MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrolobus fumarii 1A chromosome

Total Repeats: 33347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_015931	GT	3	6	1026774	1026779	0 %	50 %	50 %	0 %	347523635
18502	NC_015931	CCT	2	6	1026813	1026818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523635
18503	NC_015931	CTCGGG	2	12	1026928	1026939	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	347523635
18504	NC_015931	AAG	2	6	1026954	1026959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523635
18505	NC_015931	AGC	2	6	1026967	1026972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523635
18506	NC_015931	GCT	2	6	1027042	1027047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523635
18507	NC_015931	GTA	2	6	1027119	1027124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523635
18508	NC_015931	TA	3	6	1027189	1027194	50 %	50 %	0 %	0 %	347523635
18509	NC_015931	GTG	2	6	1027247	1027252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523635
18510	NC_015931	GCC	2	6	1027276	1027281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523635
18511	NC_015931	GA	3	6	1027312	1027317	50 %	0 %	50 %	0 %	347523635
18512	NC_015931	CTC	2	6	1027323	1027328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523635
18513	NC_015931	CAG	2	6	1027359	1027364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523635
18514	NC_015931	G	6	6	1027405	1027410	0 %	0 %	100 %	0 %	347523635
18515	NC_015931	TGT	2	6	1027541	1027546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523636
18516	NC_015931	TGC	2	6	1027547	1027552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523636
18517	NC_015931	CTC	2	6	1027621	1027626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523636
18518	NC_015931	GCGGA	2	10	1027645	1027654	20 %	0 %	60 %	20 %	347523636
18519	NC_015931	CGG	2	6	1027675	1027680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523636
18520	NC_015931	GAG	2	6	1027681	1027686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523636
18521	NC_015931	CTC	2	6	1027802	1027807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523636
18522	NC_015931	ACA	2	6	1027859	1027864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523636
18523	NC_015931	CCT	2	6	1027884	1027889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523636
18524	NC_015931	CAA	2	6	1027899	1027904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523636
18525	NC_015931	CTC	2	6	1027933	1027938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523636
18526	NC_015931	CT	3	6	1027967	1027972	0 %	50 %	0 %	50 %	347523636
18527	NC_015931	TC	3	6	1028052	1028057	0 %	50 %	0 %	50 %	347523636
18528	NC_015931	TATG	2	8	1028150	1028157	25 %	50 %	25 %	0 %	347523637
18529	NC_015931	AGC	2	6	1028178	1028183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523637
18530	NC_015931	CTT	2	6	1028256	1028261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523637
18531	NC_015931	CGT	2	6	1028276	1028281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523637
18532	NC_015931	GTT	2	6	1028669	1028674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523638
18533	NC_015931	GTG	2	6	1028733	1028738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523638
18534	NC_015931	CGAA	2	8	1028809	1028816	50 %	0 %	25 %	25 %	347523638
18535	NC_015931	GCA	2	6	1028909	1028914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523638
18536	NC_015931	AAG	2	6	1029032	1029037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523638
18537	NC_015931	GAG	2	6	1029256	1029261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523639
18538	NC_015931	ATC	2	6	1029274	1029279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523639
18539	NC_015931	GAG	2	6	1029280	1029285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523639
18540	NC_015931	GAA	2	6	1029294	1029299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523639
18541	NC_015931	GAG	2	6	1029369	1029374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523639
18542	NC_015931	GT	3	6	1029377	1029382	0 %	50 %	50 %	0 %	347523639
18543	NC_015931	GAG	2	6	1029484	1029489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523639
18544	NC_015931	TAC	2	6	1029557	1029562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523639
18545	NC_015931	CTC	2	6	1029619	1029624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523639
18546	NC_015931	AG	3	6	1029663	1029668	50 %	0 %	50 %	0 %	347523639
18547	NC_015931	TGG	2	6	1029689	1029694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523639
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18549	NC_015931	AGA	3	9	1029819	1029827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523639
18550	NC_015931	C	6	6	1030154	1030159	0 %	0 %	0 %	100 %	347523640
18551	NC_015931	TCTCGT	2	12	1030170	1030181	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	347523640
18552	NC_015931	GCG	2	6	1030238	1030243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523640
18553	NC_015931	C	6	6	1030256	1030261	0 %	0 %	0 %	100 %	347523640
18554	NC_015931	GCC	2	6	1030279	1030284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523640
18555	NC_015931	ACA	2	6	1030367	1030372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523640
18556	NC_015931	CG	3	6	1030384	1030389	0 %	0 %	50 %	50 %	347523640
18557	NC_015931	CGT	2	6	1030395	1030400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523640
18558	NC_015931	AGG	2	6	1030412	1030417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523640
