MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas fluorescens F113 chromosome

Total Repeats: 125342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016830	C	6	6	222031	222036	0 %	0 %	0 %	100 %	378948139
4002	NC_016830	CGG	2	6	222107	222112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378948139
4003	NC_016830	CGG	2	6	222118	222123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378948139
4004	NC_016830	TCT	2	6	222196	222201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378948139
4005	NC_016830	TGC	2	6	222202	222207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378948139
4006	NC_016830	CA	3	6	222214	222219	50 %	0 %	0 %	50 %	378948139
4007	NC_016830	GCG	2	6	222294	222299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378948139
4008	NC_016830	GC	3	6	222310	222315	0 %	0 %	50 %	50 %	378948139
4009	NC_016830	CGG	2	6	222379	222384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378948139
4010	NC_016830	GGTCCA	2	12	222400	222411	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378948139
4011	NC_016830	CGCA	2	8	222476	222483	25 %	0 %	25 %	50 %	378948139
4012	NC_016830	CAG	2	6	222515	222520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378948139
4013	NC_016830	CGA	2	6	222526	222531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378948139
4014	NC_016830	CAC	3	9	222563	222571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378948139
4015	NC_016830	CGC	2	6	222583	222588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378948139
4016	NC_016830	TCA	2	6	222703	222708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378948139
4017	NC_016830	CAG	3	9	222770	222778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378948139
4018	NC_016830	ACA	2	6	222784	222789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378948139
4019	NC_016830	CCCA	2	8	222800	222807	25 %	0 %	0 %	75 %	378948139
4020	NC_016830	GAA	2	6	222812	222817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378948139
4021	NC_016830	AGC	2	6	222855	222860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378948139
4022	NC_016830	TGC	2	6	222873	222878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378948139
4023	NC_016830	GCAA	2	8	222945	222952	50 %	0 %	25 %	25 %	378948139
4024	NC_016830	GGC	2	6	223010	223015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378948139
4025	NC_016830	CCG	3	9	223112	223120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378948139
4026	NC_016830	AAC	2	6	223149	223154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378948139
4027	NC_016830	GCAG	2	8	223165	223172	25 %	0 %	50 %	25 %	378948139
4028	NC_016830	CA	3	6	223234	223239	50 %	0 %	0 %	50 %	378948139
4029	NC_016830	AGCCC	2	10	223360	223369	20 %	0 %	20 %	60 %	378948139
4030	NC_016830	GTT	2	6	223481	223486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378948139
4031	NC_016830	TCGG	2	8	223530	223537	0 %	25 %	50 %	25 %	378948139
4032	NC_016830	CAG	2	6	223658	223663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378948139
4033	NC_016830	GGC	2	6	223668	223673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378948139
4034	NC_016830	TGC	2	6	223692	223697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378948139
4035	NC_016830	TGC	2	6	223719	223724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378948139
4036	NC_016830	CAC	2	6	223751	223756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378948139
4037	NC_016830	CAG	2	6	223757	223762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378948139
4038	NC_016830	GGA	2	6	223783	223788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378948139
4039	NC_016830	CAG	2	6	223793	223798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378948139
4040	NC_016830	TGG	2	6	223816	223821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378948139
4041	NC_016830	GGT	2	6	223928	223933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378948139
4042	NC_016830	CGGC	2	8	223954	223961	0 %	0 %	50 %	50 %	378948139
4043	NC_016830	CGT	2	6	223963	223968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378948139
4044	NC_016830	GCG	2	6	223979	223984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378948139
4045	NC_016830	GCA	3	9	224080	224088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378948139
4046	NC_016830	TGC	2	6	224136	224141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378948139
4047	NC_016830	CGC	2	6	224189	224194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378948139
4048	NC_016830	GCAG	2	8	224215	224222	25 %	0 %	50 %	25 %	378948139
4049	NC_016830	GGA	2	6	224240	224245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378948139
4050	NC_016830	GGA	2	6	224255	224260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378948139
4051	NC_016830	GGTTG	2	10	224288	224297	0 %	40 %	60 %	0 %	378948139
4052	NC_016830	CAG	2	6	224347	224352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378948139
4053	NC_016830	TGC	2	6	224397	224402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378948139
4054	NC_016830	GGC	2	6	224416	224421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378948139
4055	NC_016830	GCGTC	2	10	224470	224479	0 %	20 %	40 %	40 %	378948139
4056	NC_016830	CGG	3	9	224521	224529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378948139
4057	NC_016830	CAG	2	6	224531	224536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378948139
4058	NC_016830	GCT	2	6	224608	224613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378948139
4059	NC_016830	ACC	2	6	224700	224705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378948139
4060	NC_016830	GCG	2	6	224752	224757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378948139
4061	NC_016830	CCT	2	6	224764	224769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378948139
4062	NC_016830	CAG	2	6	224774	224779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378948139
4063	NC_016830	GC	3	6	224785	224790	0 %	0 %	50 %	50 %	378948139
4064	NC_016830	CAC	2	6	224804	224809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378948139
