MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrolobus fumarii 1A chromosome

Total Repeats: 33347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_015931	CCT	2	6	758332	758337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523362
13502	NC_015931	CGA	2	6	758374	758379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523362
13503	NC_015931	GCA	2	6	758404	758409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523362
13504	NC_015931	GCT	2	6	758423	758428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523362
13505	NC_015931	TAT	2	6	758444	758449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347523362
13506	NC_015931	AGG	2	6	758466	758471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523362
13507	NC_015931	CTA	2	6	758508	758513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523362
13508	NC_015931	CAAC	2	8	758682	758689	50 %	0 %	0 %	50 %	347523362
13509	NC_015931	TCT	2	6	758706	758711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523362
13510	NC_015931	CA	3	6	758722	758727	50 %	0 %	0 %	50 %	347523362
13511	NC_015931	CTA	2	6	758927	758932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523363
13512	NC_015931	GCC	2	6	759014	759019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523363
13513	NC_015931	GGC	2	6	759101	759106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523363
13514	NC_015931	CGC	2	6	759139	759144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523363
13515	NC_015931	TCA	2	6	759180	759185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523363
13516	NC_015931	CTG	2	6	759236	759241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523363
13517	NC_015931	TG	3	6	759361	759366	0 %	50 %	50 %	0 %	347523364
13518	NC_015931	CGA	2	6	759373	759378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523364
13519	NC_015931	GGC	2	6	759423	759428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523364
13520	NC_015931	GGC	2	6	759500	759505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523364
13521	NC_015931	CTT	2	6	759568	759573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523364
13522	NC_015931	TGA	2	6	759587	759592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523364
13523	NC_015931	AGG	2	6	759596	759601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523364
13524	NC_015931	AGC	2	6	759743	759748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523364
13525	NC_015931	TAT	2	6	759760	759765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347523364
13526	NC_015931	ACG	2	6	759832	759837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523364
13527	NC_015931	AGG	2	6	759842	759847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523364
13528	NC_015931	CGA	2	6	759870	759875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523364
13529	NC_015931	AGCG	2	8	759877	759884	25 %	0 %	50 %	25 %	347523364
13530	NC_015931	AGG	2	6	759955	759960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523364
13531	NC_015931	CGA	2	6	760104	760109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523364
13532	NC_015931	TC	3	6	760143	760148	0 %	50 %	0 %	50 %	347523364
13533	NC_015931	CAA	2	6	760163	760168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523364
13534	NC_015931	GAC	2	6	760186	760191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523364
13535	NC_015931	GTC	2	6	760231	760236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523364
13536	NC_015931	GTT	2	6	760237	760242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523364
13537	NC_015931	TTG	2	6	760301	760306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523364
13538	NC_015931	GGA	2	6	760346	760351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523364
13539	NC_015931	CG	3	6	760424	760429	0 %	0 %	50 %	50 %	347523364
13540	NC_015931	AGA	3	9	760475	760483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523364
13541	NC_015931	TCA	2	6	760502	760507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523364
13542	NC_015931	TGA	2	6	760527	760532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523364
13543	NC_015931	GA	4	8	760548	760555	50 %	0 %	50 %	0 %	347523364
13544	NC_015931	TGA	2	6	760602	760607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523364
13545	NC_015931	AG	3	6	760631	760636	50 %	0 %	50 %	0 %	347523364
13546	NC_015931	GAG	2	6	760666	760671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523364
13547	NC_015931	GGA	2	6	760686	760691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523364
13548	NC_015931	ACC	2	6	760728	760733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523364
13549	NC_015931	TTG	2	6	760835	760840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523365
13550	NC_015931	TCG	2	6	760885	760890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523365
13551	NC_015931	GAG	2	6	760913	760918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523365
13552	NC_015931	TGT	2	6	760954	760959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523365
13553	NC_015931	GATT	2	8	760960	760967	25 %	50 %	25 %	0 %	347523365
13554	NC_015931	CTT	2	6	760996	761001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523365
13555	NC_015931	GCG	2	6	761121	761126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523365
13556	NC_015931	ATACT	2	10	761129	761138	40 %	40 %	0 %	20 %	347523365
13557	NC_015931	GC	3	6	761207	761212	0 %	0 %	50 %	50 %	347523365
13558	NC_015931	CGA	2	6	761221	761226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523365
13559	NC_015931	GTT	2	6	761240	761245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523365
13560	NC_015931	GCG	2	6	761246	761251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523365
13561	NC_015931	CGT	2	6	761344	761349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523365
