MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudovibrio sp. FO-BEG1 plasmid unnamed

Total Repeats: 7560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016646	ACC	2	6	175906	175911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374333576
3002	NC_016646	GAC	2	6	175940	175945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333576
3003	NC_016646	CAG	2	6	176272	176277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333577
3004	NC_016646	GC	3	6	176468	176473	0 %	0 %	50 %	50 %	374333577
3005	NC_016646	AGA	2	6	176523	176528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333577
3006	NC_016646	GAAC	2	8	176569	176576	50 %	0 %	25 %	25 %	374333577
3007	NC_016646	AAAAT	2	10	176640	176649	80 %	20 %	0 %	0 %	374333577
3008	NC_016646	AAC	2	6	176710	176715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374333578
3009	NC_016646	GAC	2	6	176722	176727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333578
3010	NC_016646	AAG	2	6	176729	176734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333578
3011	NC_016646	TGA	2	6	176766	176771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333578
3012	NC_016646	AAG	2	6	176798	176803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333578
3013	NC_016646	AAG	2	6	176911	176916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333578
3014	NC_016646	TCG	2	6	176946	176951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333578
3015	NC_016646	AGC	2	6	177003	177008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333578
3016	NC_016646	TGG	2	6	177049	177054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374333578
3017	NC_016646	CGC	2	6	177178	177183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374333578
3018	NC_016646	TTC	2	6	177191	177196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374333578
3019	NC_016646	ATG	2	6	177224	177229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333578
3020	NC_016646	GGT	2	6	177253	177258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374333578
3021	NC_016646	CAAG	2	8	177302	177309	50 %	0 %	25 %	25 %	374333578
3022	NC_016646	GTG	2	6	177322	177327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374333578
3023	NC_016646	GA	3	6	177331	177336	50 %	0 %	50 %	0 %	374333578
3024	NC_016646	ATG	2	6	177362	177367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333578
3025	NC_016646	AG	3	6	177379	177384	50 %	0 %	50 %	0 %	374333578
3026	NC_016646	GA	3	6	177428	177433	50 %	0 %	50 %	0 %	374333578
3027	NC_016646	GAA	2	6	177517	177522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333578
3028	NC_016646	TAC	2	6	177532	177537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333578
3029	NC_016646	GCA	2	6	177640	177645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333578
3030	NC_016646	GAAA	2	8	177826	177833	75 %	0 %	25 %	0 %	374333579
3031	NC_016646	TCT	2	6	177869	177874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374333579
3032	NC_016646	CAAC	2	8	177926	177933	50 %	0 %	0 %	50 %	374333579
3033	NC_016646	AG	3	6	178005	178010	50 %	0 %	50 %	0 %	374333579
3034	NC_016646	TTC	2	6	178070	178075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374333579
3035	NC_016646	GCT	2	6	178104	178109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333579
3036	NC_016646	ACT	2	6	178172	178177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333579
3037	NC_016646	AAGCA	2	10	178187	178196	60 %	0 %	20 %	20 %	374333579
3038	NC_016646	AG	3	6	178265	178270	50 %	0 %	50 %	0 %	374333579
3039	NC_016646	ACA	2	6	178308	178313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374333579
3040	NC_016646	TTA	2	6	178327	178332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374333579
3041	NC_016646	GGA	2	6	178338	178343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374333579
3042	NC_016646	GGC	2	6	178350	178355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374333579
3043	NC_016646	AGG	2	6	178697	178702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374333579
3044	NC_016646	CAAT	2	8	178720	178727	50 %	25 %	0 %	25 %	374333579
3045	NC_016646	CTA	2	6	178729	178734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333579
3046	NC_016646	CAG	2	6	178771	178776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333579
3047	NC_016646	TGA	2	6	178805	178810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333579
3048	NC_016646	ATG	2	6	178825	178830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333579
3049	NC_016646	CAACA	2	10	178931	178940	60 %	0 %	0 %	40 %	374333579
3050	NC_016646	TTG	2	6	178960	178965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374333579
3051	NC_016646	CAA	2	6	178981	178986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374333579
3052	NC_016646	TAC	2	6	179057	179062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333579
3053	NC_016646	GGC	2	6	179111	179116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374333579
3054	NC_016646	TTC	2	6	179211	179216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374333579
