MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrolobus fumarii 1A chromosome

Total Repeats: 33347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_015931	ACA	2	6	537677	537682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523134
9502	NC_015931	TAC	2	6	537707	537712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523134
9503	NC_015931	CGG	2	6	537792	537797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523135
9504	NC_015931	TAC	2	6	537803	537808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523135
9505	NC_015931	TGC	2	6	537812	537817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523135
9506	NC_015931	CGT	2	6	537825	537830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523135
9507	NC_015931	CAG	2	6	537860	537865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523135
9508	NC_015931	AAC	2	6	537976	537981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523135
9509	NC_015931	TCA	2	6	537998	538003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523135
9510	NC_015931	GCG	2	6	538064	538069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523135
9511	NC_015931	CGG	2	6	538074	538079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523135
9512	NC_015931	TAC	2	6	538169	538174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523135
9513	NC_015931	GTC	2	6	538345	538350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523135
9514	NC_015931	CTC	2	6	538398	538403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523135
9515	NC_015931	TCA	2	6	538466	538471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523135
9516	NC_015931	ACGT	2	8	538477	538484	25 %	25 %	25 %	25 %	347523135
9517	NC_015931	TAG	2	6	538769	538774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523135
9518	NC_015931	AGA	2	6	538822	538827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523135
9519	NC_015931	GCC	2	6	538828	538833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523135
9520	NC_015931	GATG	2	8	538879	538886	25 %	25 %	50 %	0 %	347523135
9521	NC_015931	GCCA	2	8	538928	538935	25 %	0 %	25 %	50 %	347523135
9522	NC_015931	AGC	3	9	539086	539094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523135
9523	NC_015931	CTA	2	6	539103	539108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523135
9524	NC_015931	GAG	2	6	539116	539121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523135
9525	NC_015931	CGA	2	6	539133	539138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523135
9526	NC_015931	ACA	2	6	539150	539155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523135
9527	NC_015931	GCT	2	6	539160	539165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523135
9528	NC_015931	CATA	2	8	539264	539271	50 %	25 %	0 %	25 %	347523135
9529	NC_015931	ATC	2	6	539281	539286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523135
9530	NC_015931	GCT	2	6	539531	539536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523135
9531	NC_015931	ATA	2	6	539590	539595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347523135
9532	NC_015931	TAC	2	6	539602	539607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523135
9533	NC_015931	GCT	2	6	539619	539624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523135
9534	NC_015931	ACT	2	6	539738	539743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523135
9535	NC_015931	CAA	2	6	539796	539801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523135
9536	NC_015931	GAC	2	6	539923	539928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523135
9537	NC_015931	CGC	2	6	540020	540025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523135
9538	NC_015931	CTA	2	6	540057	540062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523135
9539	NC_015931	GCG	2	6	540086	540091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523135
9540	NC_015931	CGA	2	6	540099	540104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523135
9541	NC_015931	GGC	2	6	540163	540168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523135
9542	NC_015931	AC	3	6	540197	540202	50 %	0 %	0 %	50 %	347523135
9543	NC_015931	CTA	2	6	540342	540347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523135
9544	NC_015931	CGG	2	6	540402	540407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523135
9545	NC_015931	AGC	2	6	540501	540506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523135
9546	NC_015931	AGG	2	6	540549	540554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523135
9547	NC_015931	GAGC	2	8	540955	540962	25 %	0 %	50 %	25 %	347523136
9548	NC_015931	CTGG	2	8	541014	541021	0 %	25 %	50 %	25 %	347523136
9549	NC_015931	TAT	2	6	541022	541027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347523136
9550	NC_015931	TCTA	2	8	541041	541048	25 %	50 %	0 %	25 %	347523136
9551	NC_015931	AGTGG	2	10	541062	541071	20 %	20 %	60 %	0 %	347523136
9552	NC_015931	GTT	2	6	541196	541201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523137
9553	NC_015931	CTAT	2	8	541217	541224	25 %	50 %	0 %	25 %	347523137
9554	NC_015931	ATC	2	6	541244	541249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523137
9555	NC_015931	CGG	2	6	541264	541269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523137
9556	NC_015931	GTA	2	6	541282	541287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523137
9557	NC_015931	GTT	2	6	541288	541293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523137
9558	NC_015931	CTA	2	6	541356	541361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523137
9559	NC_015931	TGA	2	6	541376	541381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523137
9560	NC_015931	GGC	2	6	541402	541407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523137
9561	NC_015931	GCC	2	6	541412	541417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523137
9562	NC_015931	TCC	2	6	541451	541456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523137
9563	NC_015931	CGC	2	6	541549	541554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523137
9564	NC_015931	GGT	2	6	541594	541599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523137
9565	NC_015931	AGT	2	6	541634	541639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523137
9566	NC_015931	GGA	2	6	541666	541671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523137
9567	NC_015931	GGA	2	6	541865	541870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523138
9568	NC_015931	AG	3	6	541907	541912	50 %	0 %	50 %	0 %	347523138
9569	NC_015931	CTT	2	6	542028	542033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523138
9570	NC_015931	TCT	2	6	542159	542164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523138
9571	NC_015931	CG	3	6	542533	542538	0 %	0 %	50 %	50 %	347523139
9572	NC_015931	TGG	2	6	542623	542628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523139
9573	NC_015931	GTG	2	6	542757	542762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523139
9574	NC_015931	TTGGC	2	10	542769	542778	0 %	40 %	40 %	20 %	347523139
9575	NC_015931	TGG	2	6	542896	542901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523139
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9577	NC_015931	TGG	2	6	543021	543026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523139
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9580	NC_015931	TC	3	6	543167	543172	0 %	50 %	0 %	50 %	347523139
9581	NC_015931	GCA	2	6	543232	543237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523139
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9585	NC_015931	TGC	2	6	543399	543404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523139
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9587	NC_015931	GCA	2	6	543493	543498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523139
9588	NC_015931	AGG	2	6	543531	543536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523139
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9591	NC_015931	AG	3	6	543670	543675	50 %	0 %	50 %	0 %	347523139
9592	NC_015931	CGC	2	6	543694	543699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523139
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9594	NC_015931	GAG	2	6	543995	544000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523140
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9596	NC_015931	AGA	2	6	544115	544120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523140
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9599	NC_015931	AGA	2	6	544354	544359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523140
9600	NC_015931	GCCAA	2	10	544364	544373	40 %	0 %	20 %	40 %	347523140
9601	NC_015931	ACC	2	6	544467	544472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347523141
9602	NC_015931	TAC	2	6	544508	544513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523141
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9604	NC_015931	AGCC	2	8	544731	544738	25 %	0 %	25 %	50 %	347523142
9605	NC_015931	GGA	2	6	544791	544796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523142
9606	NC_015931	TCC	2	6	544822	544827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523142
9607	NC_015931	TTTGTT	2	12	544940	544951	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	347523142
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9609	NC_015931	TC	3	6	544977	544982	0 %	50 %	0 %	50 %	347523142
9610	NC_015931	TG	3	6	545047	545052	0 %	50 %	50 %	0 %	347523143
9611	NC_015931	ACT	2	6	545096	545101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523143
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9616	NC_015931	GA	3	6	545817	545822	50 %	0 %	50 %	0 %	347523144
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9619	NC_015931	AGG	2	6	545963	545968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523144
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