MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pantoea ananatis LMG 5342 plasmid pPANA10

Total Repeats: 5014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016817	TCTG	2	8	45	52	0 %	50 %	25 %	25 %	378769297
2	NC_016817	GTG	2	6	65	70	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769297
3	NC_016817	CAA	2	6	90	95	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378769297
4	NC_016817	ATA	2	6	98	103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378769297
5	NC_016817	CCA	2	6	200	205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378769297
6	NC_016817	CT	4	8	220	227	0 %	50 %	0 %	50 %	378769297
7	NC_016817	TGGATA	2	12	275	286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378769297
8	NC_016817	TAT	2	6	309	314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378769297
9	NC_016817	CA	3	6	336	341	50 %	0 %	0 %	50 %	378769297
10	NC_016817	CTC	2	6	405	410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378769297
11	NC_016817	CGA	2	6	455	460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769297
12	NC_016817	CT	4	8	464	471	0 %	50 %	0 %	50 %	378769297
13	NC_016817	TTA	2	6	519	524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378769297
14	NC_016817	ACG	2	6	765	770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769297
15	NC_016817	CG	3	6	769	774	0 %	0 %	50 %	50 %	378769297
16	NC_016817	TCA	2	6	842	847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378769297
17	NC_016817	CAG	2	6	852	857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769297
18	NC_016817	GGAA	2	8	888	895	50 %	0 %	50 %	0 %	378769297
19	NC_016817	AGTA	2	8	2781	2788	50 %	25 %	25 %	0 %	378769298
20	NC_016817	GAT	2	6	2797	2802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378769298
21	NC_016817	CTA	2	6	2898	2903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378769298
22	NC_016817	GGC	2	6	2919	2924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769298
23	NC_016817	AG	3	6	2985	2990	50 %	0 %	50 %	0 %	378769298
24	NC_016817	GC	3	6	3009	3014	0 %	0 %	50 %	50 %	378769298
25	NC_016817	ATT	2	6	3055	3060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378769298
26	NC_016817	ATC	3	9	3068	3076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378769298
27	NC_016817	GCG	2	6	3077	3082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769298
28	NC_016817	GGC	2	6	3142	3147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769298
29	NC_016817	CTCACC	2	12	3194	3205	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	378769298
30	NC_016817	TGAT	2	8	3233	3240	25 %	50 %	25 %	0 %	378769298
31	NC_016817	TCT	2	6	3253	3258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378769298
32	NC_016817	ATT	2	6	3376	3381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378769298
33	NC_016817	TG	3	6	3446	3451	0 %	50 %	50 %	0 %	378769298
34	NC_016817	CATT	2	8	3474	3481	25 %	50 %	0 %	25 %	378769298
35	NC_016817	A	6	6	3514	3519	100 %	0 %	0 %	0 %	378769298
36	NC_016817	CTTCAT	2	12	3528	3539	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378769298
37	NC_016817	CGC	2	6	3582	3587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769298
38	NC_016817	CCT	2	6	3594	3599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378769298
39	NC_016817	ATT	2	6	3679	3684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378769298
40	NC_016817	CT	3	6	3739	3744	0 %	50 %	0 %	50 %	378769298
41	NC_016817	CGG	2	6	3792	3797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769298
42	NC_016817	GTAG	2	8	3892	3899	25 %	25 %	50 %	0 %	378769298
43	NC_016817	GCC	2	6	3928	3933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769298
44	NC_016817	CT	3	6	4058	4063	0 %	50 %	0 %	50 %	378769299
45	NC_016817	CAG	2	6	4241	4246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769299
46	NC_016817	TTC	2	6	4247	4252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378769299
47	NC_016817	ACG	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769299
48	NC_016817	CG	3	6	4310	4315	0 %	0 %	50 %	50 %	378769299
49	NC_016817	GCA	2	6	4316	4321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769299
50	NC_016817	TCA	2	6	4365	4370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378769299
51	NC_016817	CGG	2	6	4465	4470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769299
52	NC_016817	TC	3	6	4563	4568	0 %	50 %	0 %	50 %	378769299
53	NC_016817	TCAG	2	8	4579	4586	25 %	25 %	25 %	25 %	378769299
54	NC_016817	TGAG	2	8	4635	4642	25 %	25 %	50 %	0 %	378769299
55	NC_016817	TGT	2	6	4693	4698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769299
56	NC_016817	A	6	6	4732	4737	100 %	0 %	0 %	0 %	378769299
57	NC_016817	GATT	2	8	4749	4756	25 %	50 %	25 %	0 %	378769299
58	NC_016817	CT	3	6	4815	4820	0 %	50 %	0 %	50 %	378769299
59	NC_016817	GC	3	6	4847	4852	0 %	0 %	50 %	50 %	378769299
60	NC_016817	A	7	7	4853	4859	100 %	0 %	0 %	0 %	378769299
61	NC_016817	GAA	2	6	4866	4871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378769299
62	NC_016817	GAA	2	6	4945	4950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378769299
