MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudonocardia dioxanivorans CB1190 plasmid pPSED02

Total Repeats: 1299

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016601	GCT	2	6	828	833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375129106
2	NC_016601	GCT	3	9	852	860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375129106
3	NC_016601	CGT	2	6	876	881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375129106
4	NC_016601	GAG	2	6	910	915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375129106
5	NC_016601	CGA	2	6	930	935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375129106
6	NC_016601	CTG	2	6	956	961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375129106
7	NC_016601	GTC	2	6	1033	1038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375129106
8	NC_016601	GC	3	6	1071	1076	0 %	0 %	50 %	50 %	375129106
9	NC_016601	GCC	2	6	1095	1100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375129106
10	NC_016601	GCC	2	6	1115	1120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375129106
11	NC_016601	CCG	2	6	1163	1168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375129106
12	NC_016601	TCGG	2	8	1216	1223	0 %	25 %	50 %	25 %	375129106
13	NC_016601	CAA	2	6	1230	1235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375129106
14	NC_016601	ACA	2	6	1250	1255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375129106
15	NC_016601	GCG	2	6	1293	1298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375129106
16	NC_016601	CG	3	6	1297	1302	0 %	0 %	50 %	50 %	375129106
17	NC_016601	CGC	2	6	1365	1370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375129106
18	NC_016601	GTC	2	6	1402	1407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375129106
19	NC_016601	GCA	2	6	1537	1542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375129106
20	NC_016601	GAA	2	6	1555	1560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375129106
21	NC_016601	CTG	2	6	1573	1578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375129106
22	NC_016601	GAC	2	6	1663	1668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375129106
23	NC_016601	GAA	2	6	1710	1715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375129106
24	NC_016601	CGC	3	9	1719	1727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375129106
25	NC_016601	GCC	2	6	1771	1776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375129106
26	NC_016601	CTG	2	6	1777	1782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375129106
27	NC_016601	ACG	2	6	1816	1821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375129106
28	NC_016601	TCC	2	6	1901	1906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375129106
29	NC_016601	CGA	2	6	1964	1969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375129106
30	NC_016601	GCCT	2	8	2001	2008	0 %	25 %	25 %	50 %	375129107
31	NC_016601	CGC	2	6	2036	2041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375129107
32	NC_016601	CCCG	2	8	2049	2056	0 %	0 %	25 %	75 %	375129107
33	NC_016601	TTG	2	6	2068	2073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375129107
34	NC_016601	CCG	2	6	2149	2154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375129107
35	NC_016601	GTC	2	6	2175	2180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375129107
36	NC_016601	CGT	2	6	2234	2239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375129107
37	NC_016601	CTG	2	6	2295	2300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375129107
38	NC_016601	GTC	2	6	2301	2306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375129107
39	NC_016601	CTG	2	6	2313	2318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375129107
40	NC_016601	CGC	3	9	2357	2365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375129107
41	NC_016601	CGA	2	6	2388	2393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375129107
42	NC_016601	GGT	2	6	2421	2426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375129107
43	NC_016601	GTCG	2	8	2427	2434	0 %	25 %	50 %	25 %	375129107
44	NC_016601	GTG	2	6	2440	2445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375129107
45	NC_016601	CTG	2	6	2451	2456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375129107
46	NC_016601	GCG	2	6	2479	2484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375129107
47	NC_016601	GCT	2	6	2486	2491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375129107
48	NC_016601	TGCG	2	8	2501	2508	0 %	25 %	50 %	25 %	375129107
49	NC_016601	GTC	2	6	2514	2519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375129107
50	NC_016601	CGG	2	6	2522	2527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375129107
51	NC_016601	TCG	2	6	2536	2541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375129107
52	NC_016601	GCC	2	6	2578	2583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375129107
53	NC_016601	CGC	3	9	2657	2665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375129107
54	NC_016601	CAC	2	6	2678	2683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375129107
55	NC_016601	GGT	2	6	2685	2690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375129107
56	NC_016601	TGC	2	6	2714	2719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375129107
57	NC_016601	GCC	2	6	2730	2735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375129107
58	NC_016601	GCC	2	6	2745	2750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375129107
59	NC_016601	TGG	2	6	2762	2767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375129107
60	NC_016601	TGCCGG	2	12	2768	2779	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	375129107
61	NC_016601	CGC	2	6	2789	2794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375129107
62	NC_016601	GTG	2	6	2803	2808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375129107
63	NC_016601	GTT	2	6	2814	2819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375129107
64	NC_016601	GTT	2	6	2838	2843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375129107
65	NC_016601	CCGGTC	2	12	2854	2865	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	375129107
66	NC_016601	GAT	2	6	2886	2891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375129107
67	NC_016601	GGCG	2	8	2903	2910	0 %	0 %	75 %	25 %	375129107
68	NC_016601	GAC	2	6	2959	2964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375129107
69	NC_016601	CGG	2	6	2978	2983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375129107
70	NC_016601	CGA	2	6	2994	2999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375129107
71	NC_016601	GCTGGT	2	12	3006	3017	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	375129107
72	NC_016601	GGT	2	6	3021	3026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375129107
73	NC_016601	GGT	2	6	3033	3038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375129107
74	NC_016601	CGG	2	6	3068	3073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375129107
75	NC_016601	CGC	2	6	3087	3092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375129107
76	NC_016601	AGCG	2	8	3093	3100	25 %	0 %	50 %	25 %	375129107
77	NC_016601	CGC	2	6	3101	3106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375129107
78	NC_016601	GACC	2	8	3117	3124	25 %	0 %	25 %	50 %	375129107
79	NC_016601	CCA	2	6	3160	3165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375129107
80	NC_016601	TTG	2	6	3229	3234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375129107
81	NC_016601	CGG	2	6	3251	3256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375129107
