MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrolobus fumarii 1A chromosome

Total Repeats: 33347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_015931	GGGTAC	2	12	1056435	1056446	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	347523666
19002	NC_015931	GCA	2	6	1056481	1056486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523666
19003	NC_015931	TGG	2	6	1056503	1056508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523666
19004	NC_015931	GGT	2	6	1056530	1056535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523666
19005	NC_015931	TGG	2	6	1056587	1056592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523666
19006	NC_015931	GCT	2	6	1056611	1056616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523666
19007	NC_015931	TAG	2	6	1056655	1056660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523666
19008	NC_015931	TCG	2	6	1056730	1056735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523666
19009	NC_015931	GAA	2	6	1056737	1056742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523666
19010	NC_015931	AGG	2	6	1056784	1056789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523666
19011	NC_015931	GCG	2	6	1056822	1056827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523666
19012	NC_015931	GAG	2	6	1056845	1056850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523666
19013	NC_015931	TACGAG	2	12	1056858	1056869	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347523666
19014	NC_015931	AG	3	6	1056893	1056898	50 %	0 %	50 %	0 %	347523666
19015	NC_015931	GAG	2	6	1056927	1056932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523666
19016	NC_015931	GAG	2	6	1056963	1056968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523666
19017	NC_015931	GAG	2	6	1056971	1056976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523666
19018	NC_015931	GAG	2	6	1056996	1057001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523666
19019	NC_015931	AG	3	6	1057019	1057024	50 %	0 %	50 %	0 %	347523666
19020	NC_015931	TAG	2	6	1057045	1057050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523666
19021	NC_015931	GA	3	6	1057093	1057098	50 %	0 %	50 %	0 %	347523666
19022	NC_015931	ATCA	2	8	1057103	1057110	50 %	25 %	0 %	25 %	347523666
19023	NC_015931	GGAC	2	8	1057135	1057142	25 %	0 %	50 %	25 %	347523666
19024	NC_015931	GAG	2	6	1057161	1057166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523666
19025	NC_015931	GA	3	6	1057215	1057220	50 %	0 %	50 %	0 %	347523666
19026	NC_015931	CGA	2	6	1057283	1057288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523666
19027	NC_015931	GA	4	8	1058038	1058045	50 %	0 %	50 %	0 %	347523667
19028	NC_015931	CAAGCT	2	12	1058108	1058119	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	347523667
19029	NC_015931	CAA	2	6	1058137	1058142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523667
19030	NC_015931	CGACT	2	10	1058163	1058172	20 %	20 %	20 %	40 %	347523667
19031	NC_015931	GCG	2	6	1058196	1058201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523667
19032	NC_015931	AGT	2	6	1058235	1058240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523667
19033	NC_015931	GAAGA	2	10	1058334	1058343	60 %	0 %	40 %	0 %	347523667
19034	NC_015931	AC	3	6	1058425	1058430	50 %	0 %	0 %	50 %	347523667
19035	NC_015931	CAG	2	6	1058467	1058472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523667
19036	NC_015931	ACA	2	6	1058476	1058481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523667
19037	NC_015931	CTC	2	6	1058487	1058492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523667
19038	NC_015931	GCC	2	6	1058499	1058504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523667
19039	NC_015931	GAA	2	6	1058572	1058577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523667
19040	NC_015931	GAT	2	6	1058586	1058591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523667
19041	NC_015931	CTG	2	6	1058662	1058667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523668
19042	NC_015931	GGC	2	6	1058689	1058694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523668
19043	NC_015931	CTG	2	6	1058698	1058703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523668
19044	NC_015931	CTT	2	6	1058722	1058727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523668
19045	NC_015931	CTC	3	9	1058731	1058739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523668
19046	NC_015931	TGG	2	6	1058770	1058775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523668
19047	NC_015931	GGC	2	6	1058833	1058838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523668
19048	NC_015931	CAG	3	9	1058857	1058865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523668
19049	NC_015931	GAA	2	6	1058884	1058889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523668
19050	NC_015931	CAG	2	6	1059151	1059156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523669
19051	NC_015931	CCT	2	6	1059228	1059233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523669
19052	NC_015931	CCT	3	9	1059261	1059269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523669
19053	NC_015931	C	6	6	1059285	1059290	0 %	0 %	0 %	100 %	347523669
19054	NC_015931	CGC	2	6	1059315	1059320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523669
19055	NC_015931	AC	3	6	1059336	1059341	50 %	0 %	0 %	50 %	347523669
19056	NC_015931	GGC	2	6	1059394	1059399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523669
19057	NC_015931	GGC	2	6	1059403	1059408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523669
19058	NC_015931	AGT	2	6	1059411	1059416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523669
19059	NC_015931	CTC	2	6	1059476	1059481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523669
19060	NC_015931	GGC	2	6	1059502	1059507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523669
19061	NC_015931	ATC	2	6	1059545	1059550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523669
19062	NC_015931	TTA	2	6	1059608	1059613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347523669
19063	NC_015931	CCT	2	6	1059669	1059674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523669
19064	NC_015931	CCT	2	6	1059741	1059746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523669
19065	NC_015931	CAC	2	6	1059775	1059780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523669
