MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Phycisphaera mikurensis NBRC 102666 plasmid pPSMK1

Total Repeats: 2005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017081	CGT	2	6	81	86	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383087768
2	NC_017081	CGGC	2	8	126	133	0 %	0 %	50 %	50 %	383087768
3	NC_017081	G	6	6	154	159	0 %	0 %	100 %	0 %	383087768
4	NC_017081	GCC	2	6	200	205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383087768
5	NC_017081	CAG	2	6	220	225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383087768
6	NC_017081	GC	3	6	308	313	0 %	0 %	50 %	50 %	383087768
7	NC_017081	CGG	2	6	361	366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383087768
8	NC_017081	GCC	2	6	386	391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383087768
9	NC_017081	CG	3	6	468	473	0 %	0 %	50 %	50 %	383087768
10	NC_017081	GCC	2	6	491	496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383087768
11	NC_017081	CAC	2	6	529	534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383087768
12	NC_017081	CTC	2	6	589	594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383087768
13	NC_017081	CGG	2	6	595	600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383087768
14	NC_017081	CAT	2	6	616	621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383087768
15	NC_017081	CAC	2	6	640	645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383087768
16	NC_017081	CAG	2	6	664	669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383087768
17	NC_017081	GCC	2	6	761	766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383087768
18	NC_017081	TCGA	2	8	803	810	25 %	25 %	25 %	25 %	383087768
19	NC_017081	GCA	3	9	900	908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383087768
20	NC_017081	CGC	2	6	928	933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383087768
21	NC_017081	TCC	2	6	946	951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383087769
22	NC_017081	CAG	2	6	954	959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383087769
23	NC_017081	CGC	2	6	1001	1006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383087769
24	NC_017081	CCCCGG	2	12	1023	1034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383087769
25	NC_017081	CAC	2	6	1107	1112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383087769
26	NC_017081	GCA	2	6	1133	1138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383087769
27	NC_017081	GCC	2	6	1148	1153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383087769
28	NC_017081	CGA	2	6	1254	1259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383087769
29	NC_017081	CGC	2	6	1302	1307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383087769
30	NC_017081	CCCG	2	8	1320	1327	0 %	0 %	25 %	75 %	383087769
31	NC_017081	CGC	3	9	1362	1370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383087769
32	NC_017081	GGC	2	6	1376	1381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383087769
33	NC_017081	CGC	2	6	1434	1439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383087769
34	NC_017081	CGC	2	6	1485	1490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383087769
35	NC_017081	CAC	2	6	1539	1544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383087769
36	NC_017081	CCT	2	6	1559	1564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383087769
37	NC_017081	TGC	3	9	1624	1632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383087769
38	NC_017081	CGC	2	6	1668	1673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383087769
39	NC_017081	CTG	2	6	1698	1703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383087769
40	NC_017081	GCC	2	6	1786	1791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383087770
41	NC_017081	TCG	2	6	1792	1797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383087770
42	NC_017081	GGC	2	6	1809	1814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383087770
43	NC_017081	CGT	2	6	2167	2172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383087771
44	NC_017081	CCG	2	6	2243	2248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383087771
45	NC_017081	CCT	2	6	2267	2272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383087771
46	NC_017081	CAG	2	6	2311	2316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383087771
47	NC_017081	CTG	2	6	2384	2389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383087771
48	NC_017081	CTC	2	6	2390	2395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383087771
49	NC_017081	GCC	2	6	2396	2401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383087771
50	NC_017081	CGAG	2	8	2412	2419	25 %	0 %	50 %	25 %	383087771
51	NC_017081	GCG	2	6	2478	2483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383087771
52	NC_017081	GGA	2	6	2500	2505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383087771
53	NC_017081	TTG	2	6	2526	2531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383087771
54	NC_017081	GTC	2	6	2532	2537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383087771
55	NC_017081	CAGC	2	8	2568	2575	25 %	0 %	25 %	50 %	383087771
56	NC_017081	GAG	2	6	2608	2613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383087771
57	NC_017081	GAT	3	9	2616	2624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383087771
58	NC_017081	GGT	2	6	2724	2729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383087772
59	NC_017081	GCTG	2	8	2789	2796	0 %	25 %	50 %	25 %	383087772
60	NC_017081	GGA	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383087772
61	NC_017081	AGA	2	6	2828	2833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383087772
62	NC_017081	CGCT	2	8	2885	2892	0 %	25 %	25 %	50 %	383087772
63	NC_017081	GTG	2	6	2908	2913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383087772
64	NC_017081	GCG	2	6	2926	2931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383087772
65	NC_017081	GGT	2	6	2970	2975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383087772
66	NC_017081	GCT	2	6	3003	3008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383087772
67	NC_017081	GAA	2	6	3066	3071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383087772
68	NC_017081	CTCG	2	8	3087	3094	0 %	25 %	25 %	50 %	383087772
69	NC_017081	CAC	2	6	3148	3153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383087772
70	NC_017081	GTG	2	6	3214	3219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383087772
71	NC_017081	AGC	2	6	3242	3247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383087772
72	NC_017081	GC	3	6	3260	3265	0 %	0 %	50 %	50 %	383087772