4065	NC_016830	CGT	2	6	224899	224904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378948139
4066	NC_016830	CCA	2	6	224950	224955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378948139
4067	NC_016830	ACCGTG	2	12	224957	224968	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378948139
4068	NC_016830	CTGG	2	8	225002	225009	0 %	25 %	50 %	25 %	378948139
4069	NC_016830	GCT	2	6	225108	225113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378948140
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4071	NC_016830	TCG	2	6	225211	225216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378948140
4072	NC_016830	TGC	2	6	225253	225258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378948140
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4074	NC_016830	GC	3	6	225300	225305	0 %	0 %	50 %	50 %	378948140
4075	NC_016830	CGC	2	6	225309	225314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378948140
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4077	NC_016830	TCG	2	6	225385	225390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378948140
4078	NC_016830	GTC	2	6	225435	225440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378948140
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4080	NC_016830	GGCGAT	2	12	225480	225491	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378948140
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4082	NC_016830	CTG	2	6	225615	225620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378948140
4083	NC_016830	CCA	2	6	225635	225640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378948140
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4085	NC_016830	CGT	2	6	225677	225682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378948140
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4088	NC_016830	CAC	2	6	225768	225773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378948140
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4091	NC_016830	GTC	3	9	225891	225899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378948140
4092	NC_016830	TCG	2	6	225929	225934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378948140
4093	NC_016830	CG	3	6	225933	225938	0 %	0 %	50 %	50 %	378948140
4094	NC_016830	GCG	2	6	226056	226061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378948141
4095	NC_016830	GCG	2	6	226065	226070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378948141
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4100	NC_016830	TGA	2	6	226408	226413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378948141
4101	NC_016830	CG	3	6	226424	226429	0 %	0 %	50 %	50 %	378948141
4102	NC_016830	CGGC	2	8	226558	226565	0 %	0 %	50 %	50 %	378948141
4103	NC_016830	GCG	2	6	226661	226666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378948141
4104	NC_016830	A	6	6	226693	226698	100 %	0 %	0 %	0 %	378948141
4105	NC_016830	GTT	2	6	226735	226740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378948141
4106	NC_016830	CGA	2	6	227451	227456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378948142
4107	NC_016830	ACG	2	6	227515	227520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378948142
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4109	NC_016830	AGC	2	6	227554	227559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378948142
4110	NC_016830	GC	3	6	227558	227563	0 %	0 %	50 %	50 %	378948142
4111	NC_016830	GAT	2	6	227564	227569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378948142
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4117	NC_016830	CCA	2	6	227882	227887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378948142
4118	NC_016830	CTG	2	6	227991	227996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378948142
4119	NC_016830	AGGC	2	8	228015	228022	25 %	0 %	50 %	25 %	378948142
4120	NC_016830	GAT	2	6	228057	228062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378948142
4121	NC_016830	GCTG	2	8	228369	228376	0 %	25 %	50 %	25 %	378948143
4122	NC_016830	TTG	2	6	228386	228391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378948143
4123	NC_016830	GGCC	2	8	228394	228401	0 %	0 %	50 %	50 %	378948143
4124	NC_016830	GCA	2	6	228508	228513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378948143
4125	NC_016830	GGT	2	6	228559	228564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378948143
4126	NC_016830	CAA	2	6	228577	228582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378948143
4127	NC_016830	ACT	2	6	228627	228632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378948143
4128	NC_016830	ACGCC	2	10	228798	228807	20 %	0 %	20 %	60 %	378948143
4129	NC_016830	GCCA	2	8	228857	228864	25 %	0 %	25 %	50 %	378948143
4130	NC_016830	CAA	2	6	228931	228936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378948143
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4132	NC_016830	GAC	2	6	229015	229020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378948143
4133	NC_016830	TCTG	2	8	229073	229080	0 %	50 %	25 %	25 %	378948144
4134	NC_016830	TGG	2	6	229085	229090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378948144
4135	NC_016830	GGCGCT	2	12	229182	229193	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378948144
4136	NC_016830	CGA	2	6	229212	229217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378948144
4137	NC_016830	TGG	2	6	229226	229231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378948144
4138	NC_016830	CTA	2	6	229263	229268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378948144
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4140	NC_016830	GGC	2	6	229422	229427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378948144
4141	NC_016830	GGT	2	6	229437	229442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378948144
4142	NC_016830	GGCT	2	8	229498	229505	0 %	25 %	50 %	25 %	378948144
4143	NC_016830	TG	3	6	229511	229516	0 %	50 %	50 %	0 %	378948144
4144	NC_016830	TGC	3	9	229544	229552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378948144
4145	NC_016830	GTG	2	6	229660	229665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378948144
