MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pelagibacterium halotolerans B2 chromosome

Total Repeats: 72577

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016078	ACC	2	6	67	72	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357383075
2	NC_016078	CCA	2	6	86	91	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357383075
3	NC_016078	GCC	2	6	133	138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383075
4	NC_016078	CAG	2	6	252	257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357383075
5	NC_016078	CAT	2	6	335	340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357383075
6	NC_016078	GCC	2	6	349	354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383075
7	NC_016078	AAC	2	6	358	363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357383075
8	NC_016078	CTC	2	6	384	389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357383075
9	NC_016078	TGG	2	6	392	397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357383075
10	NC_016078	GGCG	2	8	480	487	0 %	0 %	75 %	25 %	357383075
11	NC_016078	GGC	3	9	767	775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357383076
12	NC_016078	CGG	2	6	832	837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357383076
13	NC_016078	GC	3	6	972	977	0 %	0 %	50 %	50 %	357383076
14	NC_016078	CGATAT	2	12	1045	1056	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	357383076
15	NC_016078	TCA	2	6	1095	1100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357383076
16	NC_016078	CGGC	2	8	1116	1123	0 %	0 %	50 %	50 %	357383076
17	NC_016078	CGG	2	6	1156	1161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357383076
18	NC_016078	TCG	2	6	1248	1253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383076
19	NC_016078	TGG	2	6	1291	1296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357383076
20	NC_016078	GCC	2	6	1332	1337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383076
21	NC_016078	GCCG	2	8	1339	1346	0 %	0 %	50 %	50 %	357383076
22	NC_016078	CGC	2	6	1402	1407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383076
23	NC_016078	ATCG	2	8	1436	1443	25 %	25 %	25 %	25 %	357383076
24	NC_016078	CAGA	2	8	1473	1480	50 %	0 %	25 %	25 %	357383076
25	NC_016078	CGC	2	6	1603	1608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383076
26	NC_016078	CGCA	2	8	1645	1652	25 %	0 %	25 %	50 %	357383077
27	NC_016078	ATC	2	6	1734	1739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357383077
28	NC_016078	GC	3	6	1963	1968	0 %	0 %	50 %	50 %	357383077
29	NC_016078	ACA	2	6	2043	2048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357383077
30	NC_016078	CGT	2	6	2074	2079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383077
31	NC_016078	ACG	2	6	2127	2132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357383077
32	NC_016078	CTG	2	6	2207	2212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383077
33	NC_016078	CGC	2	6	2254	2259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383077
34	NC_016078	TTA	2	6	2317	2322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357383077
35	NC_016078	ATG	2	6	2363	2368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357383077
36	NC_016078	TCG	2	6	2382	2387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383077
37	NC_016078	CGA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357383077
38	NC_016078	CGA	2	6	2428	2433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357383077
39	NC_016078	GCG	2	6	2514	2519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357383077
40	NC_016078	CCT	2	6	2541	2546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357383077
41	NC_016078	AAG	2	6	2570	2575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357383077
42	NC_016078	CGA	2	6	2782	2787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357383077
43	NC_016078	TGA	2	6	2805	2810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357383077
44	NC_016078	TCCCGG	2	12	2818	2829	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	357383077
45	NC_016078	CCTTT	2	10	2860	2869	0 %	60 %	0 %	40 %	357383077
46	NC_016078	CGA	2	6	2959	2964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357383077
47	NC_016078	GATC	2	8	2986	2993	25 %	25 %	25 %	25 %	357383077
48	NC_016078	C	6	6	3027	3032	0 %	0 %	0 %	100 %	357383077
49	NC_016078	GGC	2	6	3263	3268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357383078
50	NC_016078	GC	3	6	3302	3307	0 %	0 %	50 %	50 %	357383078
51	NC_016078	CGA	2	6	3346	3351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357383078
52	NC_016078	TCT	2	6	3406	3411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357383078
53	NC_016078	GCCCGA	2	12	3460	3471	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	357383078
54	NC_016078	CGG	2	6	3474	3479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357383078
