MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrolobus fumarii 1A chromosome

Total Repeats: 33347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_015931	CA	3	6	513168	513173	50 %	0 %	0 %	50 %	347523106
9002	NC_015931	GTC	2	6	513461	513466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523107
9003	NC_015931	CTT	2	6	513510	513515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523107
9004	NC_015931	GAA	2	6	513525	513530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523107
9005	NC_015931	ATGG	2	8	513563	513570	25 %	25 %	50 %	0 %	347523107
9006	NC_015931	GAG	2	6	513636	513641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523107
9007	NC_015931	AAG	2	6	513658	513663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523107
9008	NC_015931	ATA	2	6	513679	513684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347523107
9009	NC_015931	AC	3	6	513733	513738	50 %	0 %	0 %	50 %	347523107
9010	NC_015931	CTC	2	6	513808	513813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523107
9011	NC_015931	CGA	2	6	513816	513821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523107
9012	NC_015931	TTC	2	6	513862	513867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523107
9013	NC_015931	AGG	2	6	513881	513886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523107
9014	NC_015931	GAG	2	6	513889	513894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523107
9015	NC_015931	CGC	2	6	514014	514019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523107
9016	NC_015931	CTA	2	6	514032	514037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523107
9017	NC_015931	CTA	2	6	514044	514049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523107
9018	NC_015931	GAG	2	6	514080	514085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523107
9019	NC_015931	GCG	2	6	514114	514119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523107
9020	NC_015931	GA	3	6	514135	514140	50 %	0 %	50 %	0 %	347523107
9021	NC_015931	CGA	2	6	514170	514175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523107
9022	NC_015931	AACA	2	8	514198	514205	75 %	0 %	0 %	25 %	347523107
9023	NC_015931	GCG	2	6	514436	514441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523108
9024	NC_015931	GT	3	6	514447	514452	0 %	50 %	50 %	0 %	347523108
9025	NC_015931	GTG	2	6	514464	514469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523108
9026	NC_015931	TGA	2	6	514514	514519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523108
9027	NC_015931	GCT	2	6	514554	514559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523108
9028	NC_015931	CTC	2	6	514635	514640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523108
9029	NC_015931	GCC	2	6	514665	514670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523108
9030	NC_015931	GAG	2	6	514671	514676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523108
9031	NC_015931	GAG	2	6	514683	514688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523108
9032	NC_015931	TGG	2	6	514739	514744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523108
9033	NC_015931	GGA	2	6	514760	514765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523108
9034	NC_015931	GCCC	2	8	514830	514837	0 %	0 %	25 %	75 %	347523108
9035	NC_015931	TGA	2	6	514852	514857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523108
9036	NC_015931	CGG	2	6	514864	514869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523108
9037	NC_015931	GTG	2	6	514938	514943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523108
9038	NC_015931	GTC	2	6	514977	514982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523108
9039	NC_015931	AGG	2	6	514984	514989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523108
9040	NC_015931	GCG	2	6	515056	515061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523108
9041	NC_015931	GAG	2	6	515109	515114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523108
9042	NC_015931	GAG	2	6	515127	515132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523108
9043	NC_015931	AGT	2	6	515181	515186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523108
9044	NC_015931	CGC	2	6	515198	515203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523108
9045	NC_015931	GCC	2	6	515207	515212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523108
9046	NC_015931	AGG	2	6	515244	515249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523108
9047	NC_015931	GGC	2	6	515264	515269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523108
9048	NC_015931	GAG	2	6	515294	515299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523108
9049	NC_015931	GTC	2	6	515304	515309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523108
9050	NC_015931	ATAG	2	8	515343	515350	50 %	25 %	25 %	0 %	347523108
9051	NC_015931	CGA	2	6	515360	515365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523108
9052	NC_015931	TTA	2	6	515561	515566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347523109
9053	NC_015931	GA	3	6	515590	515595	50 %	0 %	50 %	0 %	347523109
9054	NC_015931	TCT	2	6	515632	515637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523109
9055	NC_015931	TGT	2	6	515646	515651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523109
9056	NC_015931	TGC	2	6	515686	515691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523109
9057	NC_015931	GCT	2	6	515719	515724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523109
9058	NC_015931	GCT	2	6	515851	515856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523109
9059	NC_015931	TAG	2	6	515965	515970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523109
9060	NC_015931	ATC	2	6	515990	515995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523109
9061	NC_015931	CTG	2	6	515999	516004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523109
9062	NC_015931	AG	3	6	516025	516030	50 %	0 %	50 %	0 %	347523109
9063	NC_015931	GCCATG	2	12	516404	516415	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347523110
9064	NC_015931	AGGG	2	8	516455	516462	25 %	0 %	75 %	0 %	347523110
9065	NC_015931	TCT	2	6	516540	516545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523110
9066	NC_015931	CGA	2	6	516619	516624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523110
9067	NC_015931	AGC	2	6	516928	516933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523110
9068	NC_015931	GCAC	2	8	516963	516970	25 %	0 %	25 %	50 %	347523110
9069	NC_015931	AGG	2	6	516983	516988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523110
9070	NC_015931	ATG	2	6	516993	516998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523110
9071	NC_015931	CAT	2	6	517057	517062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523110
9072	NC_015931	CGC	2	6	517064	517069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523110
9073	NC_015931	CTC	2	6	517100	517105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523110
9074	NC_015931	TAC	2	6	517109	517114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523110
