MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrolobus fumarii 1A chromosome

Total Repeats: 33347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_015931	CGC	3	9	1175632	1175640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523810
21002	NC_015931	GCC	2	6	1175656	1175661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523810
21003	NC_015931	CCA	2	6	1175670	1175675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523810
21004	NC_015931	CGC	2	6	1175682	1175687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523810
21005	NC_015931	CTC	2	6	1175699	1175704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523810
21006	NC_015931	CCT	3	9	1175718	1175726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523810
21007	NC_015931	GTC	2	6	1175764	1175769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523810
21008	NC_015931	CGG	2	6	1175812	1175817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523810
21009	NC_015931	CCT	2	6	1175878	1175883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523810
21010	NC_015931	CTC	2	6	1175923	1175928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523810
21011	NC_015931	CGCC	2	8	1176095	1176102	0 %	0 %	25 %	75 %	347523810
21012	NC_015931	CCG	2	6	1176117	1176122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523810
21013	NC_015931	AC	3	6	1176286	1176291	50 %	0 %	0 %	50 %	347523810
21014	NC_015931	CTC	2	6	1176331	1176336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523810
21015	NC_015931	ACC	2	6	1176339	1176344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523810
21016	NC_015931	TAC	2	6	1176360	1176365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523810
21017	NC_015931	TCG	2	6	1176375	1176380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523810
21018	NC_015931	CCT	2	6	1176397	1176402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523810
21019	NC_015931	ATAC	2	8	1176624	1176631	50 %	25 %	0 %	25 %	347523811
21020	NC_015931	CTC	2	6	1176726	1176731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523811
21021	NC_015931	AGG	2	6	1176757	1176762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523811
21022	NC_015931	ATA	2	6	1176836	1176841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347523811
21023	NC_015931	TCC	2	6	1176861	1176866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523811
21024	NC_015931	AC	3	6	1176878	1176883	50 %	0 %	0 %	50 %	347523811
21025	NC_015931	CTG	2	6	1176933	1176938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523811
21026	NC_015931	AAC	2	6	1177003	1177008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523811
21027	NC_015931	TGT	2	6	1177035	1177040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523811
21028	NC_015931	TGG	2	6	1177077	1177082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523811
21029	NC_015931	AAC	2	6	1177149	1177154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523811
21030	NC_015931	ATG	2	6	1177179	1177184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523811
21031	NC_015931	ACA	2	6	1177187	1177192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523811
21032	NC_015931	GGC	2	6	1177238	1177243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523811
21033	NC_015931	TCA	2	6	1177281	1177286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523811
21034	NC_015931	ACA	2	6	1177327	1177332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523811
21035	NC_015931	TCC	2	6	1177336	1177341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523811
21036	NC_015931	AAT	2	6	1177375	1177380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347523811
21037	NC_015931	GCT	2	6	1177469	1177474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523811
21038	NC_015931	ACA	2	6	1177571	1177576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523811
21039	NC_015931	CTT	2	6	1177609	1177614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523812
21040	NC_015931	AT	3	6	1177618	1177623	50 %	50 %	0 %	0 %	347523812
21041	NC_015931	AGG	2	6	1177652	1177657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523812
21042	NC_015931	CGG	2	6	1177674	1177679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523812
21043	NC_015931	GTT	2	6	1177711	1177716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523812
21044	NC_015931	ACG	2	6	1177832	1177837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523812
21045	NC_015931	TCCC	2	8	1177881	1177888	0 %	25 %	0 %	75 %	347523813
21046	NC_015931	ACC	2	6	1177972	1177977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523813
21047	NC_015931	GCT	2	6	1178008	1178013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523813
21048	NC_015931	ACGATG	2	12	1178107	1178118	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347523813
21049	NC_015931	CCT	2	6	1178186	1178191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523813
