MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudovibrio sp. FO-BEG1 plasmid unnamed

Total Repeats: 7560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016646	CAG	2	6	235683	235688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333637
4002	NC_016646	CTCG	2	8	235743	235750	0 %	25 %	25 %	50 %	374333637
4003	NC_016646	CGA	2	6	235880	235885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333637
4004	NC_016646	GAA	2	6	235947	235952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333637
4005	NC_016646	GGC	2	6	235953	235958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374333637
4006	NC_016646	TCG	2	6	235960	235965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333637
4007	NC_016646	TGA	2	6	236038	236043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333637
4008	NC_016646	GGC	3	9	236096	236104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374333637
4009	NC_016646	CCA	2	6	236177	236182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374333637
4010	NC_016646	ACCC	2	8	236206	236213	25 %	0 %	0 %	75 %	374333637
4011	NC_016646	GGTGT	2	10	236214	236223	0 %	40 %	60 %	0 %	374333637
4012	NC_016646	ACT	2	6	236281	236286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333637
4013	NC_016646	CCT	2	6	236294	236299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374333637
4014	NC_016646	CAG	2	6	236356	236361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333637
4015	NC_016646	CTT	2	6	236456	236461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374333637
4016	NC_016646	GCCC	2	8	236510	236517	0 %	0 %	25 %	75 %	374333637
4017	NC_016646	CG	3	6	236574	236579	0 %	0 %	50 %	50 %	374333637
4018	NC_016646	GAA	3	9	236607	236615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333637
4019	NC_016646	GAG	2	6	236628	236633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374333637
4020	NC_016646	AGA	2	6	237191	237196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333638
4021	NC_016646	AG	3	6	237237	237242	50 %	0 %	50 %	0 %	374333638
4022	NC_016646	GCAGA	2	10	237243	237252	40 %	0 %	40 %	20 %	374333638
4023	NC_016646	GCA	2	6	237260	237265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333638
4024	NC_016646	ATT	2	6	237444	237449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374333638
4025	NC_016646	TCTT	2	8	237458	237465	0 %	75 %	0 %	25 %	374333638
4026	NC_016646	TTTGA	2	10	237471	237480	20 %	60 %	20 %	0 %	374333638
4027	NC_016646	TCT	2	6	237516	237521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374333638
4028	NC_016646	ATTG	2	8	237567	237574	25 %	50 %	25 %	0 %	374333638
4029	NC_016646	TGT	2	6	237643	237648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374333638
4030	NC_016646	GGT	2	6	237708	237713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374333638
4031	NC_016646	GTACTC	2	12	237717	237728	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374333638
4032	NC_016646	TTG	2	6	237904	237909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374333638
4033	NC_016646	ACG	2	6	237983	237988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333638
4034	NC_016646	AATC	2	8	238066	238073	50 %	25 %	0 %	25 %	374333638
4035	NC_016646	CCAG	2	8	238098	238105	25 %	0 %	25 %	50 %	374333638
4036	NC_016646	TCA	3	9	238252	238260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333638
4037	NC_016646	AG	3	6	238315	238320	50 %	0 %	50 %	0 %	374333638
4038	NC_016646	CTT	2	6	238326	238331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374333638
4039	NC_016646	GC	3	6	238333	238338	0 %	0 %	50 %	50 %	374333638
4040	NC_016646	AAG	2	6	238345	238350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333638
4041	NC_016646	TTG	2	6	238354	238359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374333638
4042	NC_016646	A	6	6	238411	238416	100 %	0 %	0 %	0 %	374333638
4043	NC_016646	GGCA	2	8	238610	238617	25 %	0 %	50 %	25 %	374333638
4044	NC_016646	TGGT	2	8	238697	238704	0 %	50 %	50 %	0 %	374333638
4045	NC_016646	GAA	2	6	238737	238742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333638
4046	NC_016646	A	6	6	238748	238753	100 %	0 %	0 %	0 %	374333638
4047	NC_016646	GC	3	6	238885	238890	0 %	0 %	50 %	50 %	374333638
4048	NC_016646	GCT	2	6	238902	238907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333638
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4050	NC_016646	GCA	2	6	238968	238973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333638
4051	NC_016646	GC	3	6	238995	239000	0 %	0 %	50 %	50 %	374333638
4052	NC_016646	TTG	2	6	239005	239010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374333638
4053	NC_016646	AGA	2	6	239084	239089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333638
4054	NC_016646	TGG	2	6	239301	239306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374333638
4055	NC_016646	CAT	2	6	239375	239380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333638
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4057	NC_016646	TGG	2	6	239509	239514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374333638
4058	NC_016646	TTG	2	6	239524	239529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374333638
4059	NC_016646	CAAAA	2	10	239607	239616	80 %	0 %	0 %	20 %	374333638
4060	NC_016646	G	7	7	239662	239668	0 %	0 %	100 %	0 %	374333638
4061	NC_016646	ACA	2	6	239698	239703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374333638
4062	NC_016646	GAC	2	6	239717	239722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333638
4063	NC_016646	GAT	2	6	239777	239782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333638
4064	NC_016646	GCA	2	6	239817	239822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333638
4065	NC_016646	CTT	2	6	239827	239832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374333638
4066	NC_016646	GTG	2	6	239974	239979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374333638
4067	NC_016646	ACA	2	6	240024	240029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374333638
4068	NC_016646	TCA	2	6	240067	240072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333638
4069	NC_016646	GAG	2	6	240081	240086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374333638