19066	NC_015931	GCC	2	6	1059803	1059808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523669
19067	NC_015931	CTC	2	6	1060049	1060054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523670
19068	NC_015931	CA	3	6	1060069	1060074	50 %	0 %	0 %	50 %	347523670
19069	NC_015931	CAC	2	6	1060082	1060087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523670
19070	NC_015931	GCAA	2	8	1060089	1060096	50 %	0 %	25 %	25 %	347523670
19071	NC_015931	ACT	2	6	1060197	1060202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523670
19072	NC_015931	CAA	2	6	1060207	1060212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523670
19073	NC_015931	GAG	2	6	1060217	1060222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523670
19074	NC_015931	GTG	2	6	1060557	1060562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523671
19075	NC_015931	TGC	2	6	1060633	1060638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523671
19076	NC_015931	GC	3	6	1060802	1060807	0 %	0 %	50 %	50 %	347523671
19077	NC_015931	TGG	2	6	1060849	1060854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523671
19078	NC_015931	GAG	2	6	1060884	1060889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523671
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19081	NC_015931	AGC	2	6	1060937	1060942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523671
19082	NC_015931	AAGCC	2	10	1060994	1061003	40 %	0 %	20 %	40 %	347523671
19083	NC_015931	GCA	2	6	1061024	1061029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523671
19084	NC_015931	GGAGGC	2	12	1061030	1061041	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	347523671
19085	NC_015931	CG	3	6	1061073	1061078	0 %	0 %	50 %	50 %	347523671
19086	NC_015931	AAG	3	9	1061091	1061099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523671
19087	NC_015931	CGC	2	6	1061105	1061110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523671
19088	NC_015931	GCA	2	6	1061126	1061131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523671
19089	NC_015931	GCGGAG	2	12	1061148	1061159	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	347523671
19090	NC_015931	AGA	2	6	1061191	1061196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523671
19091	NC_015931	GTCG	2	8	1061225	1061232	0 %	25 %	50 %	25 %	347523671
19092	NC_015931	GCA	2	6	1061253	1061258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523671
19093	NC_015931	GGA	2	6	1061276	1061281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523671
19094	NC_015931	GGA	2	6	1061297	1061302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523671
19095	NC_015931	AGC	2	6	1061303	1061308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523671
19096	NC_015931	TAC	3	9	1061316	1061324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523671
19097	NC_015931	GAT	2	6	1061330	1061335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523671
19098	NC_015931	GA	3	6	1061795	1061800	50 %	0 %	50 %	0 %	347523672
19099	NC_015931	TCG	2	6	1061836	1061841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523672
19100	NC_015931	ACA	2	6	1061862	1061867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523672
19101	NC_015931	AC	3	6	1061959	1061964	50 %	0 %	0 %	50 %	347523672
19102	NC_015931	TCT	2	6	1061965	1061970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523672
19103	NC_015931	GC	3	6	1061988	1061993	0 %	0 %	50 %	50 %	347523672
19104	NC_015931	TCG	2	6	1061998	1062003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523672
19105	NC_015931	AG	3	6	1062044	1062049	50 %	0 %	50 %	0 %	347523672
19106	NC_015931	GTG	2	6	1062138	1062143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523672
19107	NC_015931	CGG	2	6	1062245	1062250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523672
19108	NC_015931	TCC	2	6	1062268	1062273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523672
19109	NC_015931	GAG	2	6	1062284	1062289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523672
19110	NC_015931	AAC	2	6	1062330	1062335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523672
19111	NC_015931	TAC	2	6	1062378	1062383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523672
19112	NC_015931	ATACG	2	10	1062399	1062408	40 %	20 %	20 %	20 %	347523672
19113	NC_015931	GCCT	2	8	1062414	1062421	0 %	25 %	25 %	50 %	347523672
19114	NC_015931	GA	3	6	1062593	1062598	50 %	0 %	50 %	0 %	347523672
19115	NC_015931	GAG	2	6	1062711	1062716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523672
19116	NC_015931	CCT	2	6	1062980	1062985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523673
19117	NC_015931	GTG	2	6	1063122	1063127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523673
19118	NC_015931	TGG	2	6	1063159	1063164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523673
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19129	NC_015931	CGG	3	9	1063816	1063824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523673
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19151	NC_015931	GAG	3	9	1065096	1065104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523675
19152	NC_015931	GTGG	2	8	1065168	1065175	0 %	25 %	75 %	0 %	347523675
19153	NC_015931	AG	3	6	1065205	1065210	50 %	0 %	50 %	0 %	347523675
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19182	NC_015931	ATC	3	9	1066820	1066828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523678
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19221	NC_015931	AGGG	2	8	1068687	1068694	25 %	0 %	75 %	0 %	347523680
19222	NC_015931	GGC	2	6	1068741	1068746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523680
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19225	NC_015931	AG	3	6	1068917	1068922	50 %	0 %	50 %	0 %	347523680
19226	NC_015931	CAAGCT	2	12	1068956	1068967	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	347523680
19227	NC_015931	TAC	2	6	1068996	1069001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523680
19228	NC_015931	GA	3	6	1069018	1069023	50 %	0 %	50 %	0 %	347523680
19229	NC_015931	AAG	2	6	1069031	1069036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523680
19230	NC_015931	GCT	2	6	1069103	1069108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523680
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19232	NC_015931	AAG	2	6	1069275	1069280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523680
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