MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 107806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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102002	NC_017530	CACG	2	8	5431171	5431178	25 %	0 %	25 %	50 %	386014335
102003	NC_017530	CAT	2	6	5431286	5431291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014335
102004	NC_017530	TCA	2	6	5431305	5431310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014335
102005	NC_017530	ATAC	2	8	5431366	5431373	50 %	25 %	0 %	25 %	386014335
102006	NC_017530	TCA	2	6	5431386	5431391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014335
102007	NC_017530	C	6	6	5431396	5431401	0 %	0 %	0 %	100 %	386014335
102008	NC_017530	GGT	2	6	5431478	5431483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014335
102009	NC_017530	GCC	2	6	5431554	5431559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014335
102010	NC_017530	GTT	2	6	5431673	5431678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014335
102011	NC_017530	GGCG	2	8	5431712	5431719	0 %	0 %	75 %	25 %	386014335
102012	NC_017530	GCC	2	6	5431881	5431886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014335
102013	NC_017530	GGC	2	6	5431916	5431921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014335
102014	NC_017530	CG	3	6	5431945	5431950	0 %	0 %	50 %	50 %	386014335
102015	NC_017530	G	6	6	5431950	5431955	0 %	0 %	100 %	0 %	386014335
102016	NC_017530	CAT	2	6	5431988	5431993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014335
102017	NC_017530	ACC	2	6	5432035	5432040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014335
102018	NC_017530	TGC	2	6	5432042	5432047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014335
102019	NC_017530	ATTG	2	8	5432069	5432076	25 %	50 %	25 %	0 %	386014335
102020	NC_017530	GCCA	2	8	5432137	5432144	25 %	0 %	25 %	50 %	386014335
102021	NC_017530	GCG	2	6	5432146	5432151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014335
102022	NC_017530	GCT	2	6	5432175	5432180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014335
102023	NC_017530	GCCA	2	8	5432190	5432197	25 %	0 %	25 %	50 %	386014335
102024	NC_017530	ATC	2	6	5432255	5432260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014335
102025	NC_017530	TGGC	2	8	5432302	5432309	0 %	25 %	50 %	25 %	386014335
102026	NC_017530	CGA	2	6	5432401	5432406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014335
102027	NC_017530	CGT	2	6	5432435	5432440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014335
102028	NC_017530	GGC	2	6	5432441	5432446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014335
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102032	NC_017530	CATTC	2	10	5432593	5432602	20 %	40 %	0 %	40 %	386014335
102033	NC_017530	GCCTG	2	10	5432620	5432629	0 %	20 %	40 %	40 %	386014335
102034	NC_017530	CAG	2	6	5432725	5432730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014335
102035	NC_017530	GCGGGC	2	12	5432738	5432749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014335
102036	NC_017530	AGT	2	6	5432758	5432763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014335
102037	NC_017530	TG	3	6	5432888	5432893	0 %	50 %	50 %	0 %	386014335
102038	NC_017530	CCA	2	6	5432916	5432921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014335
102039	NC_017530	CTG	3	9	5432948	5432956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014335
102040	NC_017530	CGT	2	6	5433000	5433005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014335
102041	NC_017530	CTG	2	6	5433045	5433050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014335
102042	NC_017530	CCG	2	6	5433052	5433057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014335
102043	NC_017530	GGC	2	6	5433109	5433114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014335
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102045	NC_017530	GC	3	6	5433137	5433142	0 %	0 %	50 %	50 %	386014335
102046	NC_017530	GA	3	6	5433194	5433199	50 %	0 %	50 %	0 %	386014335
102047	NC_017530	TGG	2	6	5433444	5433449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014336
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102050	NC_017530	CAT	2	6	5433550	5433555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014336
102051	NC_017530	CAA	2	6	5433559	5433564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014336
102052	NC_017530	TGG	2	6	5433582	5433587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014336
102053	NC_017530	TGA	2	6	5433693	5433698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014336
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102062	NC_017530	GCG	2	6	5433927	5433932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014336
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102065	NC_017530	GCT	2	6	5433991	5433996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014336
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102067	NC_017530	GCTG	2	8	5434011	5434018	0 %	25 %	50 %	25 %	386014336
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102109	NC_017530	GC	3	6	5435860	5435865	0 %	0 %	50 %	50 %	386014337
102110	NC_017530	CAG	2	6	5435941	5435946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014337
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102114	NC_017530	CTG	2	6	5435980	5435985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014337
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102228	NC_017530	TCG	2	6	5441106	5441111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014340
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102310	NC_017530	CGG	2	6	5445068	5445073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014344
102311	NC_017530	TGA	2	6	5445080	5445085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014344
102312	NC_017530	CTT	2	6	5445087	5445092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014344
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102314	NC_017530	CGGC	2	8	5445298	5445305	0 %	0 %	50 %	50 %	386014344
102315	NC_017530	CAT	2	6	5445312	5445317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014344
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102319	NC_017530	CTGGT	2	10	5445699	5445708	0 %	40 %	40 %	20 %	386014345
102320	NC_017530	GCG	2	6	5445869	5445874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014345
102321	NC_017530	CAATGG	2	12	5445943	5445954	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386014345
102322	NC_017530	TTC	2	6	5445996	5446001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014345
102323	NC_017530	ACG	2	6	5446037	5446042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014345
102324	NC_017530	CAC	2	6	5446108	5446113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014345
102325	NC_017530	CAC	3	9	5446121	5446129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014345
102326	NC_017530	CGA	2	6	5446147	5446152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014345
102327	NC_017530	GCC	2	6	5446250	5446255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014345
102328	NC_017530	TGTAGG	2	12	5446261	5446272	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386014345
102329	NC_017530	CCCATG	2	12	5446275	5446286	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386014345
102330	NC_017530	CGT	2	6	5446294	5446299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014345
102331	NC_017530	AGC	2	6	5446308	5446313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014345
102332	NC_017530	CGG	2	6	5446386	5446391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014345
102333	NC_017530	CAG	2	6	5446439	5446444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014345
102334	NC_017530	ACC	2	6	5446473	5446478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014345
102335	NC_017530	GC	3	6	5446491	5446496	0 %	0 %	50 %	50 %	386014345
102336	NC_017530	GCCGG	2	10	5446524	5446533	0 %	0 %	60 %	40 %	386014345
102337	NC_017530	GAT	2	6	5446538	5446543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014345
102338	NC_017530	CGT	2	6	5446657	5446662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014345
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102340	NC_017530	CTG	2	6	5446877	5446882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014345
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