21050	NC_015931	CGG	2	6	1178234	1178239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523813
21051	NC_015931	CGC	2	6	1178246	1178251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523813
21052	NC_015931	CCT	2	6	1178297	1178302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523813
21053	NC_015931	CGAG	2	8	1178375	1178382	25 %	0 %	50 %	25 %	347523813
21054	NC_015931	GTC	2	6	1178457	1178462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523814
21055	NC_015931	TC	3	6	1178533	1178538	0 %	50 %	0 %	50 %	347523814
21056	NC_015931	TTC	2	6	1178551	1178556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523814
21057	NC_015931	GTT	2	6	1178592	1178597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523814
21058	NC_015931	TGAAGC	2	12	1178639	1178650	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347523814
21059	NC_015931	CCT	2	6	1178666	1178671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523814
21060	NC_015931	TTC	2	6	1178680	1178685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523814
21061	NC_015931	AGC	2	6	1178743	1178748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523814
21062	NC_015931	GTT	2	6	1178859	1178864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523814
21063	NC_015931	CGC	2	6	1178945	1178950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523814
21064	NC_015931	GAC	2	6	1178955	1178960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523814
21065	NC_015931	GGC	2	6	1179011	1179016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523814
21066	NC_015931	CTT	2	6	1179096	1179101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523814
21067	NC_015931	TCA	2	6	1179155	1179160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523814
21068	NC_015931	GT	3	6	1179190	1179195	0 %	50 %	50 %	0 %	347523814
21069	NC_015931	TAGCG	2	10	1179212	1179221	20 %	20 %	40 %	20 %	347523814
21070	NC_015931	CT	3	6	1179234	1179239	0 %	50 %	0 %	50 %	347523814
21071	NC_015931	CT	4	8	1179247	1179254	0 %	50 %	0 %	50 %	347523814
21072	NC_015931	CT	3	6	1179332	1179337	0 %	50 %	0 %	50 %	347523815
21073	NC_015931	CTC	2	6	1179343	1179348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523815
21074	NC_015931	TGG	2	6	1179355	1179360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523815
21075	NC_015931	GCC	2	6	1179400	1179405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523815
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21077	NC_015931	TCT	2	6	1179462	1179467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523815
21078	NC_015931	AG	3	6	1179531	1179536	50 %	0 %	50 %	0 %	347523815
21079	NC_015931	CTC	2	6	1179575	1179580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523815
21080	NC_015931	CG	3	6	1179583	1179588	0 %	0 %	50 %	50 %	347523815
21081	NC_015931	TCG	2	6	1179629	1179634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523815
21082	NC_015931	CGA	2	6	1179651	1179656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523815
21083	NC_015931	CA	3	6	1179684	1179689	50 %	0 %	0 %	50 %	347523815
21084	NC_015931	TGG	2	6	1179704	1179709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523815
21085	NC_015931	ATC	2	6	1179721	1179726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523815
21086	NC_015931	CGCCA	2	10	1179733	1179742	20 %	0 %	20 %	60 %	347523815
21087	NC_015931	TCC	2	6	1179815	1179820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523815
21088	NC_015931	TGG	2	6	1179853	1179858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523815
21089	NC_015931	CAC	2	6	1179886	1179891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523815
21090	NC_015931	CAG	2	6	1179978	1179983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523815
21091	NC_015931	CTG	2	6	1180090	1180095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523815
21092	NC_015931	TGGCC	2	10	1180107	1180116	0 %	20 %	40 %	40 %	347523815
21093	NC_015931	CAC	2	6	1180150	1180155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523815
21094	NC_015931	TCA	2	6	1180167	1180172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523815
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21096	NC_015931	GTCG	2	8	1180348	1180355	0 %	25 %	50 %	25 %	347523815
21097	NC_015931	GAA	2	6	1180378	1180383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523815
21098	NC_015931	CCAG	2	8	1180391	1180398	25 %	0 %	25 %	50 %	347523815
21099	NC_015931	AGT	2	6	1180437	1180442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523815
21100	NC_015931	CTC	2	6	1180471	1180476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523815
21101	NC_015931	CTC	2	6	1180530	1180535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523816
21102	NC_015931	CTC	2	6	1180543	1180548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523816