9075	NC_015931	ACT	2	6	517119	517124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523110
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9077	NC_015931	CGA	2	6	517318	517323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523110
9078	NC_015931	GAT	2	6	517339	517344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523110
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9080	NC_015931	GTC	2	6	517499	517504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523110
9081	NC_015931	GAG	2	6	517505	517510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523110
9082	NC_015931	GAG	2	6	517513	517518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523110
9083	NC_015931	GAG	2	6	517564	517569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523110
9084	NC_015931	CGC	2	6	517575	517580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523110
9085	NC_015931	TGT	2	6	517597	517602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523110
9086	NC_015931	GGC	2	6	517605	517610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523110
9087	NC_015931	CCTCTC	2	12	517636	517647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523111
9088	NC_015931	GCC	2	6	517705	517710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523111
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9090	NC_015931	CCG	2	6	517854	517859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523111
9091	NC_015931	CTT	2	6	517879	517884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347523111
9092	NC_015931	CCT	2	6	517962	517967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523111
9093	NC_015931	TAT	2	6	517981	517986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347523111
9094	NC_015931	CTC	2	6	518029	518034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523111
9095	NC_015931	CGG	2	6	518286	518291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523112
9096	NC_015931	GAG	2	6	518360	518365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523112
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9099	NC_015931	ATA	2	6	518405	518410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347523112
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9101	NC_015931	ATT	2	6	518525	518530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347523112
9102	NC_015931	GAG	2	6	518531	518536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523112
9103	NC_015931	AGCTG	2	10	518584	518593	20 %	20 %	40 %	20 %	347523112
9104	NC_015931	TGA	2	6	518653	518658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523112
9105	NC_015931	GGA	2	6	518697	518702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523112
9106	NC_015931	GAG	2	6	518747	518752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523112
9107	NC_015931	GGA	3	9	518806	518814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523112
9108	NC_015931	GGCG	2	8	518842	518849	0 %	0 %	75 %	25 %	347523112
9109	NC_015931	CTC	2	6	519001	519006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523112
9110	NC_015931	CTA	2	6	519035	519040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523112
9111	NC_015931	GGT	2	6	519047	519052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523112
9112	NC_015931	CGC	2	6	519061	519066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347523112
9113	NC_015931	CTG	2	6	519113	519118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523112
9114	NC_015931	GCGA	2	8	519137	519144	25 %	0 %	50 %	25 %	347523112
9115	NC_015931	GA	3	6	519143	519148	50 %	0 %	50 %	0 %	347523112
9116	NC_015931	GCGT	2	8	519169	519176	0 %	25 %	50 %	25 %	347523112
9117	NC_015931	GGGCGA	2	12	519189	519200	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	347523112
9118	NC_015931	TGA	2	6	519242	519247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523113
9119	NC_015931	GAC	2	6	519255	519260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523113
9120	NC_015931	GC	3	6	519295	519300	0 %	0 %	50 %	50 %	347523113
9121	NC_015931	ACA	2	6	519407	519412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523113
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9242	NC_015931	GAA	2	6	524710	524715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523120
9243	NC_015931	AG	3	6	524734	524739	50 %	0 %	50 %	0 %	347523120
9244	NC_015931	GCG	2	6	524881	524886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347523120
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9247	NC_015931	GCT	2	6	524989	524994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523121
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9352	NC_015931	TA	3	6	530442	530447	50 %	50 %	0 %	0 %	347523128
9353	NC_015931	GGT	2	6	530465	530470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347523128
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9357	NC_015931	TCTTG	2	10	530660	530669	0 %	60 %	20 %	20 %	347523128
9358	NC_015931	CGT	2	6	530687	530692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523128
9359	NC_015931	TGGGCG	2	12	530715	530726	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	347523128
9360	NC_015931	GCTTC	2	10	530727	530736	0 %	40 %	20 %	40 %	347523128
9361	NC_015931	ATG	2	6	530757	530762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347523128
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9485	NC_015931	GGA	2	6	536729	536734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347523133
9486	NC_015931	GCT	2	6	536801	536806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347523133
9487	NC_015931	AGA	2	6	536846	536851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347523133
9488	NC_015931	TCC	2	6	536855	536860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523133
9489	NC_015931	CTC	2	6	536875	536880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523133
9490	NC_015931	AG	3	6	537208	537213	50 %	0 %	50 %	0 %	347523134
9491	NC_015931	CCT	2	6	537222	537227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523134
9492	NC_015931	TGT	2	6	537267	537272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347523134
9493	NC_015931	TAC	2	6	537320	537325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523134
9494	NC_015931	CAA	2	6	537330	537335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347523134
9495	NC_015931	AGC	2	6	537374	537379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347523134
9496	NC_015931	TCC	2	6	537416	537421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347523134
9497	NC_015931	CCAG	2	8	537477	537484	25 %	0 %	25 %	50 %	347523134
9498	NC_015931	ATC	2	6	537541	537546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523134
9499	NC_015931	TAC	2	6	537565	537570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347523134
9500	NC_015931	TAT	2	6	537600	537605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347523134

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