MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrolobus fumarii 1A chromosome

Total Repeats: 33347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_015931	GAT	2	6	567673	567678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523169
10002	NC_015931	GCA	2	6	567741	567746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523169
10003	NC_015931	CTC	3	9	567760	567768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523169
10004	NC_015931	TCG	2	6	567803	567808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523169
10005	NC_015931	CCG	2	6	567843	567848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523169
10006	NC_015931	CT	3	6	567860	567865	0 %	50 %	0 %	50 %	347523169
10007	NC_015931	GCTACC	2	12	567905	567916	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	347523169
10008	NC_015931	AGA	2	6	567969	567974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523169
10009	NC_015931	CTT	2	6	568015	568020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523169
10010	NC_015931	CTC	2	6	568093	568098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523169
10011	NC_015931	ACT	2	6	568194	568199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523170
10012	NC_015931	GCAAC	2	10	568241	568250	40 %	0 %	20 %	40 %	347523170
10013	NC_015931	TAGCCG	2	12	568254	568265	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347523170
10014	NC_015931	G	6	6	568265	568270	0 %	0 %	100 %	0 %	347523170
10015	NC_015931	ACA	2	6	568286	568291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523170
10016	NC_015931	TGA	2	6	568447	568452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523171
10017	NC_015931	GTG	2	6	568544	568549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523171
10018	NC_015931	GGA	2	6	568563	568568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523171
10019	NC_015931	AGG	2	6	568620	568625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523171
10020	NC_015931	GGA	2	6	568752	568757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523172
10021	NC_015931	GTC	2	6	568789	568794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523172
10022	NC_015931	GCTC	2	8	568803	568810	0 %	25 %	25 %	50 %	347523172
10023	NC_015931	GAG	2	6	568818	568823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523172
10024	NC_015931	GAGAA	2	10	568827	568836	60 %	0 %	40 %	0 %	347523172
10025	NC_015931	CGA	2	6	568899	568904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523172
10026	NC_015931	AAC	2	6	568936	568941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523172
10027	NC_015931	GAC	2	6	568963	568968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523172
10028	NC_015931	AG	3	6	569005	569010	50 %	0 %	50 %	0 %	347523172
10029	NC_015931	CATG	2	8	569605	569612	25 %	25 %	25 %	25 %	347523173
10030	NC_015931	GCTTG	2	10	569629	569638	0 %	40 %	40 %	20 %	347523173
10031	NC_015931	AG	3	6	569654	569659	50 %	0 %	50 %	0 %	347523173
10032	NC_015931	TAGG	2	8	569697	569704	25 %	25 %	50 %	0 %	347523173
10033	NC_015931	TTG	2	6	569751	569756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523173
10034	NC_015931	CCA	2	6	569836	569841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523173
10035	NC_015931	CTG	2	6	569882	569887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523173
10036	NC_015931	CAG	2	6	569891	569896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523173
10037	NC_015931	TTG	2	6	569964	569969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523173
10038	NC_015931	AG	3	6	569983	569988	50 %	0 %	50 %	0 %	347523173
10039	NC_015931	ATT	2	6	569990	569995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347523173
10040	NC_015931	TGT	2	6	570055	570060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523173
10041	NC_015931	GA	3	6	570107	570112	50 %	0 %	50 %	0 %	347523173
10042	NC_015931	ACA	2	6	570138	570143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523173
10043	NC_015931	TAA	2	6	570151	570156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347523173
10044	NC_015931	GAA	2	6	570214	570219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523173
10045	NC_015931	ATCTC	2	10	570276	570285	20 %	40 %	0 %	40 %	347523173
10046	NC_015931	TTC	2	6	570293	570298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523173
10047	NC_015931	AGG	2	6	570308	570313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523173
10048	NC_015931	CCT	2	6	570316	570321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523173
10049	NC_015931	AAGAG	2	10	570404	570413	60 %	0 %	40 %	0 %	347523173
10050	NC_015931	GCACT	2	10	570480	570489	20 %	20 %	20 %	40 %	347523173
10051	NC_015931	AGCA	2	8	570537	570544	50 %	0 %	25 %	25 %	347523173
10052	NC_015931	TCT	2	6	570633	570638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523173
10053	NC_015931	ACC	2	6	570793	570798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523174
10054	NC_015931	GAG	2	6	570902	570907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523174
10055	NC_015931	TCT	2	6	570932	570937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523174
10056	NC_015931	TCT	2	6	571028	571033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523174
10057	NC_015931	CCT	2	6	571040	571045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523174
10058	NC_015931	AGT	2	6	571051	571056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523174
10059	NC_015931	ACC	2	6	571089	571094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523174
10060	NC_015931	CAA	2	6	571117	571122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523174
10061	NC_015931	CTT	2	6	571157	571162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523174
10062	NC_015931	CCTC	2	8	571439	571446	0 %	25 %	0 %	75 %	347523175
10063	NC_015931	TCC	2	6	571462	571467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523175
10064	NC_015931	CGA	2	6	571472	571477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523175
10065	NC_015931	AGC	2	6	571597	571602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523175
10066	NC_015931	G	6	6	571665	571670	0 %	0 %	100 %	0 %	347523175
10067	NC_015931	TC	3	6	571776	571781	0 %	50 %	0 %	50 %	347523175
10068	NC_015931	GAG	2	6	571812	571817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523175
10069	NC_015931	TGC	2	6	571887	571892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523175
10070	NC_015931	CAT	2	6	571953	571958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523175
10071	NC_015931	GA	3	6	571959	571964	50 %	0 %	50 %	0 %	347523175
10072	NC_015931	CTC	2	6	572010	572015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523175
10073	NC_015931	TAC	2	6	572087	572092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523175
10074	NC_015931	TGT	2	6	572098	572103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523175
