MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas fluorescens F113 chromosome

Total Repeats: 125342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016830	GCA	2	6	580	585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378947942
2	NC_016830	CTGC	2	8	611	618	0 %	25 %	25 %	50 %	378947942
3	NC_016830	CAA	2	6	620	625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378947942
4	NC_016830	CGA	2	6	667	672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378947942
5	NC_016830	CGA	2	6	751	756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378947942
6	NC_016830	ATGGCA	2	12	759	770	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378947942
7	NC_016830	TTA	2	6	788	793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378947942
8	NC_016830	GCA	2	6	798	803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378947942
9	NC_016830	CG	3	6	819	824	0 %	0 %	50 %	50 %	378947942
10	NC_016830	CGC	2	6	837	842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378947942
11	NC_016830	GCC	2	6	845	850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378947942
12	NC_016830	CAG	2	6	866	871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378947942
13	NC_016830	AAC	2	6	890	895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378947942
14	NC_016830	GCC	2	6	899	904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378947942
15	NC_016830	ACGCA	2	10	931	940	40 %	0 %	20 %	40 %	378947942
16	NC_016830	GAA	2	6	962	967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378947942
17	NC_016830	CAG	2	6	1010	1015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378947942
18	NC_016830	GTGC	2	8	1022	1029	0 %	25 %	50 %	25 %	378947942
19	NC_016830	TCG	2	6	1107	1112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378947942
20	NC_016830	CCAA	2	8	1122	1129	50 %	0 %	0 %	50 %	378947942
21	NC_016830	GGC	2	6	1199	1204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378947942
22	NC_016830	ATGC	2	8	1229	1236	25 %	25 %	25 %	25 %	378947942
23	NC_016830	AGA	2	6	1257	1262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378947942
24	NC_016830	CGA	2	6	1387	1392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378947942
25	NC_016830	TTC	2	6	1400	1405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378947942
26	NC_016830	GCA	2	6	1468	1473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378947942
27	NC_016830	GAAA	2	8	1501	1508	75 %	0 %	25 %	0 %	378947942
28	NC_016830	GAA	2	6	1520	1525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378947942
29	NC_016830	GCC	2	6	1570	1575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378947942
30	NC_016830	TGA	2	6	1602	1607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378947942
31	NC_016830	ACG	2	6	1641	1646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378947942
32	NC_016830	TTC	2	6	1652	1657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378947942
33	NC_016830	CGTG	2	8	1681	1688	0 %	25 %	50 %	25 %	378947942
34	NC_016830	CTG	2	6	1781	1786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378947942
35	NC_016830	TAC	2	6	1841	1846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378947942
36	NC_016830	CTG	2	6	1865	1870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378947942
37	NC_016830	CGTTCG	2	12	1880	1891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378947942
38	NC_016830	ACCA	2	8	1937	1944	50 %	0 %	0 %	50 %	378947942
39	NC_016830	ACCAC	2	10	1983	1992	40 %	0 %	0 %	60 %	378947942
40	NC_016830	CTG	2	6	2066	2071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378947942
41	NC_016830	TGA	2	6	2087	2092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378947942
42	NC_016830	CGT	2	6	2185	2190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378947943
43	NC_016830	CGC	2	6	2195	2200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378947943
44	NC_016830	TGC	2	6	2226	2231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378947943
45	NC_016830	GGTC	2	8	2287	2294	0 %	25 %	50 %	25 %	378947943
46	NC_016830	GAA	2	6	2306	2311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378947943
47	NC_016830	GC	3	6	2342	2347	0 %	0 %	50 %	50 %	378947943
48	NC_016830	ACG	2	6	2379	2384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378947943
49	NC_016830	GCCA	2	8	2461	2468	25 %	0 %	25 %	50 %	378947943
50	NC_016830	GAA	2	6	2486	2491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378947943
51	NC_016830	CAG	2	6	2570	2575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378947943
52	NC_016830	TTA	2	6	2584	2589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378947943
53	NC_016830	CCA	2	6	2701	2706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378947943
54	NC_016830	CTG	2	6	2747	2752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378947943
