MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrolobus fumarii 1A chromosome

Total Repeats: 33347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_015931	CCT	2	6	650987	650992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523250
11502	NC_015931	CCT	2	6	651007	651012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523250
11503	NC_015931	TC	3	6	651136	651141	0 %	50 %	0 %	50 %	347523250
11504	NC_015931	GCC	2	6	651168	651173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523250
11505	NC_015931	GCG	2	6	651289	651294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523250
11506	NC_015931	GCC	2	6	651312	651317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523250
11507	NC_015931	AGG	2	6	651321	651326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523250
11508	NC_015931	GCC	2	6	651354	651359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523250
11509	NC_015931	CGCCA	2	10	651399	651408	20 %	0 %	20 %	60 %	347523250
11510	NC_015931	TGT	2	6	651705	651710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523251
11511	NC_015931	GCA	2	6	651715	651720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523251
11512	NC_015931	AGCCT	2	10	651748	651757	20 %	20 %	20 %	40 %	347523251
11513	NC_015931	AGC	2	6	651780	651785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523251
11514	NC_015931	CGA	2	6	651803	651808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523251
11515	NC_015931	CCA	2	6	651860	651865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523251
11516	NC_015931	CAT	2	6	651914	651919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523251
11517	NC_015931	ACA	2	6	651926	651931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523251
11518	NC_015931	CAGC	2	8	651947	651954	25 %	0 %	25 %	50 %	347523251
11519	NC_015931	GCG	2	6	651979	651984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523251
11520	NC_015931	TA	3	6	651996	652001	50 %	50 %	0 %	0 %	347523251
11521	NC_015931	TGG	2	6	652011	652016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523251
11522	NC_015931	ACC	2	6	652029	652034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523251
11523	NC_015931	AG	3	6	652037	652042	50 %	0 %	50 %	0 %	347523251
11524	NC_015931	TCCA	2	8	652055	652062	25 %	25 %	0 %	50 %	347523251
11525	NC_015931	AG	3	6	652095	652100	50 %	0 %	50 %	0 %	347523251
11526	NC_015931	CCAG	2	8	652129	652136	25 %	0 %	25 %	50 %	347523251
11527	NC_015931	GCC	2	6	652200	652205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523251
11528	NC_015931	GAG	2	6	652257	652262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523251
11529	NC_015931	GGC	2	6	652287	652292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523251
11530	NC_015931	CTG	2	6	652388	652393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523251
11531	NC_015931	ATG	2	6	652420	652425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523251
11532	NC_015931	TGC	2	6	652541	652546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523251
11533	NC_015931	AC	3	6	652575	652580	50 %	0 %	0 %	50 %	347523252
11534	NC_015931	GGC	2	6	652647	652652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523252
11535	NC_015931	TAG	2	6	652679	652684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523252
11536	NC_015931	GCT	2	6	652835	652840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523252
11537	NC_015931	GCT	2	6	652850	652855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523252
11538	NC_015931	GCC	2	6	652887	652892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523252
11539	NC_015931	CCA	2	6	652927	652932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523252
11540	NC_015931	GCG	2	6	652949	652954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523252
11541	NC_015931	ACC	2	6	652955	652960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523252
11542	NC_015931	CAA	2	6	653087	653092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523252
11543	NC_015931	TCC	2	6	653133	653138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523252
11544	NC_015931	ACA	2	6	653149	653154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523252
11545	NC_015931	AGC	2	6	653182	653187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523252
11546	NC_015931	GC	3	6	653195	653200	0 %	0 %	50 %	50 %	347523252
11547	NC_015931	CCA	2	6	653262	653267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523252
11548	NC_015931	CTT	2	6	653298	653303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523252
11549	NC_015931	CGG	2	6	653319	653324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523252
11550	NC_015931	CTA	2	6	653332	653337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523252
11551	NC_015931	GGCG	2	8	653394	653401	0 %	0 %	75 %	25 %	347523252
11552	NC_015931	GCGAG	2	10	653405	653414	20 %	0 %	60 %	20 %	347523252
11553	NC_015931	TCCT	2	8	653479	653486	0 %	50 %	0 %	50 %	347523252
11554	NC_015931	GCGTCT	2	12	653495	653506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523252
11555	NC_015931	CTA	2	6	653525	653530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523252
11556	NC_015931	ACC	2	6	653605	653610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523252
11557	NC_015931	GTTACC	2	12	653641	653652	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347523252
11558	NC_015931	CTC	2	6	653663	653668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523252
11559	NC_015931	CAA	2	6	653696	653701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523252
11560	NC_015931	GCT	2	6	653710	653715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523252
