MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrolobus fumarii 1A chromosome

Total Repeats: 33347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_015931	CT	3	6	622164	622169	0 %	50 %	0 %	50 %	347523222
11002	NC_015931	CCT	2	6	622171	622176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523222
11003	NC_015931	AGA	2	6	622233	622238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523222
11004	NC_015931	ATC	2	6	622241	622246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523222
11005	NC_015931	TCT	2	6	622251	622256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523222
11006	NC_015931	CTC	2	6	622261	622266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523222
11007	NC_015931	CGA	2	6	622373	622378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523222
11008	NC_015931	CT	3	6	622459	622464	0 %	50 %	0 %	50 %	347523222
11009	NC_015931	GCC	2	6	622472	622477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523222
11010	NC_015931	ACC	2	6	622531	622536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523222
11011	NC_015931	CAC	2	6	622638	622643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523222
11012	NC_015931	CAA	2	6	622653	622658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523222
11013	NC_015931	GAG	2	6	622678	622683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523222
11014	NC_015931	TC	3	6	622703	622708	0 %	50 %	0 %	50 %	347523222
11015	NC_015931	GTC	2	6	623028	623033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523223
11016	NC_015931	TTA	2	6	623087	623092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347523223
11017	NC_015931	CTC	2	6	623118	623123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523223
11018	NC_015931	GGC	2	6	623149	623154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523223
11019	NC_015931	CAGC	2	8	623294	623301	25 %	0 %	25 %	50 %	347523223
11020	NC_015931	TAT	2	6	623304	623309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347523223
11021	NC_015931	GTT	2	6	623319	623324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523223
11022	NC_015931	CGG	2	6	623377	623382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523223
11023	NC_015931	TAT	2	6	623415	623420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347523223
11024	NC_015931	TG	3	6	623440	623445	0 %	50 %	50 %	0 %	347523223
11025	NC_015931	GTA	2	6	623454	623459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523223
11026	NC_015931	TGGTG	2	10	623564	623573	0 %	40 %	60 %	0 %	347523223
11027	NC_015931	TTC	2	6	623605	623610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523223
11028	NC_015931	GTG	2	6	623698	623703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523223
11029	NC_015931	GTG	2	6	623729	623734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523223
11030	NC_015931	CTA	2	6	623756	623761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523223
11031	NC_015931	AGC	2	6	623932	623937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523223
11032	NC_015931	CTC	2	6	623985	623990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523223
11033	NC_015931	TAG	2	6	624051	624056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523223
11034	NC_015931	CTT	2	6	624111	624116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523223
11035	NC_015931	GTA	3	9	624207	624215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523223
11036	NC_015931	CCT	2	6	624248	624253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523223
11037	NC_015931	GCC	2	6	624303	624308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523223
11038	NC_015931	TAC	2	6	624320	624325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523223
11039	NC_015931	TCT	2	6	624347	624352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523223
11040	NC_015931	GCT	2	6	624354	624359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523223
11041	NC_015931	CAGA	2	8	624594	624601	50 %	0 %	25 %	25 %	347523224
11042	NC_015931	CGAG	2	8	624656	624663	25 %	0 %	50 %	25 %	347523224
11043	NC_015931	ACC	2	6	624766	624771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523224
11044	NC_015931	A	6	6	624852	624857	100 %	0 %	0 %	0 %	347523224
11045	NC_015931	AATTG	2	10	624915	624924	40 %	40 %	20 %	0 %	347523224
11046	NC_015931	AGG	2	6	625113	625118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523225
11047	NC_015931	GATAG	2	10	625311	625320	40 %	20 %	40 %	0 %	347523225
11048	NC_015931	ACTT	2	8	625369	625376	25 %	50 %	0 %	25 %	347523225
11049	NC_015931	GCA	2	6	625434	625439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523225
11050	NC_015931	TAT	2	6	625501	625506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347523225
11051	NC_015931	ATG	2	6	625507	625512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523225
11052	NC_015931	GAA	2	6	625517	625522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523225
11053	NC_015931	TAG	2	6	625555	625560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523225
11054	NC_015931	CTT	2	6	625576	625581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523225
11055	NC_015931	TA	3	6	625631	625636	50 %	50 %	0 %	0 %	347523225
11056	NC_015931	GGAA	2	8	625684	625691	50 %	0 %	50 %	0 %	347523225
11057	NC_015931	GAA	2	6	625763	625768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523225
11058	NC_015931	ATC	2	6	625905	625910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523225
11059	NC_015931	TA	3	6	625948	625953	50 %	50 %	0 %	0 %	347523225
11060	NC_015931	GTG	2	6	626037	626042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523225
11061	NC_015931	TTG	2	6	626092	626097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523225
11062	NC_015931	GAT	2	6	626148	626153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523225
11063	NC_015931	AAG	2	6	626311	626316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523226
11064	NC_015931	CTC	2	6	626401	626406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523226
11065	NC_015931	CA	3	6	626478	626483	50 %	0 %	0 %	50 %	347523226
11066	NC_015931	TTA	2	6	626484	626489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347523226
11067	NC_015931	TGT	3	9	626500	626508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523226
11068	NC_015931	GA	3	6	626727	626732	50 %	0 %	50 %	0 %	347523226
11069	NC_015931	AGCAG	2	10	626758	626767	40 %	0 %	40 %	20 %	347523226
11070	NC_015931	GTT	2	6	626774	626779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523226
11071	NC_015931	AAG	2	6	626785	626790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523226
11072	NC_015931	GAA	3	9	626807	626815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523226
11073	NC_015931	AGAT	2	8	626841	626848	50 %	25 %	25 %	0 %	347523226
11074	NC_015931	TA	3	6	626909	626914	50 %	50 %	0 %	0 %	347523226
11075	NC_015931	AGA	2	6	627170	627175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523226
11076	NC_015931	TGT	2	6	627189	627194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523226
11077	NC_015931	TA	3	6	627209	627214	50 %	50 %	0 %	0 %	347523226
11078	NC_015931	AGA	2	6	627218	627223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523226
11079	NC_015931	GT	3	6	627401	627406	0 %	50 %	50 %	0 %	347523227