3055	NC_016646	AAG	2	6	179229	179234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333579
3056	NC_016646	AAC	2	6	179250	179255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374333579
3057	NC_016646	TCG	2	6	179296	179301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333579
3058	NC_016646	GCT	2	6	179350	179355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333579
3059	NC_016646	GGA	2	6	179361	179366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374333579
3060	NC_016646	A	6	6	179374	179379	100 %	0 %	0 %	0 %	374333579
3061	NC_016646	CAG	2	6	179446	179451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333579
3062	NC_016646	TCG	2	6	179477	179482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333579
3063	NC_016646	CTC	2	6	179510	179515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374333579
3064	NC_016646	CAG	2	6	179545	179550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333579
3065	NC_016646	ATG	2	6	179569	179574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333579
3066	NC_016646	TTAC	2	8	179596	179603	25 %	50 %	0 %	25 %	374333579
3067	NC_016646	TTCCAG	2	12	179676	179687	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374333579
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3069	NC_016646	AAT	2	6	179721	179726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374333579
3070	NC_016646	GAC	2	6	179808	179813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333579
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3073	NC_016646	ATG	2	6	180109	180114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333579
3074	NC_016646	AAGT	2	8	180119	180126	50 %	25 %	25 %	0 %	374333579
3075	NC_016646	GAA	2	6	180252	180257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333579
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3081	NC_016646	ATG	2	6	180490	180495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333579
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3085	NC_016646	GTC	2	6	180661	180666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333579
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3091	NC_016646	TGA	2	6	181018	181023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333580
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3095	NC_016646	GGA	2	6	181567	181572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374333580
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3101	NC_016646	CAGGT	2	10	182050	182059	20 %	20 %	40 %	20 %	374333581
3102	NC_016646	CGA	2	6	182076	182081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333581
3103	NC_016646	CAG	2	6	182161	182166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333581
3104	NC_016646	TTTC	2	8	182175	182182	0 %	75 %	0 %	25 %	374333581
3105	NC_016646	TGT	2	6	182190	182195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374333581
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3107	NC_016646	TTG	2	6	182219	182224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374333581
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3109	NC_016646	TGA	2	6	182277	182282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333581
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3113	NC_016646	TGCC	2	8	182454	182461	0 %	25 %	25 %	50 %	374333581
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3120	NC_016646	GCA	2	6	182814	182819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333581
3121	NC_016646	CAA	2	6	182850	182855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374333581
3122	NC_016646	GTG	2	6	182915	182920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374333581
3123	NC_016646	GA	3	6	182942	182947	50 %	0 %	50 %	0 %	374333581
3124	NC_016646	CATC	2	8	183000	183007	25 %	25 %	0 %	50 %	374333581
3125	NC_016646	GCGT	2	8	183033	183040	0 %	25 %	50 %	25 %	374333581
3126	NC_016646	TCA	2	6	183056	183061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333581
3127	NC_016646	ACC	2	6	183104	183109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374333581
3128	NC_016646	TTC	2	6	183142	183147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374333581
3129	NC_016646	GTT	2	6	183332	183337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374333581
3130	NC_016646	CTG	2	6	183429	183434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333581
3131	NC_016646	CTG	2	6	183646	183651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333582
3132	NC_016646	CGAC	2	8	183680	183687	25 %	0 %	25 %	50 %	374333582
3133	NC_016646	GTT	2	6	183792	183797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374333582
3134	NC_016646	GA	3	6	183898	183903	50 %	0 %	50 %	0 %	374333582
3135	NC_016646	TTCC	2	8	183932	183939	0 %	50 %	0 %	50 %	374333582
3136	NC_016646	AGA	2	6	183956	183961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333582
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3138	NC_016646	GCA	2	6	184060	184065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333582
3139	NC_016646	ATG	2	6	184135	184140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333582
