MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 107806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017530	GAT	2	6	249682	249687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009835
4502	NC_017530	CAAA	2	8	249714	249721	75 %	0 %	0 %	25 %	386009835
4503	NC_017530	CCG	2	6	249803	249808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009835
4504	NC_017530	GCT	2	6	249822	249827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009835
4505	NC_017530	GC	3	6	249841	249846	0 %	0 %	50 %	50 %	386009835
4506	NC_017530	CAG	2	6	249855	249860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009835
4507	NC_017530	CAA	2	6	249864	249869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009835
4508	NC_017530	GAA	2	6	249880	249885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386009835
4509	NC_017530	GGGC	2	8	249891	249898	0 %	0 %	75 %	25 %	386009835
4510	NC_017530	TCAA	2	8	249980	249987	50 %	25 %	0 %	25 %	386009836
4511	NC_017530	TG	3	6	249990	249995	0 %	50 %	50 %	0 %	386009836
4512	NC_017530	GGT	2	6	250006	250011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009836
4513	NC_017530	TCT	2	6	250024	250029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009836
4514	NC_017530	TGC	2	6	250071	250076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009836
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4519	NC_017530	GCT	2	6	251716	251721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009837
4520	NC_017530	CCA	2	6	251769	251774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009837
4521	NC_017530	GCA	2	6	252042	252047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009837
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4525	NC_017530	GCT	2	6	252429	252434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009838
4526	NC_017530	GGC	2	6	252600	252605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009838
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4529	NC_017530	ACT	2	6	252650	252655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009838
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4534	NC_017530	GGC	2	6	252939	252944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009838
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4544	NC_017530	GAT	2	6	253357	253362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009839
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4553	NC_017530	TGC	2	6	253937	253942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009840
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4555	NC_017530	GAT	2	6	254046	254051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009840
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4593	NC_017530	CAG	2	6	255475	255480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009840
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4604	NC_017530	TGC	2	6	255925	255930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009841
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4606	NC_017530	A	6	6	255974	255979	100 %	0 %	0 %	0 %	386009841
4607	NC_017530	CGC	2	6	256030	256035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009842
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4619	NC_017530	CGC	2	6	256654	256659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009842
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4621	NC_017530	CTG	2	6	256697	256702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009842
4622	NC_017530	ATC	2	6	256823	256828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009842
4623	NC_017530	CTGG	2	8	256858	256865	0 %	25 %	50 %	25 %	386009843
4624	NC_017530	ATG	2	6	256891	256896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009843
4625	NC_017530	CGT	2	6	256980	256985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009843
4626	NC_017530	TGG	2	6	257008	257013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009843
4627	NC_017530	GGC	2	6	257085	257090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009843
4628	NC_017530	AGGTGG	2	12	257117	257128	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386009843
4629	NC_017530	GGC	2	6	257140	257145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009843
4630	NC_017530	CAT	2	6	257244	257249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009843
4631	NC_017530	GCT	2	6	257598	257603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009843
4632	NC_017530	CCG	2	6	257627	257632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009843
4633	NC_017530	CCG	2	6	257636	257641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009843
4634	NC_017530	GGCGC	2	10	257689	257698	0 %	0 %	60 %	40 %	386009843
4635	NC_017530	GCC	2	6	257708	257713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009843
4636	NC_017530	GCTG	2	8	257739	257746	0 %	25 %	50 %	25 %	386009843
4637	NC_017530	CCA	2	6	257897	257902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009843
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4640	NC_017530	AGACCC	2	12	257993	258004	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386009843
4641	NC_017530	GAAG	2	8	258069	258076	50 %	0 %	50 %	0 %	386009843
4642	NC_017530	TAT	2	6	258097	258102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386009843
4643	NC_017530	CAGG	2	8	258103	258110	25 %	0 %	50 %	25 %	386009843
4644	NC_017530	TGCG	2	8	258161	258168	0 %	25 %	50 %	25 %	386009843
4645	NC_017530	GTG	2	6	258230	258235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009843
4646	NC_017530	GCA	2	6	258472	258477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009844
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4648	NC_017530	CTG	2	6	258525	258530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009844
4649	NC_017530	CCG	2	6	258552	258557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009844
4650	NC_017530	CGA	2	6	258581	258586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009844
4651	NC_017530	GCGCT	2	10	258823	258832	0 %	20 %	40 %	40 %	386009844
4652	NC_017530	CCGGCG	2	12	258868	258879	0 %	0 %	50 %	50 %	386009844
4653	NC_017530	CCCTGG	2	12	258973	258984	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386009844
4654	NC_017530	CGT	2	6	259006	259011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009844
4655	NC_017530	GAC	2	6	259026	259031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009844
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4658	NC_017530	GGC	2	6	259319	259324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009844
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4662	NC_017530	GGC	2	6	259493	259498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009844
4663	NC_017530	GCT	2	6	259502	259507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009844
