC_017530	GTC	2	6	569092	569097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010107
10529	NC_017530	CCGG	2	8	569103	569110	0 %	0 %	50 %	50 %	386010107
10530	NC_017530	AGCG	2	8	569130	569137	25 %	0 %	50 %	25 %	386010107
10531	NC_017530	CGT	2	6	569530	569535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010108
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10541	NC_017530	CGG	2	6	570160	570165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010109
10542	NC_017530	CGT	2	6	570203	570208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010109
10543	NC_017530	GCG	2	6	570252	570257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010109
10544	NC_017530	CTG	2	6	570290	570295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010109
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10553	NC_017530	ACC	2	6	570626	570631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010110
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10973	NC_017530	GAC	2	6	592651	592656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010142
10974	NC_017530	TTC	2	6	592720	592725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010142
10975	NC_017530	GCG	2	6	592927	592932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010143
10976	NC_017530	CGC	2	6	592940	592945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010143
10977	NC_017530	GGC	2	6	592947	592952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010143
10978	NC_017530	CTGG	2	8	593028	593035	0 %	25 %	50 %	25 %	386010143
10979	NC_017530	GAT	2	6	593111	593116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010143
10980	NC_017530	GCCG	2	8	593134	593141	0 %	0 %	50 %	50 %	386010143
10981	NC_017530	GGC	2	6	593186	593191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010143
10982	NC_017530	CTG	2	6	593254	593259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010143
10983	NC_017530	CTG	2	6	593271	593276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010143
10984	NC_017530	AAC	2	6	593293	593298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010143
10985	NC_017530	GGCCAT	2	12	593309	593320	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386010143
10986	NC_017530	GTC	2	6	593361	593366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010143
10987	NC_017530	GGCTG	2	10	593417	593426	0 %	20 %	60 %	20 %	386010143
10988	NC_017530	GCA	2	6	593483	593488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010143
10989	NC_017530	GC	3	6	593505	593510	0 %	0 %	50 %	50 %	386010143
10990	NC_017530	TCG	2	6	593620	593625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010143
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10992	NC_017530	AGC	2	6	593647	593652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010143
10993	NC_017530	TGG	2	6	593655	593660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010143
10994	NC_017530	T	6	6	593688	593693	0 %	100 %	0 %	0 %	386010143
10995	NC_017530	TCA	2	6	593707	593712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010143
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10997	NC_017530	GT	3	6	593743	593748	0 %	50 %	50 %	0 %	386010143
10998	NC_017530	CTG	3	9	593769	593777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010143
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11000	NC_017530	CCA	2	6	593938	593943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010143

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