MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrolobus fumarii 1A chromosome

Total Repeats: 33347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015931	CCT	2	6	338292	338297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347522926
6002	NC_015931	CCT	2	6	338307	338312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347522926
6003	NC_015931	AGG	2	6	338335	338340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522926
6004	NC_015931	CCT	2	6	338350	338355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347522926
6005	NC_015931	ACC	2	6	338359	338364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347522926
6006	NC_015931	GGC	2	6	338392	338397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347522926
6007	NC_015931	CG	3	6	338477	338482	0 %	0 %	50 %	50 %	347522926
6008	NC_015931	GCA	2	6	338508	338513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347522926
6009	NC_015931	AGC	2	6	338524	338529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347522926
6010	NC_015931	TCGCG	2	10	338532	338541	0 %	20 %	40 %	40 %	347522926
6011	NC_015931	GCCAA	2	10	338621	338630	40 %	0 %	20 %	40 %	347522926
6012	NC_015931	CGC	2	6	338637	338642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347522926
6013	NC_015931	TACGA	2	10	338659	338668	40 %	20 %	20 %	20 %	347522926
6014	NC_015931	CAG	2	6	338670	338675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347522926
6015	NC_015931	TGC	2	6	338677	338682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347522926
6016	NC_015931	AGT	2	6	338684	338689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347522926
6017	NC_015931	AAG	2	6	338864	338869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347522926
6018	NC_015931	CAC	2	6	339135	339140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347522927
6019	NC_015931	TTG	2	6	339150	339155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347522927
6020	NC_015931	GT	3	6	339255	339260	0 %	50 %	50 %	0 %	347522927
6021	NC_015931	GAA	2	6	339277	339282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347522927
6022	NC_015931	GAG	2	6	339290	339295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522927
6023	NC_015931	GTA	2	6	339348	339353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347522927
6024	NC_015931	CTG	2	6	339390	339395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347522927
6025	NC_015931	GTC	2	6	339593	339598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347522927
6026	NC_015931	AAG	2	6	339611	339616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347522927
6027	NC_015931	GGA	2	6	339717	339722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522927
6028	NC_015931	AAT	2	6	339730	339735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347522927
6029	NC_015931	ACT	2	6	339753	339758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347522927
6030	NC_015931	GTG	2	6	339843	339848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347522927
6031	NC_015931	AGG	2	6	339933	339938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522927
6032	NC_015931	TGC	2	6	339997	340002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347522928
6033	NC_015931	TGC	2	6	340045	340050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347522928
6034	NC_015931	TAC	2	6	340108	340113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347522928
6035	NC_015931	ATC	2	6	340179	340184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347522928
6036	NC_015931	CCT	2	6	340205	340210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347522928
6037	NC_015931	GCC	2	6	340244	340249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347522928
6038	NC_015931	CTA	2	6	340269	340274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347522928
6039	NC_015931	CTT	2	6	340277	340282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347522928
6040	NC_015931	TGGTG	2	10	340322	340331	0 %	40 %	60 %	0 %	347522928
6041	NC_015931	GTG	2	6	340485	340490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347522928
6042	NC_015931	CTTGG	2	10	340493	340502	0 %	40 %	40 %	20 %	347522928
6043	NC_015931	CGA	2	6	340582	340587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347522928
6044	NC_015931	GTG	2	6	340636	340641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347522928
6045	NC_015931	TC	3	6	340672	340677	0 %	50 %	0 %	50 %	347522928
6046	NC_015931	TGT	2	6	340691	340696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347522928
6047	NC_015931	GGT	2	6	340712	340717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347522928
6048	NC_015931	GAG	2	6	340759	340764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522929
6049	NC_015931	TAG	2	6	340815	340820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347522929
6050	NC_015931	GAC	2	6	340846	340851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347522929
6051	NC_015931	TAG	2	6	340914	340919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347522929
6052	NC_015931	GCC	2	6	340948	340953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347522929
6053	NC_015931	AGG	2	6	340961	340966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522929
6054	NC_015931	GGC	2	6	341155	341160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347522929
6055	NC_015931	TTG	2	6	341367	341372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347522929
6056	NC_015931	TCC	2	6	341387	341392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347522929
6057	NC_015931	TGC	2	6	341394	341399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347522929
6058	NC_015931	GGC	2	6	341416	341421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347522929
6059	NC_015931	GTG	2	6	341480	341485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347522929
6060	NC_015931	TGG	2	6	341494	341499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347522929
6061	NC_015931	GAG	2	6	341722	341727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522929
6062	NC_015931	AGG	2	6	341745	341750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522929
6063	NC_015931	GCC	2	6	341773	341778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347522929