55	NC_016078	CGC	2	6	3496	3501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383078
56	NC_016078	TGCC	2	8	3509	3516	0 %	25 %	25 %	50 %	357383078
57	NC_016078	CGG	2	6	3580	3585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357383078
58	NC_016078	GC	3	6	3600	3605	0 %	0 %	50 %	50 %	357383078
59	NC_016078	CG	3	6	3657	3662	0 %	0 %	50 %	50 %	357383078
60	NC_016078	CG	3	6	3693	3698	0 %	0 %	50 %	50 %	357383078
61	NC_016078	CCGGT	2	10	3759	3768	0 %	20 %	40 %	40 %	357383078
62	NC_016078	GC	3	6	3784	3789	0 %	0 %	50 %	50 %	357383078
63	NC_016078	CGC	2	6	3953	3958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383079
64	NC_016078	GC	4	8	3983	3990	0 %	0 %	50 %	50 %	357383079
65	NC_016078	GCC	2	6	4043	4048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383079
66	NC_016078	CAT	2	6	4102	4107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357383079
67	NC_016078	CCA	2	6	4135	4140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357383079
68	NC_016078	CAT	2	6	4162	4167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357383079
69	NC_016078	AGC	2	6	4174	4179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357383079
70	NC_016078	GC	3	6	4178	4183	0 %	0 %	50 %	50 %	357383079
71	NC_016078	TGG	2	6	4189	4194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357383079
72	NC_016078	GCG	2	6	4212	4217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357383079
73	NC_016078	TC	3	6	4264	4269	0 %	50 %	0 %	50 %	357383079
74	NC_016078	CG	3	6	4278	4283	0 %	0 %	50 %	50 %	357383079
75	NC_016078	GCT	2	6	4301	4306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383079
76	NC_016078	CCTG	2	8	4405	4412	0 %	25 %	25 %	50 %	357383079
77	NC_016078	CCG	2	6	4425	4430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383079
78	NC_016078	ACC	2	6	4439	4444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357383079
79	NC_016078	CGA	2	6	4507	4512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357383079
80	NC_016078	GCACCT	2	12	4551	4562	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	357383079
81	NC_016078	CG	3	6	4685	4690	0 %	0 %	50 %	50 %	357383079
82	NC_016078	CAAT	2	8	4711	4718	50 %	25 %	0 %	25 %	357383079
83	NC_016078	CCG	2	6	4725	4730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383079
84	NC_016078	GGC	2	6	4787	4792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357383079
85	NC_016078	CA	3	6	4802	4807	50 %	0 %	0 %	50 %	357383079
86	NC_016078	CGG	2	6	4833	4838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357383079
87	NC_016078	GTCC	2	8	4864	4871	0 %	25 %	25 %	50 %	357383079
88	NC_016078	CGT	2	6	4879	4884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383079
89	NC_016078	GC	3	6	4895	4900	0 %	0 %	50 %	50 %	357383079
90	NC_016078	CGGC	2	8	4941	4948	0 %	0 %	50 %	50 %	357383079
91	NC_016078	ACC	2	6	5006	5011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357383079
92	NC_016078	GAA	2	6	5060	5065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357383079
93	NC_016078	CGG	2	6	5146	5151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357383079
94	NC_016078	TCA	2	6	5187	5192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357383079
95	NC_016078	CCG	2	6	5199	5204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383079
96	NC_016078	CAG	2	6	5255	5260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357383079
97	NC_016078	TCC	2	6	5382	5387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357383079
98	NC_016078	GACG	2	8	5420	5427	25 %	0 %	50 %	25 %	357383079
99	NC_016078	CGC	2	6	5455	5460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383079
100	NC_016078	GCC	2	6	5480	5485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383079
101	NC_016078	CTG	2	6	5522	5527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383079
102	NC_016078	AGA	2	6	5572	5577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357383079
103	NC_016078	CCCG	2	8	5586	5593	0 %	0 %	25 %	75 %	357383079
104	NC_016078	GCT	2	6	5724	5729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383080
105	NC_016078	CGC	2	6	5747	5752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383080
106	NC_016078	GTGC	2	8	5802	5809	0 %	25 %	50 %	25 %	357383080
107	NC_016078	CGA	2	6	5832	5837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357383080
108	NC_016078	CCAC	2	8	5846	5853	25 %	0 %	0 %	75 %	357383080
109	NC_016078	CAT	2	6	5862	5867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357383080
110	NC_016078	CGT	2	6	5877	5882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383080
111	NC_016078	GGCG	2	8	6000	6007	0 %	0 %	75 %	25 %	357383080
112	NC_016078	GCT	2	6	6023	6028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383080
113	NC_016078	CGCC	2	8	6063	6070	0 %	0 %	25 %	75 %	357383080
