MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 107806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
106001	NC_017530	AGCA	2	8	5640039	5640046	50 %	0 %	25 %	25 %	386014515
106002	NC_017530	TGT	2	6	5640085	5640090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014515
106003	NC_017530	CGC	2	6	5640101	5640106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014515
106004	NC_017530	GCT	2	6	5640131	5640136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014515
106005	NC_017530	GCC	2	6	5640138	5640143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014515
106006	NC_017530	GTG	2	6	5640210	5640215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014515
106007	NC_017530	ATC	2	6	5640216	5640221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014515
106008	NC_017530	CTG	2	6	5640300	5640305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014515
106009	NC_017530	GTG	2	6	5640306	5640311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014515
106010	NC_017530	GAA	2	6	5640333	5640338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014515
106011	NC_017530	CTG	3	9	5640378	5640386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014515
106012	NC_017530	TTC	2	6	5640456	5640461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014515
106013	NC_017530	ACCTGC	2	12	5640484	5640495	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386014515
106014	NC_017530	TGG	2	6	5640511	5640516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014515
106015	NC_017530	TGG	2	6	5640538	5640543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014515
106016	NC_017530	CTG	2	6	5640552	5640557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014515
106017	NC_017530	CAGCGC	2	12	5640596	5640607	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386014515
106018	NC_017530	GGC	2	6	5640629	5640634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014515
106019	NC_017530	GTG	2	6	5640654	5640659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014515
106020	NC_017530	CTG	3	9	5640708	5640716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014515
106021	NC_017530	GCT	2	6	5640749	5640754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014515
106022	NC_017530	GCGCCC	2	12	5640766	5640777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014515
106023	NC_017530	GTG	2	6	5640846	5640851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014515
106024	NC_017530	TCG	2	6	5640853	5640858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014515
106025	NC_017530	TCG	2	6	5640880	5640885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014515
106026	NC_017530	CG	3	6	5640884	5640889	0 %	0 %	50 %	50 %	386014515
106027	NC_017530	AGA	2	6	5640904	5640909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014515
106028	NC_017530	CGTT	2	8	5640913	5640920	0 %	50 %	25 %	25 %	386014515
106029	NC_017530	CGC	2	6	5641016	5641021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014515
106030	NC_017530	GGTG	2	8	5641025	5641032	0 %	25 %	75 %	0 %	386014515
106031	NC_017530	TCA	3	9	5641045	5641053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014515
106032	NC_017530	TGA	2	6	5641058	5641063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014515
106033	NC_017530	GCC	2	6	5641071	5641076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014515
106034	NC_017530	CCG	2	6	5641084	5641089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014515
106035	NC_017530	GC	3	6	5641134	5641139	0 %	0 %	50 %	50 %	386014515
106036	NC_017530	CCG	2	6	5641220	5641225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014515
106037	NC_017530	TGG	2	6	5641231	5641236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014515
106038	NC_017530	GGC	2	6	5641259	5641264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014515
106039	NC_017530	TGA	2	6	5641328	5641333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014515
106040	NC_017530	AGG	2	6	5641360	5641365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386014515
106041	NC_017530	TGGAGC	2	12	5641372	5641383	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386014515
106042	NC_017530	GTT	2	6	5641385	5641390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014515
106043	NC_017530	CA	3	6	5641948	5641953	50 %	0 %	0 %	50 %	386014516
106044	NC_017530	GTTG	2	8	5642155	5642162	0 %	50 %	50 %	0 %	386014516
106045	NC_017530	TTAC	2	8	5642552	5642559	25 %	50 %	0 %	25 %	386014517
106046	NC_017530	TCA	2	6	5642584	5642589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014517
106047	NC_017530	CAGC	2	8	5642626	5642633	25 %	0 %	25 %	50 %	386014517
106048	NC_017530	TCA	2	6	5642689	5642694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014517
106049	NC_017530	CAC	2	6	5642771	5642776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014517
106050	NC_017530	TTC	2	6	5642789	5642794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014517
106051	NC_017530	GCC	2	6	5642802	5642807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014517
106052	NC_017530	GCT	2	6	5642857	5642862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014517
106053	NC_017530	GGGC	2	8	5642925	5642932	0 %	0 %	75 %	25 %	386014517
106054	NC_017530	TGG	2	6	5643004	5643009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014517
106055	NC_017530	GAA	2	6	5643029	5643034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014517
106056	NC_017530	CAGC	2	8	5643046	5643053	25 %	0 %	25 %	50 %	386014517
106057	NC_017530	GTT	2	6	5643062	5643067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014517
106058	NC_017530	TGG	2	6	5643117	5643122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014517
106059	NC_017530	CAG	2	6	5643128	5643133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014517
106060	NC_017530	CGT	2	6	5643142	5643147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014517
106061	NC_017530	CTA	2	6	5643432	5643437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014518
106062	NC_017530	GTC	2	6	5643448	5643453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014518
106063	NC_017530	GGC	2	6	5643460	5643465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014518
