MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrolobus fumarii 1A chromosome

Total Repeats: 33347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015931	GA	3	6	233	238	50 %	0 %	50 %	0 %	347522555
2	NC_015931	TA	3	6	287	292	50 %	50 %	0 %	0 %	347522555
3	NC_015931	CG	3	6	326	331	0 %	0 %	50 %	50 %	347522555
4	NC_015931	GAG	2	6	436	441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522555
5	NC_015931	AT	3	6	485	490	50 %	50 %	0 %	0 %	347522555
6	NC_015931	GCAG	2	8	498	505	25 %	0 %	50 %	25 %	347522555
7	NC_015931	CGTG	2	8	553	560	0 %	25 %	50 %	25 %	347522555
8	NC_015931	CT	3	6	575	580	0 %	50 %	0 %	50 %	347522555
9	NC_015931	AGG	2	6	608	613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522555
10	NC_015931	AAG	2	6	617	622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347522555
11	NC_015931	TAG	2	6	639	644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347522555
12	NC_015931	CGA	2	6	685	690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347522555
13	NC_015931	CTG	2	6	692	697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347522555
14	NC_015931	CGC	2	6	736	741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347522555
15	NC_015931	CAT	2	6	751	756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347522555
16	NC_015931	ACGA	2	8	764	771	50 %	0 %	25 %	25 %	347522555
17	NC_015931	GTA	2	6	807	812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347522555
18	NC_015931	GAG	3	9	821	829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522555
19	NC_015931	AGC	2	6	855	860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347522555
20	NC_015931	GCG	2	6	938	943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347522555
21	NC_015931	CGC	2	6	946	951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347522555
22	NC_015931	AG	3	6	953	958	50 %	0 %	50 %	0 %	347522555
23	NC_015931	TGGC	2	8	996	1003	0 %	25 %	50 %	25 %	347522555
24	NC_015931	AG	3	6	1012	1017	50 %	0 %	50 %	0 %	347522555
25	NC_015931	GC	3	6	1054	1059	0 %	0 %	50 %	50 %	347522555
26	NC_015931	AG	3	6	1072	1077	50 %	0 %	50 %	0 %	347522555
27	NC_015931	GAGG	2	8	1087	1094	25 %	0 %	75 %	0 %	347522555
28	NC_015931	ACG	2	6	1175	1180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347522555
29	NC_015931	AG	3	6	1228	1233	50 %	0 %	50 %	0 %	347522555
30	NC_015931	GAT	2	6	1333	1338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347522555
31	NC_015931	GA	3	6	1366	1371	50 %	0 %	50 %	0 %	347522555
32	NC_015931	AGG	2	6	1544	1549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522556
33	NC_015931	AGG	2	6	1717	1722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522556
34	NC_015931	CGA	2	6	1746	1751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347522556
35	NC_015931	CG	3	6	1781	1786	0 %	0 %	50 %	50 %	347522556
36	NC_015931	GGT	2	6	1934	1939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347522556
37	NC_015931	TAA	2	6	1957	1962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347522556
38	NC_015931	GTT	2	6	2014	2019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347522557
39	NC_015931	AGG	2	6	2059	2064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522557
40	NC_015931	GAG	2	6	2074	2079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522557
41	NC_015931	GCG	2	6	2087	2092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347522557
42	NC_015931	AGT	2	6	2094	2099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347522557
43	NC_015931	GAA	2	6	2106	2111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347522557
44	NC_015931	TGC	2	6	2144	2149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347522557
45	NC_015931	GAA	2	6	2184	2189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347522557
46	NC_015931	GCT	2	6	2302	2307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347522557
47	NC_015931	GATA	2	8	2382	2389	50 %	25 %	25 %	0 %	347522557
48	NC_015931	AG	4	8	2493	2500	50 %	0 %	50 %	0 %	347522557
49	NC_015931	GCC	2	6	2523	2528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347522557
50	NC_015931	GCG	2	6	2591	2596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347522557
51	NC_015931	CCT	2	6	2650	2655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347522558
52	NC_015931	CGG	2	6	2684	2689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347522558
53	NC_015931	CT	3	6	2690	2695	0 %	50 %	0 %	50 %	347522558
54	NC_015931	ACCCT	2	10	2698	2707	20 %	20 %	0 %	60 %	347522558
55	NC_015931	GAG	2	6	2712	2717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522558
56	NC_015931	ACC	2	6	2743	2748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347522558
57	NC_015931	TCG	2	6	2749	2754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347522558
