MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas stutzeri ATCC 17588 = LMG 11199 chromosome

Total Repeats: 96672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015740	GCA	2	6	481	486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339492078
2	NC_015740	GT	3	6	487	492	0 %	50 %	50 %	0 %	339492078
3	NC_015740	CTGC	2	8	512	519	0 %	25 %	25 %	50 %	339492078
4	NC_015740	GCT	2	6	646	651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339492078
5	NC_015740	CTT	2	6	689	694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339492078
6	NC_015740	CCG	3	9	714	722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339492078
7	NC_015740	GCC	3	9	734	742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339492078
8	NC_015740	CAGC	2	8	761	768	25 %	0 %	25 %	50 %	339492078
9	NC_015740	GCA	2	6	791	796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339492078
10	NC_015740	ACA	2	6	802	807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339492078
11	NC_015740	C	6	6	813	818	0 %	0 %	0 %	100 %	339492078
12	NC_015740	CCGGAG	2	12	845	856	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	339492078
13	NC_015740	CCG	2	6	857	862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339492078
14	NC_015740	CACCTT	2	12	922	933	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	339492078
15	NC_015740	TCG	2	6	942	947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339492078
16	NC_015740	GCC	2	6	977	982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339492078
17	NC_015740	TGG	2	6	1033	1038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339492078
18	NC_015740	ATGC	2	8	1064	1071	25 %	25 %	25 %	25 %	339492078
19	NC_015740	CTG	2	6	1085	1090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339492078
20	NC_015740	AAG	2	6	1091	1096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339492078
21	NC_015740	GTG	2	6	1112	1117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339492078
22	NC_015740	TCG	2	6	1137	1142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339492078
23	NC_015740	GCT	2	6	1213	1218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339492078
24	NC_015740	TTC	2	6	1235	1240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339492078
25	NC_015740	GAA	2	6	1243	1248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339492078
26	NC_015740	TTC	2	6	1268	1273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339492078
27	NC_015740	GCT	2	6	1288	1293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339492078
28	NC_015740	GGC	2	6	1298	1303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339492078
29	NC_015740	CAG	2	6	1304	1309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339492078
30	NC_015740	GAG	2	6	1355	1360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339492078
31	NC_015740	GCC	2	6	1405	1410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339492078
32	NC_015740	TGA	2	6	1437	1442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339492078
33	NC_015740	ATG	2	6	1476	1481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339492078
34	NC_015740	CTT	2	6	1486	1491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339492078
35	NC_015740	CTG	2	6	1616	1621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339492078
36	NC_015740	TAC	2	6	1676	1681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339492078
37	NC_015740	CTG	2	6	1700	1705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339492078
38	NC_015740	GCG	2	6	1711	1716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339492078
39	NC_015740	CG	3	6	1729	1734	0 %	0 %	50 %	50 %	339492078
40	NC_015740	ACCA	2	8	1772	1779	50 %	0 %	0 %	50 %	339492078
41	NC_015740	CGG	2	6	1807	1812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339492078
42	NC_015740	CAC	2	6	1822	1827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339492078
43	NC_015740	TGC	2	6	1830	1835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339492078
44	NC_015740	TGC	2	6	1902	1907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339492078
45	NC_015740	GACCA	2	10	1949	1958	40 %	0 %	20 %	40 %	339492079
46	NC_015740	CGT	2	6	2014	2019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339492079
47	NC_015740	TTC	2	6	2055	2060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339492079
48	NC_015740	TCG	2	6	2061	2066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339492079
49	NC_015740	GCA	2	6	2074	2079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339492079
50	NC_015740	TGG	2	6	2115	2120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339492079
51	NC_015740	GCC	2	6	2141	2146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339492079
52	NC_015740	GC	3	6	2171	2176	0 %	0 %	50 %	50 %	339492079
53	NC_015740	GTC	2	6	2246	2251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339492079
