MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 107806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017530	CCA	2	6	26892	26897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009663
502	NC_017530	CAG	2	6	26909	26914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009663
503	NC_017530	GAA	2	6	26916	26921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386009663
504	NC_017530	CAG	2	6	26943	26948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009663
505	NC_017530	CAG	2	6	27110	27115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009664
506	NC_017530	AGC	2	6	27171	27176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009664
507	NC_017530	AGGTC	2	10	27199	27208	20 %	20 %	40 %	20 %	386009664
508	NC_017530	ACCC	2	8	27209	27216	25 %	0 %	0 %	75 %	386009664
509	NC_017530	GCG	2	6	27248	27253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009664
510	NC_017530	CGG	2	6	27271	27276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009664
511	NC_017530	TTC	2	6	27299	27304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009664
512	NC_017530	GCCC	2	8	27306	27313	0 %	0 %	25 %	75 %	386009664
513	NC_017530	CAG	2	6	27359	27364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009664
514	NC_017530	GC	3	6	27368	27373	0 %	0 %	50 %	50 %	386009664
515	NC_017530	TCC	2	6	27387	27392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386009664
516	NC_017530	GC	3	6	27402	27407	0 %	0 %	50 %	50 %	386009664
517	NC_017530	GGC	2	6	27498	27503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009664
518	NC_017530	TCGC	2	8	27598	27605	0 %	25 %	25 %	50 %	386009664
519	NC_017530	CCA	2	6	27682	27687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009664
520	NC_017530	TG	4	8	27738	27745	0 %	50 %	50 %	0 %	386009664
521	NC_017530	CG	3	6	28329	28334	0 %	0 %	50 %	50 %	386009665
522	NC_017530	GCA	2	6	28354	28359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009665
523	NC_017530	GTTGCG	2	12	28435	28446	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386009666
524	NC_017530	ACC	2	6	28534	28539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009666
525	NC_017530	GCCA	2	8	28642	28649	25 %	0 %	25 %	50 %	386009666
526	NC_017530	CTG	2	6	28670	28675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009666
527	NC_017530	TGC	2	6	28712	28717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009666
528	NC_017530	CAA	2	6	28768	28773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009666
529	NC_017530	TCTTT	2	10	28837	28846	0 %	80 %	0 %	20 %	386009666
530	NC_017530	CAA	2	6	28862	28867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009666
531	NC_017530	CTG	2	6	28931	28936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009666
532	NC_017530	TTG	2	6	29030	29035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386009666
533	NC_017530	CAG	2	6	29045	29050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009666
534	NC_017530	GCA	2	6	29153	29158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009666
535	NC_017530	GCC	2	6	29165	29170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009666
536	NC_017530	TGGG	2	8	29343	29350	0 %	25 %	75 %	0 %	386009666
537	NC_017530	GCCA	2	8	29410	29417	25 %	0 %	25 %	50 %	386009667
538	NC_017530	AGC	2	6	29428	29433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009667
539	NC_017530	CTG	2	6	29442	29447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009667
540	NC_017530	TG	3	6	29565	29570	0 %	50 %	50 %	0 %	386009667
541	NC_017530	CAC	2	6	29576	29581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009667
542	NC_017530	GGT	2	6	29628	29633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009667
543	NC_017530	CGT	2	6	29713	29718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009667
544	NC_017530	GCC	2	6	29740	29745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009667
545	NC_017530	AACG	2	8	29766	29773	50 %	0 %	25 %	25 %	386009667
546	NC_017530	CCG	2	6	29792	29797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009667
547	NC_017530	GCA	2	6	29804	29809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009667
548	NC_017530	TCC	2	6	29902	29907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386009667
549	NC_017530	GCC	3	9	29924	29932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009667
550	NC_017530	GCA	2	6	29957	29962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009667
551	NC_017530	TGC	2	6	30032	30037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009667
552	NC_017530	GCAT	2	8	30122	30129	25 %	25 %	25 %	25 %	386009668
553	NC_017530	GGC	2	6	30187	30192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009668
554	NC_017530	CCA	2	6	30278	30283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009668
555	NC_017530	GCCA	2	8	30287	30294	25 %	0 %	25 %	50 %	386009668
556	NC_017530	CAT	2	6	30305	30310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009668
557	NC_017530	GCC	2	6	30311	30316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009668
558	NC_017530	GCA	2	6	30379	30384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009668
559	NC_017530	CAGC	2	8	30518	30525	25 %	0 %	25 %	50 %	386009668
560	NC_017530	GGC	2	6	30536	30541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009668
561	NC_017530	TTC	2	6	30653	30658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009668
562	NC_017530	CAG	3	9	30692	30700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009668
