MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 113947

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015733	ACC	2	6	210172	210177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485121
4002	NC_015733	CCTG	2	8	210199	210206	0 %	25 %	25 %	50 %	339485121
4003	NC_015733	GCA	2	6	210282	210287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485121
4004	NC_015733	CTGG	2	8	210290	210297	0 %	25 %	50 %	25 %	339485121
4005	NC_015733	CTGG	2	8	210364	210371	0 %	25 %	50 %	25 %	339485122
4006	NC_015733	CGT	2	6	210402	210407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485122
4007	NC_015733	GTTGCT	2	12	210457	210468	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	339485122
4008	NC_015733	GCT	2	6	210498	210503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485122
4009	NC_015733	GTCGCG	2	12	210583	210594	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339485122
4010	NC_015733	GGCT	2	8	210624	210631	0 %	25 %	50 %	25 %	339485122
4011	NC_015733	GCG	2	6	210720	210725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485122
4012	NC_015733	CAC	2	6	210745	210750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485122
4013	NC_015733	CCG	2	6	210762	210767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485122
4014	NC_015733	GCT	2	6	210796	210801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485122
4015	NC_015733	ATC	2	6	210868	210873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485122
4016	NC_015733	GAA	2	6	210886	210891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485122
4017	NC_015733	GCG	2	6	210914	210919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485122
4018	NC_015733	AGC	2	6	210926	210931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485122
4019	NC_015733	CAC	2	6	210952	210957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485122
4020	NC_015733	CGG	2	6	210967	210972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485122
4021	NC_015733	GCCA	2	8	211022	211029	25 %	0 %	25 %	50 %	339485122
4022	NC_015733	TGC	2	6	211031	211036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485122
4023	NC_015733	ACC	2	6	211053	211058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485122
4024	NC_015733	GGCCAG	2	12	211060	211071	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	339485122
4025	NC_015733	CAG	2	6	211075	211080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485122
4026	NC_015733	AGC	2	6	211085	211090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485122
4027	NC_015733	GCA	2	6	211092	211097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485122
4028	NC_015733	CGG	2	6	211124	211129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485122
4029	NC_015733	GCC	2	6	211268	211273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485122
4030	NC_015733	TGGCC	2	10	211278	211287	0 %	20 %	40 %	40 %	339485122
4031	NC_015733	TCG	2	6	211334	211339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485122
4032	NC_015733	GCA	2	6	211347	211352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485122
4033	NC_015733	CTGC	2	8	211356	211363	0 %	25 %	25 %	50 %	339485122
4034	NC_015733	ACC	2	6	211413	211418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485122
4035	NC_015733	GTG	2	6	211446	211451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485122
4036	NC_015733	GAT	2	6	211492	211497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485122
4037	NC_015733	GTC	2	6	211525	211530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485122
4038	NC_015733	GGC	2	6	211639	211644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485123
4039	NC_015733	CTG	2	6	211649	211654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485123
4040	NC_015733	GCT	2	6	211697	211702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485123
4041	NC_015733	GCT	3	9	211738	211746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485123
4042	NC_015733	GCG	2	6	211752	211757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485123
4043	NC_015733	TTG	2	6	211779	211784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485123
4044	NC_015733	CAG	2	6	211808	211813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485123
4045	NC_015733	CTG	2	6	211841	211846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485123
4046	NC_015733	GCT	2	6	211849	211854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485123
4047	NC_015733	GC	3	6	211888	211893	0 %	0 %	50 %	50 %	339485123
4048	NC_015733	CAG	2	6	211943	211948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485123
4049	NC_015733	CAG	2	6	212081	212086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485123
4050	NC_015733	CAGGCA	2	12	212090	212101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485123
4051	NC_015733	TGC	2	6	212179	212184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485124
4052	NC_015733	GCGAC	2	10	212186	212195	20 %	0 %	40 %	40 %	339485124
4053	NC_015733	GGCTG	2	10	212241	212250	0 %	20 %	60 %	20 %	339485124
4054	NC_015733	GCC	2	6	212253	212258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485124
4055	NC_015733	CTG	2	6	212280	212285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485124
4056	NC_015733	TGT	2	6	212309	212314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485124
4057	NC_015733	CTG	2	6	212364	212369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485124
4058	NC_015733	GTC	2	6	212433	212438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485124
4059	NC_015733	TGA	2	6	212441	212446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485124
4060	NC_015733	GGT	2	6	212502	212507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485124
