MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrolobus fumarii 1A chromosome

Total Repeats: 33347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_015931	CAC	2	6	731416	731421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523336
13002	NC_015931	TTA	2	6	731460	731465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347523336
13003	NC_015931	GAA	2	6	731512	731517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523336
13004	NC_015931	AGC	2	6	731572	731577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523336
13005	NC_015931	TAG	2	6	731592	731597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523336
13006	NC_015931	TAT	2	6	731605	731610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347523336
13007	NC_015931	TGC	2	6	731620	731625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523336
13008	NC_015931	CTC	2	6	731678	731683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523336
13009	NC_015931	CAA	2	6	731686	731691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523336
13010	NC_015931	AAC	2	6	731717	731722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523336
13011	NC_015931	CGAGCC	2	12	731771	731782	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	347523336
13012	NC_015931	TCA	2	6	731793	731798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523336
13013	NC_015931	AAC	2	6	731823	731828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523337
13014	NC_015931	CTT	2	6	731886	731891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523337
13015	NC_015931	CAT	2	6	731895	731900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523337
13016	NC_015931	TGC	2	6	731931	731936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523337
13017	NC_015931	CCA	2	6	731974	731979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523337
13018	NC_015931	TCG	2	6	731983	731988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523337
13019	NC_015931	GATTG	2	10	732045	732054	20 %	40 %	40 %	0 %	347523337
13020	NC_015931	TAC	2	6	732212	732217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523337
13021	NC_015931	CTC	2	6	732228	732233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523337
13022	NC_015931	TG	3	6	732402	732407	0 %	50 %	50 %	0 %	347523337
13023	NC_015931	TGG	2	6	732494	732499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523337
13024	NC_015931	GCA	2	6	732517	732522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523337
13025	NC_015931	CAC	2	6	732525	732530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523337
13026	NC_015931	GTG	2	6	732645	732650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523337
13027	NC_015931	GC	3	6	732693	732698	0 %	0 %	50 %	50 %	347523337
13028	NC_015931	TCC	2	6	732718	732723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523337
13029	NC_015931	CTC	2	6	732792	732797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523337
13030	NC_015931	TCGTG	2	10	732923	732932	0 %	40 %	40 %	20 %	347523337
13031	NC_015931	TAT	2	6	733020	733025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347523337
13032	NC_015931	ATA	2	6	733213	733218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347523338
13033	NC_015931	GAA	2	6	733238	733243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523338
13034	NC_015931	TAC	2	6	733272	733277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523338
13035	NC_015931	TTC	2	6	733303	733308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523338
13036	NC_015931	AGT	2	6	733327	733332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523338
13037	NC_015931	CT	3	6	733355	733360	0 %	50 %	0 %	50 %	347523338
13038	NC_015931	AG	3	6	733388	733393	50 %	0 %	50 %	0 %	347523338
13039	NC_015931	AG	3	6	733431	733436	50 %	0 %	50 %	0 %	347523338
13040	NC_015931	ATG	2	6	733438	733443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523338
13041	NC_015931	CCG	2	6	733571	733576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523338
13042	NC_015931	CTA	2	6	733613	733618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523338
13043	NC_015931	AT	3	6	733652	733657	50 %	50 %	0 %	0 %	347523338
13044	NC_015931	CG	3	6	733717	733722	0 %	0 %	50 %	50 %	347523338
13045	NC_015931	CCT	2	6	733736	733741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523338
13046	NC_015931	AGT	2	6	733811	733816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523338
13047	NC_015931	AGG	2	6	733915	733920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523338
13048	NC_015931	CA	3	6	733941	733946	50 %	0 %	0 %	50 %	347523338
13049	NC_015931	CTAGT	2	10	733973	733982	20 %	40 %	20 %	20 %	347523338
13050	NC_015931	GCTG	2	8	734001	734008	0 %	25 %	50 %	25 %	347523338
13051	NC_015931	CTA	2	6	734063	734068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523338
13052	NC_015931	GTA	2	6	734168	734173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523338
13053	NC_015931	GAG	2	6	734272	734277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523338
13054	NC_015931	C	6	6	734303	734308	0 %	0 %	0 %	100 %	347523338
13055	NC_015931	ACC	2	6	734334	734339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523338
13056	NC_015931	ACA	2	6	734341	734346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523338
13057	NC_015931	CAAC	2	8	734360	734367	50 %	0 %	0 %	50 %	347523338
13058	NC_015931	CTA	2	6	734375	734380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523338
13059	NC_015931	ATC	2	6	734422	734427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523338
13060	NC_015931	AGGAT	2	10	734471	734480	40 %	20 %	40 %	0 %	347523338
13061	NC_015931	ATG	2	6	734560	734565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523338
13062	NC_015931	CAT	2	6	734588	734593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523338
13063	NC_015931	CGC	2	6	734640	734645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523338
13064	NC_015931	ACG	2	6	734758	734763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523338
13065	NC_015931	TAC	2	6	734775	734780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523338
13066	NC_015931	CTT	2	6	734812	734817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523338
13067	NC_015931	CCT	2	6	735031	735036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523339
13068	NC_015931	TAG	2	6	735070	735075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523339