10075	NC_015931	TCC	2	6	572111	572116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523175
10076	NC_015931	TCC	2	6	572170	572175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523175
10077	NC_015931	CAT	2	6	572207	572212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523175
10078	NC_015931	ATC	2	6	572262	572267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523175
10079	NC_015931	TCG	2	6	572311	572316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523175
10080	NC_015931	TTG	2	6	572344	572349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523175
10081	NC_015931	CTC	2	6	572360	572365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523175
10082	NC_015931	GCG	2	6	572456	572461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523175
10083	NC_015931	GGA	2	6	573009	573014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523176
10084	NC_015931	CGC	2	6	573095	573100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523176
10085	NC_015931	TCA	2	6	573107	573112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523176
10086	NC_015931	GAG	2	6	573162	573167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523177
10087	NC_015931	GCT	2	6	573177	573182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523177
10088	NC_015931	CTC	2	6	573205	573210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523177
10089	NC_015931	AGG	2	6	573229	573234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523177
10090	NC_015931	GAG	2	6	573256	573261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523177
10091	NC_015931	CGA	2	6	573326	573331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523177
10092	NC_015931	GCTA	2	8	573333	573340	25 %	25 %	25 %	25 %	347523177
10093	NC_015931	CG	3	6	573401	573406	0 %	0 %	50 %	50 %	347523177
10094	NC_015931	GTGG	2	8	573408	573415	0 %	25 %	75 %	0 %	347523177
10095	NC_015931	GC	3	6	573435	573440	0 %	0 %	50 %	50 %	347523177
10096	NC_015931	ACGC	2	8	573474	573481	25 %	0 %	25 %	50 %	347523177
10097	NC_015931	CTCGC	2	10	573497	573506	0 %	20 %	20 %	60 %	347523177
10098	NC_015931	CGA	2	6	573513	573518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523177
10099	NC_015931	AAC	2	6	573520	573525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523177
10100	NC_015931	ACC	2	6	573690	573695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523177
10101	NC_015931	GTA	2	6	573734	573739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523177
10102	NC_015931	AGC	2	6	573825	573830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523177
10103	NC_015931	TCT	2	6	574044	574049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523178
10104	NC_015931	GCACG	2	10	574111	574120	20 %	0 %	40 %	40 %	347523178
10105	NC_015931	CTA	2	6	574123	574128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523178
10106	NC_015931	TCA	2	6	574156	574161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523178
10107	NC_015931	CCA	2	6	574174	574179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523178
10108	NC_015931	CCGGC	2	10	574213	574222	0 %	0 %	40 %	60 %	347523178
10109	NC_015931	CCAT	2	8	574278	574285	25 %	25 %	0 %	50 %	347523178
10110	NC_015931	CGG	2	6	574316	574321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523178
10111	NC_015931	AACGA	2	10	574331	574340	60 %	0 %	20 %	20 %	347523178
10112	NC_015931	TCC	3	9	574434	574442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523178
10113	NC_015931	CAC	2	6	574456	574461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523178
10114	NC_015931	CTC	3	9	574475	574483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523178
10115	NC_015931	AGC	2	6	574523	574528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523178
10116	NC_015931	TC	3	6	574581	574586	0 %	50 %	0 %	50 %	347523178
10117	NC_015931	GCG	2	6	574885	574890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523179
10118	NC_015931	TGC	2	6	574916	574921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523179
10119	NC_015931	CTA	2	6	574958	574963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523179
10120	NC_015931	TAC	2	6	574989	574994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523179
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10122	NC_015931	TGT	2	6	575126	575131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523179
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10230	NC_015931	GAA	2	6	582670	582675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523188
10231	NC_015931	TTG	2	6	582679	582684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523188
10232	NC_015931	GCG	2	6	582788	582793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523188
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10236	NC_015931	CGT	2	6	582925	582930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523188
10237	NC_015931	TGA	2	6	583047	583052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523188
10238	NC_015931	GCT	2	6	583070	583075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523188
10239	NC_015931	CTC	2	6	583079	583084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523188
10240	NC_015931	CGCTG	2	10	583158	583167	0 %	20 %	40 %	40 %	347523188
10241	NC_015931	GTT	2	6	583184	583189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523188
10242	NC_015931	CTA	2	6	583221	583226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523188
10243	NC_015931	TGA	2	6	583251	583256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523188
10244	NC_015931	GCT	2	6	583292	583297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523188
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10250	NC_015931	CGAG	2	8	583652	583659	25 %	0 %	50 %	25 %	347523188
10251	NC_015931	G	6	6	583666	583671	0 %	0 %	100 %	0 %	347523188
10252	NC_015931	AGG	2	6	583679	583684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523188
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10342	NC_015931	CAC	2	6	588055	588060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523193
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10347	NC_015931	AGTGG	2	10	588202	588211	20 %	20 %	60 %	0 %	347523193
10348	NC_015931	TGC	2	6	588396	588401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523194
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10352	NC_015931	CCG	2	6	588551	588556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523194
10353	NC_015931	CGGTGC	2	12	588595	588606	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	347523194
10354	NC_015931	CCT	2	6	588694	588699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523194
10355	NC_015931	TC	3	6	588702	588707	0 %	50 %	0 %	50 %	347523194
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