4664	NC_017530	CTG	2	6	259560	259565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009844
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4669	NC_017530	CGC	2	6	259769	259774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009844
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4674	NC_017530	TTC	2	6	259896	259901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009844
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4676	NC_017530	CCG	2	6	259966	259971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009844
4677	NC_017530	TGC	2	6	260011	260016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009844
4678	NC_017530	TGG	2	6	260017	260022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009844
4679	NC_017530	GCCTG	2	10	260023	260032	0 %	20 %	40 %	40 %	386009844
4680	NC_017530	TTC	2	6	260073	260078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009844
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4684	NC_017530	GTA	2	6	260112	260117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009844
4685	NC_017530	CTGG	2	8	260195	260202	0 %	25 %	50 %	25 %	386009844
4686	NC_017530	TGGC	2	8	260280	260287	0 %	25 %	50 %	25 %	386009844
4687	NC_017530	TGC	2	6	260300	260305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009844
4688	NC_017530	ACTG	2	8	260311	260318	25 %	25 %	25 %	25 %	386009844
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4690	NC_017530	CAGGG	2	10	260516	260525	20 %	0 %	60 %	20 %	386009845
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4692	NC_017530	TCG	2	6	260595	260600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009845
4693	NC_017530	TCG	3	9	260697	260705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009846
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4699	NC_017530	TCG	3	9	260958	260966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009846
4700	NC_017530	GCTC	2	8	260986	260993	0 %	25 %	25 %	50 %	386009846
4701	NC_017530	ACT	2	6	261175	261180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009847
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4709	NC_017530	CTGC	2	8	261447	261454	0 %	25 %	25 %	50 %	386009847
4710	NC_017530	GTCG	2	8	261488	261495	0 %	25 %	50 %	25 %	386009847
4711	NC_017530	CTG	2	6	261528	261533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009847
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4730	NC_017530	GCG	2	6	262715	262720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009848
4731	NC_017530	CAG	2	6	262801	262806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009848
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4733	NC_017530	GGTG	2	8	262842	262849	0 %	25 %	75 %	0 %	386009848
4734	NC_017530	ATG	2	6	262859	262864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009848
4735	NC_017530	CTGC	2	8	262881	262888	0 %	25 %	25 %	50 %	386009848
4736	NC_017530	CAG	2	6	262891	262896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009848
4737	NC_017530	TCG	2	6	262940	262945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009848
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4739	NC_017530	CGGT	2	8	263027	263034	0 %	25 %	50 %	25 %	386009848
4740	NC_017530	GAT	2	6	263131	263136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009848
4741	NC_017530	TGG	2	6	263181	263186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009848
4742	NC_017530	ATG	2	6	263204	263209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009848
4743	NC_017530	CGA	2	6	263259	263264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009848
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4765	NC_017530	ACG	2	6	264976	264981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009850
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4832	NC_017530	CTG	2	6	267862	267867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009853
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4842	NC_017530	GCA	2	6	268107	268112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009853
4843	NC_017530	AGGT	2	8	268175	268182	25 %	25 %	50 %	0 %	386009853
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4850	NC_017530	CTG	2	6	268519	268524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009853
4851	NC_017530	CTG	2	6	268534	268539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009853
4852	NC_017530	GC	3	6	268563	268568	0 %	0 %	50 %	50 %	386009853
4853	NC_017530	TGC	2	6	268796	268801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009854
4854	NC_017530	T	6	6	268819	268824	0 %	100 %	0 %	0 %	386009854
4855	NC_017530	CCTG	3	12	268828	268839	0 %	25 %	25 %	50 %	386009854
4856	NC_017530	TGC	2	6	268925	268930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009854
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4858	NC_017530	GCT	2	6	269018	269023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009854
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4981	NC_017530	GCC	2	6	274999	275004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009861
4982	NC_017530	CAT	2	6	275133	275138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009861
4983	NC_017530	CGC	2	6	275139	275144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009861
4984	NC_017530	GCTG	2	8	275160	275167	0 %	25 %	50 %	25 %	386009861
4985	NC_017530	TCA	2	6	275189	275194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009861
4986	NC_017530	TGC	2	6	275369	275374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009861
4987	NC_017530	GCT	2	6	275400	275405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009861
4988	NC_017530	CTG	2	6	275449	275454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009861
4989	NC_017530	CAG	2	6	275515	275520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009861
4990	NC_017530	GTT	2	6	275547	275552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386009861
4991	NC_017530	CG	3	6	275587	275592	0 %	0 %	50 %	50 %	386009861
4992	NC_017530	CCA	2	6	275664	275669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009862
4993	NC_017530	CAG	2	6	275677	275682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009862
4994	NC_017530	ATC	2	6	275729	275734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009862
4995	NC_017530	CTCGGC	2	12	275863	275874	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386009862
4996	NC_017530	GGCG	2	8	275877	275884	0 %	0 %	75 %	25 %	386009862
4997	NC_017530	CGCA	2	8	276046	276053	25 %	0 %	25 %	50 %	386009862
4998	NC_017530	GTC	2	6	276056	276061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009862
4999	NC_017530	GCTG	2	8	276069	276076	0 %	25 %	50 %	25 %	386009862
5000	NC_017530	CCA	2	6	276081	276086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009862

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