MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pediococcus claussenii ATCC BAA-344 chromosome

Total Repeats: 34051

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016605	ATA	2	6	121	126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	377808794
2	NC_016605	GAC	3	9	142	150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377808794
3	NC_016605	TGGT	2	8	227	234	0 %	50 %	50 %	0 %	377808794
4	NC_016605	TC	3	6	869	874	0 %	50 %	0 %	50 %	377808795
5	NC_016605	A	6	6	876	881	100 %	0 %	0 %	0 %	377808795
6	NC_016605	TACT	2	8	887	894	25 %	50 %	0 %	25 %	377808795
7	NC_016605	TCCA	2	8	903	910	25 %	25 %	0 %	50 %	377808795
8	NC_016605	ATT	2	6	923	928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	377808795
9	NC_016605	CCAGAT	2	12	1024	1035	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	377808795
10	NC_016605	A	8	8	1055	1062	100 %	0 %	0 %	0 %	377808795
11	NC_016605	GCT	2	6	1144	1149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377808795
12	NC_016605	AGA	2	6	1161	1166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377808795
13	NC_016605	CTTTT	2	10	1189	1198	0 %	80 %	0 %	20 %	377808795
14	NC_016605	TGG	2	6	1200	1205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377808795
15	NC_016605	AAT	2	6	1261	1266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	377808795
16	NC_016605	TTA	2	6	1316	1321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	377808795
17	NC_016605	A	7	7	1331	1337	100 %	0 %	0 %	0 %	377808795
18	NC_016605	TTA	2	6	1381	1386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	377808795
19	NC_016605	GAT	2	6	1390	1395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808795
20	NC_016605	T	6	6	1402	1407	0 %	100 %	0 %	0 %	377808795
21	NC_016605	CTA	2	6	1742	1747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377808795
22	NC_016605	AAC	2	6	1749	1754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377808795
23	NC_016605	A	6	6	1879	1884	100 %	0 %	0 %	0 %	377808795
24	NC_016605	AATC	2	8	1892	1899	50 %	25 %	0 %	25 %	377808795
25	NC_016605	CGG	2	6	1977	1982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377808795
26	NC_016605	AAT	2	6	2271	2276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	377808796
27	NC_016605	CATT	2	8	2300	2307	25 %	50 %	0 %	25 %	377808796
28	NC_016605	A	6	6	2308	2313	100 %	0 %	0 %	0 %	377808796
29	NC_016605	ATC	2	6	2337	2342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377808796
30	NC_016605	AAC	2	6	2436	2441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377808796
31	NC_016605	TTG	2	6	2477	2482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377808796
32	NC_016605	A	6	6	2530	2535	100 %	0 %	0 %	0 %	377808796
33	NC_016605	ATT	2	6	2584	2589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	377808796
34	NC_016605	TGC	2	6	2598	2603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377808796
35	NC_016605	CT	3	6	2791	2796	0 %	50 %	0 %	50 %	377808796
36	NC_016605	ACAG	2	8	2806	2813	50 %	0 %	25 %	25 %	377808796
37	NC_016605	ATT	3	9	2872	2880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	377808796
38	NC_016605	GAT	2	6	2920	2925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808796
39	NC_016605	CAA	2	6	2930	2935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377808796
40	NC_016605	GGAA	2	8	3006	3013	50 %	0 %	50 %	0 %	377808796
41	NC_016605	CAT	2	6	3104	3109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377808796
42	NC_016605	AAC	2	6	3130	3135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377808796
43	NC_016605	TGA	2	6	3153	3158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808796
44	NC_016605	GTT	2	6	3172	3177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377808796
45	NC_016605	GAA	3	9	3211	3219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377808796
46	NC_016605	A	6	6	3744	3749	100 %	0 %	0 %	0 %	377808797
47	NC_016605	CATTA	2	10	3772	3781	40 %	40 %	0 %	20 %	377808797
48	NC_016605	AGA	2	6	3796	3801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377808797
49	NC_016605	TGG	2	6	3817	3822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377808797
50	NC_016605	GA	3	6	3841	3846	50 %	0 %	50 %	0 %	377808797
51	NC_016605	ATG	2	6	3873	3878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808797
52	NC_016605	GAT	2	6	3905	3910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808797
53	NC_016605	GAA	2	6	3952	3957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377808797
54	NC_016605	ATG	2	6	4008	4013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808798
55	NC_016605	CTTG	2	8	4081	4088	0 %	50 %	25 %	25 %	377808798
56	NC_016605	GGGA	2	8	4155	4162	25 %	0 %	75 %	0 %	377808798
57	NC_016605	GAAA	2	8	4239	4246	75 %	0 %	25 %	0 %	377808798
58	NC_016605	ATC	2	6	4257	4262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377808798
59	NC_016605	TCA	2	6	4415	4420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377808798
60	NC_016605	AAC	2	6	4440	4445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377808798