6064	NC_015931	CGTGA	2	10	341794	341803	20 %	20 %	40 %	20 %	347522929
6065	NC_015931	GCG	2	6	341876	341881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347522930
6066	NC_015931	GGT	2	6	341905	341910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347522930
6067	NC_015931	GAC	2	6	342042	342047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347522930
6068	NC_015931	GAG	2	6	342112	342117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522930
6069	NC_015931	CTT	2	6	342145	342150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347522930
6070	NC_015931	AGA	2	6	342200	342205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347522930
6071	NC_015931	CGA	2	6	342282	342287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347522930
6072	NC_015931	GCA	2	6	342298	342303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347522930
6073	NC_015931	CAGG	2	8	342340	342347	25 %	0 %	50 %	25 %	347522930
6074	NC_015931	GGC	2	6	342396	342401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347522930
6075	NC_015931	AGG	2	6	342412	342417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522930
6076	NC_015931	TCG	2	6	342482	342487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347522930
6077	NC_015931	GAG	2	6	342714	342719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522930
6078	NC_015931	AG	3	6	342718	342723	50 %	0 %	50 %	0 %	347522930
6079	NC_015931	AAT	2	6	342843	342848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347522930
6080	NC_015931	CTGG	2	8	342895	342902	0 %	25 %	50 %	25 %	347522930
6081	NC_015931	TGT	2	6	342933	342938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347522930
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6085	NC_015931	ACG	2	6	343093	343098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347522930
6086	NC_015931	CGA	2	6	343133	343138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347522930
6087	NC_015931	ACG	2	6	343145	343150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347522930
6088	NC_015931	AGC	2	6	343235	343240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347522930
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6090	NC_015931	CGC	2	6	343276	343281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347522930
6091	NC_015931	AGG	3	9	343294	343302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522930
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6093	NC_015931	ATG	2	6	343560	343565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347522931
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6095	NC_015931	TAGC	2	8	343738	343745	25 %	25 %	25 %	25 %	347522931
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6099	NC_015931	CCCT	2	8	344027	344034	0 %	25 %	0 %	75 %	347522932
6100	NC_015931	TGT	2	6	344167	344172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347522932
6101	NC_015931	TAG	2	6	344186	344191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347522932
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6103	NC_015931	CAG	2	6	344347	344352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347522932
6104	NC_015931	ATG	2	6	344357	344362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347522932
6105	NC_015931	CAC	2	6	344410	344415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347522932
6106	NC_015931	TAG	2	6	344448	344453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347522932
6107	NC_015931	CT	3	6	344465	344470	0 %	50 %	0 %	50 %	347522932
6108	NC_015931	GAT	2	6	344473	344478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347522932
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6110	NC_015931	TC	3	6	344488	344493	0 %	50 %	0 %	50 %	347522932
6111	NC_015931	GCT	2	6	344494	344499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347522932
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6118	NC_015931	CTC	2	6	344933	344938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347522933
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6242	NC_015931	GGA	2	6	350819	350824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522940
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6481	NC_015931	GAGAGG	2	12	363599	363610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522952
6482	NC_015931	TCA	2	6	363648	363653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347522952
6483	NC_015931	CTA	2	6	363672	363677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347522952
6484	NC_015931	TCC	3	9	363687	363695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347522952
6485	NC_015931	GAG	2	6	363896	363901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522952
6486	NC_015931	GAG	2	6	363916	363921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522952
6487	NC_015931	TCA	2	6	364023	364028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347522952
6488	NC_015931	GAT	2	6	364205	364210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347522952
6489	NC_015931	GA	3	6	364250	364255	50 %	0 %	50 %	0 %	347522952
6490	NC_015931	AGG	2	6	364262	364267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522952
6491	NC_015931	AGC	2	6	364303	364308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347522952
6492	NC_015931	TCA	2	6	364309	364314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347522952
6493	NC_015931	GAG	2	6	364331	364336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347522952
6494	NC_015931	GAA	2	6	364349	364354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347522952
6495	NC_015931	GCG	2	6	364355	364360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347522952
6496	NC_015931	ATC	2	6	364379	364384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347522952
6497	NC_015931	GTC	2	6	364436	364441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347522952
6498	NC_015931	TCC	2	6	364473	364478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347522952
6499	NC_015931	AGGG	2	8	364481	364488	25 %	0 %	75 %	0 %	347522952
6500	NC_015931	ATA	2	6	364532	364537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347522952

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