3140	NC_016646	GA	3	6	184192	184197	50 %	0 %	50 %	0 %	374333582
3141	NC_016646	CTGG	2	8	184283	184290	0 %	25 %	50 %	25 %	374333582
3142	NC_016646	GCA	2	6	184627	184632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333583
3143	NC_016646	TAC	2	6	184665	184670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333583
3144	NC_016646	CAATC	2	10	184671	184680	40 %	20 %	0 %	40 %	374333583
3145	NC_016646	GTT	2	6	184684	184689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374333583
3146	NC_016646	CAAT	2	8	184692	184699	50 %	25 %	0 %	25 %	374333583
3147	NC_016646	CAG	2	6	184790	184795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333583
3148	NC_016646	ATG	2	6	184865	184870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333583
3149	NC_016646	GAT	2	6	184897	184902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333583
3150	NC_016646	AGAT	2	8	185140	185147	50 %	25 %	25 %	0 %	374333584
3151	NC_016646	AGCA	2	8	185244	185251	50 %	0 %	25 %	25 %	374333584
3152	NC_016646	AGA	2	6	185264	185269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333584
3153	NC_016646	AGAT	2	8	185344	185351	50 %	25 %	25 %	0 %	374333584
3154	NC_016646	AAG	2	6	185383	185388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333584
3155	NC_016646	GTT	2	6	185461	185466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374333584
3156	NC_016646	GCA	2	6	185515	185520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333584
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3159	NC_016646	ATC	2	6	185584	185589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333584
3160	NC_016646	TGCGC	2	10	185714	185723	0 %	20 %	40 %	40 %	374333585
3161	NC_016646	TCA	2	6	185749	185754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333585
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3201	NC_016646	GCA	2	6	187727	187732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333588
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3212	NC_016646	CGC	2	6	188460	188465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374333589
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3214	NC_016646	GCT	2	6	188550	188555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333589
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3218	NC_016646	ACG	2	6	188689	188694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333589
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3220	NC_016646	GGT	2	6	188827	188832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374333590
3221	NC_016646	GGCA	2	8	189222	189229	25 %	0 %	50 %	25 %	374333590
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3225	NC_016646	AAT	2	6	189405	189410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374333590
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3227	NC_016646	TC	3	6	189710	189715	0 %	50 %	0 %	50 %	374333591
3228	NC_016646	CT	3	6	189731	189736	0 %	50 %	0 %	50 %	374333591
3229	NC_016646	TGA	2	6	189752	189757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333591
3230	NC_016646	GTT	2	6	189852	189857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374333591
3231	NC_016646	GCA	2	6	189868	189873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333591
3232	NC_016646	ACG	2	6	189897	189902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333591
3233	NC_016646	ATC	2	6	189937	189942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333591
3234	NC_016646	GCC	2	6	189979	189984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374333591
3235	NC_016646	CTG	2	6	189996	190001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333591
3236	NC_016646	TGA	2	6	190010	190015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333591
3237	NC_016646	TGA	2	6	190022	190027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333591
3238	NC_016646	CATG	2	8	190091	190098	25 %	25 %	25 %	25 %	374333591
3239	NC_016646	CAT	2	6	190136	190141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333591
3240	NC_016646	TCT	2	6	190219	190224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374333591
3241	NC_016646	ATT	2	6	190242	190247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374333591
3242	NC_016646	GCT	2	6	190324	190329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333591
3243	NC_016646	TG	3	6	190345	190350	0 %	50 %	50 %	0 %	374333591
3244	NC_016646	GTG	3	9	190348	190356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374333591
3245	NC_016646	CTT	2	6	190418	190423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374333591
3246	NC_016646	CTGA	2	8	190464	190471	25 %	25 %	25 %	25 %	374333591
3247	NC_016646	GAAG	2	8	190526	190533	50 %	0 %	50 %	0 %	374333591
3248	NC_016646	AAGG	2	8	190611	190618	50 %	0 %	50 %	0 %	374333591
3249	NC_016646	ATG	2	6	190639	190644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333591
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3252	NC_016646	TGC	2	6	190738	190743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333591
