MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 107806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017530	GCG	2	6	328778	328783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009913
6002	NC_017530	CAC	2	6	328837	328842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009913
6003	NC_017530	CAC	2	6	328846	328851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009913
6004	NC_017530	GTG	2	6	328881	328886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009913
6005	NC_017530	CGAC	2	8	328899	328906	25 %	0 %	25 %	50 %	386009913
6006	NC_017530	ACC	2	6	328913	328918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009913
6007	NC_017530	GC	3	6	328930	328935	0 %	0 %	50 %	50 %	386009913
6008	NC_017530	CAC	2	6	328951	328956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009913
6009	NC_017530	GCC	2	6	329018	329023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009913
6010	NC_017530	TGC	2	6	329026	329031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009913
6011	NC_017530	CCCA	2	8	329066	329073	25 %	0 %	0 %	75 %	386009913
6012	NC_017530	GCC	2	6	329078	329083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009913
6013	NC_017530	GGT	2	6	329096	329101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009913
6014	NC_017530	GCC	2	6	329102	329107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009913
6015	NC_017530	CGC	2	6	329119	329124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009913
6016	NC_017530	ACA	3	9	329140	329148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009913
6017	NC_017530	GAG	2	6	329154	329159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386009913
6018	NC_017530	CTT	2	6	329162	329167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009913
6019	NC_017530	CTCG	2	8	329385	329392	0 %	25 %	25 %	50 %	386009914
6020	NC_017530	CGC	3	9	329490	329498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009914
6021	NC_017530	CAG	2	6	329523	329528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009914
6022	NC_017530	C	6	6	329561	329566	0 %	0 %	0 %	100 %	386009914
6023	NC_017530	GAT	2	6	329613	329618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009914
6024	NC_017530	GTC	2	6	329673	329678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009914
6025	NC_017530	GTG	2	6	329692	329697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009914
6026	NC_017530	AGC	2	6	329773	329778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009914
6027	NC_017530	GCA	2	6	329786	329791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009914
6028	NC_017530	CCA	2	6	329951	329956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009914
6029	NC_017530	GCCAGT	2	12	329957	329968	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386009914
6030	NC_017530	TTGC	2	8	329976	329983	0 %	50 %	25 %	25 %	386009914
6031	NC_017530	GGC	3	9	329991	329999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009914
6032	NC_017530	CTGC	2	8	330101	330108	0 %	25 %	25 %	50 %	386009914
6033	NC_017530	GCC	2	6	330282	330287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009914
6034	NC_017530	CAG	2	6	330399	330404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009914
6035	NC_017530	GGCG	2	8	330412	330419	0 %	0 %	75 %	25 %	386009914
6036	NC_017530	GCA	2	6	330509	330514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009914
6037	NC_017530	GC	3	6	330615	330620	0 %	0 %	50 %	50 %	386009914
6038	NC_017530	GGCGT	2	10	330676	330685	0 %	20 %	60 %	20 %	386009914
6039	NC_017530	CCA	2	6	330686	330691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009914
6040	NC_017530	GCCATG	2	12	330711	330722	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386009914
6041	NC_017530	GCA	2	6	330812	330817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009914
6042	NC_017530	GAA	2	6	330846	330851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386009914
6043	NC_017530	CAC	2	6	330951	330956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009914
6044	NC_017530	GTC	2	6	331059	331064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009914
6045	NC_017530	GTT	2	6	331152	331157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386009914
6046	NC_017530	GC	3	6	331168	331173	0 %	0 %	50 %	50 %	386009914
6047	NC_017530	CGC	2	6	331194	331199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009914
6048	NC_017530	GGC	2	6	331284	331289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009914
6049	NC_017530	CGT	2	6	331325	331330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009914
6050	NC_017530	TCGGT	2	10	331337	331346	0 %	40 %	40 %	20 %	386009914
6051	NC_017530	CCAG	2	8	331364	331371	25 %	0 %	25 %	50 %	386009914
6052	NC_017530	TGC	2	6	331381	331386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009914
6053	NC_017530	AGC	2	6	331387	331392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009914
6054	NC_017530	GAA	2	6	331413	331418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386009914
6055	NC_017530	GCA	2	6	331420	331425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009914
6056	NC_017530	TGG	2	6	331439	331444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009914
6057	NC_017530	C	6	6	331508	331513	0 %	0 %	0 %	100 %	386009914
6058	NC_017530	CCG	2	6	331537	331542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009914
6059	NC_017530	TGGT	2	8	331546	331553	0 %	50 %	50 %	0 %	386009914
6060	NC_017530	TTC	2	6	331573	331578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009914
6061	NC_017530	CCG	2	6	331726	331731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009915
6062	NC_017530	AGGTTG	2	12	331776	331787	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386009915
6063	NC_017530	GC	3	6	331793	331798	0 %	0 %	50 %	50 %	386009915
6064	NC_017530	GGCCA	2	10	331904	331913	20 %	0 %	40 %	40 %	386009915
6065	NC_017530	GCA	2	6	331936	331941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009915
6066	NC_017530	GCCG	2	8	331972	331979	0 %	0 %	50 %	50 %	386009915
6067	NC_017530	AGC	2	6	331995	332000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009915
6068	NC_017530	TGC	2	6	332027	332032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009915
6069	NC_017530	CA	3	6	332173	332178	50 %	0 %	0 %	50 %	386009915
6070	NC_017530	GGC	2	6	332206	332211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009915
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6073	NC_017530	CTG	2	6	332772	332777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009916
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6080	NC_017530	TGC	2	6	333145	333150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009916
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6088	NC_017530	CCAG	2	8	333845	333852	25 %	0 %	25 %	50 %	386009917
6089	NC_017530	CCAT	2	8	333886	333893	25 %	25 %	0 %	50 %	386009917
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6098	NC_017530	CTGTCG	2	12	334339	334350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009918
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6101	NC_017530	CGA	2	6	334419	334424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009918
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6104	NC_017530	AGGCG	2	10	334616	334625	20 %	0 %	60 %	20 %	386009919
6105	NC_017530	GC	3	6	334640	334645	0 %	0 %	50 %	50 %	386009919
6106	NC_017530	CAA	2	6	334661	334666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009919
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6118	NC_017530	GGTG	2	8	335114	335121	0 %	25 %	75 %	0 %	386009919
6119	NC_017530	CTGC	2	8	335159	335166	0 %	25 %	25 %	50 %	386009919
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6121	NC_017530	GTG	2	6	335241	335246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009919
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