MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 113947

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015733	GCTG	2	8	152153	152160	0 %	25 %	50 %	25 %	339485078
3002	NC_015733	TGG	2	6	152196	152201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485078
3003	NC_015733	GC	3	6	152260	152265	0 %	0 %	50 %	50 %	339485078
3004	NC_015733	GCG	2	6	152312	152317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485078
3005	NC_015733	GTG	2	6	152536	152541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485079
3006	NC_015733	CTG	2	6	152584	152589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485079
3007	NC_015733	GGT	2	6	152593	152598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485079
3008	NC_015733	GCA	2	6	152693	152698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485079
3009	NC_015733	AGC	2	6	153750	153755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485080
3010	NC_015733	GCGGT	2	10	153877	153886	0 %	20 %	60 %	20 %	339485080
3011	NC_015733	CAG	2	6	153959	153964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485080
3012	NC_015733	CGACC	2	10	154040	154049	20 %	0 %	20 %	60 %	339485080
3013	NC_015733	CGGC	2	8	154069	154076	0 %	0 %	50 %	50 %	339485080
3014	NC_015733	GCA	2	6	154083	154088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485080
3015	NC_015733	GGT	2	6	154092	154097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485080
3016	NC_015733	GAA	2	6	154131	154136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485080
3017	NC_015733	GCAG	2	8	154140	154147	25 %	0 %	50 %	25 %	339485080
3018	NC_015733	GGGCT	2	10	154179	154188	0 %	20 %	60 %	20 %	339485080
3019	NC_015733	TGC	2	6	154190	154195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485080
3020	NC_015733	ACC	2	6	154230	154235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485080
3021	NC_015733	CGA	2	6	154258	154263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485080
3022	NC_015733	GACGCC	2	12	154266	154277	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	339485080
3023	NC_015733	GTC	2	6	154377	154382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485080
3024	NC_015733	ATC	2	6	154404	154409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485080
3025	NC_015733	CGT	2	6	154442	154447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485080
3026	NC_015733	ACC	2	6	154509	154514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485080
3027	NC_015733	ACC	3	9	154584	154592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485080
3028	NC_015733	GGC	2	6	154626	154631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485080
3029	NC_015733	GTGACC	2	12	154677	154688	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339485080
3030	NC_015733	ACG	2	6	154762	154767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485080
3031	NC_015733	ACA	2	6	154771	154776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485080
3032	NC_015733	TCGA	2	8	154875	154882	25 %	25 %	25 %	25 %	339485080
3033	NC_015733	CAC	2	6	154886	154891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485080
3034	NC_015733	GGC	2	6	154926	154931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485080
3035	NC_015733	GTGACC	2	12	154977	154988	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339485080
3036	NC_015733	ACG	2	6	155062	155067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485080
3037	NC_015733	ACA	2	6	155071	155076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485080
3038	NC_015733	TCA	2	6	155164	155169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485080
3039	NC_015733	TACCGT	2	12	155183	155194	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	339485080
3040	NC_015733	GCAATG	2	12	155206	155217	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	339485080
3041	NC_015733	CAG	2	6	155229	155234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485080
3042	NC_015733	CCTT	2	8	155235	155242	0 %	50 %	0 %	50 %	339485080
3043	NC_015733	CCGT	2	8	155270	155277	0 %	25 %	25 %	50 %	339485080
3044	NC_015733	TCA	2	6	155368	155373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485080
3045	NC_015733	CGG	2	6	155447	155452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485080
3046	NC_015733	GTC	2	6	155490	155495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485080
3047	NC_015733	GGT	2	6	155532	155537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485080
3048	NC_015733	GC	3	6	155596	155601	0 %	0 %	50 %	50 %	339485080
3049	NC_015733	GAT	2	6	155682	155687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485080
3050	NC_015733	GGT	2	6	155697	155702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485080
3051	NC_015733	CAA	2	6	155717	155722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485080
3052	NC_015733	GCG	2	6	155770	155775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485080
3053	NC_015733	CAC	2	6	155783	155788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485080
3054	NC_015733	TGA	2	6	155798	155803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485080
3055	NC_015733	CGC	2	6	155921	155926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485080