114	NC_016078	TCG	2	6	6077	6082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383080
115	NC_016078	GAA	2	6	6129	6134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357383080
116	NC_016078	GCT	2	6	6284	6289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383081
117	NC_016078	CG	3	6	6290	6295	0 %	0 %	50 %	50 %	357383081
118	NC_016078	CATCA	2	10	6303	6312	40 %	20 %	0 %	40 %	357383081
119	NC_016078	GGCT	2	8	6368	6375	0 %	25 %	50 %	25 %	357383081
120	NC_016078	CCA	2	6	6455	6460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357383081
121	NC_016078	CGG	2	6	6473	6478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357383081
122	NC_016078	TCC	3	9	6484	6492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357383081
123	NC_016078	TGC	2	6	6543	6548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383081
124	NC_016078	CGC	2	6	6557	6562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383081
125	NC_016078	CCT	2	6	6578	6583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357383081
126	NC_016078	AGCC	2	8	6609	6616	25 %	0 %	25 %	50 %	357383081
127	NC_016078	TGGG	2	8	6642	6649	0 %	25 %	75 %	0 %	357383081
128	NC_016078	AGGGC	2	10	6752	6761	20 %	0 %	60 %	20 %	357383081
129	NC_016078	GCC	2	6	6817	6822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383081
130	NC_016078	AGA	2	6	6845	6850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357383081
131	NC_016078	TGCGC	2	10	6851	6860	0 %	20 %	40 %	40 %	357383081
132	NC_016078	GTTTCC	2	12	6868	6879	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	357383081
133	NC_016078	CCA	3	9	6899	6907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357383081
134	NC_016078	GAG	2	6	6922	6927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357383081
135	NC_016078	GAA	2	6	6996	7001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357383081
136	NC_016078	CGT	2	6	7022	7027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383081
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138	NC_016078	CG	3	6	7169	7174	0 %	0 %	50 %	50 %	357383081
139	NC_016078	GC	3	6	7179	7184	0 %	0 %	50 %	50 %	357383081
140	NC_016078	CCA	2	6	7218	7223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357383081
141	NC_016078	CAG	2	6	7296	7301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357383081
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143	NC_016078	GAAC	2	8	7370	7377	50 %	0 %	25 %	25 %	357383081
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145	NC_016078	CGT	2	6	7467	7472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383081
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151	NC_016078	CGC	2	6	7794	7799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383081
152	NC_016078	CGG	2	6	7821	7826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357383081
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154	NC_016078	TCG	2	6	7939	7944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383081
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259	NC_016078	CG	3	6	13448	13453	0 %	0 %	50 %	50 %	357383087
260	NC_016078	TGA	2	6	13521	13526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357383087
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263	NC_016078	CGC	2	6	13602	13607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383088
264	NC_016078	GTC	2	6	13648	13653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383088
265	NC_016078	CCA	2	6	13707	13712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357383088
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267	NC_016078	GCA	2	6	13793	13798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357383088
268	NC_016078	CTCAT	2	10	13802	13811	20 %	40 %	0 %	40 %	357383088
269	NC_016078	GCG	2	6	13812	13817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357383088
270	NC_016078	GCG	2	6	13870	13875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357383088
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279	NC_016078	GAC	2	6	14208	14213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357383089
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288	NC_016078	T	6	6	14654	14659	0 %	100 %	0 %	0 %	357383089
289	NC_016078	GCC	2	6	14709	14714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383089
290	NC_016078	TGC	2	6	14740	14745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383089
291	NC_016078	TCC	2	6	14753	14758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357383089
292	NC_016078	AGCGC	2	10	14772	14781	20 %	0 %	40 %	40 %	357383089
293	NC_016078	GGCG	2	8	14785	14792	0 %	0 %	75 %	25 %	357383089
294	NC_016078	GTC	2	6	14801	14806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383089
295	NC_016078	TCG	2	6	14925	14930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383089
