MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 113947

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015733	GCC	2	6	182860	182865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485092
3502	NC_015733	CG	3	6	182904	182909	0 %	0 %	50 %	50 %	339485092
3503	NC_015733	TGG	2	6	182918	182923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485092
3504	NC_015733	CGA	2	6	183051	183056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485092
3505	NC_015733	GCT	2	6	183151	183156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485092
3506	NC_015733	CCG	2	6	183185	183190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485092
3507	NC_015733	CCG	2	6	183194	183199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485092
3508	NC_015733	CGC	2	6	183265	183270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485092
3509	NC_015733	GCTG	2	8	183297	183304	0 %	25 %	50 %	25 %	339485092
3510	NC_015733	CCA	2	6	183455	183460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485092
3511	NC_015733	AGC	2	6	183504	183509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485092
3512	NC_015733	GTG	2	6	183529	183534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485092
3513	NC_015733	AGACCC	2	12	183551	183562	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	339485092
3514	NC_015733	CTG	2	6	183583	183588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485092
3515	NC_015733	CAGAC	2	10	183638	183647	40 %	0 %	20 %	40 %	339485092
3516	NC_015733	CTA	2	6	183654	183659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485092
3517	NC_015733	TGCG	2	8	183719	183726	0 %	25 %	50 %	25 %	339485092
3518	NC_015733	CGG	2	6	183786	183791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485092
3519	NC_015733	TCTGCT	2	12	184278	184289	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	339485093
3520	NC_015733	ACCAC	2	10	184373	184382	40 %	0 %	0 %	60 %	339485093
3521	NC_015733	CCT	2	6	184402	184407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339485093
3522	NC_015733	ACC	2	6	184647	184652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485094
3523	NC_015733	GAT	2	6	184728	184733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485094
3524	NC_015733	TTC	2	6	184756	184761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485094
3525	NC_015733	CCCGTT	2	12	184954	184965	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	339485095
3526	NC_015733	GCA	2	6	185014	185019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485095
3527	NC_015733	GCTG	2	8	185027	185034	0 %	25 %	50 %	25 %	339485095
3528	NC_015733	CCG	2	6	185041	185046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485095
3529	NC_015733	CTG	2	6	185067	185072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485095
3530	NC_015733	CCG	2	6	185094	185099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485095
3531	NC_015733	AGC	2	6	185143	185148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485095
3532	NC_015733	GCCT	2	8	185185	185192	0 %	25 %	25 %	50 %	339485095
3533	NC_015733	CAGG	2	8	185279	185286	25 %	0 %	50 %	25 %	339485095
3534	NC_015733	CCGGCG	2	12	185410	185421	0 %	0 %	50 %	50 %	339485095
3535	NC_015733	CGG	2	6	185428	185433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485095
3536	NC_015733	ACA	2	6	185509	185514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485095
3537	NC_015733	GAC	2	6	185568	185573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485095
3538	NC_015733	GCC	2	6	185628	185633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485095
3539	NC_015733	CGC	2	6	185690	185695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485095
3540	NC_015733	GCC	2	6	185744	185749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485095
3541	NC_015733	GGC	2	6	185813	185818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485095
3542	NC_015733	GGC	2	6	185861	185866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485095
3543	NC_015733	TGG	2	6	185887	185892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485095
3544	NC_015733	ACA	2	6	185905	185910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485095
3545	NC_015733	GC	3	6	185922	185927	0 %	0 %	50 %	50 %	339485095
3546	NC_015733	GCCAAG	2	12	186015	186026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485095
3547	NC_015733	GCC	2	6	186036	186041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485095
3548	NC_015733	GCT	2	6	186044	186049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485095
3549	NC_015733	TTG	2	6	186093	186098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485095
3550	NC_015733	CTG	2	6	186102	186107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485095
3551	NC_015733	CGG	2	6	186178	186183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485095
3552	NC_015733	GGCGCT	2	12	186206	186217	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339485095
3553	NC_015733	GGC	2	6	186245	186250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485095
3554	NC_015733	GTGG	2	8	186264	186271	0 %	25 %	75 %	0 %	339485095
3555	NC_015733	CCG	2	6	186353	186358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485095
3556	NC_015733	GCT	3	9	186363	186371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485095
3557	NC_015733	AGC	2	6	186390	186395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485095
3558	NC_015733	GCG	3	9	186403	186411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485095
3559	NC_015733	TTC	2	6	186438	186443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485095
3560	NC_015733	GCAG	2	8	186497	186504	25 %	0 %	50 %	25 %	339485095
3561	NC_015733	TGG	2	6	186533	186538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485095
3562	NC_015733	GTT	2	6	186554	186559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485095