4070	NC_016646	GCT	2	6	240096	240101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333638
4071	NC_016646	TCTG	2	8	240185	240192	0 %	50 %	25 %	25 %	374333638
4072	NC_016646	ATCC	2	8	240228	240235	25 %	25 %	0 %	50 %	374333638
4073	NC_016646	AAC	2	6	240284	240289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374333638
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4076	NC_016646	TGA	2	6	240434	240439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333638
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4079	NC_016646	TCTGA	2	10	240513	240522	20 %	40 %	20 %	20 %	374333638
4080	NC_016646	TCTGC	2	10	240537	240546	0 %	40 %	20 %	40 %	374333638
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4088	NC_016646	GCG	2	6	240807	240812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374333638
4089	NC_016646	ACTG	2	8	240813	240820	25 %	25 %	25 %	25 %	374333638
4090	NC_016646	GATTT	2	10	240832	240841	20 %	60 %	20 %	0 %	374333638
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4100	NC_016646	CA	3	6	241365	241370	50 %	0 %	0 %	50 %	374333638
4101	NC_016646	TCAAG	2	10	241540	241549	40 %	20 %	20 %	20 %	374333638
4102	NC_016646	CTGG	2	8	241556	241563	0 %	25 %	50 %	25 %	374333638
4103	NC_016646	TCAGT	2	10	241565	241574	20 %	40 %	20 %	20 %	374333638
4104	NC_016646	CAATTG	2	12	241594	241605	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	374333638
4105	NC_016646	GTT	2	6	241629	241634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374333638
4106	NC_016646	AGC	3	9	241669	241677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333638
4107	NC_016646	GATA	2	8	241697	241704	50 %	25 %	25 %	0 %	374333638
4108	NC_016646	TGAA	2	8	241834	241841	50 %	25 %	25 %	0 %	374333638
4109	NC_016646	ATC	2	6	241902	241907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333638
4110	NC_016646	TGA	2	6	241954	241959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333638
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4112	NC_016646	TGC	2	6	242078	242083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333638
4113	NC_016646	GAAC	2	8	242216	242223	50 %	0 %	25 %	25 %	374333638
4114	NC_016646	TTC	2	6	242224	242229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374333638
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4116	NC_016646	AACTT	2	10	242308	242317	40 %	40 %	0 %	20 %	374333638
4117	NC_016646	ACC	2	6	242338	242343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374333638
4118	NC_016646	GCA	2	6	242403	242408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333638
4119	NC_016646	GTGAT	2	10	242425	242434	20 %	40 %	40 %	0 %	374333638
4120	NC_016646	TGC	2	6	242449	242454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333638
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4122	NC_016646	TGG	2	6	242582	242587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374333638
4123	NC_016646	CTC	2	6	242591	242596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374333638
4124	NC_016646	TAC	2	6	242691	242696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333638
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4229	NC_016646	GAGCT	2	10	249023	249032	20 %	20 %	40 %	20 %	374333642
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4231	NC_016646	AG	3	6	249153	249158	50 %	0 %	50 %	0 %	374333642
4232	NC_016646	AGC	2	6	249218	249223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333642
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4236	NC_016646	ACA	2	6	249382	249387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374333642
4237	NC_016646	TCT	2	6	249406	249411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374333642
4238	NC_016646	GAA	2	6	249436	249441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333642
4239	NC_016646	GTT	2	6	249445	249450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374333642
4240	NC_016646	GCA	2	6	249481	249486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333642
4241	NC_016646	CAA	2	6	249526	249531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374333642
4242	NC_016646	TCC	2	6	249552	249557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374333642
4243	NC_016646	CGT	2	6	249586	249591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333642
4244	NC_016646	GGT	2	6	250687	250692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374333643
4245	NC_016646	TTG	2	6	250730	250735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374333643
4246	NC_016646	TTG	2	6	250775	250780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374333643
4247	NC_016646	CCG	2	6	250910	250915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374333643
4248	NC_016646	TGA	2	6	250944	250949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333643
4249	NC_016646	AAACT	2	10	250958	250967	60 %	20 %	0 %	20 %	374333643
4250	NC_016646	GAAC	2	8	251002	251009	50 %	0 %	25 %	25 %	374333643
4251	NC_016646	A	6	6	251013	251018	100 %	0 %	0 %	0 %	374333643
4252	NC_016646	AGA	2	6	251076	251081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333643
4253	NC_016646	AGT	2	6	251114	251119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333643
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4255	NC_016646	GTTGG	2	10	251265	251274	0 %	40 %	60 %	0 %	374333644
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4257	NC_016646	TGAT	2	8	251329	251336	25 %	50 %	25 %	0 %	374333644
4258	NC_016646	TAT	2	6	251361	251366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374333644
4259	NC_016646	CGG	2	6	251373	251378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374333644
4260	NC_016646	ATC	2	6	251383	251388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333644
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4264	NC_016646	TAT	2	6	251673	251678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374333644
4265	NC_016646	TTG	2	6	251767	251772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374333644
4266	NC_016646	ACT	2	6	251785	251790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333644
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4272	NC_016646	AGC	2	6	251981	251986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333644
