MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 113947

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_015733	GCT	2	6	511544	511549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485369
10002	NC_015733	GAA	2	6	511568	511573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485369
10003	NC_015733	GCT	2	6	511679	511684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485369
10004	NC_015733	CG	3	6	511747	511752	0 %	0 %	50 %	50 %	339485369
10005	NC_015733	ATCAAG	2	12	511755	511766	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	339485369
10006	NC_015733	GAAG	2	8	511844	511851	50 %	0 %	50 %	0 %	339485369
10007	NC_015733	TGC	2	6	511910	511915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485369
10008	NC_015733	GAA	2	6	511940	511945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485369
10009	NC_015733	GTG	3	9	511972	511980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485369
10010	NC_015733	GGT	2	6	512000	512005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485369
10011	NC_015733	TG	3	6	512042	512047	0 %	50 %	50 %	0 %	339485369
10012	NC_015733	AAG	2	6	512058	512063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485369
10013	NC_015733	GTT	2	6	517954	517959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485370
10014	NC_015733	GGC	2	6	518005	518010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485370
10015	NC_015733	GCA	2	6	518047	518052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485370
10016	NC_015733	GAGC	2	8	518059	518066	25 %	0 %	50 %	25 %	339485370
10017	NC_015733	TCGAC	2	10	518196	518205	20 %	20 %	20 %	40 %	339485370
10018	NC_015733	GCCG	2	8	518279	518286	0 %	0 %	50 %	50 %	339485370
10019	NC_015733	GTC	2	6	518289	518294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485370
10020	NC_015733	TGG	2	6	518359	518364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485370
10021	NC_015733	TGG	3	9	518391	518399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485370
10022	NC_015733	TCC	2	6	518499	518504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339485370
10023	NC_015733	TGG	2	6	518511	518516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485370
10024	NC_015733	ATCG	2	8	518633	518640	25 %	25 %	25 %	25 %	339485370
10025	NC_015733	CAG	2	6	518666	518671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485370
10026	NC_015733	GCA	2	6	518674	518679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485370
10027	NC_015733	TCG	2	6	518695	518700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485370
10028	NC_015733	GAA	2	6	518723	518728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485370
10029	NC_015733	GGC	2	6	518822	518827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485370
10030	NC_015733	GTG	3	9	518865	518873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485370
10031	NC_015733	TGA	2	6	518893	518898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485370
10032	NC_015733	TCA	2	6	518926	518931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485371
10033	NC_015733	GCG	2	6	518971	518976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485371
10034	NC_015733	TCG	2	6	518980	518985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485371
10035	NC_015733	TGG	2	6	519001	519006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485371
10036	NC_015733	GAA	2	6	519072	519077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485371
10037	NC_015733	GC	3	6	519091	519096	0 %	0 %	50 %	50 %	339485371
10038	NC_015733	CCCGG	2	10	519137	519146	0 %	0 %	40 %	60 %	339485371
10039	NC_015733	GTTG	2	8	519202	519209	0 %	50 %	50 %	0 %	339485371
10040	NC_015733	GCG	2	6	519210	519215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485371
10041	NC_015733	GCCT	2	8	519243	519250	0 %	25 %	25 %	50 %	339485371
10042	NC_015733	GCG	2	6	519291	519296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485371
10043	NC_015733	CCG	2	6	519394	519399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485371
10044	NC_015733	G	6	6	519517	519522	0 %	0 %	100 %	0 %	339485371
10045	NC_015733	AGG	2	6	519568	519573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339485371
10046	NC_015733	GTTG	2	8	519656	519663	0 %	50 %	50 %	0 %	339485372
10047	NC_015733	CTG	2	6	519667	519672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485372
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10049	NC_015733	GCG	2	6	519819	519824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485372
10050	NC_015733	TGG	2	6	519836	519841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485372
10051	NC_015733	GGT	2	6	519844	519849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485372
10052	NC_015733	GGGGCA	2	12	519855	519866	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	339485372
10053	NC_015733	GGT	2	6	519918	519923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485372
10054	NC_015733	AGCG	2	8	519973	519980	25 %	0 %	50 %	25 %	339485372
10055	NC_015733	ATT	2	6	520042	520047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339485372
10056	NC_015733	TTCCC	2	10	520618	520627	0 %	40 %	0 %	60 %	339485373
10057	NC_015733	TTCGG	2	10	520712	520721	0 %	40 %	40 %	20 %	339485373
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10060	NC_015733	GAA	2	6	520861	520866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485373
10061	NC_015733	TGC	2	6	520879	520884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485373
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10066	NC_015733	CTG	2	6	521063	521068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485373
10067	NC_015733	CGA	2	6	521089	521094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485373
10068	NC_015733	ATC	3	9	521102	521110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485373
10069	NC_015733	GAC	2	6	521141	521146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485373
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10073	NC_015733	ACC	5	15	521354	521368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485373
10074	NC_015733	GCG	2	6	521427	521432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485373
10075	NC_015733	CTG	2	6	521435	521440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485373
10076	NC_015733	TGA	2	6	521455	521460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485373
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10078	NC_015733	GTC	2	6	521556	521561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485373
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10088	NC_015733	GAA	2	6	522467	522472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485375
10089	NC_015733	GTC	2	6	522473	522478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485375
10090	NC_015733	TTC	2	6	522518	522523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485375
10091	NC_015733	TGG	2	6	522607	522612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485375