55	NC_016830	CAC	2	6	2792	2797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378947943
56	NC_016830	CCA	2	6	2805	2810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378947943
57	NC_016830	TGG	2	6	2838	2843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378947943
58	NC_016830	TGC	2	6	2871	2876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378947943
59	NC_016830	AAC	2	6	3014	3019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378947943
60	NC_016830	GAA	2	6	3029	3034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378947943
61	NC_016830	GAA	3	9	3038	3046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378947943
62	NC_016830	CGG	2	6	3064	3069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378947943
63	NC_016830	TGA	2	6	3120	3125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378947943
64	NC_016830	CAG	2	6	3163	3168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378947943
65	NC_016830	ACG	2	6	3192	3197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378947943
66	NC_016830	C	6	6	3323	3328	0 %	0 %	0 %	100 %	378947944
67	NC_016830	CGTT	2	8	3406	3413	0 %	50 %	25 %	25 %	378947944
68	NC_016830	GCA	2	6	3416	3421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378947944
69	NC_016830	GCC	2	6	3422	3427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378947944
70	NC_016830	GGC	2	6	3493	3498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378947944
71	NC_016830	GCT	2	6	3574	3579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378947944
72	NC_016830	CTG	2	6	3631	3636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378947944
73	NC_016830	GCCAG	2	10	3809	3818	20 %	0 %	40 %	40 %	378947944
74	NC_016830	CCG	2	6	3837	3842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378947944
75	NC_016830	TGGC	2	8	3965	3972	0 %	25 %	50 %	25 %	378947944
76	NC_016830	CAG	2	6	3988	3993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378947944
77	NC_016830	CGC	2	6	4056	4061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378947944
78	NC_016830	GCA	2	6	4080	4085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378947944
79	NC_016830	TGG	2	6	4091	4096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378947944
80	NC_016830	TG	3	6	4097	4102	0 %	50 %	50 %	0 %	378947944
81	NC_016830	TGG	2	6	4163	4168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378947944
82	NC_016830	CG	3	6	4204	4209	0 %	0 %	50 %	50 %	378947944
83	NC_016830	TCA	2	6	4247	4252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378947944
84	NC_016830	ATT	2	6	4269	4274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378947944
85	NC_016830	CGA	2	6	4463	4468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378947945
86	NC_016830	CAC	2	6	4482	4487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378947945
87	NC_016830	GGT	2	6	4499	4504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378947945
88	NC_016830	CGA	2	6	4517	4522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378947945
89	NC_016830	CGA	2	6	4541	4546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378947945
90	NC_016830	CAT	3	9	4553	4561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378947945
91	NC_016830	CCG	2	6	4639	4644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378947945
92	NC_016830	TCA	2	6	4651	4656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378947945
93	NC_016830	TCC	2	6	4663	4668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378947945
94	NC_016830	CGG	2	6	4673	4678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378947945
95	NC_016830	CGA	2	6	4685	4690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378947945
96	NC_016830	CGG	2	6	4709	4714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378947945
97	NC_016830	AAC	2	6	4756	4761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378947945
98	NC_016830	CGC	2	6	4776	4781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378947945
99	NC_016830	TCCT	2	8	4953	4960	0 %	50 %	0 %	50 %	378947945
100	NC_016830	TCG	2	6	5044	5049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378947945
101	NC_016830	CAA	2	6	5063	5068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378947945
102	NC_016830	TGT	2	6	5167	5172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378947945
103	NC_016830	CAA	2	6	5180	5185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378947945
104	NC_016830	CGG	2	6	5201	5206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378947945
105	NC_016830	TGG	2	6	5215	5220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378947945
106	NC_016830	AAC	2	6	5250	5255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378947945
107	NC_016830	GAA	2	6	5279	5284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378947945