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4276	NC_016646	AGGC	2	8	252284	252291	25 %	0 %	50 %	25 %	374333644
4277	NC_016646	GCTG	2	8	252293	252300	0 %	25 %	50 %	25 %	374333644
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4280	NC_016646	TGC	3	9	252462	252470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333645
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4284	NC_016646	GACT	2	8	252580	252587	25 %	25 %	25 %	25 %	374333645
4285	NC_016646	CTG	2	6	252668	252673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333645
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4300	NC_016646	CTG	2	6	253429	253434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333645
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4325	NC_016646	GACG	2	8	254979	254986	25 %	0 %	50 %	25 %	374333647
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4332	NC_016646	CAT	2	6	255339	255344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333647
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4352	NC_016646	C	6	6	256743	256748	0 %	0 %	0 %	100 %	374333651
4353	NC_016646	AAAC	2	8	256796	256803	75 %	0 %	0 %	25 %	374333651
4354	NC_016646	GAA	2	6	256822	256827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333651
4355	NC_016646	CTGAT	2	10	256892	256901	20 %	40 %	20 %	20 %	374333651
4356	NC_016646	GAA	2	6	256915	256920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333651
4357	NC_016646	GCT	2	6	256959	256964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333651
4358	NC_016646	ACC	2	6	256982	256987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374333651
4359	NC_016646	CAA	2	6	257001	257006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374333651
4360	NC_016646	GCA	2	6	257058	257063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333651
4361	NC_016646	GAA	2	6	257116	257121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333651
4362	NC_016646	TGC	2	6	257156	257161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333651
4363	NC_016646	TC	3	6	257270	257275	0 %	50 %	0 %	50 %	374333651
4364	NC_016646	GCA	2	6	257352	257357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333651
4365	NC_016646	CAC	2	6	257416	257421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374333651
4366	NC_016646	TTGA	2	8	257488	257495	25 %	50 %	25 %	0 %	374333651
4367	NC_016646	CAC	2	6	257502	257507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374333651
4368	NC_016646	GCC	3	9	257530	257538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374333651
4369	NC_016646	AGA	2	6	257588	257593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333651
4370	NC_016646	AGA	2	6	257598	257603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333651
4371	NC_016646	ATG	2	6	257624	257629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333651
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4373	NC_016646	CCG	2	6	257701	257706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374333651
4374	NC_016646	CGC	2	6	257722	257727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374333651
4375	NC_016646	CAG	2	6	257730	257735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333651
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4377	NC_016646	CAT	2	6	257874	257879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333651
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4379	NC_016646	AACC	2	8	258041	258048	50 %	0 %	0 %	50 %	374333651
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4382	NC_016646	GGCA	2	8	258314	258321	25 %	0 %	50 %	25 %	374333652
4383	NC_016646	ATC	2	6	258323	258328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333652
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4385	NC_016646	TTC	2	6	258421	258426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374333652
4386	NC_016646	GCCT	2	8	258475	258482	0 %	25 %	25 %	50 %	374333652
4387	NC_016646	CAA	2	6	258484	258489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374333652
4388	NC_016646	TCA	2	6	258582	258587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333652
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4392	NC_016646	ATG	2	6	258856	258861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333653
4393	NC_016646	TGCC	2	8	258943	258950	0 %	25 %	25 %	50 %	374333653
4394	NC_016646	CTG	2	6	259026	259031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333653
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4397	NC_016646	TGA	2	6	259181	259186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333653
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4436	NC_016646	GACC	2	8	261454	261461	25 %	0 %	25 %	50 %	374333655
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4465	NC_016646	GCT	2	6	263595	263600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333657
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4480	NC_016646	CAC	2	6	264540	264545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374333658
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4482	NC_016646	TCA	2	6	264749	264754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333658
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4484	NC_016646	CCA	2	6	264860	264865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374333658
4485	NC_016646	TGA	2	6	264881	264886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333658
4486	NC_016646	AGGT	2	8	264889	264896	25 %	25 %	50 %	0 %	374333658
4487	NC_016646	AAT	2	6	264984	264989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374333658
4488	NC_016646	GCC	2	6	265041	265046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374333658
4489	NC_016646	GCA	2	6	265160	265165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333658
4490	NC_016646	ATG	2	6	265174	265179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333658
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4497	NC_016646	GCAG	2	8	265556	265563	25 %	0 %	50 %	25 %	374333658
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4500	NC_016646	CG	4	8	265777	265784	0 %	0 %	50 %	50 %	374333658

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