54	NC_015740	GAA	2	6	2315	2320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339492079
55	NC_015740	AGCGC	2	10	2376	2385	20 %	0 %	40 %	40 %	339492079
56	NC_015740	CAG	2	6	2399	2404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339492079
57	NC_015740	CCA	2	6	2530	2535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339492079
58	NC_015740	GC	3	6	2570	2575	0 %	0 %	50 %	50 %	339492079
59	NC_015740	CCA	2	6	2634	2639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339492079
60	NC_015740	TTCACC	2	12	2648	2659	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	339492079
61	NC_015740	TGG	2	6	2667	2672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339492079
62	NC_015740	TGC	2	6	2700	2705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339492079
63	NC_015740	TGG	2	6	2724	2729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339492079
64	NC_015740	GCT	2	6	2743	2748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339492079
65	NC_015740	CAA	2	6	2842	2847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339492079
66	NC_015740	AGG	2	6	2856	2861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339492079
67	NC_015740	GAA	2	6	2870	2875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339492079
68	NC_015740	CGG	2	6	2893	2898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339492079
69	NC_015740	TGA	2	6	2949	2954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339492079
70	NC_015740	TC	3	6	2977	2982	0 %	50 %	0 %	50 %	339492079
71	NC_015740	CAG	2	6	2992	2997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339492079
72	NC_015740	ACG	2	6	3021	3026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339492079
73	NC_015740	CGT	2	6	3037	3042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339492079
74	NC_015740	TC	3	6	3085	3090	0 %	50 %	0 %	50 %	339492080
75	NC_015740	CTG	2	6	3185	3190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339492080
76	NC_015740	CCAT	2	8	3195	3202	25 %	25 %	0 %	50 %	339492080
77	NC_015740	GCC	2	6	3386	3391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339492080
78	NC_015740	GCAG	2	8	3468	3475	25 %	0 %	50 %	25 %	339492080
79	NC_015740	G	6	6	3486	3491	0 %	0 %	100 %	0 %	339492080
80	NC_015740	GCA	2	6	3535	3540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339492080
81	NC_015740	CGA	2	6	3631	3636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339492080
82	NC_015740	GC	3	6	3832	3837	0 %	0 %	50 %	50 %	339492080
83	NC_015740	TGG	2	6	3903	3908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339492080
84	NC_015740	TG	3	6	3909	3914	0 %	50 %	50 %	0 %	339492080
85	NC_015740	CGA	2	6	3979	3984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339492080
86	NC_015740	GCA	2	6	4006	4011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339492080
87	NC_015740	TTA	2	6	4059	4064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339492080
88	NC_015740	AAG	2	6	4089	4094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339492080
89	NC_015740	TGAG	2	8	4181	4188	25 %	25 %	50 %	0 %	339492080
90	NC_015740	CAC	2	6	4294	4299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339492081
91	NC_015740	GTC	2	6	4312	4317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339492081
92	NC_015740	TCGA	2	8	4324	4331	25 %	25 %	25 %	25 %	339492081
93	NC_015740	CCAT	2	8	4370	4377	25 %	25 %	0 %	50 %	339492081
94	NC_015740	GAA	2	6	4435	4440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339492081
95	NC_015740	TCA	2	6	4460	4465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339492081
96	NC_015740	TGC	2	6	4472	4477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339492081
97	NC_015740	CGA	2	6	4494	4499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339492081
98	NC_015740	GAG	2	6	4564	4569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339492081
99	NC_015740	CTG	3	9	4570	4578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339492081
100	NC_015740	CCG	2	6	4584	4589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339492081
101	NC_015740	CCG	2	6	4697	4702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339492081
102	NC_015740	CGA	2	6	4797	4802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339492081
103	NC_015740	GAA	2	6	4816	4821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339492081
104	NC_015740	GGC	2	6	4837	4842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339492081
105	NC_015740	TCG	2	6	4853	4858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339492081
106	NC_015740	CAA	2	6	4872	4877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339492081
107	NC_015740	CAA	2	6	4989	4994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339492081
108	NC_015740	CGG	2	6	5010	5015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339492081
109	NC_015740	TCCGC	2	10	5033	5042	0 %	20 %	20 %	60 %	339492081
