MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Paenibacillus terrae HPL-003 chromosome

Total Repeats: 97097

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016641	AGC	2	6	37610	37615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319911
502	NC_016641	TCA	3	9	37616	37624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319911
503	NC_016641	TG	3	6	37625	37630	0 %	50 %	50 %	0 %	374319911
504	NC_016641	GCC	2	6	37634	37639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374319911
505	NC_016641	CGAG	2	8	37712	37719	25 %	0 %	50 %	25 %	374319911
506	NC_016641	CTGCC	2	10	37744	37753	0 %	20 %	20 %	60 %	374319911
507	NC_016641	GCC	2	6	37841	37846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374319911
508	NC_016641	TGGC	2	8	37851	37858	0 %	25 %	50 %	25 %	374319911
509	NC_016641	CTG	2	6	37863	37868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319911
510	NC_016641	CCTTG	2	10	37899	37908	0 %	40 %	20 %	40 %	374319911
511	NC_016641	A	6	6	37925	37930	100 %	0 %	0 %	0 %	374319911
512	NC_016641	CCA	2	6	38066	38071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374319911
513	NC_016641	CTC	2	6	38074	38079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374319911
514	NC_016641	ACT	2	6	38095	38100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319911
515	NC_016641	CGA	3	9	38196	38204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319911
516	NC_016641	CGG	2	6	38208	38213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374319911
517	NC_016641	CGC	2	6	38227	38232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374319911
518	NC_016641	CCA	2	6	38265	38270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374319911
519	NC_016641	TCA	2	6	38340	38345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319911
520	NC_016641	CAT	2	6	38380	38385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319911
521	NC_016641	GT	3	6	38497	38502	0 %	50 %	50 %	0 %	374319911
522	NC_016641	GCA	2	6	38583	38588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319911
523	NC_016641	CTT	2	6	38595	38600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319911
524	NC_016641	TTCC	2	8	38655	38662	0 %	50 %	0 %	50 %	374319911
525	NC_016641	CCA	2	6	38673	38678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374319911
526	NC_016641	TGAT	2	8	38684	38691	25 %	50 %	25 %	0 %	374319911
527	NC_016641	AT	3	6	38734	38739	50 %	50 %	0 %	0 %	374319911
528	NC_016641	TCA	2	6	38757	38762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319911
529	NC_016641	CTA	2	6	38871	38876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319911
530	NC_016641	CAT	2	6	38898	38903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319912
531	NC_016641	AAGG	2	8	39116	39123	50 %	0 %	50 %	0 %	374319912
532	NC_016641	GCA	2	6	39172	39177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319912
533	NC_016641	CAG	2	6	39182	39187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319912
534	NC_016641	CTG	2	6	39235	39240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319912
535	NC_016641	TCC	2	6	39252	39257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374319912
536	NC_016641	TA	3	6	39260	39265	50 %	50 %	0 %	0 %	374319912
537	NC_016641	AAT	2	6	39317	39322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319912
538	NC_016641	CTGG	2	8	39416	39423	0 %	25 %	50 %	25 %	374319912
539	NC_016641	GCT	2	6	39434	39439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319912
540	NC_016641	TCC	2	6	39468	39473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374319912
541	NC_016641	TCC	2	6	39513	39518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374319912
542	NC_016641	CCAG	2	8	39603	39610	25 %	0 %	25 %	50 %	374319912
543	NC_016641	CCAC	2	8	39648	39655	25 %	0 %	0 %	75 %	374319912
544	NC_016641	T	8	8	39700	39707	0 %	100 %	0 %	0 %	374319912
545	NC_016641	ACA	2	6	39708	39713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374319912
546	NC_016641	GC	3	6	39790	39795	0 %	0 %	50 %	50 %	374319912
547	NC_016641	TCTG	2	8	39796	39803	0 %	50 %	25 %	25 %	374319912
548	NC_016641	CTAC	2	8	39804	39811	25 %	25 %	0 %	50 %	374319912
549	NC_016641	TCC	2	6	39832	39837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374319913
550	NC_016641	TCT	2	6	39865	39870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319913
551	NC_016641	CGT	2	6	39895	39900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319913
552	NC_016641	GCT	2	6	39918	39923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319913
553	NC_016641	CAG	2	6	39936	39941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319913
554	NC_016641	TGC	2	6	39952	39957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319913
555	NC_016641	GATAC	2	10	39964	39973	40 %	20 %	20 %	20 %	374319913
556	NC_016641	AAC	2	6	40033	40038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374319913
557	NC_016641	ACCTGC	2	12	40077	40088	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374319913
558	NC_016641	GAT	2	6	40122	40127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319913
559	NC_016641	TC	3	6	40222	40227	0 %	50 %	0 %	50 %	374319913
560	NC_016641	CGGT	2	8	40228	40235	0 %	25 %	50 %	25 %	374319913
561	NC_016641	CGC	2	6	40236	40241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374319913
562	NC_016641	GCT	2	6	40301	40306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319913