61	NC_016605	TGC	2	6	4522	4527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377808798
62	NC_016605	A	6	6	4567	4572	100 %	0 %	0 %	0 %	377808798
63	NC_016605	ATG	2	6	4689	4694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808798
64	NC_016605	AAG	2	6	4728	4733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377808798
65	NC_016605	ACA	2	6	4825	4830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377808798
66	NC_016605	GAC	2	6	4834	4839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377808798
67	NC_016605	GTT	2	6	4903	4908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377808798
68	NC_016605	GAT	2	6	4934	4939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808798
69	NC_016605	GTC	2	6	4941	4946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377808798
70	NC_016605	GTG	2	6	5010	5015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377808798
71	NC_016605	CAA	2	6	5021	5026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377808798
72	NC_016605	AGG	2	6	5082	5087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	377808798
73	NC_016605	ATG	2	6	5139	5144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808799
74	NC_016605	CAT	2	6	5231	5236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377808799
75	NC_016605	TGA	2	6	5266	5271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808799
76	NC_016605	TGG	2	6	5422	5427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377808799
77	NC_016605	CGG	2	6	5458	5463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377808799
78	NC_016605	CCAGAT	2	12	5639	5650	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	377808799
79	NC_016605	ACA	3	9	5663	5671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377808799
80	NC_016605	ACGG	2	8	5909	5916	25 %	0 %	50 %	25 %	377808799
81	NC_016605	TAA	2	6	5944	5949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	377808799
82	NC_016605	CA	3	6	5954	5959	50 %	0 %	0 %	50 %	377808799
83	NC_016605	GGT	2	6	5966	5971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377808799
84	NC_016605	GAA	2	6	5978	5983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377808799
85	NC_016605	TAAT	2	8	6009	6016	50 %	50 %	0 %	0 %	377808799
86	NC_016605	TGA	2	6	6052	6057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808799
87	NC_016605	GAT	2	6	6071	6076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808799
88	NC_016605	CGG	2	6	6174	6179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377808799
89	NC_016605	TTG	2	6	6215	6220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377808799
90	NC_016605	GCA	2	6	6284	6289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377808799
91	NC_016605	GC	3	6	6292	6297	0 %	0 %	50 %	50 %	377808799
92	NC_016605	AAG	2	6	6314	6319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377808799
93	NC_016605	AAT	2	6	6335	6340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	377808799
94	NC_016605	GCTG	2	8	6352	6359	0 %	25 %	50 %	25 %	377808799
95	NC_016605	CTG	2	6	6414	6419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377808799
96	NC_016605	GCAA	2	8	6454	6461	50 %	0 %	25 %	25 %	377808799
97	NC_016605	TTCG	2	8	6534	6541	0 %	50 %	25 %	25 %	377808799
98	NC_016605	ATT	2	6	6611	6616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	377808799
99	NC_016605	TGAT	2	8	6693	6700	25 %	50 %	25 %	0 %	377808799
100	NC_016605	ACC	2	6	6724	6729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377808799
101	NC_016605	TGA	2	6	6787	6792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808799
102	NC_016605	ACC	2	6	6808	6813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377808799
103	NC_016605	AAC	2	6	6880	6885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377808799
104	NC_016605	CTG	2	6	6921	6926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377808799
105	NC_016605	CGT	2	6	6986	6991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377808799
106	NC_016605	AGA	2	6	7088	7093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377808800
107	NC_016605	CAT	2	6	7141	7146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377808800
108	NC_016605	TTG	2	6	7171	7176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377808800
109	NC_016605	TCG	2	6	7220	7225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377808800
110	NC_016605	A	6	6	7275	7280	100 %	0 %	0 %	0 %	377808800
111	NC_016605	TTG	2	6	7291	7296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377808800
112	NC_016605	ATC	2	6	7315	7320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377808800
113	NC_016605	TTG	2	6	7390	7395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377808800
114	NC_016605	TGATGG	2	12	7421	7432	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	377808800
115	NC_016605	GCT	3	9	7434	7442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377808800
116	NC_016605	TAA	2	6	7499	7504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	377808800