11561	NC_015931	CTT	2	6	653731	653736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523252
11562	NC_015931	TCA	2	6	653742	653747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523253
11563	NC_015931	CAC	2	6	653797	653802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523253
11564	NC_015931	TAC	2	6	653836	653841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523253
11565	NC_015931	AGGA	2	8	653894	653901	50 %	0 %	50 %	0 %	347523253
11566	NC_015931	CTT	2	6	653924	653929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523253
11567	NC_015931	CGA	2	6	654100	654105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523254
11568	NC_015931	TCTCC	2	10	654167	654176	0 %	40 %	0 %	60 %	347523254
11569	NC_015931	GCT	2	6	654197	654202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523254
11570	NC_015931	TA	3	6	654257	654262	50 %	50 %	0 %	0 %	347523254
11571	NC_015931	TCA	2	6	654283	654288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523254
11572	NC_015931	ACCAC	2	10	654321	654330	40 %	0 %	0 %	60 %	347523254
11573	NC_015931	GTA	2	6	654395	654400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523254
11574	NC_015931	GGT	2	6	654418	654423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523254
11575	NC_015931	ACAT	2	8	654441	654448	50 %	25 %	0 %	25 %	347523254
11576	NC_015931	CTA	2	6	654502	654507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523254
11577	NC_015931	TCG	2	6	654529	654534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523254
11578	NC_015931	GCG	2	6	654545	654550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523254
11579	NC_015931	GAT	2	6	654572	654577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523254
11580	NC_015931	CCT	2	6	654600	654605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523254
11581	NC_015931	ACT	2	6	654711	654716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523254
11582	NC_015931	AGC	2	6	654774	654779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523254
11583	NC_015931	CAC	2	6	654866	654871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523254
11584	NC_015931	GGA	2	6	654889	654894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523254
11585	NC_015931	GA	3	6	654931	654936	50 %	0 %	50 %	0 %	347523254
11586	NC_015931	CTA	2	6	654937	654942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523254
11587	NC_015931	GAG	2	6	654968	654973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523254
11588	NC_015931	GCC	2	6	654987	654992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523254
11589	NC_015931	GT	3	6	655012	655017	0 %	50 %	50 %	0 %	347523254
11590	NC_015931	ATC	2	6	655041	655046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523254
11591	NC_015931	CT	3	6	655076	655081	0 %	50 %	0 %	50 %	347523254
11592	NC_015931	GAGCG	2	10	655109	655118	20 %	0 %	60 %	20 %	347523254
11593	NC_015931	G	6	6	655158	655163	0 %	0 %	100 %	0 %	347523254
11594	NC_015931	ACG	2	6	655164	655169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523254
11595	NC_015931	CG	3	6	655198	655203	0 %	0 %	50 %	50 %	347523254
11596	NC_015931	CG	3	6	655216	655221	0 %	0 %	50 %	50 %	347523254
11597	NC_015931	TCGTGT	2	12	655436	655447	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	347523255
11598	NC_015931	AGC	2	6	655493	655498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523255
11599	NC_015931	ATG	2	6	655519	655524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523255
11600	NC_015931	TCG	2	6	655525	655530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523255
11601	NC_015931	GCG	2	6	655597	655602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523255
11602	NC_015931	GCC	2	6	655623	655628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523255
11603	NC_015931	GCC	2	6	655691	655696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523255
11604	NC_015931	G	6	6	655709	655714	0 %	0 %	100 %	0 %	347523255
11605	NC_015931	GCG	2	6	655717	655722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523255
11606	NC_015931	GCC	2	6	655728	655733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523255
11607	NC_015931	GCA	2	6	655734	655739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523255
11608	NC_015931	CCT	3	9	655754	655762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523255
11609	NC_015931	GAGGCT	2	12	655806	655817	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	347523255
11610	NC_015931	GCA	2	6	655821	655826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523255
11611	NC_015931	TCC	2	6	655879	655884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523255
11612	NC_015931	GCA	2	6	655891	655896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523255
11613	NC_015931	AGA	2	6	655925	655930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523255
11614	NC_015931	GCC	2	6	655976	655981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523255
11615	NC_015931	TGA	2	6	656002	656007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523255
11616	NC_015931	GA	3	6	656006	656011	50 %	0 %	50 %	0 %	347523255
11617	NC_015931	AG	3	6	656022	656027	50 %	0 %	50 %	0 %	347523255
11618	NC_015931	TGGA	2	8	656052	656059	25 %	25 %	50 %	0 %	347523255
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11620	NC_015931	AGG	2	6	656140	656145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523255
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11855	NC_015931	GCG	2	6	667211	667216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523269
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