58	NC_015931	AGG	2	6	2785	2790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522558
59	NC_015931	CTC	2	6	2841	2846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347522558
60	NC_015931	CGC	2	6	2850	2855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347522558
61	NC_015931	GAG	2	6	2961	2966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522558
62	NC_015931	CCT	2	6	2976	2981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347522558
63	NC_015931	CGC	2	6	2982	2987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347522558
64	NC_015931	CT	3	6	2997	3002	0 %	50 %	0 %	50 %	347522558
65	NC_015931	TCC	2	6	3038	3043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347522559
66	NC_015931	CTC	2	6	3070	3075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347522559
67	NC_015931	AC	4	8	3266	3273	50 %	0 %	0 %	50 %	347522559
68	NC_015931	GAG	3	9	3313	3321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522559
69	NC_015931	CA	3	6	3353	3358	50 %	0 %	0 %	50 %	347522559
70	NC_015931	TCT	2	6	3368	3373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347522559
71	NC_015931	ATG	2	6	3374	3379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347522559
72	NC_015931	CTC	2	6	3409	3414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347522559
73	NC_015931	CT	3	6	3417	3422	0 %	50 %	0 %	50 %	347522559
74	NC_015931	AGC	2	6	3451	3456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347522559
75	NC_015931	TC	3	6	3457	3462	0 %	50 %	0 %	50 %	347522559
76	NC_015931	GGT	2	6	3488	3493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347522559
77	NC_015931	CTAGC	2	10	3534	3543	20 %	20 %	20 %	40 %	347522559
78	NC_015931	AGCC	2	8	3571	3578	25 %	0 %	25 %	50 %	347522559
79	NC_015931	CTC	2	6	3602	3607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347522559
80	NC_015931	CCACG	2	10	3655	3664	20 %	0 %	20 %	60 %	347522559
81	NC_015931	GTC	2	6	3667	3672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347522559
82	NC_015931	TC	3	6	3739	3744	0 %	50 %	0 %	50 %	347522559
83	NC_015931	GGC	2	6	3764	3769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347522559
84	NC_015931	AGT	2	6	3783	3788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347522559
85	NC_015931	GCG	2	6	3949	3954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347522559
86	NC_015931	GAG	2	6	3969	3974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522559
87	NC_015931	GGA	2	6	4127	4132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522559
88	NC_015931	GCC	2	6	4216	4221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347522559
89	NC_015931	CAA	2	6	4269	4274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347522559
90	NC_015931	GCA	2	6	4350	4355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347522559
91	NC_015931	TCG	2	6	4364	4369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347522559
92	NC_015931	CTA	2	6	4389	4394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347522559
93	NC_015931	CAA	2	6	4434	4439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347522559
94	NC_015931	CAA	2	6	4455	4460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347522559
95	NC_015931	CCCA	2	8	4525	4532	25 %	0 %	0 %	75 %	347522559
96	NC_015931	GTA	2	6	4603	4608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347522559
97	NC_015931	TGA	2	6	4680	4685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347522559
98	NC_015931	TCG	2	6	4733	4738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347522559
99	NC_015931	CAC	2	6	4805	4810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347522559
100	NC_015931	CGA	2	6	4833	4838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347522559
101	NC_015931	GCA	2	6	4856	4861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347522559
102	NC_015931	CTAG	2	8	4937	4944	25 %	25 %	25 %	25 %	347522559
103	NC_015931	CT	3	6	4946	4951	0 %	50 %	0 %	50 %	347522559
104	NC_015931	CTC	2	6	4970	4975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347522559
105	NC_015931	ATC	2	6	5025	5030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347522560
106	NC_015931	C	6	6	5045	5050	0 %	0 %	0 %	100 %	347522560
107	NC_015931	ATA	2	6	5091	5096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347522560
108	NC_015931	GAG	2	6	5118	5123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522560
109	NC_015931	GGC	2	6	5174	5179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347522560
110	NC_015931	CACT	2	8	5235	5242	25 %	25 %	0 %	50 %	347522560
111	NC_015931	TAC	2	6	5292	5297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347522560
112	NC_015931	TAC	2	6	5317	5322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347522560
