MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 107806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
101501	NC_017530	CTG	2	6	5405480	5405485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014319
101502	NC_017530	AGC	2	6	5405499	5405504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014319
101503	NC_017530	TCA	3	9	5405520	5405528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014319
101504	NC_017530	TCGACG	2	12	5405604	5405615	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386014319
101505	NC_017530	GC	3	6	5405635	5405640	0 %	0 %	50 %	50 %	386014319
101506	NC_017530	AGC	2	6	5405658	5405663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014319
101507	NC_017530	GC	3	6	5405690	5405695	0 %	0 %	50 %	50 %	386014319
101508	NC_017530	AGG	2	6	5405730	5405735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386014319
101509	NC_017530	GCC	2	6	5405751	5405756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014319
101510	NC_017530	CCGGCA	2	12	5405796	5405807	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386014319
101511	NC_017530	TGG	2	6	5405814	5405819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014319
101512	NC_017530	AGC	2	6	5405848	5405853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014319
101513	NC_017530	GCC	2	6	5405879	5405884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014319
101514	NC_017530	TGC	2	6	5405944	5405949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014319
101515	NC_017530	TGG	2	6	5405983	5405988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014319
101516	NC_017530	CGA	2	6	5406001	5406006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014319
101517	NC_017530	TGCC	2	8	5406018	5406025	0 %	25 %	25 %	50 %	386014319
101518	NC_017530	GGC	2	6	5406080	5406085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014319
101519	NC_017530	CAT	2	6	5406112	5406117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014319
101520	NC_017530	CGC	2	6	5406118	5406123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014319
101521	NC_017530	CACC	2	8	5406124	5406131	25 %	0 %	0 %	75 %	386014319
101522	NC_017530	CCG	2	6	5406226	5406231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014319
101523	NC_017530	CGCC	2	8	5406250	5406257	0 %	0 %	25 %	75 %	386014319
101524	NC_017530	GGC	2	6	5406271	5406276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014319
101525	NC_017530	CCA	2	6	5406431	5406436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014319
101526	NC_017530	CTG	2	6	5406440	5406445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014319
101527	NC_017530	GC	3	6	5406518	5406523	0 %	0 %	50 %	50 %	386014319
101528	NC_017530	CTG	2	6	5406536	5406541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014319
101529	NC_017530	CCG	2	6	5406597	5406602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014319
101530	NC_017530	GCC	2	6	5406603	5406608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014319
101531	NC_017530	GCG	2	6	5406617	5406622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014319
101532	NC_017530	G	7	7	5406689	5406695	0 %	0 %	100 %	0 %	386014319
101533	NC_017530	ATG	2	6	5406696	5406701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014319
101534	NC_017530	TGA	2	6	5406709	5406714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014319
101535	NC_017530	GC	3	6	5407252	5407257	0 %	0 %	50 %	50 %	386014320
101536	NC_017530	CCA	2	6	5407260	5407265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014320
101537	NC_017530	CAA	2	6	5407273	5407278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014320
101538	NC_017530	CCTT	2	8	5407280	5407287	0 %	50 %	0 %	50 %	386014320
101539	NC_017530	GCTGT	2	10	5407288	5407297	0 %	40 %	40 %	20 %	386014320
101540	NC_017530	CTG	2	6	5407456	5407461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014320
101541	NC_017530	ATC	2	6	5407496	5407501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014320
101542	NC_017530	CCG	2	6	5407649	5407654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014321
101543	NC_017530	CAT	2	6	5407666	5407671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014321
101544	NC_017530	GTT	2	6	5407837	5407842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014321
101545	NC_017530	ACC	2	6	5407850	5407855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014321
101546	NC_017530	CCAG	2	8	5407888	5407895	25 %	0 %	25 %	50 %	386014321
101547	NC_017530	AG	3	6	5407918	5407923	50 %	0 %	50 %	0 %	386014321
101548	NC_017530	GCCG	2	8	5407933	5407940	0 %	0 %	50 %	50 %	386014321
101549	NC_017530	GCCG	2	8	5407957	5407964	0 %	0 %	50 %	50 %	386014321
101550	NC_017530	GGC	2	6	5408049	5408054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014321
101551	NC_017530	TTA	2	6	5408229	5408234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386014322
101552	NC_017530	GAAC	2	8	5408328	5408335	50 %	0 %	25 %	25 %	386014322
101553	NC_017530	CTG	2	6	5408457	5408462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014322
101554	NC_017530	TGT	2	6	5408675	5408680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014322
101555	NC_017530	GCA	2	6	5408686	5408691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014322
101556	NC_017530	GTCA	2	8	5408709	5408716	25 %	25 %	25 %	25 %	386014322
101557	NC_017530	GCC	2	6	5408761	5408766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014323
101558	NC_017530	CG	3	6	5408787	5408792	0 %	0 %	50 %	50 %	386014323
101559	NC_017530	TGC	2	6	5408831	5408836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014323
101560	NC_017530	CGGC	2	8	5408863	5408870	0 %	0 %	50 %	50 %	386014323
