MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrolobus fumarii 1A chromosome

Total Repeats: 33347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_015931	GTG	2	6	595536	595541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523200
10502	NC_015931	GTA	2	6	595561	595566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523200
10503	NC_015931	TTG	2	6	595575	595580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523200
10504	NC_015931	GCT	2	6	595590	595595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523200
10505	NC_015931	ATGC	2	8	595656	595663	25 %	25 %	25 %	25 %	347523200
10506	NC_015931	GCG	2	6	595674	595679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523200
10507	NC_015931	TCG	2	6	595704	595709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523200
10508	NC_015931	AGG	2	6	595710	595715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523200
10509	NC_015931	GAG	2	6	595817	595822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523200
10510	NC_015931	CCG	2	6	595831	595836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523200
10511	NC_015931	AG	3	6	595881	595886	50 %	0 %	50 %	0 %	347523200
10512	NC_015931	TCG	2	6	595896	595901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523200
10513	NC_015931	GTC	2	6	595925	595930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523200
10514	NC_015931	TCC	2	6	595954	595959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523200
10515	NC_015931	GGA	2	6	596026	596031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523200
10516	NC_015931	CCAGGA	2	12	596038	596049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523200
10517	NC_015931	GGT	2	6	596054	596059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523200
10518	NC_015931	AGG	2	6	596082	596087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523200
10519	NC_015931	ACC	2	6	596091	596096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523200
10520	NC_015931	GCA	2	6	596128	596133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523200
10521	NC_015931	CGC	2	6	596205	596210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523201
10522	NC_015931	AGC	2	6	596218	596223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523201
10523	NC_015931	GCC	2	6	596250	596255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523201
10524	NC_015931	CTC	2	6	596278	596283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523201
10525	NC_015931	C	6	6	596285	596290	0 %	0 %	0 %	100 %	347523201
10526	NC_015931	CCA	2	6	596400	596405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523201
10527	NC_015931	GCC	2	6	596446	596451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523201
10528	NC_015931	AGG	2	6	596452	596457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523201
10529	NC_015931	AGGA	2	8	596488	596495	50 %	0 %	50 %	0 %	347523201
10530	NC_015931	AGG	2	6	596497	596502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523201
10531	NC_015931	CA	3	6	596578	596583	50 %	0 %	0 %	50 %	347523201
10532	NC_015931	CGGC	2	8	596600	596607	0 %	0 %	50 %	50 %	347523201
10533	NC_015931	CAG	2	6	596625	596630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523201
10534	NC_015931	GCG	2	6	596671	596676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523201
10535	NC_015931	CGG	2	6	596678	596683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523201
10536	NC_015931	GGA	2	6	596711	596716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523201
10537	NC_015931	CGG	2	6	596747	596752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523201
10538	NC_015931	AGG	2	6	596755	596760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523201
10539	NC_015931	GGA	2	6	596799	596804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523201
10540	NC_015931	GGC	2	6	596823	596828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523201
10541	NC_015931	CGC	2	6	596892	596897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523201
10542	NC_015931	CT	3	6	596923	596928	0 %	50 %	0 %	50 %	347523201
10543	NC_015931	TCAC	2	8	596947	596954	25 %	25 %	0 %	50 %	347523202
10544	NC_015931	GCTG	2	8	596956	596963	0 %	25 %	50 %	25 %	347523202
10545	NC_015931	CCA	2	6	596982	596987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523202
10546	NC_015931	CTA	2	6	597018	597023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523202
10547	NC_015931	CCT	2	6	597093	597098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523202
10548	NC_015931	ATC	2	6	597107	597112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523202
10549	NC_015931	CAG	2	6	597184	597189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523202
10550	NC_015931	GAGGT	2	10	597319	597328	20 %	20 %	60 %	0 %	347523203
10551	NC_015931	CCA	2	6	597348	597353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523203
10552	NC_015931	CCG	2	6	597503	597508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523203
10553	NC_015931	GCC	2	6	597541	597546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523203
10554	NC_015931	GTA	2	6	597574	597579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523203