4061	NC_015733	GTA	2	6	212562	212567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485124
4062	NC_015733	CGC	2	6	212585	212590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485124
4063	NC_015733	GAT	2	6	212607	212612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485124
4064	NC_015733	GCC	2	6	212620	212625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485124
4065	NC_015733	CCG	2	6	212662	212667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485124
4066	NC_015733	GAA	2	6	212706	212711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485124
4067	NC_015733	CAT	2	6	212717	212722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485124
4068	NC_015733	AGT	2	6	212727	212732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485124
4069	NC_015733	CGG	2	6	212744	212749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485124
4070	NC_015733	GCC	3	9	212751	212759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485124
4071	NC_015733	GTG	2	6	212854	212859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485124
4072	NC_015733	TTG	2	6	213011	213016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485125
4073	NC_015733	GTA	2	6	213103	213108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485125
4074	NC_015733	TTGCTC	2	12	213130	213141	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	339485125
4075	NC_015733	TCG	2	6	213239	213244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485125
4076	NC_015733	CTG	2	6	213310	213315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485125
4077	NC_015733	GC	3	6	213329	213334	0 %	0 %	50 %	50 %	339485125
4078	NC_015733	GGGT	2	8	213507	213514	0 %	25 %	75 %	0 %	339485125
4079	NC_015733	CCA	2	6	213632	213637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485125
4080	NC_015733	CAC	2	6	213640	213645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485125
4081	NC_015733	GCC	2	6	213649	213654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485125
4082	NC_015733	CAT	2	6	213703	213708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485125
4083	NC_015733	CG	4	8	213885	213892	0 %	0 %	50 %	50 %	339485125
4084	NC_015733	TCGG	2	8	213911	213918	0 %	25 %	50 %	25 %	339485125
4085	NC_015733	GC	3	6	213974	213979	0 %	0 %	50 %	50 %	339485125
4086	NC_015733	CGG	2	6	213999	214004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485125
4087	NC_015733	CCAG	2	8	214017	214024	25 %	0 %	25 %	50 %	339485125
4088	NC_015733	TTG	2	6	214052	214057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485125
4089	NC_015733	GCG	2	6	214058	214063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485125
4090	NC_015733	CAG	2	6	214123	214128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485125
4091	NC_015733	CGGGT	2	10	214182	214191	0 %	20 %	60 %	20 %	339485125
4092	NC_015733	GTC	2	6	214243	214248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485125
4093	NC_015733	CGGCC	2	10	214252	214261	0 %	0 %	40 %	60 %	339485125
4094	NC_015733	ATC	2	6	214268	214273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485125
4095	NC_015733	GCA	2	6	214311	214316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485125
4096	NC_015733	CGT	2	6	214320	214325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485125
4097	NC_015733	GTA	2	6	214345	214350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485125
4098	NC_015733	GCT	2	6	214370	214375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485125
4099	NC_015733	GGC	2	6	214416	214421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485125
4100	NC_015733	CAG	3	9	214517	214525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485126
4101	NC_015733	GCT	2	6	214580	214585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485126
4102	NC_015733	CAG	2	6	214604	214609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485126
4103	NC_015733	GTA	2	6	214619	214624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485126
4104	NC_015733	GCCC	2	8	214633	214640	0 %	0 %	25 %	75 %	339485126
4105	NC_015733	CTG	2	6	214701	214706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485126
4106	NC_015733	CAG	2	6	214712	214717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485126
4107	NC_015733	GCA	2	6	214720	214725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485126
4108	NC_015733	GGC	2	6	214735	214740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485126
4109	NC_015733	TGG	2	6	214879	214884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485126
4110	NC_015733	GCG	2	6	214918	214923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485126
4111	NC_015733	GCT	2	6	214997	215002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485126
4112	NC_015733	GCTCCA	2	12	215041	215052	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	339485126
4113	NC_015733	CAG	2	6	215054	215059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485126
4114	NC_015733	AGC	2	6	215075	215080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485126
4115	NC_015733	ACCGA	2	10	215097	215106	40 %	0 %	20 %	40 %	339485126
4116	NC_015733	CGG	2	6	215212	215217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485126
4117	NC_015733	GCTC	2	8	215251	215258	0 %	25 %	25 %	50 %	339485126
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4119	NC_015733	CTG	2	6	215486	215491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485126
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4240	NC_015733	GCTG	2	8	220701	220708	0 %	25 %	50 %	25 %	339485130
4241	NC_015733	GAAC	2	8	220789	220796	50 %	0 %	25 %	25 %	339485130
4242	NC_015733	CTG	2	6	220822	220827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485130
4243	NC_015733	GGC	2	6	220882	220887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485130