18559	NC_015931	GGC	2	6	1030447	1030452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523640
18560	NC_015931	ACA	2	6	1030481	1030486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523640
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18569	NC_015931	GAG	2	6	1030892	1030897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523641
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18571	NC_015931	CG	3	6	1030932	1030937	0 %	0 %	50 %	50 %	347523641
18572	NC_015931	AG	4	8	1030998	1031005	50 %	0 %	50 %	0 %	347523641
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18578	NC_015931	GA	4	8	1031204	1031211	50 %	0 %	50 %	0 %	347523641
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18585	NC_015931	AAG	2	6	1031636	1031641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523641
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18587	NC_015931	CGA	2	6	1031820	1031825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523642
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18591	NC_015931	GAG	2	6	1031956	1031961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523642
18592	NC_015931	ACCAG	2	10	1031967	1031976	40 %	0 %	20 %	40 %	347523642
18593	NC_015931	ACG	2	6	1031998	1032003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523642
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18598	NC_015931	AC	3	6	1032274	1032279	50 %	0 %	0 %	50 %	347523643
18599	NC_015931	CAA	2	6	1032444	1032449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523643
18600	NC_015931	TTG	2	6	1032473	1032478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523643
18601	NC_015931	CAA	3	9	1032505	1032513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523643
18602	NC_015931	GGC	2	6	1032614	1032619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523643
18603	NC_015931	ATC	2	6	1032647	1032652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523643
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18606	NC_015931	TATCC	2	10	1032844	1032853	20 %	40 %	0 %	40 %	347523643
18607	NC_015931	TGC	2	6	1032894	1032899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523643
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18611	NC_015931	CAA	2	6	1032966	1032971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523643
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18614	NC_015931	TGCA	2	8	1033420	1033427	25 %	25 %	25 %	25 %	347523644
18615	NC_015931	ATC	2	6	1033494	1033499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523644
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18962	NC_015931	GTCT	2	8	1054303	1054310	0 %	50 %	25 %	25 %	347523664
18963	NC_015931	CCTC	2	8	1054322	1054329	0 %	25 %	0 %	75 %	347523664
18964	NC_015931	CTC	2	6	1054504	1054509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523664
18965	NC_015931	CGG	2	6	1054511	1054516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523664
18966	NC_015931	GAT	2	6	1054596	1054601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523664
18967	NC_015931	CCT	2	6	1054604	1054609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523664
18968	NC_015931	CAC	2	6	1054652	1054657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523664
18969	NC_015931	AAG	2	6	1054681	1054686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523664
18970	NC_015931	CCT	2	6	1054698	1054703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523664
18971	NC_015931	TGA	2	6	1054712	1054717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523664
18972	NC_015931	CCA	2	6	1054721	1054726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523664
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18981	NC_015931	GTCCAC	2	12	1055396	1055407	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	347523665
18982	NC_015931	GCC	2	6	1055491	1055496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523665
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18984	NC_015931	AGG	2	6	1055513	1055518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523665
18985	NC_015931	GAG	2	6	1055525	1055530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523665
18986	NC_015931	GGT	2	6	1055553	1055558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523665
18987	NC_015931	CTA	2	6	1055563	1055568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523665
18988	NC_015931	AGACC	2	10	1055571	1055580	40 %	0 %	20 %	40 %	347523665
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18990	NC_015931	CA	3	6	1055761	1055766	50 %	0 %	0 %	50 %	347523665
18991	NC_015931	CGA	2	6	1055860	1055865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523665
18992	NC_015931	GAG	2	6	1055882	1055887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523665
18993	NC_015931	AG	3	6	1055897	1055902	50 %	0 %	50 %	0 %	347523665
18994	NC_015931	GAG	2	6	1055933	1055938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523665
18995	NC_015931	ACT	2	6	1055952	1055957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523665
18996	NC_015931	AC	3	6	1055964	1055969	50 %	0 %	0 %	50 %	347523665
18997	NC_015931	CTC	2	6	1056005	1056010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523665
18998	NC_015931	GAG	2	6	1056034	1056039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523665
18999	NC_015931	C	6	6	1056110	1056115	0 %	0 %	0 %	100 %	347523665
19000	NC_015931	AG	3	6	1056392	1056397	50 %	0 %	50 %	0 %	347523666

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