MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrolobus fumarii 1A chromosome

Total Repeats: 33347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_015931	TAG	2	6	947553	947558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523552
17003	NC_015931	CTA	2	6	947676	947681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523553
17004	NC_015931	TAT	2	6	947701	947706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347523553
17005	NC_015931	CTA	2	6	947802	947807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523553
17006	NC_015931	TGG	2	6	947824	947829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523553
17007	NC_015931	GCT	2	6	947981	947986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523554
17008	NC_015931	GTG	2	6	947992	947997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523554
17009	NC_015931	GCTAG	2	10	948045	948054	20 %	20 %	40 %	20 %	347523554
17010	NC_015931	GC	3	6	948092	948097	0 %	0 %	50 %	50 %	347523554
17011	NC_015931	GA	3	6	948155	948160	50 %	0 %	50 %	0 %	347523554
17012	NC_015931	TGTCG	2	10	948179	948188	0 %	40 %	40 %	20 %	347523554
17013	NC_015931	CG	3	6	948249	948254	0 %	0 %	50 %	50 %	347523554
17014	NC_015931	TGGCT	2	10	948401	948410	0 %	40 %	40 %	20 %	347523554
17015	NC_015931	GCT	2	6	948468	948473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523554
17016	NC_015931	GCT	2	6	948509	948514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523554
17017	NC_015931	TGG	2	6	948584	948589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523554
17018	NC_015931	CAT	2	6	948638	948643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523554
17019	NC_015931	GAG	2	6	948674	948679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523554
17020	NC_015931	GGA	2	6	948683	948688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523554
17021	NC_015931	CCT	2	6	948718	948723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523555
17022	NC_015931	GTG	2	6	948738	948743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523555
17023	NC_015931	GT	3	6	948840	948845	0 %	50 %	50 %	0 %	347523555
17024	NC_015931	TAG	2	6	948921	948926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523555
17025	NC_015931	GCA	2	6	948939	948944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523555
17026	NC_015931	TGT	2	6	948961	948966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523555
17027	NC_015931	TAG	2	6	949023	949028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523555
17028	NC_015931	CTG	2	6	949031	949036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523555
17029	NC_015931	GTG	2	6	949047	949052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523555
17030	NC_015931	GTA	2	6	949149	949154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523555
17031	NC_015931	CTC	2	6	949160	949165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523555
17032	NC_015931	CAC	2	6	949179	949184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523555
17033	NC_015931	ACGC	2	8	949202	949209	25 %	0 %	25 %	50 %	347523555
17034	NC_015931	GTT	2	6	949211	949216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523555
17035	NC_015931	GA	3	6	949302	949307	50 %	0 %	50 %	0 %	347523555
17036	NC_015931	AGCAT	2	10	949319	949328	40 %	20 %	20 %	20 %	347523555
17037	NC_015931	TTG	2	6	949411	949416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523555
17038	NC_015931	AGGTG	2	10	949432	949441	20 %	20 %	60 %	0 %	347523555
17039	NC_015931	G	6	6	949443	949448	0 %	0 %	100 %	0 %	347523555
17040	NC_015931	GCT	2	6	949481	949486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523555
17041	NC_015931	ATT	2	6	949582	949587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347523555
17042	NC_015931	AGT	2	6	949601	949606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523555
17043	NC_015931	AG	3	6	949618	949623	50 %	0 %	50 %	0 %	347523555
17044	NC_015931	GAC	2	6	949642	949647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523555
17045	NC_015931	GTG	2	6	949704	949709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523555
17046	NC_015931	TCT	2	6	949767	949772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523555
17047	NC_015931	GCTA	2	8	949795	949802	25 %	25 %	25 %	25 %	347523555
17048	NC_015931	AGG	2	6	949814	949819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523555
17049	NC_015931	CGG	2	6	949827	949832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523555
17050	NC_015931	GC	3	6	950017	950022	0 %	0 %	50 %	50 %	347523556
17051	NC_015931	GT	3	6	950086	950091	0 %	50 %	50 %	0 %	347523556
17052	NC_015931	CT	3	6	950104	950109	0 %	50 %	0 %	50 %	347523556
17053	NC_015931	ACA	2	6	950122	950127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523556