13069	NC_015931	TGC	2	6	735093	735098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523339
13070	NC_015931	CTC	2	6	735103	735108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523339
13071	NC_015931	CCT	2	6	735186	735191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523339
13072	NC_015931	TCT	2	6	735210	735215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523339
13073	NC_015931	TTA	2	6	735246	735251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347523339
13074	NC_015931	TCT	2	6	735264	735269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523339
13075	NC_015931	ACC	2	6	735281	735286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523339
13076	NC_015931	TGG	2	6	735309	735314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523339
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13078	NC_015931	CTC	2	6	735445	735450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523339
13079	NC_015931	TCT	2	6	735453	735458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523339
13080	NC_015931	CCA	2	6	735481	735486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523339
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13082	NC_015931	ATC	2	6	735653	735658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523339
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13084	NC_015931	CA	3	6	735711	735716	50 %	0 %	0 %	50 %	347523339
13085	NC_015931	GC	3	6	735725	735730	0 %	0 %	50 %	50 %	347523339
13086	NC_015931	CCT	2	6	735733	735738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523339
13087	NC_015931	CTG	2	6	735804	735809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523339
13088	NC_015931	TG	3	6	735812	735817	0 %	50 %	50 %	0 %	347523339
13089	NC_015931	TGA	2	6	735900	735905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523339
13090	NC_015931	GCT	2	6	735919	735924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523339
13091	NC_015931	ACCTC	2	10	735935	735944	20 %	20 %	0 %	60 %	347523339
13092	NC_015931	TC	3	6	735943	735948	0 %	50 %	0 %	50 %	347523339
13093	NC_015931	GTT	2	6	736015	736020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523339
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13098	NC_015931	TGGT	2	8	736241	736248	0 %	50 %	50 %	0 %	347523339
13099	NC_015931	CCT	2	6	736290	736295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523339
13100	NC_015931	GTTG	2	8	736462	736469	0 %	50 %	50 %	0 %	347523339
13101	NC_015931	CCT	2	6	736485	736490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523339
13102	NC_015931	CTC	2	6	736678	736683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523339
13103	NC_015931	GTA	2	6	736738	736743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523339
13104	NC_015931	GGGCT	2	10	736777	736786	0 %	20 %	60 %	20 %	347523339
13105	NC_015931	AGC	2	6	736800	736805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523339
13106	NC_015931	TGCT	2	8	736823	736830	0 %	50 %	25 %	25 %	347523339
13107	NC_015931	CGCC	2	8	736911	736918	0 %	0 %	25 %	75 %	347523339
13108	NC_015931	TAG	3	9	736972	736980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523339
13109	NC_015931	ATAGGG	2	12	736989	737000	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	347523339
13110	NC_015931	AGC	2	6	737365	737370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523340
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13112	NC_015931	TCC	2	6	737404	737409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523340
13113	NC_015931	CGT	2	6	737448	737453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523340
13114	NC_015931	CCT	2	6	737470	737475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523340
13115	NC_015931	TCT	2	6	737480	737485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523340
13116	NC_015931	GAA	2	6	737523	737528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523340
13117	NC_015931	TAT	2	6	737580	737585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347523340
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13361	NC_015931	GA	3	6	749933	749938	50 %	0 %	50 %	0 %	347523352
13362	NC_015931	ACG	2	6	749949	749954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523352
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13364	NC_015931	CAT	2	6	749988	749993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523352
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13479	NC_015931	GC	3	6	757068	757073	0 %	0 %	50 %	50 %	347523361
13480	NC_015931	CAT	2	6	757079	757084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523361
13481	NC_015931	CCTC	2	8	757124	757131	0 %	25 %	0 %	75 %	347523361
13482	NC_015931	CCA	2	6	757156	757161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523361
13483	NC_015931	TCC	2	6	757258	757263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523361
13484	NC_015931	GAC	2	6	757284	757289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523361
13485	NC_015931	GC	3	6	757310	757315	0 %	0 %	50 %	50 %	347523361
13486	NC_015931	CCA	2	6	757325	757330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523361
13487	NC_015931	CTG	2	6	757472	757477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523361
13488	NC_015931	CAA	2	6	757814	757819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523362
13489	NC_015931	AG	3	6	757906	757911	50 %	0 %	50 %	0 %	347523362
13490	NC_015931	CTC	2	6	757943	757948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523362
13491	NC_015931	GC	3	6	757949	757954	0 %	0 %	50 %	50 %	347523362
13492	NC_015931	CTGG	2	8	757983	757990	0 %	25 %	50 %	25 %	347523362
13493	NC_015931	TCA	2	6	758004	758009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523362
13494	NC_015931	CTT	2	6	758036	758041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523362
13495	NC_015931	CTATC	2	10	758062	758071	20 %	40 %	0 %	40 %	347523362
13496	NC_015931	GCC	2	6	758081	758086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523362
13497	NC_015931	C	6	6	758090	758095	0 %	0 %	0 %	100 %	347523362
13498	NC_015931	ACA	2	6	758118	758123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523362
13499	NC_015931	ATT	2	6	758127	758132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347523362
13500	NC_015931	CCA	2	6	758187	758192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523362

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