MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pediococcus claussenii ATCC BAA-344 plasmid pPECL-8

Total Repeats: 477

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017019	TTC	2	6	540	545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381280287
2	NC_017019	CAC	2	6	579	584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	381280287
3	NC_017019	CGT	2	6	730	735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381280287
4	NC_017019	AGC	2	6	871	876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381280287
5	NC_017019	CATT	2	8	920	927	25 %	50 %	0 %	25 %	381280287
6	NC_017019	GCCA	2	8	972	979	25 %	0 %	25 %	50 %	381280287
7	NC_017019	C	6	6	1053	1058	0 %	0 %	0 %	100 %	381280287
8	NC_017019	TC	3	6	1151	1156	0 %	50 %	0 %	50 %	381280287
9	NC_017019	GCT	2	6	1161	1166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381280287
10	NC_017019	GTC	2	6	1247	1252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381280287
11	NC_017019	TCA	2	6	1298	1303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381280287
12	NC_017019	AGC	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381280287
13	NC_017019	ATA	2	6	1360	1365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381280287
14	NC_017019	TCA	2	6	1377	1382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381280287
15	NC_017019	A	8	8	1414	1421	100 %	0 %	0 %	0 %	381280287
16	NC_017019	ATT	2	6	1459	1464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381280287
17	NC_017019	GTT	2	6	1491	1496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381280287
18	NC_017019	CTT	2	6	1561	1566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381280287
19	NC_017019	GTA	2	6	1594	1599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381280287
20	NC_017019	ATC	2	6	1628	1633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381280287
21	NC_017019	GAAT	2	8	1638	1645	50 %	25 %	25 %	0 %	381280287
22	NC_017019	CCAG	2	8	1797	1804	25 %	0 %	25 %	50 %	381280287
23	NC_017019	CTG	2	6	1907	1912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381280287
24	NC_017019	CTT	2	6	1930	1935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381280287
25	NC_017019	ACT	2	6	1972	1977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381280287
26	NC_017019	TATG	2	8	1991	1998	25 %	50 %	25 %	0 %	381280287
27	NC_017019	AGT	2	6	2625	2630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381280288
28	NC_017019	CTT	2	6	2680	2685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381280288
29	NC_017019	TCAA	2	8	2714	2721	50 %	25 %	0 %	25 %	381280288
30	NC_017019	TTGA	2	8	2731	2738	25 %	50 %	25 %	0 %	381280288
31	NC_017019	TAC	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381280288
32	NC_017019	A	6	6	2838	2843	100 %	0 %	0 %	0 %	381280288
33	NC_017019	A	6	6	2862	2867	100 %	0 %	0 %	0 %	381280288
34	NC_017019	ATATTT	2	12	2949	2960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381280288
35	NC_017019	T	8	8	3002	3009	0 %	100 %	0 %	0 %	381280288
36	NC_017019	AAT	2	6	3045	3050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381280288
37	NC_017019	AAG	2	6	3080	3085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381280288
38	NC_017019	GGAA	2	8	3102	3109	50 %	0 %	50 %	0 %	381280288
39	NC_017019	GAA	2	6	3160	3165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381280288
40	NC_017019	AAG	2	6	3214	3219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381280288
41	NC_017019	AG	3	6	3238	3243	50 %	0 %	50 %	0 %	381280288
42	NC_017019	TAT	2	6	3282	3287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381280288
43	NC_017019	ATCA	2	8	3446	3453	50 %	25 %	0 %	25 %	381280288
44	NC_017019	ATTAC	2	10	3478	3487	40 %	40 %	0 %	20 %	381280288
45	NC_017019	AAAT	2	8	3506	3513	75 %	25 %	0 %	0 %	381280288
46	NC_017019	AAACA	2	10	3539	3548	80 %	0 %	0 %	20 %	381280289
47	NC_017019	AGA	2	6	3550	3555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381280289
48	NC_017019	ATT	2	6	3575	3580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381280289
49	NC_017019	TCC	2	6	3652	3657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	381280289
50	NC_017019	A	6	6	3762	3767	100 %	0 %	0 %	0 %	381280289
51	NC_017019	AAAT	2	8	3791	3798	75 %	25 %	0 %	0 %	381280289
52	NC_017019	TAA	2	6	4158	4163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381280290
53	NC_017019	T	7	7	4235	4241	0 %	100 %	0 %	0 %	381280290
54	NC_017019	TTA	2	6	4293	4298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381280290
55	NC_017019	TAA	2	6	4302	4307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381280290
56	NC_017019	AAAT	2	8	4310	4317	75 %	25 %	0 %	0 %	381280290
57	NC_017019	ATGA	2	8	4332	4339	50 %	25 %	25 %	0 %	381280290
58	NC_017019	TAAT	2	8	4403	4410	50 %	50 %	0 %	0 %	381280290
59	NC_017019	ATCA	2	8	4411	4418	50 %	25 %	0 %	25 %	381280290
60	NC_017019	TCT	2	6	4463	4468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381280291
61	NC_017019	ACGAT	2	10	4591	4600	40 %	20 %	20 %	20 %	381280291
62	NC_017019	GCG	2	6	4636	4641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	381280291
63	NC_017019	T	6	6	4717	4722	0 %	100 %	0 %	0 %	381280291
64	NC_017019	GAAA	2	8	4807	4814	75 %	0 %	25 %	0 %	381280291
65	NC_017019	CGT	2	6	4877	4882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381280291
66	NC_017019	ACT	2	6	4915	4920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381280291
67	NC_017019	CGC	2	6	4950	4955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	381280291
68	NC_017019	TTC	2	6	4998	5003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381280291
69	NC_017019	TCA	2	6	5093	5098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381280291