63	NC_016817	T	6	6	4999	5004	0 %	100 %	0 %	0 %	378769300
64	NC_016817	AAAT	2	8	5074	5081	75 %	25 %	0 %	0 %	378769300
65	NC_016817	AGACC	2	10	6098	6107	40 %	0 %	20 %	40 %	378769301
66	NC_016817	TC	3	6	8431	8436	0 %	50 %	0 %	50 %	378769302
67	NC_016817	GA	3	6	8496	8501	50 %	0 %	50 %	0 %	378769302
68	NC_016817	AAT	2	6	8545	8550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378769302
69	NC_016817	GTAA	2	8	8584	8591	50 %	25 %	25 %	0 %	378769302
70	NC_016817	CCA	2	6	8635	8640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378769302
71	NC_016817	ACT	2	6	8642	8647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378769302
72	NC_016817	TGT	2	6	8826	8831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769303
73	NC_016817	T	6	6	8835	8840	0 %	100 %	0 %	0 %	378769303
74	NC_016817	GTC	2	6	8872	8877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769303
75	NC_016817	AT	3	6	8883	8888	50 %	50 %	0 %	0 %	378769303
76	NC_016817	CAGC	2	8	8899	8906	25 %	0 %	25 %	50 %	378769303
77	NC_016817	AAT	2	6	9151	9156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378769304
78	NC_016817	TGC	2	6	9237	9242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769304
79	NC_016817	AG	3	6	9243	9248	50 %	0 %	50 %	0 %	378769304
80	NC_016817	GCC	2	6	9258	9263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769304
81	NC_016817	CAT	2	6	9437	9442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378769304
82	NC_016817	AT	3	6	9458	9463	50 %	50 %	0 %	0 %	378769305
83	NC_016817	TTG	2	6	9467	9472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769305
84	NC_016817	AGC	2	6	9479	9484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769305
85	NC_016817	TGC	2	6	9508	9513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769305
86	NC_016817	CTG	4	12	9514	9525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769305
87	NC_016817	GGCCA	2	10	9565	9574	20 %	0 %	40 %	40 %	378769305
88	NC_016817	T	6	6	9588	9593	0 %	100 %	0 %	0 %	378769305
89	NC_016817	GTA	2	6	9691	9696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378769305
90	NC_016817	CCA	2	6	9730	9735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378769305
91	NC_016817	GGC	2	6	9757	9762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769305
92	NC_016817	AGA	3	9	10141	10149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378769306
93	NC_016817	GATA	2	8	10170	10177	50 %	25 %	25 %	0 %	378769306
94	NC_016817	TCTGGC	2	12	10178	10189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769306
95	NC_016817	T	6	6	10241	10246	0 %	100 %	0 %	0 %	378769306
96	NC_016817	CA	3	6	10251	10256	50 %	0 %	0 %	50 %	378769306
97	NC_016817	TAC	2	6	10357	10362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378769307
98	NC_016817	ATT	2	6	10376	10381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378769307
99	NC_016817	TCT	2	6	10410	10415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378769307
100	NC_016817	TTG	2	6	10505	10510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769307
101	NC_016817	GCATT	2	10	10611	10620	20 %	40 %	20 %	20 %	378769307
102	NC_016817	ATC	2	6	10633	10638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378769307
103	NC_016817	AGC	2	6	10683	10688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769307
104	NC_016817	TAT	2	6	10710	10715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378769307
105	NC_016817	T	6	6	10717	10722	0 %	100 %	0 %	0 %	378769307
106	NC_016817	TTA	2	6	10824	10829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378769307
107	NC_016817	A	6	6	10843	10848	100 %	0 %	0 %	0 %	378769307
108	NC_016817	GGT	2	6	11272	11277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769308
109	NC_016817	GC	3	6	11386	11391	0 %	0 %	50 %	50 %	378769308
110	NC_016817	T	6	6	11398	11403	0 %	100 %	0 %	0 %	378769308
111	NC_016817	CAA	2	6	11454	11459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378769309
112	NC_016817	AC	3	6	11513	11518	50 %	0 %	0 %	50 %	378769310
113	NC_016817	TCA	2	6	11584	11589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378769310
114	NC_016817	GAT	2	6	11622	11627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378769310
115	NC_016817	AGC	2	6	11683	11688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769310
116	NC_016817	A	6	6	11724	11729	100 %	0 %	0 %	0 %	378769310
117	NC_016817	GAT	2	6	11733	11738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378769310
118	NC_016817	T	6	6	11914	11919	0 %	100 %	0 %	0 %	378769311
119	NC_016817	TGG	2	6	11929	11934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769311
120	NC_016817	CGT	2	6	11937	11942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769311
121	NC_016817	CGG	2	6	11981	11986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769311
122	NC_016817	CAA	2	6	12021	12026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378769311
123	NC_016817	T	6	6	12171	12176	0 %	100 %	0 %	0 %	378769311