4146	NC_016830	CTG	2	6	229846	229851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378948144
4147	NC_016830	TTG	2	6	229852	229857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378948144
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4149	NC_016830	GGTG	2	8	229926	229933	0 %	25 %	75 %	0 %	378948144
4150	NC_016830	TGC	2	6	229940	229945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378948144
4151	NC_016830	GC	3	6	229952	229957	0 %	0 %	50 %	50 %	378948144
4152	NC_016830	CGG	2	6	229995	230000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378948144
4153	NC_016830	CGC	2	6	230156	230161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378948144
4154	NC_016830	GTG	2	6	230164	230169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378948144
4155	NC_016830	GCCT	2	8	230227	230234	0 %	25 %	25 %	50 %	378948144
4156	NC_016830	TGA	2	6	230262	230267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378948144
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4159	NC_016830	GCC	2	6	230344	230349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378948144
4160	NC_016830	GGT	2	6	230361	230366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378948144
4161	NC_016830	CGA	2	6	230397	230402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378948144
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4164	NC_016830	CG	3	6	230463	230468	0 %	0 %	50 %	50 %	378948144
4165	NC_016830	TGG	2	6	230727	230732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378948144
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4168	NC_016830	GTT	2	6	230937	230942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378948144
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4201	NC_016830	GTA	2	6	233410	233415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378948146
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4213	NC_016830	GTA	2	6	233989	233994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378948146
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4223	NC_016830	GTA	2	6	234412	234417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378948146
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4225	NC_016830	GAAC	2	8	234436	234443	50 %	0 %	25 %	25 %	378948146
4226	NC_016830	CCGC	2	8	234455	234462	0 %	0 %	25 %	75 %	378948146
4227	NC_016830	C	6	6	234462	234467	0 %	0 %	0 %	100 %	378948146
4228	NC_016830	CGG	2	6	234480	234485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378948146
4229	NC_016830	GCC	2	6	234490	234495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378948146
4230	NC_016830	CAG	2	6	234505	234510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378948146
4231	NC_016830	CACGTT	2	12	234592	234603	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378948146
4232	NC_016830	TGC	2	6	234633	234638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378948146
4233	NC_016830	GCCGC	2	10	234686	234695	0 %	0 %	40 %	60 %	378948146
4234	NC_016830	GTT	2	6	234760	234765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378948146
4235	NC_016830	GCCG	2	8	234898	234905	0 %	0 %	50 %	50 %	378948146
4236	NC_016830	GTT	2	6	234988	234993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378948146
4237	NC_016830	CTGG	2	8	235069	235076	0 %	25 %	50 %	25 %	378948146
4238	NC_016830	CGG	2	6	235077	235082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378948146
4239	NC_016830	GGT	3	9	235201	235209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378948146
4240	NC_016830	TGA	2	6	235251	235256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378948146
4241	NC_016830	TGT	2	6	235284	235289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378948146
4242	NC_016830	TGA	2	6	235290	235295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378948146
4243	NC_016830	CTG	2	6	235312	235317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378948146
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4355	NC_016830	GGTCAC	2	12	241555	241566	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378948146
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4475	NC_016830	GCA	2	6	247835	247840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378948146
4476	NC_016830	ATCACG	2	12	247841	247852	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378948146
4477	NC_016830	GGTC	2	8	247878	247885	0 %	25 %	50 %	25 %	378948146
4478	NC_016830	GCGTC	2	10	247965	247974	0 %	20 %	40 %	40 %	378948146
4479	NC_016830	CGG	2	6	248085	248090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378948146
4480	NC_016830	CAC	2	6	248101	248106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378948146
4481	NC_016830	GCC	2	6	248116	248121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378948146
4482	NC_016830	CGG	2	6	248124	248129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378948146
4483	NC_016830	C	6	6	248132	248137	0 %	0 %	0 %	100 %	378948146
4484	NC_016830	GTC	2	6	248180	248185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378948146
4485	NC_016830	TTG	2	6	248209	248214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378948146
4486	NC_016830	ACG	2	6	248432	248437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378948146
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4490	NC_016830	CGG	2	6	248979	248984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378948147
4491	NC_016830	GGC	2	6	248998	249003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378948147
4492	NC_016830	GGC	2	6	249008	249013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378948147
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4496	NC_016830	GCG	2	6	249375	249380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378948147
4497	NC_016830	GC	3	6	249401	249406	0 %	0 %	50 %	50 %	378948147
4498	NC_016830	CAA	2	6	249421	249426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378948147
4499	NC_016830	AACC	2	8	249442	249449	50 %	0 %	0 %	50 %	378948147
4500	NC_016830	TGC	2	6	249531	249536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378948147

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