110	NC_015740	AAC	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339492081
111	NC_015740	GAA	2	6	5088	5093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339492081
112	NC_015740	CCA	2	6	5105	5110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339492081
113	NC_015740	ATC	2	6	5143	5148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339492081
114	NC_015740	AGTTC	2	10	5171	5180	20 %	40 %	20 %	20 %	339492081
115	NC_015740	TCC	2	6	5203	5208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339492081
116	NC_015740	CTG	2	6	5260	5265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339492081
117	NC_015740	GAT	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339492081
118	NC_015740	GC	3	6	5332	5337	0 %	0 %	50 %	50 %	339492081
119	NC_015740	GC	3	6	5366	5371	0 %	0 %	50 %	50 %	339492081
120	NC_015740	TCC	2	6	5507	5512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339492081
121	NC_015740	ACA	2	6	5627	5632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339492081
122	NC_015740	CAT	4	12	5655	5666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339492081
123	NC_015740	CTG	3	9	5704	5712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339492081
124	NC_015740	CTT	3	9	5715	5723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339492081
125	NC_015740	CCG	2	6	5773	5778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339492081
126	NC_015740	GAC	2	6	5821	5826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339492081
127	NC_015740	GGA	2	6	5835	5840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339492081
128	NC_015740	TGA	2	6	5948	5953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339492081
129	NC_015740	ATCT	2	8	6007	6014	25 %	50 %	0 %	25 %	339492081
130	NC_015740	AGC	2	6	6032	6037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339492081
131	NC_015740	GC	3	6	6080	6085	0 %	0 %	50 %	50 %	339492081
132	NC_015740	GCG	2	6	6095	6100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339492081
133	NC_015740	GCA	2	6	6227	6232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339492081
134	NC_015740	CTG	2	6	6277	6282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339492081
135	NC_015740	GAA	2	6	6283	6288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339492081
136	NC_015740	AAG	2	6	6316	6321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339492081
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139	NC_015740	CGG	2	6	6494	6499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339492081
140	NC_015740	CCG	2	6	6540	6545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339492081
141	NC_015740	CTC	2	6	6938	6943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339492082
142	NC_015740	TGA	2	6	7021	7026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339492082
143	NC_015740	CAA	2	6	7175	7180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339492082
144	NC_015740	TGC	2	6	7258	7263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339492082
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149	NC_015740	TGAT	2	8	7423	7430	25 %	50 %	25 %	0 %	339492082
150	NC_015740	GT	3	6	7447	7452	0 %	50 %	50 %	0 %	339492082
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154	NC_015740	ATC	2	6	7704	7709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339492082
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157	NC_015740	CTG	2	6	7826	7831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339492083
158	NC_015740	ACC	2	6	7891	7896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339492083
159	NC_015740	CCG	2	6	8004	8009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339492083
160	NC_015740	CGA	2	6	8033	8038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339492084
161	NC_015740	TGC	2	6	8077	8082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339492084
162	NC_015740	CTA	2	6	8099	8104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339492084
163	NC_015740	GACC	2	8	8123	8130	25 %	0 %	25 %	50 %	339492084
164	NC_015740	ACG	2	6	8153	8158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339492084
165	NC_015740	GC	3	6	8220	8225	0 %	0 %	50 %	50 %	339492084
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167	NC_015740	CGT	2	6	8312	8317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339492084
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244	NC_015740	CGG	2	6	12285	12290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339492087
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261	NC_015740	GC	3	6	13388	13393	0 %	0 %	50 %	50 %	339492088
262	NC_015740	CGG	2	6	13429	13434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339492088
263	NC_015740	CG	3	6	13505	13510	0 %	0 %	50 %	50 %	339492088
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