113	NC_015931	AAC	2	6	5408	5413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347522560
114	NC_015931	CGG	2	6	5622	5627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347522561
115	NC_015931	CGA	2	6	5639	5644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347522561
116	NC_015931	TAG	2	6	5658	5663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347522561
117	NC_015931	GGC	2	6	5836	5841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347522561
118	NC_015931	TCACG	2	10	5990	5999	20 %	20 %	20 %	40 %	347522561
119	NC_015931	CG	3	6	5998	6003	0 %	0 %	50 %	50 %	347522561
120	NC_015931	AAG	2	6	6055	6060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347522561
121	NC_015931	AGCT	2	8	6087	6094	25 %	25 %	25 %	25 %	347522561
122	NC_015931	GCCTC	2	10	6112	6121	0 %	20 %	20 %	60 %	347522561
123	NC_015931	CTT	2	6	6361	6366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347522562
124	NC_015931	CTT	2	6	6444	6449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347522562
125	NC_015931	CCG	2	6	6460	6465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347522562
126	NC_015931	CT	3	6	6520	6525	0 %	50 %	0 %	50 %	347522562
127	NC_015931	CAA	2	6	6560	6565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347522562
128	NC_015931	GTC	2	6	6804	6809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347522562
129	NC_015931	TCC	2	6	6818	6823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347522562
130	NC_015931	ACC	2	6	6895	6900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347522562
131	NC_015931	GTA	2	6	6936	6941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347522562
132	NC_015931	TCG	2	6	6959	6964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347522562
133	NC_015931	GC	3	6	6975	6980	0 %	0 %	50 %	50 %	347522562
134	NC_015931	TCG	2	6	7006	7011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347522562
135	NC_015931	ATA	2	6	7014	7019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347522562
136	NC_015931	CCT	2	6	7020	7025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347522562
137	NC_015931	G	6	6	7038	7043	0 %	0 %	100 %	0 %	347522562
138	NC_015931	GGT	2	6	7203	7208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347522563
139	NC_015931	TGC	2	6	7244	7249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347522563
140	NC_015931	AG	3	6	7251	7256	50 %	0 %	50 %	0 %	347522563
141	NC_015931	GAT	3	9	7309	7317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347522563
142	NC_015931	GGA	2	6	7388	7393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522563
143	NC_015931	GA	3	6	7397	7402	50 %	0 %	50 %	0 %	347522563
144	NC_015931	TGT	2	6	7455	7460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347522563
145	NC_015931	CCG	2	6	7486	7491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347522563
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147	NC_015931	AGA	2	6	7527	7532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347522563
148	NC_015931	ACG	2	6	7596	7601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347522563
149	NC_015931	TGGT	2	8	7684	7691	0 %	50 %	50 %	0 %	347522563
150	NC_015931	CAT	2	6	7997	8002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347522563
151	NC_015931	ACACG	2	10	8034	8043	40 %	0 %	20 %	40 %	347522563
152	NC_015931	GGC	2	6	8112	8117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347522563
153	NC_015931	AGG	2	6	8121	8126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522563
154	NC_015931	TAC	2	6	8137	8142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347522563
155	NC_015931	TAC	2	6	8168	8173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347522563
156	NC_015931	CAC	2	6	8245	8250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347522563
157	NC_015931	CTC	2	6	8375	8380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347522564
158	NC_015931	TGT	2	6	8494	8499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347522564
159	NC_015931	GTAT	2	8	8509	8516	25 %	50 %	25 %	0 %	347522564
160	NC_015931	CG	3	6	8522	8527	0 %	0 %	50 %	50 %	347522564
161	NC_015931	CT	3	6	8576	8581	0 %	50 %	0 %	50 %	347522564
162	NC_015931	TAG	2	6	8588	8593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347522564
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164	NC_015931	AAC	2	6	8730	8735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347522564
165	NC_015931	CTC	2	6	8753	8758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347522564
166	NC_015931	GCTC	2	8	8859	8866	0 %	25 %	25 %	50 %	347522564
167	NC_015931	GT	3	6	8867	8872	0 %	50 %	50 %	0 %	347522564
168	NC_015931	TAT	2	6	8948	8953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347522564
169	NC_015931	CT	3	6	8975	8980	0 %	50 %	0 %	50 %	347522564