82	NC_016601	CGG	2	6	3302	3307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375129107
83	NC_016601	GTC	2	6	3312	3317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375129107
84	NC_016601	GTG	2	6	3334	3339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375129107
85	NC_016601	CTG	2	6	3357	3362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375129107
86	NC_016601	CG	3	6	3426	3431	0 %	0 %	50 %	50 %	375129107
87	NC_016601	AGC	2	6	3484	3489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375129107
88	NC_016601	GCC	2	6	3537	3542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375129107
89	NC_016601	GCC	2	6	3552	3557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375129107
90	NC_016601	TGCTGG	2	12	3566	3577	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	375129107
91	NC_016601	CGA	2	6	3629	3634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375129107
92	NC_016601	GTG	2	6	3643	3648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375129107
93	NC_016601	GCG	3	9	3673	3681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375129107
94	NC_016601	GGT	3	9	3699	3707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375129107
95	NC_016601	CGC	2	6	3854	3859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375129108
96	NC_016601	GCCCGA	2	12	3875	3886	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	375129108
97	NC_016601	GTCGGT	2	12	3917	3928	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	375129108
98	NC_016601	GGT	2	6	3938	3943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375129108
99	NC_016601	GCC	2	6	3950	3955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375129108
100	NC_016601	CGA	2	6	4006	4011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375129108
101	NC_016601	GCC	2	6	4085	4090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375129108
102	NC_016601	CGC	2	6	4144	4149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375129108
103	NC_016601	CG	3	6	4200	4205	0 %	0 %	50 %	50 %	375129108
104	NC_016601	TGG	2	6	4255	4260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375129108
105	NC_016601	TGG	2	6	4294	4299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375129108
106	NC_016601	AGA	2	6	4300	4305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375129108
107	NC_016601	GGA	2	6	4385	4390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375129108
108	NC_016601	TCT	2	6	4462	4467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375129108
109	NC_016601	GGT	2	6	4496	4501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375129108
110	NC_016601	GCC	2	6	4589	4594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375129108
111	NC_016601	CGA	2	6	4727	4732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375129108
112	NC_016601	GCC	2	6	4890	4895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375129108
113	NC_016601	TCC	2	6	4919	4924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375129108
114	NC_016601	GCT	2	6	4957	4962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375129108
115	NC_016601	CGG	2	6	4987	4992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375129108
116	NC_016601	CAG	2	6	5002	5007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375129108
117	NC_016601	GGGC	2	8	5041	5048	0 %	0 %	75 %	25 %	375129108
118	NC_016601	GCG	2	6	5085	5090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375129108
119	NC_016601	GAC	2	6	5093	5098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375129108
120	NC_016601	CCGC	2	8	5125	5132	0 %	0 %	25 %	75 %	375129109
121	NC_016601	GCA	2	6	5226	5231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375129109
122	NC_016601	GCC	2	6	5248	5253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375129109
123	NC_016601	CGA	2	6	5283	5288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375129109
124	NC_016601	GAC	2	6	5365	5370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375129109
125	NC_016601	ATCGC	2	10	5372	5381	20 %	20 %	20 %	40 %	375129109
126	NC_016601	TCG	2	6	5390	5395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375129109
127	NC_016601	CGT	3	9	5422	5430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375129109
128	NC_016601	CGG	2	6	5439	5444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375129109
129	NC_016601	GTC	2	6	5483	5488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375129109
130	NC_016601	TGA	2	6	5538	5543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375129109
131	NC_016601	GAA	2	6	5551	5556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375129109
132	NC_016601	CAG	2	6	5563	5568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375129109
133	NC_016601	CGG	2	6	5579	5584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375129109
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136	NC_016601	CGC	2	6	5811	5816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375129109
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139	NC_016601	TGC	2	6	5877	5882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375129109
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143	NC_016601	GC	3	6	6008	6013	0 %	0 %	50 %	50 %	375129109
144	NC_016601	CGCGG	2	10	6018	6027	0 %	0 %	60 %	40 %	375129109
145	NC_016601	TGG	2	6	6106	6111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375129109
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152	NC_016601	CCG	2	6	6362	6367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375129109
153	NC_016601	TGG	2	6	6381	6386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375129109
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163	NC_016601	CGA	3	9	6689	6697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375129110
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202	NC_016601	CAG	2	6	8226	8231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375129112
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246	NC_016601	GTAC	2	8	11125	11132	25 %	25 %	25 %	25 %	375129115
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253	NC_016601	GCTG	2	8	11318	11325	0 %	25 %	50 %	25 %	375129115
254	NC_016601	CTG	2	6	11476	11481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375129115
255	NC_016601	TCG	2	6	11507	11512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375129115
256	NC_016601	CGG	2	6	11558	11563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375129115
257	NC_016601	GGACC	2	10	11607	11616	20 %	0 %	40 %	40 %	375129115
258	NC_016601	ACG	2	6	11652	11657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375129115
259	NC_016601	CGA	2	6	11671	11676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375129115
260	NC_016601	TCG	2	6	11860	11865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375129116
261	NC_016601	CGA	2	6	11900	11905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375129116
262	NC_016601	CGC	2	6	11939	11944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375129116
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380	NC_016601	GA	3	6	16111	16116	50 %	0 %	50 %	0 %	375129119
381	NC_016601	CCG	2	6	16138	16143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375129119
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499	NC_016601	TCG	2	6	23023	23028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375129124
500	NC_016601	GC	3	6	23079	23084	0 %	0 %	50 %	50 %	375129124

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