4244	NC_015733	CCT	2	6	220896	220901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339485130
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4248	NC_015733	CAGT	2	8	221037	221044	25 %	25 %	25 %	25 %	339485130
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4330	NC_015733	CGGCC	2	10	228732	228741	0 %	0 %	40 %	60 %	339485133
4331	NC_015733	GGC	2	6	228766	228771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485133
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4340	NC_015733	GCC	2	6	229284	229289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485133
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4343	NC_015733	TGCG	2	8	229439	229446	0 %	25 %	50 %	25 %	339485133
4344	NC_015733	ACC	2	6	229529	229534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485133
4345	NC_015733	TGCCAC	2	12	229576	229587	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	339485133
4346	NC_015733	AAG	2	6	229624	229629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485133
4347	NC_015733	GCC	2	6	229705	229710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485133
4348	NC_015733	TCT	2	6	229879	229884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485134
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4351	NC_015733	CTG	2	6	229974	229979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485134
4352	NC_015733	CGGTG	2	10	230063	230072	0 %	20 %	60 %	20 %	339485134
4353	NC_015733	CTG	2	6	230091	230096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485134
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4355	NC_015733	GGCC	2	8	230243	230250	0 %	0 %	50 %	50 %	339485135
4356	NC_015733	ACC	2	6	230319	230324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485135
4357	NC_015733	CTG	2	6	230346	230351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485135
4358	NC_015733	CTG	2	6	230367	230372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485135
4359	NC_015733	GCG	2	6	230443	230448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485135
4360	NC_015733	CGC	2	6	230449	230454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485135
4361	NC_015733	TCA	2	6	230560	230565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485135
4362	NC_015733	TCG	2	6	230605	230610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485135
4363	NC_015733	CGG	2	6	230614	230619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485135
4364	NC_015733	TGC	2	6	230698	230703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485135
4365	NC_015733	GC	3	6	230702	230707	0 %	0 %	50 %	50 %	339485135
4366	NC_015733	GCA	2	6	230788	230793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485135
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4370	NC_015733	GACCT	2	10	231096	231105	20 %	20 %	20 %	40 %	339485135
4371	NC_015733	GCT	2	6	231155	231160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485135
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4373	NC_015733	CGA	2	6	231200	231205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485135
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4390	NC_015733	TGC	2	6	231955	231960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485136
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4464	NC_015733	TCA	2	6	235583	235588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485141
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4468	NC_015733	GCTG	2	8	235675	235682	0 %	25 %	50 %	25 %	339485141
4469	NC_015733	GCCCTG	2	12	235723	235734	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	339485141
4470	NC_015733	CGG	2	6	235806	235811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485141
4471	NC_015733	GAA	2	6	235885	235890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485141
4472	NC_015733	AAG	2	6	235906	235911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485141
4473	NC_015733	CGA	2	6	235953	235958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485141
4474	NC_015733	ATC	2	6	235990	235995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485141
4475	NC_015733	CAA	2	6	236007	236012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485141
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4477	NC_015733	GCC	2	6	236086	236091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485141
4478	NC_015733	CAC	3	9	236133	236141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485141
4479	NC_015733	ATC	2	6	236236	236241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485141
4480	NC_015733	CTT	2	6	236250	236255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485141
4481	NC_015733	GGCCT	2	10	236389	236398	0 %	20 %	40 %	40 %	339485141
4482	NC_015733	GT	3	6	236426	236431	0 %	50 %	50 %	0 %	339485141
4483	NC_015733	TGG	2	6	236462	236467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485141
4484	NC_015733	CGG	2	6	236508	236513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485141
4485	NC_015733	CGT	2	6	236815	236820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485142
4486	NC_015733	TCG	2	6	236864	236869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485142
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4491	NC_015733	CTG	2	6	237103	237108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485142
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4496	NC_015733	CGTAC	2	10	237243	237252	20 %	20 %	20 %	40 %	339485142
4497	NC_015733	GGC	2	6	237277	237282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485142
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4500	NC_015733	CG	3	6	237377	237382	0 %	0 %	50 %	50 %	339485142

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