108	NC_016830	CCA	2	6	5296	5301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378947945
109	NC_016830	ATC	2	6	5334	5339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378947945
110	NC_016830	AGTTC	2	10	5362	5371	20 %	40 %	20 %	20 %	378947945
111	NC_016830	CTG	2	6	5451	5456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378947945
112	NC_016830	CGAA	2	8	5464	5471	50 %	0 %	25 %	25 %	378947945
113	NC_016830	TGG	2	6	5479	5484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378947945
114	NC_016830	GAT	2	6	5492	5497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378947945
115	NC_016830	CGC	2	6	5501	5506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378947945
116	NC_016830	GC	3	6	5523	5528	0 %	0 %	50 %	50 %	378947945
117	NC_016830	CGC	2	6	5547	5552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378947945
118	NC_016830	GC	3	6	5557	5562	0 %	0 %	50 %	50 %	378947945
119	NC_016830	CCCTG	2	10	5612	5621	0 %	20 %	20 %	60 %	378947945
120	NC_016830	TGG	2	6	5635	5640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378947945
121	NC_016830	CTG	2	6	5650	5655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378947945
122	NC_016830	CCG	2	6	5681	5686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378947945
123	NC_016830	GC	3	6	5736	5741	0 %	0 %	50 %	50 %	378947945
124	NC_016830	GAT	2	6	5750	5755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378947945
125	NC_016830	TCC	2	6	5757	5762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378947945
126	NC_016830	ACA	2	6	5818	5823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378947945
127	NC_016830	CAT	4	12	5846	5857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378947945
128	NC_016830	CTG	3	9	5895	5903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378947945
129	NC_016830	CTT	3	9	5906	5914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378947945
130	NC_016830	CTACAT	2	12	5945	5956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378947945
131	NC_016830	GCC	2	6	5963	5968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378947945
132	NC_016830	GCAA	2	8	5989	5996	50 %	0 %	25 %	25 %	378947945
133	NC_016830	GAC	3	9	6012	6020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378947945
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158	NC_016830	ACC	2	6	7712	7717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378947946
159	NC_016830	CGG	2	6	7755	7760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378947946
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247	NC_016830	GCA	2	6	12262	12267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378947950
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252	NC_016830	CTC	2	6	12522	12527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378947950
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259	NC_016830	CAG	2	6	12904	12909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378947951
260	NC_016830	AC	3	6	12915	12920	50 %	0 %	0 %	50 %	378947951
261	NC_016830	GCAC	2	8	13022	13029	25 %	0 %	25 %	50 %	378947951
262	NC_016830	AGGT	2	8	13034	13041	25 %	25 %	50 %	0 %	378947951
263	NC_016830	CGCA	2	8	13072	13079	25 %	0 %	25 %	50 %	378947951
264	NC_016830	TGC	2	6	13134	13139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378947951
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267	NC_016830	CG	3	6	13225	13230	0 %	0 %	50 %	50 %	378947951
268	NC_016830	TGC	2	6	13251	13256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378947951
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280	NC_016830	GCA	2	6	13779	13784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378947951
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386	NC_016830	GCG	2	6	19821	19826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378947957
387	NC_016830	TGG	2	6	19838	19843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378947957
388	NC_016830	GGT	2	6	19844	19849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378947957
389	NC_016830	CAT	2	6	19856	19861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378947957
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393	NC_016830	CGT	2	6	20140	20145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378947958
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496	NC_016830	ACC	2	6	28252	28257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378947968
497	NC_016830	ACC	2	6	28311	28316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378947968
498	NC_016830	GGGC	2	8	28393	28400	0 %	0 %	75 %	25 %	378947968
499	NC_016830	GCA	2	6	28406	28411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378947968
500	NC_016830	GAT	2	6	28422	28427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378947968

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