296	NC_016078	GTC	2	6	15005	15010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383089
297	NC_016078	CGGT	2	8	15036	15043	0 %	25 %	50 %	25 %	357383089
298	NC_016078	TCTCGG	2	12	15085	15096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383089
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300	NC_016078	CAT	2	6	15127	15132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357383089
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303	NC_016078	GTC	2	6	15248	15253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383089
304	NC_016078	GGC	2	6	15278	15283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357383089
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354	NC_016078	CG	3	6	18032	18037	0 %	0 %	50 %	50 %	357383092
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363	NC_016078	CGC	2	6	18554	18559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383093
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371	NC_016078	TGA	2	6	18881	18886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357383093
372	NC_016078	TCG	2	6	18937	18942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383093
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374	NC_016078	GCT	2	6	19007	19012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383093
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378	NC_016078	CGG	2	6	19184	19189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357383093
379	NC_016078	GGTGTG	2	12	19194	19205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357383093
380	NC_016078	ACGA	2	8	19356	19363	50 %	0 %	25 %	25 %	357383093
381	NC_016078	CGA	2	6	19409	19414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357383093
382	NC_016078	AAC	2	6	19416	19421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357383093
383	NC_016078	TCA	2	6	19429	19434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357383093
384	NC_016078	GC	3	6	19445	19450	0 %	0 %	50 %	50 %	357383093
385	NC_016078	ATC	2	6	19476	19481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357383093
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387	NC_016078	CCGGCC	2	12	19595	19606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383094
388	NC_016078	CT	3	6	19615	19620	0 %	50 %	0 %	50 %	357383094
389	NC_016078	CAA	2	6	19642	19647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357383094
390	NC_016078	CG	3	6	19695	19700	0 %	0 %	50 %	50 %	357383094
391	NC_016078	GCG	2	6	19785	19790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357383094
392	NC_016078	TCA	2	6	19815	19820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357383094
393	NC_016078	TCC	2	6	19829	19834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357383094
394	NC_016078	GCT	2	6	19936	19941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383094
395	NC_016078	GC	3	6	19961	19966	0 %	0 %	50 %	50 %	357383094
396	NC_016078	CGA	2	6	19987	19992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357383094
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398	NC_016078	CAG	2	6	20045	20050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357383094
399	NC_016078	CGA	2	6	20104	20109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357383094
400	NC_016078	CGA	2	6	20173	20178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357383094
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402	NC_016078	AACC	2	8	20290	20297	50 %	0 %	0 %	50 %	357383094
403	NC_016078	TGG	2	6	20319	20324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357383094
404	NC_016078	GCC	2	6	20325	20330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383094
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411	NC_016078	T	6	6	20668	20673	0 %	100 %	0 %	0 %	357383094
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413	NC_016078	CCGCC	2	10	20785	20794	0 %	0 %	20 %	80 %	357383094
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420	NC_016078	TCG	2	6	21051	21056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383094
421	NC_016078	CCG	2	6	21075	21080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383094
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423	NC_016078	ATC	2	6	21190	21195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357383095
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496	NC_016078	GC	3	6	24151	24156	0 %	0 %	50 %	50 %	357383098
497	NC_016078	CGG	2	6	24168	24173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357383098
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499	NC_016078	AGG	2	6	24198	24203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357383098
500	NC_016078	GCCG	2	8	24241	24248	0 %	0 %	50 %	50 %	357383098

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