MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrolobus fumarii 1A chromosome

Total Repeats: 33347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_015931	TTC	2	6	1082500	1082505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523696
19503	NC_015931	TGG	3	9	1082591	1082599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523696
19504	NC_015931	GC	3	6	1082615	1082620	0 %	0 %	50 %	50 %	347523696
19505	NC_015931	CGG	2	6	1082634	1082639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523696
19506	NC_015931	AGC	2	6	1082674	1082679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523696
19507	NC_015931	GGC	2	6	1082728	1082733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523696
19508	NC_015931	CG	3	6	1082756	1082761	0 %	0 %	50 %	50 %	347523696
19509	NC_015931	CTA	2	6	1082769	1082774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523696
19510	NC_015931	ACC	2	6	1082827	1082832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523696
19511	NC_015931	CTT	2	6	1082916	1082921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523696
19512	NC_015931	GCCG	2	8	1082931	1082938	0 %	0 %	50 %	50 %	347523696
19513	NC_015931	GTG	2	6	1082977	1082982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523696
19514	NC_015931	CCT	2	6	1083069	1083074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523696
19515	NC_015931	GCC	2	6	1083093	1083098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523696
19516	NC_015931	CCT	2	6	1083108	1083113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523696
19517	NC_015931	CTA	2	6	1083219	1083224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523696
19518	NC_015931	CTC	2	6	1083235	1083240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523696
19519	NC_015931	C	6	6	1083252	1083257	0 %	0 %	0 %	100 %	347523696
19520	NC_015931	CA	3	6	1083275	1083280	50 %	0 %	0 %	50 %	347523696
19521	NC_015931	GGCG	2	8	1083378	1083385	0 %	0 %	75 %	25 %	347523696
19522	NC_015931	ACC	2	6	1083409	1083414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523696
19523	NC_015931	CGA	3	9	1083431	1083439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523696
19524	NC_015931	CGGCAC	2	12	1083441	1083452	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	347523696
19525	NC_015931	ACC	2	6	1083500	1083505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523696
19526	NC_015931	CCT	2	6	1083531	1083536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523696
19527	NC_015931	AGT	2	6	1083547	1083552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523696
19528	NC_015931	CAG	2	6	1083785	1083790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523696
19529	NC_015931	GGT	2	6	1083849	1083854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523696
19530	NC_015931	CCCG	2	8	1083880	1083887	0 %	0 %	25 %	75 %	347523696
19531	NC_015931	GTG	2	6	1083892	1083897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523696
19532	NC_015931	AGG	2	6	1083916	1083921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523696
19533	NC_015931	CCCA	2	8	1084004	1084011	25 %	0 %	0 %	75 %	347523696
19534	NC_015931	TCG	3	9	1084049	1084057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523696
19535	NC_015931	GTA	2	6	1084081	1084086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523696
19536	NC_015931	GCT	2	6	1084125	1084130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523696
19537	NC_015931	TAG	2	6	1084205	1084210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523696
19538	NC_015931	TAC	2	6	1084258	1084263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523696
19539	NC_015931	TCG	2	6	1084271	1084276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523696
19540	NC_015931	ACG	2	6	1084303	1084308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523696
19541	NC_015931	ACGAG	2	10	1084511	1084520	40 %	0 %	40 %	20 %	347523696
19542	NC_015931	CGA	2	6	1084601	1084606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523696
19543	NC_015931	CGG	2	6	1084631	1084636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523696
19544	NC_015931	CGT	2	6	1084671	1084676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523696
19545	NC_015931	CTA	2	6	1084790	1084795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523696
19546	NC_015931	GTC	2	6	1084843	1084848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523696
19547	NC_015931	CAG	2	6	1084913	1084918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523696
19548	NC_015931	ACC	2	6	1085000	1085005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523696
19549	NC_015931	CTC	2	6	1085029	1085034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523696