563	NC_016641	TGA	2	6	40349	40354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319913
564	NC_016641	C	6	6	40414	40419	0 %	0 %	0 %	100 %	374319913
565	NC_016641	ACA	2	6	40425	40430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374319913
566	NC_016641	TGC	2	6	40468	40473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319913
567	NC_016641	CACT	2	8	40481	40488	25 %	25 %	0 %	50 %	374319914
568	NC_016641	TGA	2	6	40500	40505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319914
569	NC_016641	TCA	2	6	40648	40653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319914
570	NC_016641	CAG	3	9	40667	40675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319914
571	NC_016641	TTC	2	6	40685	40690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319914
572	NC_016641	AAT	2	6	40694	40699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319914
573	NC_016641	CAT	2	6	40775	40780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319914
574	NC_016641	AGC	2	6	40923	40928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319914
575	NC_016641	TCCA	2	8	40971	40978	25 %	25 %	0 %	50 %	374319914
576	NC_016641	TAT	2	6	40981	40986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319914
577	NC_016641	TAA	2	6	41008	41013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319914
578	NC_016641	AGC	2	6	41019	41024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319914
579	NC_016641	AAAT	2	8	41080	41087	75 %	25 %	0 %	0 %	374319914
580	NC_016641	A	6	6	41100	41105	100 %	0 %	0 %	0 %	374319914
581	NC_016641	AT	4	8	41157	41164	50 %	50 %	0 %	0 %	374319914
582	NC_016641	ACA	2	6	41184	41189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374319914
583	NC_016641	AT	3	6	41288	41293	50 %	50 %	0 %	0 %	374319914
584	NC_016641	ACG	2	6	41348	41353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319915
585	NC_016641	GGCCTG	2	12	41361	41372	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374319915
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587	NC_016641	TCC	2	6	41449	41454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374319915
588	NC_016641	TCC	2	6	41461	41466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374319915
589	NC_016641	CAT	2	6	41553	41558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319915
590	NC_016641	TTG	2	6	41626	41631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374319915
591	NC_016641	ATC	2	6	41817	41822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319915
592	NC_016641	ATCA	2	8	41889	41896	50 %	25 %	0 %	25 %	374319915
593	NC_016641	AT	3	6	41956	41961	50 %	50 %	0 %	0 %	374319915
594	NC_016641	TCC	2	6	42019	42024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374319915
595	NC_016641	GCT	2	6	42103	42108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319915
596	NC_016641	GCTC	2	8	42137	42144	0 %	25 %	25 %	50 %	374319915
597	NC_016641	CTT	2	6	42171	42176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319915
598	NC_016641	CTG	2	6	42215	42220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319915
599	NC_016641	GAA	2	6	42344	42349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374319915
600	NC_016641	TTC	2	6	42355	42360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319915
601	NC_016641	AT	5	10	42450	42459	50 %	50 %	0 %	0 %	374319915
602	NC_016641	CCA	2	6	42545	42550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374319915
603	NC_016641	AT	3	6	42555	42560	50 %	50 %	0 %	0 %	374319915
604	NC_016641	AC	3	6	42599	42604	50 %	0 %	0 %	50 %	374319915
605	NC_016641	TGAGTT	2	12	42611	42622	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	374319915
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607	NC_016641	CAA	2	6	42704	42709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374319915
608	NC_016641	CGA	2	6	42710	42715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319915
609	NC_016641	CTT	3	9	42979	42987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319916
610	NC_016641	GTT	2	6	42997	43002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374319916
611	NC_016641	TCG	2	6	43011	43016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319916
612	NC_016641	GACC	2	8	43037	43044	25 %	0 %	25 %	50 %	374319916
613	NC_016641	CTT	2	6	43066	43071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319916
614	NC_016641	AAAC	2	8	43088	43095	75 %	0 %	0 %	25 %	374319916
615	NC_016641	TTA	2	6	43123	43128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319916
616	NC_016641	CCG	2	6	43145	43150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374319916
617	NC_016641	CAT	2	6	43223	43228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319916
618	NC_016641	ATC	2	6	43232	43237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319916
619	NC_016641	TGG	2	6	43244	43249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374319916
620	NC_016641	CGTAAC	2	12	43357	43368	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	374319916
621	NC_016641	CGA	2	6	43378	43383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319916
622	NC_016641	ATC	2	6	43391	43396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319916
623	NC_016641	TAA	2	6	43407	43412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319916
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626	NC_016641	GAC	2	6	43488	43493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319916
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