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17055	NC_015931	CCT	2	6	950240	950245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523556
17056	NC_015931	GGC	2	6	950273	950278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523556
17057	NC_015931	CGA	2	6	950279	950284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523556
17058	NC_015931	GGC	2	6	950298	950303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523556
17059	NC_015931	C	6	6	950363	950368	0 %	0 %	0 %	100 %	347523557
17060	NC_015931	C	6	6	950387	950392	0 %	0 %	0 %	100 %	347523557
17061	NC_015931	GT	3	6	950419	950424	0 %	50 %	50 %	0 %	347523557
17062	NC_015931	TCA	2	6	950454	950459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523557
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17064	NC_015931	GCT	2	6	950722	950727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523558
17065	NC_015931	GAG	2	6	950779	950784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523558
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17067	NC_015931	GTAACG	2	12	950960	950971	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347523558
17068	NC_015931	TAG	2	6	950972	950977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523558
17069	NC_015931	TGCC	2	8	951018	951025	0 %	25 %	25 %	50 %	347523558
17070	NC_015931	CAGA	2	8	951030	951037	50 %	0 %	25 %	25 %	347523558
17071	NC_015931	GAT	2	6	951271	951276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523558
17072	NC_015931	AGT	2	6	951306	951311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523558
17073	NC_015931	AAG	2	6	951376	951381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523558
17074	NC_015931	TTGG	2	8	951395	951402	0 %	50 %	50 %	0 %	347523558
17075	NC_015931	TTC	2	6	951511	951516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523558
17076	NC_015931	GCT	2	6	951571	951576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523558
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17086	NC_015931	TTC	2	6	952288	952293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523559
17087	NC_015931	TCC	2	6	952301	952306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523559
17088	NC_015931	GGAA	2	8	952357	952364	50 %	0 %	50 %	0 %	347523559
17089	NC_015931	GAG	2	6	952382	952387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523559
17090	NC_015931	CGCGG	2	10	952520	952529	0 %	0 %	60 %	40 %	347523559
17091	NC_015931	ATG	2	6	952537	952542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523559
17092	NC_015931	CGGCG	2	10	952584	952593	0 %	0 %	60 %	40 %	347523559
17093	NC_015931	GGT	2	6	952871	952876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523560
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17097	NC_015931	GAG	2	6	952932	952937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523560
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17101	NC_015931	AG	3	6	953122	953127	50 %	0 %	50 %	0 %	347523561
17102	NC_015931	AAC	2	6	953151	953156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523561
17103	NC_015931	AGA	2	6	953256	953261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523561
17104	NC_015931	AAG	2	6	953344	953349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523561
17105	NC_015931	TCC	2	6	953359	953364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523561
17106	NC_015931	CTC	2	6	953513	953518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523561
17107	NC_015931	TTGTC	2	10	953649	953658	0 %	60 %	20 %	20 %	347523562
17108	NC_015931	TC	3	6	953753	953758	0 %	50 %	0 %	50 %	347523562
17109	NC_015931	CGT	2	6	953925	953930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523562
17110	NC_015931	GAG	2	6	954114	954119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523563
17111	NC_015931	AG	3	6	954197	954202	50 %	0 %	50 %	0 %	347523563
17112	NC_015931	GAT	2	6	954221	954226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523563
17113	NC_015931	ACC	2	6	954357	954362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523563
17114	NC_015931	ACT	2	6	954378	954383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523563
17115	NC_015931	CAG	2	6	954400	954405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523563
17116	NC_015931	CGT	2	6	954425	954430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523563
17117	NC_015931	TCA	2	6	954516	954521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523563
17118	NC_015931	TCCC	2	8	954540	954547	0 %	25 %	0 %	75 %	347523563
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17120	NC_015931	AGC	2	6	954561	954566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523563
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