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3255	NC_016646	AGC	2	6	190927	190932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333591
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3261	NC_016646	TGA	2	6	191439	191444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333592
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3281	NC_016646	AATT	2	8	192735	192742	50 %	50 %	0 %	0 %	374333594
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3353	NC_016646	CAAA	2	8	196918	196925	75 %	0 %	0 %	25 %	374333599
3354	NC_016646	CAG	2	6	196961	196966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333599
3355	NC_016646	CAAT	2	8	196971	196978	50 %	25 %	0 %	25 %	374333599
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3359	NC_016646	CAT	3	9	197134	197142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333599
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3361	NC_016646	TCA	2	6	197211	197216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333599
3362	NC_016646	CCT	2	6	197280	197285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374333599
3363	NC_016646	TGCG	2	8	197301	197308	0 %	25 %	50 %	25 %	374333599
3364	NC_016646	TGG	2	6	197359	197364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374333599
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3366	NC_016646	CAT	2	6	197476	197481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333599
3367	NC_016646	CAT	2	6	197503	197508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333599
3368	NC_016646	GCT	2	6	197799	197804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333599
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3370	NC_016646	CCA	2	6	197896	197901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374333599
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3383	NC_016646	GAA	2	6	198568	198573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333600
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3435	NC_016646	GTGA	2	8	201478	201485	25 %	25 %	50 %	0 %	374333602
3436	NC_016646	GCA	2	6	201535	201540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333603
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3455	NC_016646	TCA	2	6	203157	203162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333605
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3469	NC_016646	TCACC	2	10	204272	204281	20 %	20 %	0 %	60 %	374333606
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3471	NC_016646	CCG	2	6	204365	204370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374333606
3472	NC_016646	GC	3	6	204423	204428	0 %	0 %	50 %	50 %	374333606
3473	NC_016646	GC	3	6	205266	205271	0 %	0 %	50 %	50 %	374333607
3474	NC_016646	GCA	2	6	205299	205304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333607
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3477	NC_016646	TCA	2	6	205400	205405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333607
3478	NC_016646	CAT	2	6	205440	205445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333607
3479	NC_016646	TGC	2	6	205508	205513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333607
3480	NC_016646	GTCT	2	8	205516	205523	0 %	50 %	25 %	25 %	374333607
3481	NC_016646	GTG	2	6	205525	205530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374333607
3482	NC_016646	GGT	2	6	205531	205536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374333607
3483	NC_016646	ATC	3	9	205585	205593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333607
3484	NC_016646	TCA	2	6	205625	205630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333607
3485	NC_016646	CT	3	6	205662	205667	0 %	50 %	0 %	50 %	374333607
3486	NC_016646	CTG	2	6	205684	205689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333607
3487	NC_016646	ATC	2	6	205711	205716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333607
3488	NC_016646	GCT	2	6	205720	205725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333607
3489	NC_016646	CTGTTG	2	12	205751	205762	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	374333607
3490	NC_016646	TGA	2	6	205766	205771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333607
3491	NC_016646	ATT	2	6	205852	205857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374333607
3492	NC_016646	GT	3	6	205934	205939	0 %	50 %	50 %	0 %	374333607
3493	NC_016646	TGA	2	6	205992	205997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333607
3494	NC_016646	CAA	2	6	206063	206068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374333607
3495	NC_016646	TCA	2	6	206096	206101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333607
3496	NC_016646	CTG	2	6	206155	206160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333607
3497	NC_016646	CTG	2	6	206170	206175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333607
3498	NC_016646	CG	3	6	206207	206212	0 %	0 %	50 %	50 %	374333607
3499	NC_016646	TGC	2	6	206216	206221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333607
3500	NC_016646	GAT	2	6	206278	206283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333607

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