MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrolobus fumarii 1A chromosome

Total Repeats: 33347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_015931	CAA	2	6	675064	675069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523279
12003	NC_015931	CCAG	2	8	675070	675077	25 %	0 %	25 %	50 %	347523279
12004	NC_015931	GT	3	6	675088	675093	0 %	50 %	50 %	0 %	347523279
12005	NC_015931	CGC	2	6	675123	675128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523279
12006	NC_015931	ACC	2	6	675142	675147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523279
12007	NC_015931	CGA	2	6	675171	675176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523279
12008	NC_015931	ATC	2	6	675245	675250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523279
12009	NC_015931	GAA	2	6	675259	675264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523279
12010	NC_015931	AGT	2	6	675272	675277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523279
12011	NC_015931	CCA	2	6	675290	675295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523279
12012	NC_015931	ACC	2	6	675334	675339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523279
12013	NC_015931	CAA	2	6	675369	675374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523279
12014	NC_015931	CAC	2	6	675474	675479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523279
12015	NC_015931	GCT	2	6	675512	675517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523279
12016	NC_015931	TCA	2	6	675567	675572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523279
12017	NC_015931	AGGCT	2	10	675590	675599	20 %	20 %	40 %	20 %	347523279
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12020	NC_015931	CTG	2	6	675701	675706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523279
12021	NC_015931	TAGGGC	2	12	675739	675750	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	347523279
12022	NC_015931	CCA	2	6	675801	675806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523279
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12024	NC_015931	GCT	2	6	675935	675940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523280
12025	NC_015931	AGC	2	6	675982	675987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523280
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12028	NC_015931	CTC	2	6	676089	676094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523280
12029	NC_015931	GTC	2	6	676158	676163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523280
12030	NC_015931	GCTGG	2	10	676174	676183	0 %	20 %	60 %	20 %	347523280
12031	NC_015931	TGC	2	6	676184	676189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523280
12032	NC_015931	GAT	2	6	676230	676235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523280
12033	NC_015931	GCG	2	6	676246	676251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523280
12034	NC_015931	GAT	2	6	676266	676271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523280
12035	NC_015931	CTG	2	6	676320	676325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523280
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12041	NC_015931	CGA	2	6	676634	676639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523280
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12053	NC_015931	GTC	2	6	677179	677184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523280
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12059	NC_015931	GCT	2	6	677520	677525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523281
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12084	NC_015931	GGA	2	6	679103	679108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523282
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12087	NC_015931	GTGCT	2	10	679270	679279	0 %	40 %	40 %	20 %	347523282
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12091	NC_015931	GCT	2	6	679433	679438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523282
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12100	NC_015931	CAT	2	6	679792	679797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523283
12101	NC_015931	AG	3	6	679807	679812	50 %	0 %	50 %	0 %	347523283
12102	NC_015931	TCC	2	6	679996	680001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523284
12103	NC_015931	CCT	2	6	680062	680067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523284
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12105	NC_015931	AAC	3	9	680211	680219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523285
12106	NC_015931	GA	4	8	680281	680288	50 %	0 %	50 %	0 %	347523285
12107	NC_015931	CT	3	6	680415	680420	0 %	50 %	0 %	50 %	347523285
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12111	NC_015931	ACCACT	2	12	680514	680525	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	347523285
12112	NC_015931	TCA	2	6	680530	680535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523285
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12114	NC_015931	ACA	2	6	680620	680625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523285
12115	NC_015931	CA	3	6	680627	680632	50 %	0 %	0 %	50 %	347523285
12116	NC_015931	CTAA	2	8	680641	680648	50 %	25 %	0 %	25 %	347523285
12117	NC_015931	TCA	2	6	680672	680677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523285
12118	NC_015931	TCG	2	6	680680	680685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523285
12119	NC_015931	CCT	2	6	680731	680736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523285
12120	NC_015931	GTA	2	6	680744	680749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523285
12121	NC_015931	TACT	2	8	680813	680820	25 %	50 %	0 %	25 %	347523285
12122	NC_015931	GAA	2	6	680835	680840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523285
12123	NC_015931	TCC	2	6	680924	680929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523285
12124	NC_015931	AAC	2	6	681001	681006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523285
12125	NC_015931	TGG	2	6	681126	681131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523286
12126	NC_015931	ACT	2	6	681136	681141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523286