3563	NC_015733	CGCTGT	2	12	186604	186615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485095
3564	NC_015733	CGC	2	6	186629	186634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485095
3565	NC_015733	GCT	2	6	186635	186640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485095
3566	NC_015733	GGT	2	6	186653	186658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485095
3567	NC_015733	AAG	2	6	186688	186693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485095
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3569	NC_015733	CTGG	2	8	186737	186744	0 %	25 %	50 %	25 %	339485095
3570	NC_015733	GGC	2	6	186791	186796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485095
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3572	NC_015733	GCC	2	6	186973	186978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485096
3573	NC_015733	GCC	2	6	187019	187024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485096
3574	NC_015733	TGC	2	6	187047	187052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485096
3575	NC_015733	GCT	2	6	187072	187077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485096
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3577	NC_015733	ACTCA	2	10	187225	187234	40 %	20 %	0 %	40 %	339485097
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3579	NC_015733	TCA	2	6	187302	187307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485097
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3583	NC_015733	TCG	3	9	187496	187504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485097
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3587	NC_015733	GCCT	2	8	187733	187740	0 %	25 %	25 %	50 %	339485098
3588	NC_015733	GGC	2	6	187762	187767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485098
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3590	NC_015733	GGC	2	6	187882	187887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485098
3591	NC_015733	CTG	2	6	187894	187899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485098
3592	NC_015733	CTG	2	6	188047	188052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485098
3593	NC_015733	AAG	2	6	188170	188175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485098
3594	NC_015733	TGC	2	6	188222	188227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485098
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3598	NC_015733	CGCA	2	8	188512	188519	25 %	0 %	25 %	50 %	339485099
3599	NC_015733	GCGCCG	2	12	188523	188534	0 %	0 %	50 %	50 %	339485099
3600	NC_015733	ACC	2	6	188536	188541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485099
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3602	NC_015733	GC	3	6	188831	188836	0 %	0 %	50 %	50 %	339485099
3603	NC_015733	CGG	2	6	188856	188861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485099
3604	NC_015733	TTG	2	6	188897	188902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485099
3605	NC_015733	TCA	2	6	188922	188927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485099
3606	NC_015733	CAG	2	6	188932	188937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485099
3607	NC_015733	AC	3	6	188955	188960	50 %	0 %	0 %	50 %	339485099
3608	NC_015733	CAGG	2	8	189042	189049	25 %	0 %	50 %	25 %	339485099
3609	NC_015733	GAACTG	2	12	189055	189066	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	339485099
3610	NC_015733	CAT	2	6	189112	189117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485099
3611	NC_015733	GCC	2	6	189128	189133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485099
3612	NC_015733	CAG	2	6	189205	189210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485099
3613	NC_015733	GGT	2	6	189241	189246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485099
3614	NC_015733	GCG	2	6	189257	189262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485099
3615	NC_015733	CAG	2	6	189343	189348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485099
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3618	NC_015733	CAG	2	6	189433	189438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485099
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3982	NC_015733	CAT	2	6	209125	209130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485121
3983	NC_015733	CCCG	2	8	209143	209150	0 %	0 %	25 %	75 %	339485121
3984	NC_015733	GCTG	2	8	209159	209166	0 %	25 %	50 %	25 %	339485121
3985	NC_015733	TGGC	2	8	209219	209226	0 %	25 %	50 %	25 %	339485121
3986	NC_015733	GCTG	2	8	209330	209337	0 %	25 %	50 %	25 %	339485121
3987	NC_015733	TGA	2	6	209398	209403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485121
3988	NC_015733	GC	3	6	209409	209414	0 %	0 %	50 %	50 %	339485121
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3990	NC_015733	CAG	2	6	209570	209575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485121
3991	NC_015733	TCC	2	6	209625	209630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339485121
3992	NC_015733	CAC	2	6	209675	209680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485121
3993	NC_015733	TA	3	6	209773	209778	50 %	50 %	0 %	0 %	339485121
3994	NC_015733	CAG	2	6	209798	209803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485121
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3996	NC_015733	TTGGCG	2	12	209878	209889	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	339485121
3997	NC_015733	TTGGC	2	10	209896	209905	0 %	40 %	40 %	20 %	339485121
3998	NC_015733	CAG	2	6	210079	210084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485121
3999	NC_015733	CAG	2	6	210107	210112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485121
4000	NC_015733	CTGC	2	8	210115	210122	0 %	25 %	25 %	50 %	339485121

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