MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pelagibacterium halotolerans B2 plasmid pPHB2

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016079	GCC	2	6	108	113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383071
2	NC_016079	A	6	6	162	167	100 %	0 %	0 %	0 %	357383071
3	NC_016079	CGCC	2	8	188	195	0 %	0 %	25 %	75 %	357383071
4	NC_016079	GAT	2	6	237	242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357383071
5	NC_016079	TGA	2	6	425	430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357383071
6	NC_016079	CGA	2	6	461	466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357383071
7	NC_016079	ACTGCA	2	12	503	514	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	357383071
8	NC_016079	CTC	2	6	537	542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357383071
9	NC_016079	CGT	2	6	631	636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383071
10	NC_016079	TCG	2	6	699	704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383071
11	NC_016079	GC	3	6	773	778	0 %	0 %	50 %	50 %	357383071
12	NC_016079	TCC	2	6	807	812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357383071
13	NC_016079	TCCA	2	8	831	838	25 %	25 %	0 %	50 %	357383071
14	NC_016079	CTCG	2	8	863	870	0 %	25 %	25 %	50 %	357383072
15	NC_016079	AC	3	6	939	944	50 %	0 %	0 %	50 %	357383072
16	NC_016079	GAGC	2	8	1104	1111	25 %	0 %	50 %	25 %	357383072
17	NC_016079	GAC	2	6	1118	1123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357383072
18	NC_016079	GTC	2	6	1223	1228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383072
19	NC_016079	AGAAC	2	10	1237	1246	60 %	0 %	20 %	20 %	357383072
20	NC_016079	CTG	2	6	1316	1321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383072
21	NC_016079	TCG	2	6	1398	1403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383072
22	NC_016079	G	6	6	1425	1430	0 %	0 %	100 %	0 %	357383072
23	NC_016079	GGC	2	6	1521	1526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357383072
24	NC_016079	AGCC	2	8	1569	1576	25 %	0 %	25 %	50 %	357383072
25	NC_016079	AAC	2	6	1591	1596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357383072
26	NC_016079	AGT	2	6	1627	1632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357383072
27	NC_016079	TCG	2	6	1734	1739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383072
28	NC_016079	CG	6	12	1792	1803	0 %	0 %	50 %	50 %	357383072
29	NC_016079	CCA	2	6	1843	1848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357383072
30	NC_016079	CGT	2	6	1864	1869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383072
31	NC_016079	A	7	7	1914	1920	100 %	0 %	0 %	0 %	357383072
32	NC_016079	TCG	2	6	1943	1948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383072
33	NC_016079	CCG	2	6	1980	1985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383072
34	NC_016079	CCTG	2	8	1999	2006	0 %	25 %	25 %	50 %	357383072
35	NC_016079	AGC	2	6	2025	2030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357383072
36	NC_016079	AGA	2	6	2194	2199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357383072
37	NC_016079	C	6	6	2234	2239	0 %	0 %	0 %	100 %	357383072
38	NC_016079	TGG	2	6	2325	2330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357383072
39	NC_016079	CCA	2	6	2345	2350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357383072
40	NC_016079	GTA	2	6	2372	2377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357383072
41	NC_016079	ACG	2	6	2398	2403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357383072
42	NC_016079	TGC	2	6	2485	2490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383073
43	NC_016079	TGGC	2	8	2571	2578	0 %	25 %	50 %	25 %	357383073
44	NC_016079	CG	3	6	3043	3048	0 %	0 %	50 %	50 %	357383073
45	NC_016079	CGC	2	6	3176	3181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383073
46	NC_016079	TGT	2	6	3214	3219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357383073
47	NC_016079	TCG	2	6	3225	3230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383073
48	NC_016079	TCC	2	6	3306	3311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357383073
49	NC_016079	TGA	2	6	3504	3509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357383073
50	NC_016079	TGC	2	6	3613	3618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383073
51	NC_016079	TGG	2	6	3763	3768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357383073
52	NC_016079	CAG	2	6	3812	3817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357383073
53	NC_016079	CCT	2	6	3889	3894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357383073
54	NC_016079	GAA	2	6	3895	3900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357383073
55	NC_016079	CAG	2	6	3950	3955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357383073
56	NC_016079	TGA	2	6	3985	3990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357383073
57	NC_016079	CAT	2	6	3995	4000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357383073

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.