73	NC_017081	TC	4	8	3335	3342	0 %	50 %	0 %	50 %	383087772
74	NC_017081	GAA	2	6	3385	3390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383087772
75	NC_017081	GAT	2	6	3393	3398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383087772
76	NC_017081	GCG	2	6	3432	3437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383087772
77	NC_017081	CGCC	2	8	3467	3474	0 %	0 %	25 %	75 %	383087772
78	NC_017081	CCCG	2	8	3492	3499	0 %	0 %	25 %	75 %	383087772
79	NC_017081	ATG	2	6	3507	3512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383087772
80	NC_017081	CTT	2	6	3579	3584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383087773
81	NC_017081	CCA	2	6	3587	3592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383087773
82	NC_017081	CTT	2	6	3601	3606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383087773
83	NC_017081	CGC	2	6	3675	3680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383087773
84	NC_017081	GCC	2	6	3685	3690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383087773
85	NC_017081	GAGC	2	8	3694	3701	25 %	0 %	50 %	25 %	383087773
86	NC_017081	GCC	2	6	3709	3714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383087773
87	NC_017081	GCC	2	6	3721	3726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383087773
88	NC_017081	GCC	2	6	3742	3747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383087773
89	NC_017081	CCG	2	6	3764	3769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383087773
90	NC_017081	CGACG	2	10	3789	3798	20 %	0 %	40 %	40 %	383087773
91	NC_017081	AGC	2	6	3830	3835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383087773
92	NC_017081	GGC	2	6	3843	3848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383087773
93	NC_017081	CCTC	2	8	3872	3879	0 %	25 %	0 %	75 %	383087773
94	NC_017081	AGC	2	6	3899	3904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383087773
95	NC_017081	TCA	3	9	3905	3913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383087773
96	NC_017081	GACG	2	8	3936	3943	25 %	0 %	50 %	25 %	383087773
97	NC_017081	TGG	2	6	3953	3958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383087773
98	NC_017081	TCG	2	6	4055	4060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383087773
99	NC_017081	AGC	2	6	4370	4375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383087774
100	NC_017081	GAG	2	6	4384	4389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383087774
101	NC_017081	CGAT	2	8	4400	4407	25 %	25 %	25 %	25 %	383087774
102	NC_017081	CAC	2	6	4408	4413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383087774
103	NC_017081	GGT	2	6	4441	4446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383087774
104	NC_017081	GAC	3	9	4501	4509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383087774
105	NC_017081	CCG	2	6	4517	4522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383087774
106	NC_017081	CGG	2	6	4532	4537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383087774
107	NC_017081	GTC	2	6	4627	4632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383087774
108	NC_017081	CTT	2	6	4650	4655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383087774
109	NC_017081	CGGCGT	2	12	4695	4706	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	383087774
110	NC_017081	TCC	2	6	4748	4753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383087774
111	NC_017081	CGG	2	6	4758	4763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383087774
112	NC_017081	G	6	6	4762	4767	0 %	0 %	100 %	0 %	383087774
113	NC_017081	AGT	2	6	4779	4784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383087774
114	NC_017081	CCT	2	6	4821	4826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383087774
115	NC_017081	CGT	2	6	4935	4940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383087774
116	NC_017081	CCCAG	2	10	4950	4959	20 %	0 %	20 %	60 %	383087774
117	NC_017081	CG	3	6	4970	4975	0 %	0 %	50 %	50 %	383087774
118	NC_017081	CGG	2	6	4979	4984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383087774
119	NC_017081	GTC	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383087774
120	NC_017081	TCT	2	6	5015	5020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383087774
121	NC_017081	TCA	2	6	5021	5026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383087774
122	NC_017081	GCC	2	6	5084	5089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383087774
123	NC_017081	GGC	2	6	5111	5116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383087774
124	NC_017081	TCT	3	9	5117	5125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383087774
125	NC_017081	CGC	2	6	5134	5139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383087774
126	NC_017081	ACC	2	6	5144	5149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383087774
127	NC_017081	CAG	2	6	5155	5160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383087774
128	NC_017081	C	6	6	5218	5223	0 %	0 %	0 %	100 %	383087774
129	NC_017081	CAG	2	6	5237	5242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383087774
130	NC_017081	GTG	2	6	5276	5281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383087774
131	NC_017081	GAA	2	6	5380	5385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383087775
132	NC_017081	GC	3	6	5459	5464	0 %	0 %	50 %	50 %	383087775
133	NC_017081	CGG	2	6	5492	5497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383087775
134	NC_017081	CGT	2	6	5510	5515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383087775
135	NC_017081	CTTC	2	8	5522	5529	0 %	50 %	0 %	50 %	383087775
136	NC_017081	G	6	6	5545	5550	0 %	0 %	100 %	0 %	383087775
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249	NC_017081	CTC	2	6	12044	12049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383087784
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254	NC_017081	GCG	2	6	12205	12210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383087784
255	NC_017081	CTT	2	6	12217	12222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383087784
256	NC_017081	AGC	2	6	12239	12244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383087784
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260	NC_017081	CGG	2	6	12409	12414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383087785
261	NC_017081	CAC	2	6	12424	12429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383087785
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264	NC_017081	CGG	2	6	12597	12602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383087786
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