MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 107806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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100002	NC_017530	CAC	2	6	5332772	5332777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014258
100003	NC_017530	CCT	2	6	5332834	5332839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386014258
100004	NC_017530	CTG	2	6	5332862	5332867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014258
100005	NC_017530	GCA	2	6	5332870	5332875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014258
100006	NC_017530	CCT	2	6	5332885	5332890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386014258
100007	NC_017530	GC	3	6	5332893	5332898	0 %	0 %	50 %	50 %	386014258
100008	NC_017530	TGC	2	6	5332962	5332967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014258
100009	NC_017530	GTC	2	6	5333003	5333008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014258
100010	NC_017530	CTG	2	6	5333027	5333032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014258
100011	NC_017530	GCA	2	6	5333071	5333076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014258
100012	NC_017530	CGT	2	6	5333131	5333136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014258
100013	NC_017530	CTG	2	6	5333141	5333146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014258
100014	NC_017530	GAT	2	6	5333162	5333167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014258
100015	NC_017530	GTC	2	6	5333195	5333200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014258
100016	NC_017530	AGC	2	6	5333202	5333207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014258
100017	NC_017530	AGC	2	6	5333273	5333278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014258
100018	NC_017530	GGC	2	6	5333283	5333288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014258
100019	NC_017530	CTGT	2	8	5333304	5333311	0 %	50 %	25 %	25 %	386014258
100020	NC_017530	GCG	2	6	5333316	5333321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014258
100021	NC_017530	CTG	2	6	5333322	5333327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014258
100022	NC_017530	GCA	2	6	5333425	5333430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014258
100023	NC_017530	GCG	2	6	5333440	5333445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014258
100024	NC_017530	GGC	2	6	5333451	5333456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014258
100025	NC_017530	GC	3	6	5333534	5333539	0 %	0 %	50 %	50 %	386014258
100026	NC_017530	GCT	2	6	5333588	5333593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014258
100027	NC_017530	GC	3	6	5333612	5333617	0 %	0 %	50 %	50 %	386014258
100028	NC_017530	GCC	2	6	5333622	5333627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014258
100029	NC_017530	GCG	2	6	5333628	5333633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014258
100030	NC_017530	CGA	2	6	5333638	5333643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014258
100031	NC_017530	TTC	2	6	5333654	5333659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014258
100032	NC_017530	CAG	2	6	5333672	5333677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014258
100033	NC_017530	CCT	2	6	5333698	5333703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386014258
100034	NC_017530	GGTG	2	8	5333736	5333743	0 %	25 %	75 %	0 %	386014258
100035	NC_017530	CCA	2	6	5333806	5333811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014258
100036	NC_017530	CAG	2	6	5333843	5333848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014258
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100041	NC_017530	CATC	2	8	5334028	5334035	25 %	25 %	0 %	50 %	386014258
100042	NC_017530	GCG	2	6	5334057	5334062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014258
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100044	NC_017530	TGC	2	6	5334123	5334128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014258
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100050	NC_017530	AAC	2	6	5334351	5334356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014258
100051	NC_017530	GC	3	6	5334359	5334364	0 %	0 %	50 %	50 %	386014258
100052	NC_017530	GGC	2	6	5334479	5334484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014258
100053	NC_017530	GT	3	6	5334496	5334501	0 %	50 %	50 %	0 %	386014258
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100081	NC_017530	CCGC	2	8	5335582	5335589	0 %	0 %	25 %	75 %	386014258
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100085	NC_017530	GCT	2	6	5335711	5335716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014258
100086	NC_017530	CGC	2	6	5335732	5335737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014258
100087	NC_017530	GTC	2	6	5335775	5335780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014258
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100093	NC_017530	GC	3	6	5335953	5335958	0 %	0 %	50 %	50 %	386014258
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100113	NC_017530	TCGA	2	8	5337066	5337073	25 %	25 %	25 %	25 %	386014259
100114	NC_017530	CGG	2	6	5337175	5337180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014259
100115	NC_017530	CTGCA	2	10	5337188	5337197	20 %	20 %	20 %	40 %	386014259
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100217	NC_017530	ACCTGC	2	12	5342687	5342698	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386014265
100218	NC_017530	CCAG	2	8	5342702	5342709	25 %	0 %	25 %	50 %	386014265
100219	NC_017530	CTG	3	9	5342739	5342747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014266
100220	NC_017530	GCA	2	6	5342761	5342766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014266
100221	NC_017530	GTC	2	6	5342901	5342906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014266
100222	NC_017530	CGCC	2	8	5342966	5342973	0 %	0 %	25 %	75 %	386014266
100223	NC_017530	CACG	2	8	5343005	5343012	25 %	0 %	25 %	50 %	386014266
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