MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrolobus fumarii 1A chromosome

Total Repeats: 33347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_015931	CCT	2	6	893895	893900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523497
16002	NC_015931	GAT	2	6	893904	893909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523497
16003	NC_015931	GGAGT	2	10	893922	893931	20 %	20 %	60 %	0 %	347523497
16004	NC_015931	GGCG	2	8	893937	893944	0 %	0 %	75 %	25 %	347523497
16005	NC_015931	GC	3	6	893966	893971	0 %	0 %	50 %	50 %	347523497
16006	NC_015931	CTG	2	6	894032	894037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523497
16007	NC_015931	GAC	2	6	894067	894072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523497
16008	NC_015931	CAG	2	6	894085	894090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523497
16009	NC_015931	CGC	2	6	894110	894115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523497
16010	NC_015931	TTG	2	6	894143	894148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523497
16011	NC_015931	GGC	2	6	894159	894164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523497
16012	NC_015931	ATC	2	6	894259	894264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523497
16013	NC_015931	GAA	2	6	894267	894272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523497
16014	NC_015931	CCT	2	6	894351	894356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523497
16015	NC_015931	ACG	2	6	894431	894436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523497
16016	NC_015931	GCC	2	6	894616	894621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523497
16017	NC_015931	AAG	2	6	894721	894726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523497
16018	NC_015931	CAGC	2	8	894780	894787	25 %	0 %	25 %	50 %	347523497
16019	NC_015931	GAG	2	6	894829	894834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523497
16020	NC_015931	ACG	2	6	894835	894840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523497
16021	NC_015931	ACA	2	6	894844	894849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523497
16022	NC_015931	CCG	2	6	894887	894892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523497
16023	NC_015931	GCT	2	6	894898	894903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523497
16024	NC_015931	CAA	2	6	894908	894913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523497
16025	NC_015931	ACC	3	9	894934	894942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523497
16026	NC_015931	ATG	2	6	895018	895023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523497
16027	NC_015931	GCT	2	6	895024	895029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523497
16028	NC_015931	GCA	2	6	895030	895035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523497
16029	NC_015931	TGC	2	6	895038	895043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523497
16030	NC_015931	CTT	2	6	895605	895610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523498
16031	NC_015931	TCG	2	6	895677	895682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523498
16032	NC_015931	CGA	2	6	895708	895713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523498
16033	NC_015931	TGG	2	6	895733	895738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523498
16034	NC_015931	CCAGG	2	10	895759	895768	20 %	0 %	40 %	40 %	347523498
16035	NC_015931	CTT	2	6	895780	895785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523498
16036	NC_015931	CG	3	6	895786	895791	0 %	0 %	50 %	50 %	347523498
16037	NC_015931	CTT	2	6	895820	895825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523498
16038	NC_015931	TTC	2	6	895866	895871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523498
16039	NC_015931	GCC	2	6	895907	895912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523498
16040	NC_015931	CAG	2	6	895961	895966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523498
16041	NC_015931	TCA	2	6	895999	896004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523498
16042	NC_015931	TCTCC	2	10	896012	896021	0 %	40 %	0 %	60 %	347523498
16043	NC_015931	GTC	2	6	896069	896074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523498
16044	NC_015931	TCA	2	6	896130	896135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523498
16045	NC_015931	AGCC	2	8	896145	896152	25 %	0 %	25 %	50 %	347523498
16046	NC_015931	CCT	2	6	896169	896174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523498
16047	NC_015931	TCTA	2	8	896198	896205	25 %	50 %	0 %	25 %	347523498
16048	NC_015931	GTT	2	6	896216	896221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523498
16049	NC_015931	GGCA	2	8	896285	896292	25 %	0 %	50 %	25 %	347523498
16050	NC_015931	GGTTGT	2	12	896746	896757	0 %	50 %	50 %	0 %	347523499
16051	NC_015931	GAG	2	6	896789	896794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523499
16052	NC_015931	GCGG	2	8	896969	896976	0 %	0 %	75 %	25 %	347523499
16053	NC_015931	TGG	2	6	897009	897014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523499
16054	NC_015931	GCG	2	6	897023	897028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523499
16055	NC_015931	TAC	2	6	897029	897034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523499
16056	NC_015931	AGGG	2	8	897128	897135	25 %	0 %	75 %	0 %	347523499