563	NC_017530	TCT	2	6	30753	30758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009668
564	NC_017530	CAC	2	6	30772	30777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009668
565	NC_017530	CTG	2	6	30793	30798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009668
566	NC_017530	AATA	2	8	30948	30955	75 %	25 %	0 %	0 %	386009668
567	NC_017530	CCT	2	6	30988	30993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386009668
568	NC_017530	GCA	2	6	31016	31021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009668
569	NC_017530	GCA	2	6	31159	31164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009668
570	NC_017530	AGC	2	6	31173	31178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009668
571	NC_017530	TGCC	2	8	31391	31398	0 %	25 %	25 %	50 %	386009669
572	NC_017530	ACT	2	6	31484	31489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009669
573	NC_017530	GCA	2	6	31508	31513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009669
574	NC_017530	CAG	2	6	31539	31544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009669
575	NC_017530	CCG	2	6	31545	31550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009669
576	NC_017530	T	8	8	31590	31597	0 %	100 %	0 %	0 %	386009669
577	NC_017530	TGGG	2	8	31624	31631	0 %	25 %	75 %	0 %	386009669
578	NC_017530	GCC	2	6	31637	31642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009669
579	NC_017530	ACC	2	6	31654	31659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009669
580	NC_017530	GCCT	2	8	31803	31810	0 %	25 %	25 %	50 %	386009670
581	NC_017530	AAATG	2	10	31869	31878	60 %	20 %	20 %	0 %	386009670
582	NC_017530	GCT	2	6	31932	31937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009670
583	NC_017530	TGC	2	6	32059	32064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009671
584	NC_017530	TGC	3	9	32067	32075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009671
585	NC_017530	GTG	2	6	32109	32114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009671
586	NC_017530	CGGT	2	8	32199	32206	0 %	25 %	50 %	25 %	386009671
587	NC_017530	TCT	2	6	32209	32214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009671
588	NC_017530	CAT	2	6	32336	32341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009671
589	NC_017530	GC	3	6	32343	32348	0 %	0 %	50 %	50 %	386009671
590	NC_017530	GGC	2	6	32355	32360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009671
591	NC_017530	TTC	2	6	32364	32369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009671
592	NC_017530	TGG	2	6	32428	32433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009671
593	NC_017530	GCA	2	6	32455	32460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009671
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595	NC_017530	CTT	2	6	32680	32685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009672
596	NC_017530	CTG	2	6	32711	32716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009672
597	NC_017530	CGC	2	6	32725	32730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009672
598	NC_017530	TGGCCA	2	12	32895	32906	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386009672
599	NC_017530	GGC	2	6	32916	32921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009672
600	NC_017530	GAA	2	6	32930	32935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386009672
601	NC_017530	CCGC	2	8	32943	32950	0 %	0 %	25 %	75 %	386009672
602	NC_017530	GC	3	6	32974	32979	0 %	0 %	50 %	50 %	386009672
603	NC_017530	CATGC	2	10	32998	33007	20 %	20 %	20 %	40 %	386009672
604	NC_017530	CTG	2	6	33029	33034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009672
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607	NC_017530	GAC	2	6	33122	33127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009672
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609	NC_017530	GCA	2	6	33145	33150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009672
610	NC_017530	GCC	2	6	33167	33172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009672
611	NC_017530	TGC	2	6	33243	33248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009672
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613	NC_017530	TGG	3	9	33339	33347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009672
614	NC_017530	CGG	2	6	33367	33372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009672
615	NC_017530	CGA	2	6	33385	33390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009672
616	NC_017530	GCCT	2	8	33461	33468	0 %	25 %	25 %	50 %	386009672
617	NC_017530	CCG	2	6	33515	33520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009672
618	NC_017530	TTC	2	6	33611	33616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009672
619	NC_017530	ATTC	2	8	33626	33633	25 %	50 %	0 %	25 %	386009672
620	NC_017530	CGC	2	6	33691	33696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009672
621	NC_017530	TAC	2	6	33711	33716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009672
622	NC_017530	GAG	2	6	33717	33722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386009672
623	NC_017530	ACC	2	6	33756	33761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009672
624	NC_017530	CGC	2	6	33772	33777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009672
625	NC_017530	GC	3	6	33805	33810	0 %	0 %	50 %	50 %	386009672
626	NC_017530	GGT	2	6	33856	33861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009672
627	NC_017530	TGG	2	6	33864	33869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009672
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