117	NC_016605	ATG	2	6	7531	7536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808800
118	NC_016605	GTT	2	6	7554	7559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377808800
119	NC_016605	GAC	2	6	7619	7624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377808800
120	NC_016605	TCC	2	6	7631	7636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	377808800
121	NC_016605	TGG	2	6	7742	7747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377808800
122	NC_016605	ATT	2	6	7803	7808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	377808800
123	NC_016605	TTGATA	2	12	7822	7833	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	377808800
124	NC_016605	A	6	6	7837	7842	100 %	0 %	0 %	0 %	377808800
125	NC_016605	ATG	2	6	7960	7965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808800
126	NC_016605	AGT	3	9	7988	7996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808800
127	NC_016605	GTT	2	6	8025	8030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377808800
128	NC_016605	TA	3	6	8041	8046	50 %	50 %	0 %	0 %	377808800
129	NC_016605	ACT	2	6	8064	8069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377808800
130	NC_016605	GC	3	6	8101	8106	0 %	0 %	50 %	50 %	377808800
131	NC_016605	AAG	3	9	8155	8163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377808800
132	NC_016605	CCG	2	6	8168	8173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377808800
133	NC_016605	A	7	7	8192	8198	100 %	0 %	0 %	0 %	377808800
134	NC_016605	TGA	2	6	8252	8257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808800
135	NC_016605	ATC	2	6	8259	8264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377808800
136	NC_016605	TAT	2	6	8267	8272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	377808800
137	NC_016605	AAT	2	6	8316	8321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	377808800
138	NC_016605	ATA	2	6	8413	8418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	377808800
139	NC_016605	TGG	2	6	8425	8430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377808800
140	NC_016605	AG	3	6	8463	8468	50 %	0 %	50 %	0 %	377808800
141	NC_016605	ATT	2	6	8481	8486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	377808800
142	NC_016605	TGA	2	6	8522	8527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808800
143	NC_016605	TCG	2	6	8528	8533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377808800
144	NC_016605	TGAAGA	2	12	8567	8578	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	377808800
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147	NC_016605	AT	3	6	8624	8629	50 %	50 %	0 %	0 %	377808800
148	NC_016605	GTG	2	6	8668	8673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377808800
149	NC_016605	GAG	2	6	8677	8682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	377808800
150	NC_016605	GAT	3	9	8703	8711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808800
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152	NC_016605	TAAT	2	8	8839	8846	50 %	50 %	0 %	0 %	377808800
153	NC_016605	TAG	2	6	8858	8863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808800
154	NC_016605	TGA	2	6	8864	8869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808800
155	NC_016605	CTT	2	6	8936	8941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377808800
156	NC_016605	TAAGGA	2	12	9026	9037	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	377808800
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158	NC_016605	ATT	2	6	9081	9086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	377808800
159	NC_016605	AGA	2	6	9119	9124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377808800
160	NC_016605	TGA	2	6	9179	9184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808800
161	NC_016605	TGGT	2	8	9193	9200	0 %	50 %	50 %	0 %	377808800
162	NC_016605	GTG	2	6	9295	9300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377808800
163	NC_016605	GCTA	2	8	9353	9360	25 %	25 %	25 %	25 %	377808800
164	NC_016605	TGA	2	6	9371	9376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808800
165	NC_016605	GTG	2	6	9400	9405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377808800
166	NC_016605	TGA	2	6	9406	9411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808800
167	NC_016605	TTAATA	2	12	9418	9429	50 %	50 %	0 %	0 %	377808800
168	NC_016605	TGA	2	6	9479	9484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808800
169	NC_016605	TGA	2	6	9527	9532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808800
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173	NC_016605	TGA	2	6	9804	9809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377808801
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176	NC_016605	TGG	2	6	9918	9923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377808801
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259	NC_016605	TGT	2	6	14308	14313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377808806
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