16057	NC_015931	ATA	2	6	897224	897229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347523499
16058	NC_015931	CT	3	6	897252	897257	0 %	50 %	0 %	50 %	347523499
16059	NC_015931	CAG	2	6	897288	897293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523499
16060	NC_015931	AAG	2	6	897332	897337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523499
16061	NC_015931	CAC	2	6	897347	897352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523499
16062	NC_015931	GGC	2	6	897379	897384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523499
16063	NC_015931	ACT	2	6	897469	897474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523500
16064	NC_015931	CG	3	6	897534	897539	0 %	0 %	50 %	50 %	347523500
16065	NC_015931	GTG	2	6	897555	897560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523500
16066	NC_015931	CTC	2	6	897633	897638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523500
16067	NC_015931	TCTA	2	8	897642	897649	25 %	50 %	0 %	25 %	347523500
16068	NC_015931	CAA	2	6	897656	897661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523500
16069	NC_015931	TGC	2	6	897704	897709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523500
16070	NC_015931	CTC	2	6	897795	897800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523500
16071	NC_015931	CTA	2	6	897890	897895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523501
16072	NC_015931	GCA	2	6	897935	897940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523501
16073	NC_015931	CCAT	2	8	897963	897970	25 %	25 %	0 %	50 %	347523501
16074	NC_015931	TCT	2	6	898036	898041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523501
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16076	NC_015931	CAC	2	6	898189	898194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523501
16077	NC_015931	TCG	2	6	898213	898218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523501
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16082	NC_015931	CTTG	2	8	898764	898771	0 %	50 %	25 %	25 %	347523502
16083	NC_015931	AG	3	6	898785	898790	50 %	0 %	50 %	0 %	347523502
16084	NC_015931	GTG	2	6	898835	898840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523502
16085	NC_015931	GTG	2	6	898858	898863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523502
16086	NC_015931	CG	4	8	898878	898885	0 %	0 %	50 %	50 %	347523502
16087	NC_015931	GC	3	6	898895	898900	0 %	0 %	50 %	50 %	347523502
16088	NC_015931	AGC	2	6	898952	898957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523502
16089	NC_015931	TTAGGG	2	12	898973	898984	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	347523502
16090	NC_015931	TGT	2	6	899069	899074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523503
16091	NC_015931	CCT	2	6	899129	899134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523503
16092	NC_015931	AAT	2	6	899232	899237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347523503
16093	NC_015931	TGCG	2	8	899241	899248	0 %	25 %	50 %	25 %	347523503
16094	NC_015931	TTG	2	6	899289	899294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523503
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16097	NC_015931	GGAG	2	8	899372	899379	25 %	0 %	75 %	0 %	347523503
16098	NC_015931	TAT	2	6	899427	899432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347523503
16099	NC_015931	GTT	2	6	899550	899555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523503
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16101	NC_015931	CTG	2	6	899628	899633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523503
16102	NC_015931	GTG	2	6	899659	899664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523503
16103	NC_015931	GT	3	6	899785	899790	0 %	50 %	50 %	0 %	347523503
16104	NC_015931	ACT	2	6	899924	899929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523503
16105	NC_015931	GAG	2	6	899933	899938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523503
16106	NC_015931	GGC	2	6	899964	899969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523504
16107	NC_015931	TGA	2	6	900055	900060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523504
16108	NC_015931	TGT	2	6	900106	900111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523504
16109	NC_015931	GAG	2	6	900176	900181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523504
16110	NC_015931	AC	3	6	900198	900203	50 %	0 %	0 %	50 %	347523504
16111	NC_015931	GTG	2	6	900227	900232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523504
16112	NC_015931	ACT	2	6	900538	900543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523504
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16114	NC_015931	AG	3	6	900700	900705	50 %	0 %	50 %	0 %	347523504
16115	NC_015931	AAC	2	6	900782	900787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523504
16116	NC_015931	GA	3	6	900866	900871	50 %	0 %	50 %	0 %	347523504
16117	NC_015931	ATC	2	6	900908	900913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523504
16118	NC_015931	GAA	2	6	900924	900929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523504
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16120	NC_015931	CAAG	2	8	901039	901046	50 %	0 %	25 %	25 %	347523505
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