12127	NC_015931	GCTA	2	8	681160	681167	25 %	25 %	25 %	25 %	347523286
12128	NC_015931	TAC	2	6	681189	681194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523286
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12132	NC_015931	GTG	2	6	681738	681743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523287
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12143	NC_015931	TCG	2	6	682391	682396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523288
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12147	NC_015931	TCT	2	6	682522	682527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523288
12148	NC_015931	GTG	2	6	682588	682593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523288
12149	NC_015931	TTGG	2	8	682606	682613	0 %	50 %	50 %	0 %	347523288
12150	NC_015931	AGC	2	6	682661	682666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523288
12151	NC_015931	TCG	2	6	682676	682681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523288
12152	NC_015931	TGG	2	6	682731	682736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523288
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12154	NC_015931	TTG	2	6	682996	683001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523289
12155	NC_015931	GA	3	6	683070	683075	50 %	0 %	50 %	0 %	347523289
12156	NC_015931	CGAAG	2	10	683084	683093	40 %	0 %	40 %	20 %	347523289
12157	NC_015931	AG	3	6	683117	683122	50 %	0 %	50 %	0 %	347523289
12158	NC_015931	AGAT	2	8	683164	683171	50 %	25 %	25 %	0 %	347523289
12159	NC_015931	ACT	2	6	683274	683279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523289
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12164	NC_015931	GAC	2	6	683373	683378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523289
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12173	NC_015931	CTG	2	6	683869	683874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523289
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12202	NC_015931	GCT	2	6	685199	685204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523291
12203	NC_015931	CTG	2	6	685218	685223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523291
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12209	NC_015931	GA	3	6	685607	685612	50 %	0 %	50 %	0 %	347523291
12210	NC_015931	CCT	2	6	685615	685620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523291
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12212	NC_015931	GTCG	2	8	685711	685718	0 %	25 %	50 %	25 %	347523291
12213	NC_015931	GAATG	2	10	685728	685737	40 %	20 %	40 %	0 %	347523291
12214	NC_015931	CGC	2	6	685795	685800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523292
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12220	NC_015931	GAG	2	6	686154	686159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523293
12221	NC_015931	TGGC	2	8	686287	686294	0 %	25 %	50 %	25 %	347523293
12222	NC_015931	TGG	2	6	686330	686335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523293
12223	NC_015931	GTT	2	6	686349	686354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523293
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12225	NC_015931	CGCA	2	8	686426	686433	25 %	0 %	25 %	50 %	347523293
12226	NC_015931	TTG	2	6	686560	686565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523293
12227	NC_015931	TGG	2	6	686679	686684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523293
12228	NC_015931	TCG	2	6	686737	686742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523293
12229	NC_015931	GAG	2	6	686765	686770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523293
12230	NC_015931	TC	3	6	686786	686791	0 %	50 %	0 %	50 %	347523293
12231	NC_015931	CAC	2	6	686819	686824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523293
12232	NC_015931	ACGCT	2	10	686866	686875	20 %	20 %	20 %	40 %	347523293
12233	NC_015931	TGC	2	6	686888	686893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523293
12234	NC_015931	GAG	2	6	686919	686924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523293
12235	NC_015931	CTC	2	6	687060	687065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523294
12236	NC_015931	ATC	2	6	687089	687094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523294
12237	NC_015931	CG	3	6	687119	687124	0 %	0 %	50 %	50 %	347523294
12238	NC_015931	CGC	2	6	687137	687142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523294
12239	NC_015931	TG	4	8	687155	687162	0 %	50 %	50 %	0 %	347523294
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12335	NC_015931	CAGC	2	8	691777	691784	25 %	0 %	25 %	50 %	347523300
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12340	NC_015931	ACT	2	6	691977	691982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523300
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12342	NC_015931	AGGCT	2	10	692069	692078	20 %	20 %	40 %	20 %	347523300
12343	NC_015931	TCG	2	6	692210	692215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523300
12344	NC_015931	CT	3	6	692219	692224	0 %	50 %	0 %	50 %	347523300
12345	NC_015931	GC	3	6	692231	692236	0 %	0 %	50 %	50 %	347523300
12346	NC_015931	CCT	2	6	692295	692300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523300
12347	NC_015931	CA	3	6	692398	692403	50 %	0 %	0 %	50 %	347523300
12348	NC_015931	AGGCT	2	10	692543	692552	20 %	20 %	40 %	20 %	347523300
12349	NC_015931	CCA	2	6	692556	692561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523300
12350	NC_015931	AGA	2	6	692586	692591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523300
12351	NC_015931	CGA	2	6	692616	692621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523300
12352	NC_015931	CTA	2	6	692739	692744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523300
12353	NC_015931	ACT	2	6	692748	692753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523300
12354	NC_015931	AC	4	8	692759	692766	50 %	0 %	0 %	50 %	347523300
12355	NC_015931	TC	3	6	692839	692844	0 %	50 %	0 %	50 %	347523301
12356	NC_015931	AGC	2	6	693097	693102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523301
12357	NC_015931	CTC	2	6	693129	693134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523301
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