21103	NC_015931	TCT	2	6	1180616	1180621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523816
21104	NC_015931	CAT	2	6	1180650	1180655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523816
21105	NC_015931	GGCTG	2	10	1180668	1180677	0 %	20 %	60 %	20 %	347523816
21106	NC_015931	TAG	2	6	1180731	1180736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523816
21107	NC_015931	GGCA	2	8	1180774	1180781	25 %	0 %	50 %	25 %	347523816
21108	NC_015931	GAG	2	6	1180797	1180802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523816
21109	NC_015931	GCG	2	6	1180987	1180992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523816
21110	NC_015931	GCG	2	6	1180999	1181004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523816
21111	NC_015931	CGA	2	6	1181033	1181038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523816
21112	NC_015931	GAT	3	9	1181103	1181111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523816
21113	NC_015931	GCC	2	6	1181133	1181138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523816
21114	NC_015931	GGT	2	6	1181150	1181155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523816
21115	NC_015931	CGA	2	6	1181171	1181176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523816
21116	NC_015931	TCG	2	6	1181236	1181241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523816
21117	NC_015931	GCG	2	6	1181304	1181309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523816
21118	NC_015931	CCTG	2	8	1181321	1181328	0 %	25 %	25 %	50 %	347523816
21119	NC_015931	GAT	2	6	1181334	1181339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523816
21120	NC_015931	GC	3	6	1181407	1181412	0 %	0 %	50 %	50 %	347523816
21121	NC_015931	GAC	2	6	1181442	1181447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523816
21122	NC_015931	CAT	2	6	1181486	1181491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523816
21123	NC_015931	GCT	2	6	1181531	1181536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523816
21124	NC_015931	GGAG	2	8	1181546	1181553	25 %	0 %	75 %	0 %	347523816
21125	NC_015931	TTC	2	6	1181599	1181604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523816
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21128	NC_015931	GC	3	6	1181749	1181754	0 %	0 %	50 %	50 %	347523816
21129	NC_015931	AGC	2	6	1181755	1181760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523816
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21132	NC_015931	CGC	2	6	1182159	1182164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523817
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21136	NC_015931	CTC	2	6	1182322	1182327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523817
21137	NC_015931	TCC	2	6	1182422	1182427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523817
21138	NC_015931	GCC	2	6	1182433	1182438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523817
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21143	NC_015931	TGGC	2	8	1182531	1182538	0 %	25 %	50 %	25 %	347523817
21144	NC_015931	CCA	2	6	1182572	1182577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523817
21145	NC_015931	CAC	2	6	1182586	1182591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523817
21146	NC_015931	CCTC	2	8	1182711	1182718	0 %	25 %	0 %	75 %	347523817
21147	NC_015931	CCT	2	6	1182724	1182729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523817
21148	NC_015931	CCT	2	6	1182747	1182752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523817
21149	NC_015931	CCTC	2	8	1182756	1182763	0 %	25 %	0 %	75 %	347523817
21150	NC_015931	CGC	2	6	1182844	1182849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523817
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21152	NC_015931	CTA	2	6	1182975	1182980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523817
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21154	NC_015931	ATG	2	6	1183162	1183167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523818
21155	NC_015931	GTT	3	9	1183170	1183178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523818
21156	NC_015931	TGC	2	6	1183214	1183219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523818
21157	NC_015931	CGG	2	6	1183276	1183281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523818
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21163	NC_015931	TGC	2	6	1183435	1183440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523818
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21172	NC_015931	CGG	2	6	1183727	1183732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523818
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21179	NC_015931	GA	3	6	1183927	1183932	50 %	0 %	50 %	0 %	347523818
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21181	NC_015931	GGC	2	6	1184034	1184039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523818
21182	NC_015931	TGC	2	6	1184044	1184049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523818