19550	NC_015931	AGGA	2	8	1085149	1085156	50 %	0 %	50 %	0 %	347523696
19551	NC_015931	GC	3	6	1085240	1085245	0 %	0 %	50 %	50 %	347523696
19552	NC_015931	GCG	2	6	1085302	1085307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523696
19553	NC_015931	CGA	2	6	1085433	1085438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523696
19554	NC_015931	ACC	2	6	1085501	1085506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523696
19555	NC_015931	AGG	2	6	1085534	1085539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523696
19556	NC_015931	GAT	2	6	1085556	1085561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523696
19557	NC_015931	ATA	2	6	1085605	1085610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347523696
19558	NC_015931	GCT	2	6	1085682	1085687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523696
19559	NC_015931	AGG	2	6	1085690	1085695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523696
19560	NC_015931	GCTCT	2	10	1085750	1085759	0 %	40 %	20 %	40 %	347523697
19561	NC_015931	CTC	2	6	1085786	1085791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523697
19562	NC_015931	CAC	2	6	1085885	1085890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523697
19563	NC_015931	ATT	2	6	1086193	1086198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347523698
19564	NC_015931	AGG	2	6	1086224	1086229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523698
19565	NC_015931	AG	3	6	1086267	1086272	50 %	0 %	50 %	0 %	347523698
19566	NC_015931	TAT	2	6	1086636	1086641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347523699
19567	NC_015931	GGA	2	6	1086748	1086753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523699
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19573	NC_015931	AGT	3	9	1087252	1087260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523700
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19584	NC_015931	AGT	2	6	1088041	1088046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523701
19585	NC_015931	AGT	2	6	1088078	1088083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523701
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19587	NC_015931	GTAT	2	8	1088195	1088202	25 %	50 %	25 %	0 %	347523701
19588	NC_015931	GT	3	6	1088207	1088212	0 %	50 %	50 %	0 %	347523701
19589	NC_015931	CGC	2	6	1088363	1088368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523701
19590	NC_015931	CGAT	2	8	1088375	1088382	25 %	25 %	25 %	25 %	347523701
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19592	NC_015931	CT	3	6	1088398	1088403	0 %	50 %	0 %	50 %	347523701
19593	NC_015931	CCA	2	6	1088438	1088443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523701
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19596	NC_015931	TC	3	6	1088575	1088580	0 %	50 %	0 %	50 %	347523701
19597	NC_015931	AGT	2	6	1088627	1088632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523701
19598	NC_015931	TGC	2	6	1088672	1088677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523701
19599	NC_015931	AGTGTA	2	12	1088707	1088718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523701
19600	NC_015931	TCG	2	6	1088720	1088725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523701
19601	NC_015931	AGC	2	6	1088865	1088870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523702
19602	NC_015931	TTAC	2	8	1088880	1088887	25 %	50 %	0 %	25 %	347523702
19603	NC_015931	TC	3	6	1088903	1088908	0 %	50 %	0 %	50 %	347523702
19604	NC_015931	CTC	2	6	1088975	1088980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523702
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19610	NC_015931	GTT	2	6	1089423	1089428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523703
19611	NC_015931	TCG	2	6	1089454	1089459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523703
19612	NC_015931	GCCC	2	8	1089515	1089522	0 %	0 %	25 %	75 %	347523703
19613	NC_015931	CTC	2	6	1089529	1089534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523703
19614	NC_015931	TACC	2	8	1089619	1089626	25 %	25 %	0 %	50 %	347523703
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19952	NC_015931	AGA	2	6	1110864	1110869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523734
19953	NC_015931	GA	3	6	1110875	1110880	50 %	0 %	50 %	0 %	347523734
19954	NC_015931	CG	3	6	1110952	1110957	0 %	0 %	50 %	50 %	347523735
19955	NC_015931	TAC	2	6	1111002	1111007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523735
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19963	NC_015931	GAGTG	2	10	1112444	1112453	20 %	20 %	60 %	0 %	347523736
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