MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 107806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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102502	NC_017530	CAG	2	6	5455321	5455326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014350
102503	NC_017530	T	6	6	5455333	5455338	0 %	100 %	0 %	0 %	386014350
102504	NC_017530	GCC	2	6	5455365	5455370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014350
102505	NC_017530	CGG	2	6	5455504	5455509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014350
102506	NC_017530	GTT	2	6	5455513	5455518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014350
102507	NC_017530	TTG	2	6	5455574	5455579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014350
102508	NC_017530	CAGCGA	2	12	5455606	5455617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014350
102509	NC_017530	ACC	2	6	5455718	5455723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014350
102510	NC_017530	T	6	6	5455755	5455760	0 %	100 %	0 %	0 %	386014350
102511	NC_017530	CAA	2	6	5455801	5455806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014350
102512	NC_017530	CTG	2	6	5455820	5455825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014350
102513	NC_017530	CGA	2	6	5455848	5455853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014350
102514	NC_017530	CGA	2	6	5455941	5455946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014350
102515	NC_017530	CCA	2	6	5455992	5455997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014350
102516	NC_017530	ACC	2	6	5456036	5456041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014350
102517	NC_017530	CAG	2	6	5456107	5456112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014350
102518	NC_017530	CGG	2	6	5456127	5456132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014350
102519	NC_017530	GTG	2	6	5456140	5456145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014350
102520	NC_017530	GCA	2	6	5456151	5456156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014350
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102523	NC_017530	TGC	2	6	5456286	5456291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014350
102524	NC_017530	GCA	2	6	5456292	5456297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014350
102525	NC_017530	CAGC	2	8	5456394	5456401	25 %	0 %	25 %	50 %	386014350
102526	NC_017530	GCA	2	6	5456406	5456411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014350
102527	NC_017530	CGCA	2	8	5456413	5456420	25 %	0 %	25 %	50 %	386014350
102528	NC_017530	CAG	2	6	5456491	5456496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014351
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102530	NC_017530	TGA	2	6	5456569	5456574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014351
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102532	NC_017530	CAG	2	6	5456717	5456722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014351
102533	NC_017530	GCC	2	6	5456733	5456738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014351
102534	NC_017530	CG	3	6	5456740	5456745	0 %	0 %	50 %	50 %	386014351
102535	NC_017530	GCTG	2	8	5456798	5456805	0 %	25 %	50 %	25 %	386014351
102536	NC_017530	CGC	2	6	5456810	5456815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014351
102537	NC_017530	GTC	2	6	5457014	5457019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014351
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102541	NC_017530	CAAG	2	8	5457124	5457131	50 %	0 %	25 %	25 %	386014351
102542	NC_017530	CGG	2	6	5457187	5457192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014351
102543	NC_017530	GCT	2	6	5457220	5457225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014351
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102547	NC_017530	CTG	2	6	5457329	5457334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014351
102548	NC_017530	GCAG	2	8	5457345	5457352	25 %	0 %	50 %	25 %	386014351
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102551	NC_017530	GCCA	2	8	5457438	5457445	25 %	0 %	25 %	50 %	386014351
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102553	NC_017530	CCA	2	6	5457591	5457596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014352
102554	NC_017530	GC	3	6	5457725	5457730	0 %	0 %	50 %	50 %	386014352
102555	NC_017530	GCAC	2	8	5457776	5457783	25 %	0 %	25 %	50 %	386014352
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102559	NC_017530	CAT	2	6	5457997	5458002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014352
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102562	NC_017530	AGCC	2	8	5458123	5458130	25 %	0 %	25 %	50 %	386014353
102563	NC_017530	GCT	2	6	5458146	5458151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014353
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102583	NC_017530	CAG	2	6	5459380	5459385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014354
102584	NC_017530	GC	3	6	5459392	5459397	0 %	0 %	50 %	50 %	386014354
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102598	NC_017530	ACC	2	6	5459951	5459956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014354
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102602	NC_017530	AGCC	2	8	5460120	5460127	25 %	0 %	25 %	50 %	386014354
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102604	NC_017530	GC	3	6	5460215	5460220	0 %	0 %	50 %	50 %	386014354
102605	NC_017530	TCA	2	6	5460225	5460230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014354
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102610	NC_017530	CGG	2	6	5460403	5460408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014354
102611	NC_017530	GAGCA	2	10	5460419	5460428	40 %	0 %	40 %	20 %	386014354
102612	NC_017530	GAA	2	6	5460586	5460591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014354
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102614	NC_017530	CAA	2	6	5460724	5460729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014354
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