MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 107806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
104501	NC_017530	GCA	2	6	5558826	5558831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014446
104502	NC_017530	GCC	2	6	5559004	5559009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014446
104503	NC_017530	CTG	2	6	5559094	5559099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014446
104504	NC_017530	CACC	2	8	5559102	5559109	25 %	0 %	0 %	75 %	386014446
104505	NC_017530	ACA	2	6	5559159	5559164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014446
104506	NC_017530	GAC	2	6	5559175	5559180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014446
104507	NC_017530	ACC	2	6	5560659	5560664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014447
104508	NC_017530	CCA	2	6	5560700	5560705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014447
104509	NC_017530	TGG	2	6	5560714	5560719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014447
104510	NC_017530	AAG	2	6	5560813	5560818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014447
104511	NC_017530	GCG	2	6	5560931	5560936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014447
104512	NC_017530	GT	3	6	5560943	5560948	0 %	50 %	50 %	0 %	386014447
104513	NC_017530	TTG	2	6	5560969	5560974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014447
104514	NC_017530	GCA	2	6	5561339	5561344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014448
104515	NC_017530	CTG	2	6	5561359	5561364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014448
104516	NC_017530	CGA	2	6	5561375	5561380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014448
104517	NC_017530	GGC	2	6	5561394	5561399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014448
104518	NC_017530	GAA	2	6	5561413	5561418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014448
104519	NC_017530	CCG	2	6	5561490	5561495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014448
104520	NC_017530	GGT	2	6	5561515	5561520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014448
104521	NC_017530	GTC	2	6	5561557	5561562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014448
104522	NC_017530	CAT	2	6	5561581	5561586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014448
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104524	NC_017530	CGC	2	6	5561593	5561598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014448
104525	NC_017530	ATC	2	6	5561612	5561617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014448
104526	NC_017530	GAA	2	6	5561632	5561637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014448
104527	NC_017530	CGC	2	6	5561668	5561673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014448
104528	NC_017530	TCGA	2	8	5561678	5561685	25 %	25 %	25 %	25 %	386014448
104529	NC_017530	ACC	3	9	5561714	5561722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014448
104530	NC_017530	CGC	2	6	5561731	5561736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014448
104531	NC_017530	ATC	2	6	5561795	5561800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014448
104532	NC_017530	CAG	2	6	5561818	5561823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014448
104533	NC_017530	GCG	2	6	5561862	5561867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014448
104534	NC_017530	GCC	2	6	5561930	5561935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014448
104535	NC_017530	CCG	2	6	5561961	5561966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014448
104536	NC_017530	AGCG	2	8	5561984	5561991	25 %	0 %	50 %	25 %	386014448
104537	NC_017530	GCC	2	6	5562052	5562057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014448
104538	NC_017530	CAG	2	6	5562213	5562218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014449
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104542	NC_017530	ATC	2	6	5562316	5562321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014449
104543	NC_017530	GCC	2	6	5562333	5562338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014449
104544	NC_017530	CAC	2	6	5562366	5562371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014449
104545	NC_017530	GAT	2	6	5562399	5562404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014449
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104551	NC_017530	CAG	2	6	5562780	5562785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014449
104552	NC_017530	CAG	2	6	5562789	5562794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014449
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104582	NC_017530	GCC	2	6	5564063	5564068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014450
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104584	NC_017530	TCG	2	6	5564130	5564135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014450
104585	NC_017530	T	6	6	5564201	5564206	0 %	100 %	0 %	0 %	386014450
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104598	NC_017530	GCT	2	6	5565632	5565637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014452
104599	NC_017530	GCA	2	6	5565703	5565708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014452
104600	NC_017530	CCTT	2	8	5565850	5565857	0 %	50 %	0 %	50 %	386014452
104601	NC_017530	CGG	2	6	5566034	5566039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014452
104602	NC_017530	TCT	2	6	5566048	5566053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014452
104603	NC_017530	GTCG	2	8	5566065	5566072	0 %	25 %	50 %	25 %	386014452
104604	NC_017530	GCAGC	2	10	5566088	5566097	20 %	0 %	40 %	40 %	386014452
104605	NC_017530	TCGG	2	8	5566108	5566115	0 %	25 %	50 %	25 %	386014452
104606	NC_017530	CGC	2	6	5566133	5566138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014452
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104609	NC_017530	TTC	2	6	5566330	5566335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014452
104610	NC_017530	CTC	2	6	5566362	5566367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386014452
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104612	NC_017530	ACG	2	6	5566414	5566419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014452
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