MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Pediococcus claussenii ATCC BAA-344 plasmid pPECL-5

Total Repeats: 627

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016608	TCA	2	6	28611	28616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377808788
502	NC_016608	ACC	2	6	28637	28642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377808788
503	NC_016608	GGT	2	6	28754	28759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377808788
504	NC_016608	ACG	2	6	28791	28796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377808788
505	NC_016608	TCA	2	6	28821	28826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377808788
506	NC_016608	ACC	2	6	28847	28852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377808788
507	NC_016608	GGT	2	6	28964	28969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377808788
508	NC_016608	ACG	2	6	29001	29006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377808788
509	NC_016608	TCA	2	6	29031	29036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377808788
510	NC_016608	ACC	2	6	29057	29062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377808788
511	NC_016608	GGT	2	6	29174	29179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377808788
512	NC_016608	ACG	2	6	29211	29216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377808788
513	NC_016608	TCA	2	6	29241	29246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377808788
514	NC_016608	ACC	2	6	29267	29272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377808788
515	NC_016608	GGT	2	6	29384	29389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377808788
516	NC_016608	ACG	2	6	29421	29426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377808788
517	NC_016608	TCA	2	6	29451	29456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377808788
518	NC_016608	ACC	2	6	29477	29482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377808788
519	NC_016608	TAA	2	6	29578	29583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	377808788
520	NC_016608	GTA	2	6	29610	29615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808788
521	NC_016608	TGC	2	6	29711	29716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377808788
522	NC_016608	TTG	2	6	29747	29752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377808788
523	NC_016608	CAC	2	6	29764	29769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377808788
524	NC_016608	TAG	2	6	29878	29883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808788
525	NC_016608	CAT	2	6	29887	29892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377808788
526	NC_016608	TCCA	2	8	29918	29925	25 %	25 %	0 %	50 %	377808788
527	NC_016608	CCA	2	6	29972	29977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377808788
528	NC_016608	TCA	2	6	30015	30020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377808788
529	NC_016608	TCG	2	6	30060	30065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377808788
530	NC_016608	CCA	2	6	30201	30206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377808788
531	NC_016608	AGT	2	6	30221	30226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808788
532	NC_016608	CAT	2	6	30232	30237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377808788
533	NC_016608	ACT	2	6	30308	30313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377808788
534	NC_016608	AAG	2	6	30435	30440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377808788
535	NC_016608	TTA	2	6	30489	30494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	377808788
536	NC_016608	ATG	2	6	30495	30500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808788
537	NC_016608	GTA	2	6	30531	30536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808788
538	NC_016608	GAA	2	6	30543	30548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377808788
539	NC_016608	TTC	2	6	30555	30560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377808788
540	NC_016608	TGC	2	6	30571	30576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377808788
541	NC_016608	TGC	2	6	30578	30583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377808788
542	NC_016608	GCA	2	6	30588	30593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377808788
543	NC_016608	TGCT	2	8	30628	30635	0 %	50 %	25 %	25 %	377808788
544	NC_016608	TGA	2	6	30644	30649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808788
545	NC_016608	TGC	2	6	30683	30688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377808788
546	NC_016608	TGA	2	6	30698	30703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808788
547	NC_016608	TGC	2	6	30737	30742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377808788
548	NC_016608	TGA	2	6	30755	30760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808788
549	NC_016608	TTG	2	6	30790	30795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377808788
550	NC_016608	TGA	2	6	30809	30814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808788
551	NC_016608	TTG	2	6	30844	30849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377808788
552	NC_016608	TGC	2	6	30892	30897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377808788
553	NC_016608	TTG	2	6	30898	30903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377808788
554	NC_016608	TGC	2	6	30946	30951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377808788
555	NC_016608	TTG	2	6	30952	30957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377808788
556	NC_016608	TGC	2	6	31000	31005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377808788
557	NC_016608	TTG	2	6	31006	31011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377808788
558	NC_016608	ACT	2	6	31055	31060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377808788
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562	NC_016608	TGT	2	6	31364	31369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377808789
563	NC_016608	CAG	2	6	31372	31377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377808789
564	NC_016608	AAG	2	6	31453	31458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377808789
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572	NC_016608	TAA	2	6	31736	31741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	377808789
573	NC_016608	TTA	2	6	31754	31759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	377808789
574	NC_016608	GATTTT	2	12	31794	31805	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	377808789
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582	NC_016608	A	6	6	32175	32180	100 %	0 %	0 %	0 %	377808789
583	NC_016608	AT	3	6	32246	32251	50 %	50 %	0 %	0 %	377808789
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587	NC_016608	ATG	2	6	32417	32422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808789
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589	NC_016608	AT	3	6	34217	34222	50 %	50 %	0 %	0 %	377808790
590	NC_016608	ACT	2	6	34241	34246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377808790
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592	NC_016608	CAA	2	6	34277	34282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377808790
593	NC_016608	TTGA	2	8	34409	34416	25 %	50 %	25 %	0 %	377808790
594	NC_016608	AAG	2	6	34500	34505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377808790
595	NC_016608	AAACG	2	10	34520	34529	60 %	0 %	20 %	20 %	377808790
596	NC_016608	AG	3	6	34541	34546	50 %	0 %	50 %	0 %	377808790
597	NC_016608	GGC	2	6	34548	34553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377808790
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600	NC_016608	CAA	2	6	34658	34663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377808790
601	NC_016608	AAC	2	6	34691	34696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377808790
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603	NC_016608	AAC	2	6	34859	34864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377808791
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608	NC_016608	ACA	2	6	35101	35106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377808791
609	NC_016608	ATG	2	6	35118	35123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808791
610	NC_016608	AAC	2	6	35142	35147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377808791
611	NC_016608	TGAC	2	8	35164	35171	25 %	25 %	25 %	25 %	377808791
612	NC_016608	AC	3	6	35193	35198	50 %	0 %	0 %	50 %	377808791
613	NC_016608	T	6	6	35376	35381	0 %	100 %	0 %	0 %	377808791
614	NC_016608	ATG	2	6	35443	35448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808791
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616	NC_016608	TAGC	2	8	35524	35531	25 %	25 %	25 %	25 %	377808791
617	NC_016608	AAAAC	2	10	35549	35558	80 %	0 %	0 %	20 %	377808791
618	NC_016608	CAA	2	6	35592	35597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377808791
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620	NC_016608	TAAG	2	8	35612	35619	50 %	25 %	25 %	0 %	377808791
621	NC_016608	CAA	2	6	35649	35654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377808792
622	NC_016608	A	9	9	35653	35661	100 %	0 %	0 %	0 %	377808792
623	NC_016608	GAA	2	6	35665	35670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377808792
624	NC_016608	AAGA	2	8	35707	35714	75 %	0 %	25 %	0 %	377808792
625	NC_016608	T	6	6	35727	35732	0 %	100 %	0 %	0 %	377808792
626	NC_016608	AAG	2	6	35750	35755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377808792
627	NC_016608	GCT	2	6	35818	35823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377808792

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