MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 107806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9002	NC_017530	GCT	2	6	485910	485915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010040
9003	NC_017530	CGC	2	6	485945	485950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010040
9004	NC_017530	AGT	2	6	485951	485956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010040
9005	NC_017530	CAG	2	6	486120	486125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010040
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9007	NC_017530	TGT	2	6	486266	486271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010040
9008	NC_017530	CAT	2	6	486281	486286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010040
9009	NC_017530	CGC	2	6	486287	486292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010040
9010	NC_017530	CCA	2	6	486341	486346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010040
9011	NC_017530	CGG	2	6	486368	486373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010040
9012	NC_017530	TGT	2	6	486407	486412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010040
9013	NC_017530	CGC	2	6	486452	486457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010040
9014	NC_017530	TGG	2	6	486478	486483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010040
9015	NC_017530	AGC	2	6	486484	486489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010040
9016	NC_017530	CCGGG	2	10	486610	486619	0 %	0 %	60 %	40 %	386010041
9017	NC_017530	GGGT	2	8	486627	486634	0 %	25 %	75 %	0 %	386010041
9018	NC_017530	CCA	2	6	486639	486644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010041
9019	NC_017530	CGT	2	6	486721	486726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010041
9020	NC_017530	GCT	2	6	486748	486753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010041
9021	NC_017530	CCG	2	6	486754	486759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010041
9022	NC_017530	CTG	2	6	486767	486772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010041
9023	NC_017530	GC	3	6	486820	486825	0 %	0 %	50 %	50 %	386010041
9024	NC_017530	GAT	2	6	486884	486889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010041
9025	NC_017530	TCT	2	6	486919	486924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010041
9026	NC_017530	GCA	2	6	486970	486975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010041
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9028	NC_017530	CAG	2	6	487088	487093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010041
9029	NC_017530	GTCCTT	2	12	487112	487123	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386010041
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9033	NC_017530	CGG	2	6	487324	487329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010041
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9035	NC_017530	CGC	2	6	487363	487368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010041
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9044	NC_017530	CTG	2	6	487715	487720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010041
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9049	NC_017530	ACC	2	6	488031	488036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010041
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9052	NC_017530	CCAG	2	8	488158	488165	25 %	0 %	25 %	50 %	386010041
9053	NC_017530	TCG	2	6	488166	488171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010041
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9057	NC_017530	TGC	2	6	488614	488619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010042
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9062	NC_017530	GCT	2	6	488752	488757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010042
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9355	NC_017530	TGCA	2	8	504129	504136	25 %	25 %	25 %	25 %	386010055
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9479	NC_017530	CAG	2	6	510570	510575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010061
9480	NC_017530	GAT	2	6	510618	510623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010061
9481	NC_017530	CGT	2	6	510629	510634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010061
9482	NC_017530	GC	3	6	510660	510665	0 %	0 %	50 %	50 %	386010061
9483	NC_017530	GAT	2	6	510803	510808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010062
9484	NC_017530	CGGC	2	8	510937	510944	0 %	0 %	50 %	50 %	386010062
9485	NC_017530	GAT	2	6	510998	511003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010062
9486	NC_017530	TTC	2	6	511010	511015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010062
9487	NC_017530	GCC	2	6	511028	511033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010062
9488	NC_017530	CAT	2	6	511220	511225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010062
9489	NC_017530	ATC	2	6	511326	511331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010062
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9491	NC_017530	ACC	2	6	511422	511427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010062
9492	NC_017530	GCC	2	6	511431	511436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010062
9493	NC_017530	GCA	2	6	511507	511512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010062
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9497	NC_017530	GGC	2	6	511678	511683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010063
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9499	NC_017530	TCG	2	6	511757	511762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010063
9500	NC_017530	CTG	2	6	511792	511797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010063

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