106064	NC_017530	CGGG	2	8	5643477	5643484	0 %	0 %	75 %	25 %	386014518
106065	NC_017530	GCG	2	6	5643646	5643651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014518
106066	NC_017530	ATC	2	6	5643655	5643660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014518
106067	NC_017530	CG	3	6	5643680	5643685	0 %	0 %	50 %	50 %	386014518
106068	NC_017530	ACC	2	6	5643709	5643714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014518
106069	NC_017530	CCG	2	6	5643798	5643803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014518
106070	NC_017530	TGA	2	6	5643878	5643883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014518
106071	NC_017530	GCT	2	6	5643963	5643968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014518
106072	NC_017530	ACA	2	6	5644040	5644045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014518
106073	NC_017530	GCA	2	6	5644049	5644054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014518
106074	NC_017530	TGA	2	6	5644086	5644091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014518
106075	NC_017530	GGC	2	6	5644170	5644175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014518
106076	NC_017530	TGC	2	6	5644256	5644261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014518
106077	NC_017530	GATC	2	8	5644278	5644285	25 %	25 %	25 %	25 %	386014518
106078	NC_017530	GAG	2	6	5644294	5644299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386014518
106079	NC_017530	CA	3	6	5644542	5644547	50 %	0 %	0 %	50 %	386014519
106080	NC_017530	GCT	2	6	5644623	5644628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014519
106081	NC_017530	GTCGGC	2	12	5644750	5644761	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386014519
106082	NC_017530	GGC	2	6	5644798	5644803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014519
106083	NC_017530	CTG	2	6	5644825	5644830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014519
106084	NC_017530	CCGAGT	2	12	5644853	5644864	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386014519
106085	NC_017530	GAT	2	6	5644926	5644931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014519
106086	NC_017530	TGG	2	6	5644993	5644998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014519
106087	NC_017530	CAA	2	6	5645055	5645060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014519
106088	NC_017530	ACA	2	6	5645066	5645071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014519
106089	NC_017530	CCAC	2	8	5645075	5645082	25 %	0 %	0 %	75 %	386014519
106090	NC_017530	ACC	2	6	5645107	5645112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014519
106091	NC_017530	AACCTG	2	12	5645221	5645232	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386014519
106092	NC_017530	CTG	2	6	5645326	5645331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014519
106093	NC_017530	TCG	2	6	5645405	5645410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014519
106094	NC_017530	GCG	2	6	5645411	5645416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014519
106095	NC_017530	GCCTGA	2	12	5645525	5645536	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386014519
106096	NC_017530	CGG	2	6	5645568	5645573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014519
106097	NC_017530	GCGG	2	8	5645584	5645591	0 %	0 %	75 %	25 %	386014519
106098	NC_017530	ACGGCG	2	12	5645609	5645620	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386014519
106099	NC_017530	GTG	2	6	5645656	5645661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014519
106100	NC_017530	GTCA	2	8	5645704	5645711	25 %	25 %	25 %	25 %	386014519
106101	NC_017530	CCAGGC	2	12	5645721	5645732	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386014519
106102	NC_017530	GAT	2	6	5645737	5645742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014519
106103	NC_017530	ATC	2	6	5645761	5645766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014519
106104	NC_017530	ACC	2	6	5645837	5645842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014520
106105	NC_017530	CCA	2	6	5645862	5645867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014520
106106	NC_017530	GGCT	2	8	5645909	5645916	0 %	25 %	50 %	25 %	386014520
106107	NC_017530	TTC	2	6	5645984	5645989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014520
106108	NC_017530	GCCG	2	8	5645998	5646005	0 %	0 %	50 %	50 %	386014520
106109	NC_017530	GCG	2	6	5646011	5646016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014520
106110	NC_017530	CGC	2	6	5646032	5646037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014520
106111	NC_017530	GGC	2	6	5646085	5646090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014520
106112	NC_017530	GAT	2	6	5646106	5646111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014520
106113	NC_017530	TTG	2	6	5646122	5646127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014520
106114	NC_017530	TGA	2	6	5646165	5646170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014520
106115	NC_017530	TGG	2	6	5646201	5646206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014520
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106225	NC_017530	GTC	2	6	5651956	5651961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014525
106226	NC_017530	GTT	2	6	5651965	5651970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014525
106227	NC_017530	GC	4	8	5652048	5652055	0 %	0 %	50 %	50 %	386014525
106228	NC_017530	CTG	2	6	5652068	5652073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014525
106229	NC_017530	GCC	2	6	5652092	5652097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014525
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106234	NC_017530	TGG	2	6	5652225	5652230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014525
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106332	NC_017530	CTG	2	6	5656956	5656961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014528
106333	NC_017530	TTC	2	6	5656983	5656988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014528
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106337	NC_017530	GCT	2	6	5657066	5657071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014528
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