3056	NC_015733	CGA	2	6	156023	156028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485080
3057	NC_015733	GTG	2	6	156115	156120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485080
3058	NC_015733	CGA	2	6	156149	156154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485080
3059	NC_015733	GGC	2	6	156195	156200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485080
3060	NC_015733	CAA	2	6	156227	156232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485080
3061	NC_015733	GGT	2	6	156377	156382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485080
3062	NC_015733	CAC	2	6	156458	156463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485080
3063	NC_015733	TGACC	2	10	156596	156605	20 %	20 %	20 %	40 %	339485080
3064	NC_015733	CAA	2	6	156617	156622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485080
3065	NC_015733	TCA	2	6	156634	156639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485080
3066	NC_015733	CGA	2	6	156686	156691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485080
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3069	NC_015733	TGACC	2	10	157259	157268	20 %	20 %	20 %	40 %	339485080
3070	NC_015733	CAA	2	6	157280	157285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485080
3071	NC_015733	CGA	2	6	157349	157354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485080
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3078	NC_015733	CAA	2	6	157943	157948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485080
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3091	NC_015733	TGACC	2	10	159248	159257	20 %	20 %	20 %	40 %	339485080
3092	NC_015733	CAA	2	6	159269	159274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485080
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3105	NC_015733	CAA	2	6	160595	160600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485080
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3115	NC_015733	TGACC	2	10	161900	161909	20 %	20 %	20 %	40 %	339485080
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3119	NC_015733	GTG	2	6	162123	162128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485080
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3232	NC_015733	CAGG	2	8	170331	170338	25 %	0 %	50 %	25 %	339485080
3233	NC_015733	CAG	2	6	170360	170365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485080
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3235	NC_015733	GCC	2	6	170678	170683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485080
3236	NC_015733	GTTC	2	8	170698	170705	0 %	50 %	25 %	25 %	339485080
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3238	NC_015733	TCG	2	6	170860	170865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485080
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3477	NC_015733	TAC	2	6	181619	181624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485091
3478	NC_015733	GCG	2	6	181740	181745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485091
3479	NC_015733	GCCAA	2	10	181791	181800	40 %	0 %	20 %	40 %	339485091
3480	NC_015733	TGG	2	6	181878	181883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485091
3481	NC_015733	GGA	2	6	181897	181902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339485091
3482	NC_015733	GCCCGC	2	12	181919	181930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485091
3483	NC_015733	GGT	2	6	181990	181995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485091
3484	NC_015733	CCG	2	6	182055	182060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485091
3485	NC_015733	GCC	2	6	182061	182066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485091
3486	NC_015733	GGT	2	6	182077	182082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485091
3487	NC_015733	GAA	2	6	182117	182122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485091
3488	NC_015733	GGC	2	6	182132	182137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485091
3489	NC_015733	ACA	2	6	182178	182183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485091
3490	NC_015733	GCC	2	6	182213	182218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485091
3491	NC_015733	GACCGC	2	12	182228	182239	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	339485091
3492	NC_015733	GTG	2	6	182244	182249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485091
3493	NC_015733	CTG	2	6	182255	182260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485091
3494	NC_015733	ATC	2	6	182381	182386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485091
3495	NC_015733	CTGG	2	8	182416	182423	0 %	25 %	50 %	25 %	339485092
3496	NC_015733	ATG	2	6	182449	182454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485092
3497	NC_015733	CGG	2	6	182486	182491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485092
3498	NC_015733	TGG	2	6	182566	182571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485092
3499	NC_015733	CTG	2	6	182761	182766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485092
3500	NC_015733	CAT	2	6	182802	182807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485092

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