MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 107806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
103001	NC_017530	GCC	2	6	5481061	5481066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014376
103002	NC_017530	GCG	2	6	5481209	5481214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014376
103003	NC_017530	GGC	2	6	5481250	5481255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014376
103004	NC_017530	CCG	2	6	5481361	5481366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014377
103005	NC_017530	GCA	2	6	5481399	5481404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014377
103006	NC_017530	GTGCTG	2	12	5481407	5481418	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386014377
103007	NC_017530	ACC	2	6	5481433	5481438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014377
103008	NC_017530	GGC	2	6	5481619	5481624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014377
103009	NC_017530	CAA	2	6	5481677	5481682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014377
103010	NC_017530	GCG	2	6	5481845	5481850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014377
103011	NC_017530	CAG	2	6	5481874	5481879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014377
103012	NC_017530	GCC	2	6	5481885	5481890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014377
103013	NC_017530	GGC	2	6	5481895	5481900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014377
103014	NC_017530	GCTG	2	8	5481904	5481911	0 %	25 %	50 %	25 %	386014377
103015	NC_017530	TGC	2	6	5481915	5481920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014377
103016	NC_017530	CCGA	2	8	5481946	5481953	25 %	0 %	25 %	50 %	386014377
103017	NC_017530	GCCGG	2	10	5481969	5481978	0 %	0 %	60 %	40 %	386014377
103018	NC_017530	TGGG	2	8	5482005	5482012	0 %	25 %	75 %	0 %	386014377
103019	NC_017530	CTC	2	6	5482036	5482041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386014377
103020	NC_017530	TTC	2	6	5482386	5482391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014378
103021	NC_017530	TCC	2	6	5482458	5482463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386014378
103022	NC_017530	GCCA	2	8	5482464	5482471	25 %	0 %	25 %	50 %	386014378
103023	NC_017530	TGG	2	6	5482534	5482539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014378
103024	NC_017530	TCC	2	6	5482560	5482565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386014378
103025	NC_017530	CCG	2	6	5482573	5482578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014378
103026	NC_017530	GGT	2	6	5482588	5482593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014378
103027	NC_017530	GTC	3	9	5482628	5482636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014378
103028	NC_017530	GGC	2	6	5482678	5482683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014378
103029	NC_017530	CG	3	6	5482702	5482707	0 %	0 %	50 %	50 %	386014378
103030	NC_017530	TCG	2	6	5482743	5482748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014378
103031	NC_017530	CTT	2	6	5482769	5482774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014378
103032	NC_017530	GAA	2	6	5482790	5482795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014378
103033	NC_017530	TGG	2	6	5482813	5482818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014378
103034	NC_017530	TCA	2	6	5482939	5482944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014378
103035	NC_017530	CTG	2	6	5483066	5483071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014378
103036	NC_017530	ATA	2	6	5483072	5483077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386014378
103037	NC_017530	CAG	2	6	5483114	5483119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014378
103038	NC_017530	GGCG	2	8	5483341	5483348	0 %	0 %	75 %	25 %	386014379
103039	NC_017530	CAA	2	6	5483375	5483380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014379
103040	NC_017530	CGC	2	6	5483422	5483427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014379
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103042	NC_017530	CAG	2	6	5483516	5483521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014379
103043	NC_017530	CGGC	2	8	5483561	5483568	0 %	0 %	50 %	50 %	386014379
103044	NC_017530	GCC	2	6	5483585	5483590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014379
103045	NC_017530	ACG	2	6	5483618	5483623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014379
103046	NC_017530	CAG	2	6	5483663	5483668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014379
103047	NC_017530	TCGG	2	8	5483829	5483836	0 %	25 %	50 %	25 %	386014379
103048	NC_017530	ACC	3	9	5483841	5483849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014379
103049	NC_017530	CTG	3	9	5483903	5483911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014379
103050	NC_017530	CTC	2	6	5483915	5483920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386014379
103051	NC_017530	CGCCA	2	10	5483954	5483963	20 %	0 %	20 %	60 %	386014379
103052	NC_017530	TCG	2	6	5483979	5483984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014379
103053	NC_017530	GC	3	6	5484045	5484050	0 %	0 %	50 %	50 %	386014379
103054	NC_017530	GCT	2	6	5484067	5484072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014379
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103058	NC_017530	GCT	2	6	5484157	5484162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014379
103059	NC_017530	GGC	2	6	5484169	5484174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014379
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103062	NC_017530	CAT	2	6	5484244	5484249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014379
103063	NC_017530	T	6	6	5484263	5484268	0 %	100 %	0 %	0 %	386014379
103064	NC_017530	GTGTT	2	10	5484328	5484337	0 %	60 %	40 %	0 %	386014379
103065	NC_017530	GC	3	6	5484403	5484408	0 %	0 %	50 %	50 %	386014380
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103070	NC_017530	GCT	3	9	5484576	5484584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014380
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103077	NC_017530	CGGCT	2	10	5485044	5485053	0 %	20 %	40 %	40 %	386014381
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103082	NC_017530	CGG	2	6	5485300	5485305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014381
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103099	NC_017530	GC	3	6	5485917	5485922	0 %	0 %	50 %	50 %	386014381
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103103	NC_017530	GCGG	2	8	5485999	5486006	0 %	0 %	75 %	25 %	386014381
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103114	NC_017530	GCCTGC	2	12	5487142	5487153	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386014382
103115	NC_017530	CGA	2	6	5487158	5487163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014382
103116	NC_017530	TCA	2	6	5487184	5487189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014382
103117	NC_017530	GAA	2	6	5487192	5487197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014382
103118	NC_017530	CGC	2	6	5487198	5487203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014382
103119	NC_017530	CGA	2	6	5487212	5487217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014382
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103220	NC_017530	CTG	2	6	5493437	5493442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014387
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103224	NC_017530	C	6	6	5493714	5493719	0 %	0 %	0 %	100 %	386014387
103225	NC_017530	ACT	2	6	5493744	5493749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014387
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103228	NC_017530	ATC	2	6	5493803	5493808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014387
103229	NC_017530	TTG	2	6	5494035	5494040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014388
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