10555	NC_015931	CCA	2	6	597582	597587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523203
10556	NC_015931	CCA	2	6	597638	597643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523203
10557	NC_015931	GAG	2	6	597709	597714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523203
10558	NC_015931	GC	3	6	597726	597731	0 %	0 %	50 %	50 %	347523203
10559	NC_015931	GCC	2	6	597754	597759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523203
10560	NC_015931	CGG	2	6	598263	598268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523204
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10562	NC_015931	CGT	2	6	598320	598325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523204
10563	NC_015931	GTG	2	6	598364	598369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523204
10564	NC_015931	TCG	2	6	598394	598399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523204
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10566	NC_015931	GTA	2	6	598427	598432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523204
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10574	NC_015931	GGCT	2	8	598623	598630	0 %	25 %	50 %	25 %	347523204
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10577	NC_015931	GAGG	2	8	599026	599033	25 %	0 %	75 %	0 %	347523205
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10587	NC_015931	AGGA	2	8	599333	599340	50 %	0 %	50 %	0 %	347523205
10588	NC_015931	ACC	2	6	599393	599398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523205
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10591	NC_015931	AGT	2	6	599507	599512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523205
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10593	NC_015931	GGCT	2	8	599566	599573	0 %	25 %	50 %	25 %	347523205
10594	NC_015931	GTG	2	6	599756	599761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523205
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10600	NC_015931	CG	3	6	600187	600192	0 %	0 %	50 %	50 %	347523205
10601	NC_015931	CAAC	2	8	600210	600217	50 %	0 %	0 %	50 %	347523205
10602	NC_015931	GAC	2	6	600257	600262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523205
10603	NC_015931	GAG	2	6	600265	600270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523205
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10605	NC_015931	CGG	2	6	600321	600326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523205
10606	NC_015931	GGA	2	6	600346	600351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523205
10607	NC_015931	GAG	2	6	600355	600360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523205
10608	NC_015931	GCT	2	6	600380	600385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523205
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10610	NC_015931	CT	3	6	600423	600428	0 %	50 %	0 %	50 %	347523205
10611	NC_015931	GAG	2	6	600430	600435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523205
10612	NC_015931	GA	3	6	600481	600486	50 %	0 %	50 %	0 %	347523205
10613	NC_015931	CAT	2	6	600502	600507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523205
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10617	NC_015931	GAG	2	6	600677	600682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523205
10618	NC_015931	GCT	2	6	600697	600702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523205
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10620	NC_015931	GCT	2	6	600790	600795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523205
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10978	NC_015931	CGT	2	6	620899	620904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523222
10979	NC_015931	TCT	2	6	620913	620918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523222
10980	NC_015931	CGTC	2	8	620928	620935	0 %	25 %	25 %	50 %	347523222
10981	NC_015931	CT	3	6	620992	620997	0 %	50 %	0 %	50 %	347523222
10982	NC_015931	ACT	2	6	621035	621040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523222
10983	NC_015931	TCG	2	6	621116	621121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523222
10984	NC_015931	CCT	2	6	621282	621287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523222
10985	NC_015931	TCC	2	6	621296	621301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523222
10986	NC_015931	CT	3	6	621401	621406	0 %	50 %	0 %	50 %	347523222
10987	NC_015931	ACC	2	6	621419	621424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523222
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10991	NC_015931	CTA	2	6	621585	621590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523222
10992	NC_015931	AGC	2	6	621662	621667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523222
10993	NC_015931	GTA	2	6	621766	621771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523222
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10996	NC_015931	CCT	2	6	621972	621977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523222
10997	NC_015931	CT	3	6	622007	622012	0 %	50 %	0 %	50 %	347523222
10998	NC_015931	CGTC	2	8	622077	622084	0 %	25 %	25 %	50 %	347523222
10999	NC_015931	CCTGG	2	10	622085	622094	0 %	20 %	40 %	40 %	347523222
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