MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 107806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
104001	NC_017530	CTTT	2	8	5532255	5532262	0 %	75 %	0 %	25 %	386014421
104002	NC_017530	GGCCAC	2	12	5532296	5532307	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386014421
104003	NC_017530	CCG	2	6	5532322	5532327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014421
104004	NC_017530	CCG	2	6	5532665	5532670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014422
104005	NC_017530	ATC	2	6	5532730	5532735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014422
104006	NC_017530	CAT	2	6	5532753	5532758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014422
104007	NC_017530	TGTC	2	8	5532812	5532819	0 %	50 %	25 %	25 %	386014422
104008	NC_017530	GGC	2	6	5532834	5532839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014422
104009	NC_017530	GCA	2	6	5532854	5532859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014422
104010	NC_017530	CTCG	2	8	5532987	5532994	0 %	25 %	25 %	50 %	386014422
104011	NC_017530	CAG	2	6	5533017	5533022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014422
104012	NC_017530	CGGC	2	8	5533085	5533092	0 %	0 %	50 %	50 %	386014422
104013	NC_017530	TGA	2	6	5533112	5533117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014422
104014	NC_017530	CAG	2	6	5533119	5533124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014422
104015	NC_017530	CAC	2	6	5533188	5533193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014422
104016	NC_017530	ATG	2	6	5533308	5533313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014423
104017	NC_017530	TTC	2	6	5533358	5533363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014423
104018	NC_017530	CGA	2	6	5533444	5533449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014423
104019	NC_017530	TTG	2	6	5533464	5533469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014423
104020	NC_017530	CGAAG	2	10	5533481	5533490	40 %	0 %	40 %	20 %	386014423
104021	NC_017530	GTC	2	6	5533493	5533498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014423
104022	NC_017530	ACCAC	2	10	5533561	5533570	40 %	0 %	0 %	60 %	386014423
104023	NC_017530	TCA	2	6	5533741	5533746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014423
104024	NC_017530	CAG	2	6	5533835	5533840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014423
104025	NC_017530	CGC	2	6	5533882	5533887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014423
104026	NC_017530	GAA	2	6	5533919	5533924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014423
104027	NC_017530	GCA	2	6	5533963	5533968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014423
104028	NC_017530	TGG	2	6	5534044	5534049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014423
104029	NC_017530	CCG	2	6	5534223	5534228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014423
104030	NC_017530	GCC	2	6	5534246	5534251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014423
104031	NC_017530	CTGG	2	8	5534255	5534262	0 %	25 %	50 %	25 %	386014423
104032	NC_017530	TAA	2	6	5534289	5534294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386014423
104033	NC_017530	GAC	2	6	5534333	5534338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014423
104034	NC_017530	CTGG	2	8	5534341	5534348	0 %	25 %	50 %	25 %	386014423
104035	NC_017530	CGA	2	6	5534407	5534412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014423
104036	NC_017530	GCC	2	6	5534427	5534432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014423
104037	NC_017530	GTCA	2	8	5534609	5534616	25 %	25 %	25 %	25 %	386014423
104038	NC_017530	TCA	2	6	5534641	5534646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014423
104039	NC_017530	TTC	2	6	5534648	5534653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014423
104040	NC_017530	TC	3	6	5534858	5534863	0 %	50 %	0 %	50 %	386014424
104041	NC_017530	CTT	3	9	5534885	5534893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014424
104042	NC_017530	GCC	2	6	5534930	5534935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014424
104043	NC_017530	GCT	2	6	5535084	5535089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014424
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104045	NC_017530	CTG	3	9	5535209	5535217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014424
104046	NC_017530	GAA	2	6	5535232	5535237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014424
104047	NC_017530	CCT	2	6	5535240	5535245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386014424
104048	NC_017530	GGC	2	6	5535254	5535259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014424
104049	NC_017530	TCG	2	6	5535312	5535317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014424
104050	NC_017530	CTT	2	6	5535379	5535384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014424
104051	NC_017530	GCT	2	6	5535442	5535447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014424
104052	NC_017530	GAT	2	6	5535502	5535507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014424
104053	NC_017530	GAA	2	6	5535532	5535537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014424
104054	NC_017530	CGC	2	6	5535556	5535561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014424
104055	NC_017530	ACC	2	6	5535585	5535590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014424
104056	NC_017530	GCC	2	6	5535626	5535631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014424
104057	NC_017530	ACG	2	6	5535663	5535668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014424
104058	NC_017530	CGC	2	6	5535714	5535719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014424
104059	NC_017530	TGG	2	6	5535724	5535729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014424
104060	NC_017530	CCG	2	6	5535735	5535740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014424
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104064	NC_017530	T	6	6	5536118	5536123	0 %	100 %	0 %	0 %	386014425
104065	NC_017530	TCT	2	6	5536142	5536147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014425
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104088	NC_017530	GCCC	2	8	5537730	5537737	0 %	0 %	25 %	75 %	386014427
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104103	NC_017530	GGCA	2	8	5538443	5538450	25 %	0 %	50 %	25 %	386014428
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104112	NC_017530	CCAGGC	2	12	5538864	5538875	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386014429
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104114	NC_017530	CTT	2	6	5538939	5538944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014429
104115	NC_017530	CGC	2	6	5538950	5538955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014429
104116	NC_017530	GTG	2	6	5538967	5538972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014429
104117	NC_017530	CGA	2	6	5539047	5539052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014429
104118	NC_017530	CTG	2	6	5539057	5539062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014429
104119	NC_017530	ATC	2	6	5539063	5539068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014429
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104121	NC_017530	GCC	2	6	5539138	5539143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014429
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104219	NC_017530	CTG	2	6	5544436	5544441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014435
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104222	NC_017530	ACG	2	6	5544560	5544565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014435
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104224	NC_017530	GCC	2	6	5544668	5544673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014435
104225	NC_017530	GCCA	2	8	5544847	5544854	25 %	0 %	25 %	50 %	386014435
104226	NC_017530	CCG	2	6	5544905	5544910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014435
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