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21185	NC_015931	GAGG	2	8	1184102	1184109	25 %	0 %	75 %	0 %	347523818
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21187	NC_015931	GTAGAC	2	12	1184190	1184201	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347523818
21188	NC_015931	GTT	2	6	1184231	1184236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523818
21189	NC_015931	TGCA	2	8	1184252	1184259	25 %	25 %	25 %	25 %	347523818
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21194	NC_015931	TGC	2	6	1184422	1184427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523818
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21197	NC_015931	GAG	2	6	1184511	1184516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523818
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21200	NC_015931	GCT	2	6	1184670	1184675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523818
21201	NC_015931	GA	4	8	1184684	1184691	50 %	0 %	50 %	0 %	347523818
21202	NC_015931	ACT	2	6	1184740	1184745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523818
21203	NC_015931	GGA	2	6	1184794	1184799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523818
21204	NC_015931	TGAGG	2	10	1184804	1184813	20 %	20 %	60 %	0 %	347523818
21205	NC_015931	GC	3	6	1184831	1184836	0 %	0 %	50 %	50 %	347523818
21206	NC_015931	CTA	2	6	1184837	1184842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523818
21207	NC_015931	GTG	2	6	1184851	1184856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523819
21208	NC_015931	TGG	2	6	1184896	1184901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523819
21209	NC_015931	GAG	2	6	1184965	1184970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523819
21210	NC_015931	GGCT	2	8	1184994	1185001	0 %	25 %	50 %	25 %	347523819
21211	NC_015931	GGCT	2	8	1185053	1185060	0 %	25 %	50 %	25 %	347523819
21212	NC_015931	TGA	2	6	1185090	1185095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523819
21213	NC_015931	CTT	2	6	1185123	1185128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523819
21214	NC_015931	TCG	2	6	1185146	1185151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523819
21215	NC_015931	AGG	2	6	1185157	1185162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523819
21216	NC_015931	AGA	2	6	1185254	1185259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523819
21217	NC_015931	GGA	2	6	1185414	1185419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523819
21218	NC_015931	GC	3	6	1185461	1185466	0 %	0 %	50 %	50 %	347523819
21219	NC_015931	ACG	2	6	1185513	1185518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523819
21220	NC_015931	GGC	2	6	1185542	1185547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523819
21221	NC_015931	C	6	6	1185697	1185702	0 %	0 %	0 %	100 %	347523819
21222	NC_015931	TGA	2	6	1185741	1185746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523819
21223	NC_015931	CTA	2	6	1185764	1185769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523820
21224	NC_015931	CA	3	6	1185799	1185804	50 %	0 %	0 %	50 %	347523820
21225	NC_015931	AGGG	2	8	1185809	1185816	25 %	0 %	75 %	0 %	347523820
21226	NC_015931	GAG	2	6	1185819	1185824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523820
21227	NC_015931	GCG	2	6	1185883	1185888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523820
21228	NC_015931	AGA	2	6	1185893	1185898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523820
21229	NC_015931	AAG	2	6	1185903	1185908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523820
21230	NC_015931	AG	3	6	1185917	1185922	50 %	0 %	50 %	0 %	347523820
21231	NC_015931	GAA	2	6	1185950	1185955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523820
21232	NC_015931	AGCAT	2	10	1186047	1186056	40 %	20 %	20 %	20 %	347523820
21233	NC_015931	AGCCC	2	10	1186072	1186081	20 %	0 %	20 %	60 %	347523820
21234	NC_015931	TGC	2	6	1186275	1186280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523820
21235	NC_015931	TGC	2	6	1186295	1186300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523820
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21345	NC_015931	GCA	2	6	1191806	1191811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523827
21346	NC_015931	CGT	2	6	1191816	1191821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523827
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21465	NC_015931	CGA	3	9	1198313	1198321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523835
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21467	NC_015931	GGT	2	6	1198465	1198470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523835
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21491	NC_015931	TGG	2	6	1199661	1199666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523836
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