170	NC_015931	ATC	2	6	8994	8999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347522564
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172	NC_015931	CGGG	2	8	9083	9090	0 %	0 %	75 %	25 %	347522564
173	NC_015931	CGTA	2	8	9110	9117	25 %	25 %	25 %	25 %	347522564
174	NC_015931	C	6	6	9172	9177	0 %	0 %	0 %	100 %	347522564
175	NC_015931	GGA	2	6	9273	9278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522564
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177	NC_015931	AC	3	6	9406	9411	50 %	0 %	0 %	50 %	347522565
178	NC_015931	GCA	2	6	9430	9435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347522565
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183	NC_015931	CTT	2	6	9706	9711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347522565
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245	NC_015931	CATT	2	8	13139	13146	25 %	50 %	0 %	25 %	347522570
246	NC_015931	CAA	2	6	13214	13219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347522570
247	NC_015931	ATCCTC	2	12	13305	13316	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	347522570
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249	NC_015931	CG	3	6	13390	13395	0 %	0 %	50 %	50 %	347522570
250	NC_015931	CAG	2	6	13455	13460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347522570
251	NC_015931	CGC	2	6	13484	13489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347522570
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254	NC_015931	CT	3	6	13782	13787	0 %	50 %	0 %	50 %	347522570
255	NC_015931	CCAC	2	8	13840	13847	25 %	0 %	0 %	75 %	347522570
256	NC_015931	GT	3	6	13854	13859	0 %	50 %	50 %	0 %	347522570
257	NC_015931	ACA	2	6	13959	13964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347522570
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261	NC_015931	CTC	2	6	14106	14111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347522570
262	NC_015931	TGG	2	6	14251	14256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347522571
263	NC_015931	GA	3	6	14271	14276	50 %	0 %	50 %	0 %	347522571
264	NC_015931	CGC	2	6	14277	14282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347522571
265	NC_015931	GCAC	2	8	14307	14314	25 %	0 %	25 %	50 %	347522571
266	NC_015931	TTC	2	6	14335	14340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347522571
267	NC_015931	ATG	3	9	14341	14349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347522571
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269	NC_015931	TCGTA	2	10	14528	14537	20 %	40 %	20 %	20 %	347522571
270	NC_015931	CTGGC	2	10	14574	14583	0 %	20 %	40 %	40 %	347522571
271	NC_015931	GGAG	2	8	14623	14630	25 %	0 %	75 %	0 %	347522571
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273	NC_015931	GGA	2	6	14720	14725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522571
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279	NC_015931	CTC	2	6	15116	15121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347522572
280	NC_015931	ATC	2	6	15146	15151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347522572
281	NC_015931	CAT	2	6	15232	15237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347522572
282	NC_015931	ACT	2	6	15252	15257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347522572
283	NC_015931	CCT	2	6	15289	15294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347522572
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285	NC_015931	GCAC	2	8	15408	15415	25 %	0 %	25 %	50 %	347522572
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287	NC_015931	ACG	2	6	15777	15782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347522573
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290	NC_015931	AGA	2	6	16032	16037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347522574
291	NC_015931	ACC	2	6	16121	16126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347522574
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362	NC_015931	CAT	2	6	20087	20092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347522579
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375	NC_015931	CT	3	6	20927	20932	0 %	50 %	0 %	50 %	347522580
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387	NC_015931	CGCT	2	8	21501	21508	0 %	25 %	25 %	50 %	347522581
388	NC_015931	AGC	2	6	21545	21550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347522581
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390	NC_015931	CCT	2	6	21634	21639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347522581
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499	NC_015931	TCT	2	6	27203	27208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347522587
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