124	NC_016817	CTT	2	6	12177	12182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378769311
125	NC_016817	TGC	2	6	12414	12419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769312
126	NC_016817	GC	3	6	12492	12497	0 %	0 %	50 %	50 %	378769312
127	NC_016817	CAA	3	9	12505	12513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378769312
128	NC_016817	CTG	2	6	12530	12535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769312
129	NC_016817	TAT	2	6	12580	12585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378769312
130	NC_016817	CGT	2	6	12863	12868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769313
131	NC_016817	CAT	2	6	12968	12973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378769313
132	NC_016817	TGAT	2	8	13057	13064	25 %	50 %	25 %	0 %	378769313
133	NC_016817	GAT	2	6	13092	13097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378769313
134	NC_016817	TGC	2	6	13111	13116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769313
135	NC_016817	ATG	2	6	13489	13494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378769314
136	NC_016817	TTA	2	6	13505	13510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378769314
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259	NC_016817	TTGG	2	8	19854	19861	0 %	50 %	50 %	0 %	378769320
260	NC_016817	CGAT	2	8	19883	19890	25 %	25 %	25 %	25 %	378769320
261	NC_016817	CCG	2	6	20055	20060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769320
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264	NC_016817	GCCA	2	8	20219	20226	25 %	0 %	25 %	50 %	378769320
265	NC_016817	ACTC	2	8	20266	20273	25 %	25 %	0 %	50 %	378769320
266	NC_016817	CATC	2	8	20287	20294	25 %	25 %	0 %	50 %	378769320
267	NC_016817	GCT	2	6	20332	20337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769320
268	NC_016817	GGC	2	6	20372	20377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769320
269	NC_016817	TGAA	2	8	20430	20437	50 %	25 %	25 %	0 %	378769320
270	NC_016817	TTG	2	6	20484	20489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769320
271	NC_016817	GTGG	2	8	20590	20597	0 %	25 %	75 %	0 %	378769320
272	NC_016817	GGC	2	6	20636	20641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769320
273	NC_016817	AAT	2	6	20675	20680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378769320
274	NC_016817	CAC	2	6	20725	20730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378769320
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276	NC_016817	CGG	3	9	20948	20956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769321
277	NC_016817	GCC	2	6	20963	20968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769321
278	NC_016817	CTG	2	6	20998	21003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769321
279	NC_016817	TCC	2	6	21026	21031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378769321
280	NC_016817	GGCAAG	2	12	21048	21059	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378769321
281	NC_016817	TTG	2	6	21074	21079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769321
282	NC_016817	TGC	2	6	21110	21115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769321
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284	NC_016817	GTCA	2	8	21142	21149	25 %	25 %	25 %	25 %	378769321
285	NC_016817	AGC	2	6	21168	21173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769321
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292	NC_016817	ATG	2	6	21612	21617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378769322
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296	NC_016817	GGC	2	6	21774	21779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769322
297	NC_016817	TGG	2	6	21793	21798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769322
298	NC_016817	GCG	2	6	21823	21828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769322
299	NC_016817	GTT	2	6	21830	21835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769322
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302	NC_016817	TGG	2	6	22000	22005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769322
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362	NC_016817	CCG	2	6	25197	25202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769324
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375	NC_016817	CTGC	2	8	25723	25730	0 %	25 %	25 %	50 %	378769324
376	NC_016817	T	6	6	25763	25768	0 %	100 %	0 %	0 %	378769324
377	NC_016817	ATT	2	6	25770	25775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378769324
378	NC_016817	T	6	6	25774	25779	0 %	100 %	0 %	0 %	378769324
379	NC_016817	ATC	2	6	25785	25790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378769324
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387	NC_016817	TGA	2	6	26675	26680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378769325
388	NC_016817	GCG	2	6	26831	26836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769325
389	NC_016817	ATG	2	6	26848	26853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378769325
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