13562	NC_015931	TTC	2	6	761435	761440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523365
13563	NC_015931	CCG	2	6	761505	761510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523365
13564	NC_015931	ATG	2	6	761543	761548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523365
13565	NC_015931	AGC	2	6	761564	761569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523365
13566	NC_015931	GGA	2	6	761692	761697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523365
13567	NC_015931	GGT	2	6	761781	761786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523365
13568	NC_015931	TGA	2	6	761789	761794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523365
13569	NC_015931	GCC	2	6	761808	761813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523366
13570	NC_015931	TGC	2	6	761870	761875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523366
13571	NC_015931	GCT	2	6	761881	761886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523366
13572	NC_015931	GGC	2	6	761889	761894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523366
13573	NC_015931	GGC	2	6	761896	761901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523366
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13575	NC_015931	GAG	2	6	762136	762141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523366
13576	NC_015931	TTG	2	6	762143	762148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523366
13577	NC_015931	GTT	2	6	762165	762170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523366
13578	NC_015931	GGGAGA	2	12	762247	762258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523366
13579	NC_015931	CA	3	6	762305	762310	50 %	0 %	0 %	50 %	347523366
13580	NC_015931	CCA	2	6	762379	762384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523366
13581	NC_015931	TGC	2	6	762414	762419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523366
13582	NC_015931	AGCT	2	8	762425	762432	25 %	25 %	25 %	25 %	347523366
13583	NC_015931	GCG	2	6	762485	762490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523366
13584	NC_015931	GAT	2	6	762621	762626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523366
13585	NC_015931	AGC	2	6	762632	762637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523366
13586	NC_015931	GAG	2	6	762688	762693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523366
13587	NC_015931	CTA	2	6	762715	762720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523366
13588	NC_015931	GCCGC	2	10	762736	762745	0 %	0 %	40 %	60 %	347523366
13589	NC_015931	AGA	2	6	762786	762791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523366
13590	NC_015931	GAG	2	6	762820	762825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523366
13591	NC_015931	AG	3	6	762873	762878	50 %	0 %	50 %	0 %	347523366
13592	NC_015931	CGC	2	6	762969	762974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523366
13593	NC_015931	CTA	2	6	762983	762988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523366
13594	NC_015931	AG	4	8	762999	763006	50 %	0 %	50 %	0 %	347523366
13595	NC_015931	ATG	2	6	763043	763048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523366
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13597	NC_015931	AG	3	6	763123	763128	50 %	0 %	50 %	0 %	347523367
13598	NC_015931	CTT	2	6	763259	763264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523367
13599	NC_015931	AG	3	6	763285	763290	50 %	0 %	50 %	0 %	347523367
13600	NC_015931	CGA	2	6	763321	763326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523367
13601	NC_015931	ATA	2	6	763334	763339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347523367
13602	NC_015931	CTG	2	6	763392	763397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523367
13603	NC_015931	CCT	2	6	763404	763409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523367
13604	NC_015931	CTT	2	6	763441	763446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523367
13605	NC_015931	CAA	2	6	763522	763527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523367
13606	NC_015931	TTGA	2	8	763586	763593	25 %	50 %	25 %	0 %	347523367
13607	NC_015931	GAC	2	6	763683	763688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523367
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13609	NC_015931	ATG	2	6	763995	764000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523368
13610	NC_015931	ATCT	2	8	764018	764025	25 %	50 %	0 %	25 %	347523368
13611	NC_015931	TTC	2	6	764036	764041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523368
13612	NC_015931	TC	4	8	764047	764054	0 %	50 %	0 %	50 %	347523368
13613	NC_015931	C	6	6	764144	764149	0 %	0 %	0 %	100 %	347523368
13614	NC_015931	TAT	2	6	764153	764158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347523368
13615	NC_015931	TCG	2	6	764167	764172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523368
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13617	NC_015931	TAG	2	6	764488	764493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523369
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13979	NC_015931	CG	3	6	785030	785035	0 %	0 %	50 %	50 %	347523390
13980	NC_015931	AAC	2	6	785037	785042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523390
13981	NC_015931	CT	3	6	785212	785217	0 %	50 %	0 %	50 %	347523390
13982	NC_015931	AAC	2	6	785337	785342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523390
13983	NC_015931	TCA	2	6	785362	785367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523390
13984	NC_015931	GTT	2	6	785382	785387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523390
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13987	NC_015931	CCTA	2	8	785658	785665	25 %	25 %	0 %	50 %	347523390
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