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10093	NC_015733	AAGCCG	2	12	522689	522700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485375
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10095	NC_015733	GGCC	2	8	523035	523042	0 %	0 %	50 %	50 %	339485376
10096	NC_015733	CAT	2	6	523095	523100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485376
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10100	NC_015733	GCT	2	6	523240	523245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485376
10101	NC_015733	GCT	2	6	523363	523368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485376
10102	NC_015733	GCA	2	6	523394	523399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485376
10103	NC_015733	GT	3	6	523418	523423	0 %	50 %	50 %	0 %	339485376
10104	NC_015733	GAA	2	6	523494	523499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485377
10105	NC_015733	CTG	2	6	523509	523514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485377
10106	NC_015733	CGTA	2	8	523598	523605	25 %	25 %	25 %	25 %	339485377
10107	NC_015733	TGC	2	6	523615	523620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485377
10108	NC_015733	GCT	2	6	523671	523676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485377
10109	NC_015733	GGC	2	6	523740	523745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485377
10110	NC_015733	CGT	2	6	523760	523765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485377
10111	NC_015733	ATCGC	2	10	523767	523776	20 %	20 %	20 %	40 %	339485377
10112	NC_015733	TACCG	2	10	523911	523920	20 %	20 %	20 %	40 %	339485377
10113	NC_015733	ATC	2	6	523932	523937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485377
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10116	NC_015733	TCG	2	6	524349	524354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485378
10117	NC_015733	GTG	2	6	524409	524414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485378
10118	NC_015733	TACG	2	8	524468	524475	25 %	25 %	25 %	25 %	339485378
10119	NC_015733	CGTA	2	8	524479	524486	25 %	25 %	25 %	25 %	339485378
10120	NC_015733	CTG	2	6	524492	524497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485378
10121	NC_015733	GC	3	6	524500	524505	0 %	0 %	50 %	50 %	339485378
10122	NC_015733	ACG	2	6	524535	524540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485378
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10127	NC_015733	GCT	3	9	524804	524812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485378
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10150	NC_015733	GCT	2	6	526007	526012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485380
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10153	NC_015733	CGTA	2	8	526085	526092	25 %	25 %	25 %	25 %	339485380
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10227	NC_015733	CAA	2	6	529187	529192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485380
10228	NC_015733	TACATG	2	12	529218	529229	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	339485380
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10231	NC_015733	CAG	2	6	529299	529304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485380
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10234	NC_015733	GAC	2	6	529419	529424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485380
10235	NC_015733	TATCGA	2	12	529535	529546	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	339485380
10236	NC_015733	AAG	2	6	529741	529746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485381
10237	NC_015733	GCG	2	6	529889	529894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485381
10238	NC_015733	TCG	2	6	529917	529922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485381
10239	NC_015733	CTG	2	6	530002	530007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485381
10240	NC_015733	CGT	2	6	530058	530063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485381
10241	NC_015733	GAC	2	6	530079	530084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485381
10242	NC_015733	GCT	2	6	530100	530105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485381
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10249	NC_015733	CCTG	2	8	530349	530356	0 %	25 %	25 %	50 %	339485381
10250	NC_015733	TGC	2	6	530357	530362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485381
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10254	NC_015733	CTG	2	6	530470	530475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485381
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10257	NC_015733	CTG	2	6	530542	530547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485381
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10282	NC_015733	ATG	2	6	531796	531801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485381
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10304	NC_015733	CGT	2	6	533143	533148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485381
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10307	NC_015733	CTG	2	6	533293	533298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485381
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10321	NC_015733	GGT	2	6	534239	534244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485382
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10330	NC_015733	CGT	2	6	534798	534803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	394896020
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10334	NC_015733	TGC	2	6	534911	534916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	394896020
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10341	NC_015733	GCAGGA	2	12	535178	535189	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	339485384
10342	NC_015733	ACC	2	6	535221	535226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485384
10343	NC_015733	CAA	2	6	535406	535411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485384
10344	NC_015733	TGT	2	6	535427	535432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485384
10345	NC_015733	AGA	2	6	535541	535546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485384
10346	NC_015733	GAC	2	6	535602	535607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485384
10347	NC_015733	CAC	2	6	535613	535618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485384
10348	NC_015733	GAA	3	9	535626	535634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485384
10349	NC_015733	CAA	2	6	535673	535678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485384
10350	NC_015733	GCC	3	9	535689	535697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485384
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10352	NC_015733	GAA	2	6	535731	535736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485384
10353	NC_015733	GAA	2	6	535752	535757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485384
10354	NC_015733	TGCG	2	8	535771	535778	0 %	25 %	50 %	25 %	339485384
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