70	NC_017019	GTC	2	6	5416	5421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381280292
71	NC_017019	GCA	2	6	5468	5473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381280292
72	NC_017019	TTG	2	6	5479	5484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381280292
73	NC_017019	GTA	3	9	5668	5676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381280292
74	NC_017019	GTATC	2	10	5823	5832	20 %	40 %	20 %	20 %	381280292
75	NC_017019	TCA	2	6	5841	5846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381280292
76	NC_017019	CAG	2	6	5929	5934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381280292
77	NC_017019	TCA	2	6	6027	6032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381280292
78	NC_017019	GACC	2	8	6052	6059	25 %	0 %	25 %	50 %	381280292
79	NC_017019	AAG	2	6	6107	6112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381280292
80	NC_017019	TGC	2	6	6128	6133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381280292
81	NC_017019	GACG	2	8	6189	6196	25 %	0 %	50 %	25 %	381280292
82	NC_017019	CTTG	2	8	6275	6282	0 %	50 %	25 %	25 %	381280293
83	NC_017019	TAA	2	6	6311	6316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381280293
84	NC_017019	TTC	2	6	6349	6354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381280293
85	NC_017019	CTT	2	6	6368	6373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381280293
86	NC_017019	GCT	2	6	6392	6397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381280293
87	NC_017019	GTTT	2	8	6421	6428	0 %	75 %	25 %	0 %	381280293
88	NC_017019	CAT	3	9	6461	6469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381280293
89	NC_017019	GTG	2	6	6529	6534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	381280293
90	NC_017019	ATA	2	6	6561	6566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381280293
91	NC_017019	TCA	2	6	6689	6694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381280293
92	NC_017019	ACA	2	6	6695	6700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381280293
93	NC_017019	AATC	2	8	6725	6732	50 %	25 %	0 %	25 %	381280293
94	NC_017019	AAT	2	6	6829	6834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381280293
95	NC_017019	ACC	2	6	6853	6858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	381280293
96	NC_017019	AAAT	2	8	6922	6929	75 %	25 %	0 %	0 %	381280293
97	NC_017019	GTAAAG	2	12	6931	6942	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	381280293
98	NC_017019	AAAC	2	8	7004	7011	75 %	0 %	0 %	25 %	381280293
99	NC_017019	GCC	2	6	7046	7051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	381280293
100	NC_017019	ATC	2	6	7071	7076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381280293
101	NC_017019	ACACA	2	10	7077	7086	60 %	0 %	0 %	40 %	381280293
102	NC_017019	A	6	6	7178	7183	100 %	0 %	0 %	0 %	381280293
103	NC_017019	TGAT	2	8	7229	7236	25 %	50 %	25 %	0 %	381280294
104	NC_017019	GTT	2	6	7321	7326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381280294
105	NC_017019	ACC	2	6	7371	7376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	381280294
106	NC_017019	GATA	2	8	7519	7526	50 %	25 %	25 %	0 %	381280294
107	NC_017019	CAC	2	6	7612	7617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	381280294
108	NC_017019	GAC	2	6	7630	7635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381280294
109	NC_017019	CGA	2	6	7636	7641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381280294
110	NC_017019	CGCC	2	8	7679	7686	0 %	0 %	25 %	75 %	381280294
111	NC_017019	GTTT	2	8	7786	7793	0 %	75 %	25 %	0 %	381280294
112	NC_017019	ACA	2	6	7836	7841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381280294
113	NC_017019	GAC	2	6	7856	7861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381280294
114	NC_017019	TGG	2	6	7918	7923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	381280294
115	NC_017019	TCA	3	9	7950	7958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381280294
116	NC_017019	CTG	2	6	8310	8315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381280295
117	NC_017019	T	6	6	8322	8327	0 %	100 %	0 %	0 %	381280295
118	NC_017019	ATC	2	6	8382	8387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381280295
119	NC_017019	ATT	2	6	8457	8462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381280295
120	NC_017019	CTT	2	6	8489	8494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381280295
121	NC_017019	CGT	2	6	8504	8509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381280295
122	NC_017019	AAC	2	6	8522	8527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381280295
123	NC_017019	ACCAA	2	10	8569	8578	60 %	0 %	0 %	40 %	381280295
124	NC_017019	CA	3	6	8615	8620	50 %	0 %	0 %	50 %	381280295
125	NC_017019	TCA	2	6	8701	8706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381280295
126	NC_017019	CTGC	2	8	8759	8766	0 %	25 %	25 %	50 %	381280295
127	NC_017019	GAAC	2	8	8895	8902	50 %	0 %	25 %	25 %	381280295
128	NC_017019	AAG	2	6	8947	8952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381280295
129	NC_017019	ATG	2	6	8994	8999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381280295
130	NC_017019	ATT	2	6	9179	9184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381280295
131	NC_017019	GAA	2	6	9195	9200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381280295
132	NC_017019	CGG	2	6	9350	9355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	381280295
133	NC_017019	GCA	2	6	9409	9414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381280295
134	NC_017019	ACGCA	2	10	9589	9598	40 %	0 %	20 %	40 %	381280295
135	NC_017019	AGA	2	6	9607	9612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381280295
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