101561	NC_017530	GC	3	6	5408959	5408964	0 %	0 %	50 %	50 %	386014323
101562	NC_017530	AGT	2	6	5408978	5408983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014323
101563	NC_017530	GGC	2	6	5409070	5409075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014324
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101565	NC_017530	CTG	2	6	5409118	5409123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014324
101566	NC_017530	CGA	3	9	5409135	5409143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014324
101567	NC_017530	TCTTT	2	10	5409150	5409159	0 %	80 %	0 %	20 %	386014324
101568	NC_017530	CGA	2	6	5409219	5409224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014324
101569	NC_017530	CGG	2	6	5409231	5409236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014324
101570	NC_017530	CCA	2	6	5409323	5409328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014324
101571	NC_017530	TGA	2	6	5409342	5409347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014324
101572	NC_017530	GCA	2	6	5409348	5409353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014324
101573	NC_017530	CAG	2	6	5409358	5409363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014324
101574	NC_017530	TGAT	2	8	5409628	5409635	25 %	50 %	25 %	0 %	386014325
101575	NC_017530	GCC	2	6	5409718	5409723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014325
101576	NC_017530	CGT	2	6	5409858	5409863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014325
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101578	NC_017530	CTG	2	6	5409985	5409990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014325
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101581	NC_017530	TGG	2	6	5410025	5410030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014325
101582	NC_017530	GCC	2	6	5410045	5410050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014325
101583	NC_017530	GC	3	6	5410115	5410120	0 %	0 %	50 %	50 %	386014325
101584	NC_017530	GTC	2	6	5410122	5410127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014325
101585	NC_017530	CTA	2	6	5410194	5410199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014325
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101587	NC_017530	TCG	2	6	5410253	5410258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014325
101588	NC_017530	CTGG	2	8	5410291	5410298	0 %	25 %	50 %	25 %	386014325
101589	NC_017530	CGA	2	6	5410320	5410325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014325
101590	NC_017530	CGA	2	6	5410329	5410334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014325
101591	NC_017530	GC	3	6	5410474	5410479	0 %	0 %	50 %	50 %	386014325
101592	NC_017530	GGC	2	6	5410491	5410496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014325
101593	NC_017530	CAG	2	6	5410538	5410543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014325
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101598	NC_017530	TCG	2	6	5410772	5410777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014325
101599	NC_017530	CAG	2	6	5410789	5410794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014325
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101601	NC_017530	CA	3	6	5411009	5411014	50 %	0 %	0 %	50 %	386014325
101602	NC_017530	GCG	2	6	5411072	5411077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014325
101603	NC_017530	GCT	2	6	5411109	5411114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014325
101604	NC_017530	TCC	2	6	5411326	5411331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386014326
101605	NC_017530	CAG	2	6	5411385	5411390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014326
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101609	NC_017530	A	9	9	5411583	5411591	100 %	0 %	0 %	0 %	386014326
101610	NC_017530	AAC	3	9	5411611	5411619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014326
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101842	NC_017530	CCA	2	6	5422611	5422616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014330
101843	NC_017530	AGC	2	6	5422653	5422658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014330
101844	NC_017530	GCT	2	6	5422682	5422687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014330
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101933	NC_017530	ATC	2	6	5427354	5427359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014332
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101941	NC_017530	GC	3	6	5427705	5427710	0 %	0 %	50 %	50 %	386014332
101942	NC_017530	GCGCC	2	10	5427995	5428004	0 %	0 %	40 %	60 %	386014333
101943	NC_017530	ACG	2	6	5428027	5428032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014333
101944	NC_017530	CGC	2	6	5428194	5428199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014333
101945	NC_017530	GAT	2	6	5428295	5428300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014333
101946	NC_017530	ACC	2	6	5428329	5428334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014333
101947	NC_017530	CGG	2	6	5428463	5428468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014333
101948	NC_017530	CAC	3	9	5428469	5428477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014333
101949	NC_017530	GAAG	2	8	5428517	5428524	50 %	0 %	50 %	0 %	386014333
101950	NC_017530	GGC	2	6	5428539	5428544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014333
101951	NC_017530	ATC	2	6	5428557	5428562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014333
101952	NC_017530	GCCGAC	2	12	5428566	5428577	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386014333
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