11080	NC_015931	GGT	2	6	627424	627429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523227
11081	NC_015931	TAC	2	6	627440	627445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523227
11082	NC_015931	TTAA	2	8	627451	627458	50 %	50 %	0 %	0 %	347523227
11083	NC_015931	GAG	2	6	627497	627502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523227
11084	NC_015931	CCG	2	6	627529	627534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523227
11085	NC_015931	CTT	2	6	627600	627605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523227
11086	NC_015931	AGT	2	6	627622	627627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523227
11087	NC_015931	AAGG	2	8	627662	627669	50 %	0 %	50 %	0 %	347523227
11088	NC_015931	ATC	2	6	627765	627770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523227
11089	NC_015931	GGT	2	6	627775	627780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523227
11090	NC_015931	TAG	2	6	627827	627832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523227
11091	NC_015931	ATA	2	6	627844	627849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347523227
11092	NC_015931	ACA	2	6	627857	627862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523227
11093	NC_015931	AGC	2	6	627909	627914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523227
11094	NC_015931	ATA	2	6	628028	628033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347523227
11095	NC_015931	ATA	2	6	628150	628155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347523227
11096	NC_015931	GTT	2	6	628206	628211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523227
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11098	NC_015931	AAAG	2	8	628252	628259	75 %	0 %	25 %	0 %	347523227
11099	NC_015931	AC	3	6	628290	628295	50 %	0 %	0 %	50 %	347523227
11100	NC_015931	ATT	2	6	628309	628314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347523227
11101	NC_015931	CAA	2	6	628368	628373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523227
11102	NC_015931	GAT	2	6	628468	628473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523227
11103	NC_015931	ATA	2	6	628474	628479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347523227
11104	NC_015931	A	6	6	628479	628484	100 %	0 %	0 %	0 %	347523227
11105	NC_015931	TTG	2	6	628487	628492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523227
11106	NC_015931	AT	3	6	628561	628566	50 %	50 %	0 %	0 %	347523227
11107	NC_015931	ATA	2	6	628597	628602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347523227
11108	NC_015931	GTA	2	6	628630	628635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523227
11109	NC_015931	CTAT	2	8	628652	628659	25 %	50 %	0 %	25 %	347523227
11110	NC_015931	ATC	2	6	628714	628719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523227
11111	NC_015931	AAG	3	9	628738	628746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523227
11112	NC_015931	CAT	2	6	628791	628796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523227
11113	NC_015931	GTT	2	6	629501	629506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523228
11114	NC_015931	CTT	2	6	629542	629547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523228
11115	NC_015931	AAC	2	6	629582	629587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523228
11116	NC_015931	GAG	2	6	629626	629631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523228
11117	NC_015931	GTT	2	6	629636	629641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523228
11118	NC_015931	AGG	2	6	629732	629737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523228
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11120	NC_015931	GGA	2	6	629779	629784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523228
11121	NC_015931	CTT	2	6	629795	629800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523228
11122	NC_015931	TCC	2	6	629806	629811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523228
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11232	NC_015931	CGC	2	6	636844	636849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523235
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11236	NC_015931	TCCTC	2	10	637117	637126	0 %	40 %	0 %	60 %	347523235
11237	NC_015931	CAT	2	6	637139	637144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523235
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11361	NC_015931	TGGGC	2	10	643078	643087	0 %	20 %	60 %	20 %	347523241
11362	NC_015931	GTT	2	6	643109	643114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523241
11363	NC_015931	GA	3	6	643156	643161	50 %	0 %	50 %	0 %	347523241
11364	NC_015931	TCC	2	6	643173	643178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523241
11365	NC_015931	ACC	2	6	643227	643232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523241
11366	NC_015931	GCT	2	6	643355	643360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523241
11367	NC_015931	GGAGTG	2	12	643393	643404	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	347523241
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11370	NC_015931	AGG	2	6	643472	643477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523241
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11374	NC_015931	GAC	2	6	643713	643718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523242
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11379	NC_015931	GAG	2	6	643897	643902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523242
11380	NC_015931	ACGAG	2	10	643934	643943	40 %	0 %	40 %	20 %	347523242
11381	NC_015931	TACGC	2	10	643962	643971	20 %	20 %	20 %	40 %	347523242
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11383	NC_015931	GAC	2	6	644056	644061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523242
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11386	NC_015931	CCA	3	9	644185	644193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523242
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11392	NC_015931	GC	3	6	644405	644410	0 %	0 %	50 %	50 %	347523242
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11432	NC_015931	TCC	2	6	646713	646718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523244
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11455	NC_015931	CTG	2	6	648354	648359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523246
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11461	NC_015931	AG	3	6	648738	648743	50 %	0 %	50 %	0 %	347523247
11462	NC_015931	AG	3	6	648785	648790	50 %	0 %	50 %	0 %	347523247
11463	NC_015931	GCT	2	6	648840	648845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523247
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11480	NC_015931	GAA	2	6	649622	649627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523247
11481	NC_015931	GCG	2	6	649699	649704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523247
11482	NC_015931	TTC	2	6	649944	649949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523248
11483	NC_015931	AGTCG	2	10	650021	650030	20 %	20 %	40 %	20 %	347523248
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11485	NC_015931	GCT	2	6	650121	650126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523248
11486	NC_015931	TCG	2	6	650197	650202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523248
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